常见序列整理

来自osm&bio
跳转到导航 跳转到搜索

AQP   Asn-Pro-Ala

O-linked或N-linked     Asn-X-Ser/Thr

PTS1 转运序列   Ser-Lys-Leu

PTS2 转运序列   Arg/Lys-Leu/Ile-5X-His/Gln-Leu

ER 转运序列    疏水aa核心,多碱性aa(Arg,Lys)

Mt 转运序列    两性螺旋,一侧疏水,一侧碱性(Arg,Lys)

Cp 转运序列     富含Ser,Thr和少量疏水aa,罕见Glu和Asp

Nuclear 转运序列 富含短的Arg,Lys序列

KDEL   字面意思

KKXX   字面意思

两酸   字面意思,如:Asp-X-Gln

NPXY   字面意思

YXXφ 字面意思

LL     字面意思

SH2结构域特异结合 p-Tyr

SH3结构域特异结合 PXXP和RXXK

PTB结构域特异结合 NPXY

PDZ结构域特异结合 膜蛋白C端aa,通常末端为Val-COOH

WW结构域特异结合 XPPXY

(还剩几个结构域无特定结合序列,故不特地列出)

PKA磷酸化序列   X-Arg-Arg/Lys-X-Ser/Thr-Φ

膜蛋白内吞序列   YXXΦ

P62 Nup153核孔复合物蛋白疏水结构域     FXFG

Nup98核孔复合物蛋白疏水结构域         GLFG

NLS         PKKKRKV

破坏框       RXXLGXIXN

层粘连蛋白,纤连蛋白等与外基质结合区域   RGD

胶原α链 GXY(X常为Pro,Y常为Hypro或Hylys)


PS:有无好心人帮我对齐一下QAQ,不会编辑

名称 序列或特征 描述 附加说明
定位信号 KDEL KDEL 可溶性蛋白内质网驻留信号
HDEL HDEL 同上,在酵母和植物中更常见
KKXX KKXX(X为任意氨基酸) 膜蛋白内质网驻留信号
两酸 如DXE ER→高尔基体转运信号
PTS1 SKL,存在许多变体 C端过氧化物酶体定位信号 受体为PEX5
PTS2 (R/K)(L/V/I/Q)(X)5(H/Q)(L/A/F) N端过氧化物酶体定位信号 受体为PEX7,共受体为18或20
mPTS 膜蛋白过氧化物酶体定位信号 受体为PEX19
信号肽 疏水aa核心,多碱性aa(Arg,Lys) 内质网定位序列
转运肽 富含Ser,Thr和少量疏水aa,罕见Glu和Asp 叶绿体定位序列
导肽 两性螺旋,一侧疏水,一侧碱性(Arg,Lys) 线粒体定位序列
功能序列 GXY(X常为Pro,Y常为Hypro或Hylys) 胶原的三股螺旋重复序列
七肽重复序列,第一位和第四位是疏水氨基酸 α角蛋白的卷曲螺旋重复序列
G-A/S-G-A/S β角蛋白的β折叠重复序列
N*-X-S/T,X≠P N糖基化,发生在N上 O糖基化没有特定的识别位点
NPA 水孔蛋白通道中的关键序列