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微生物遗传

来自osm&bio

本文所述尽可能来源于教科书和向教授提问得到的回答,但难免会有一些笔者个人的主观理解,写在osm.上也是希望可以获得指正,所以请谨慎接受本文的观点。

真核生物

基因转变

若为染色单体转变则分离比6:2

若为半染色单体转变则为5:3或异常4:4(3:1:3:1)

真菌类的连锁分析

着丝粒作图

基因与着丝粒的重组率为0.5×(交换型子囊数/(交换型子囊数+非交换型子囊数))×100%

粗糙链孢霉的连锁

子囊分为三种类型:亲型(PD)、非亲二型(NPD)、四型(T)

RF=(NPD+0.5×T)/总子囊数

这里有一个校正公式,推理过程略,对于顺序四分子是校正但对于非顺序四分子而言却是必须使用的——RF=(0.5×T+3NPD)/总子囊数(但在题目中往往会很看出题人怎么想)

细菌

在细菌的基因作图中,“根本没转进去的基因”成为很严重的干扰项,隐性筛选是必须的,而这在下述方法中有不同的解决方式。

转化

转化的阴性筛选方式就是全部放弃。

R=单基因转化个体数/(单基因转化个体数+2基因共转化个体数)

从一位遗传学教授一位相关领域博士综合得到的结果:完全舍弃双阴个体已经是误差最小的方式,而且基因的远近本来就是一个相对关系,如果所有的基因都按照同样的方法计算,那么结果依然是准确的,定义什么本来就是为了人的方便(毕竟转化没有像转导一样转化成了图距)。

接合

三种类型

F⁺——>F⁻,F⁻会变F⁺,基因传递效率低

Hfr(F因子整合到细菌基因组上)——>F⁻高频重组,F⁻不变

F'——>F⁻,类似F⁺,特定基因高频传递

作图

作图有两种

中断杂交作图

以最先进入基因作为分子标记来做隐性筛选

重组作图

可能掺杂笔者的主观臆断:应该是以较靠后的基因来做隐性筛选标记,而“某单基因”是非选择标记基因,所以虽然在式子上有些类似转化,其实依然是不同的方法。

R=某单基因整合个体数/(某单基因整个个体数+2基因同时整合个体数)

转导

依旧很可能是笔者的主观臆断:任选一个标记基因即可,噬菌体双感染可以直接当三点测交做

而只用一个噬菌体的情况又分为普遍性转导和局限性转导。(注意一点:无论是普遍性转导还是局限性转导,都是温和噬菌体介导的)

普遍性转导

如P1噬菌体,其并不整合到细菌的染色体上,独立地存在于细菌细胞质内,因此裂解细胞后携带的供体染色体片段是完全随机的。

求物理距离——图距d=L(1-³√x),其中L为转导噬菌体基因组平均长度(cM),x为2个基因共转导率。(物理距离?遗传距离?)

局限性转导

如λ噬菌体,会整合到噬菌体基因组中,所以只能转导供体基因组中的特定基因。

噬菌体

如果亲本类型为h⁺r和hr⁺,那么重组值=(hr+h⁺r⁺)/总噬菌斑数×100%