细菌的营养类型
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微生物代谢可分为多种方式,其中明显的主要分为:
- 自养生物autotrophs:使用CO2/HCO3作为唯一碳源,同时从光介导反应(光自养生物photoautotrophs)或无机氧化反应(化能自养生物lithoautotrophs)获取能量
- 异养生物heterotrophs:使用多碳原子的化合物,其能量和碳都来自同一分子,而不是来自不同的来源,其中甲烷营养methanotrophs和甲基营养methylotrophs是某种“灰色区域”(它们生长在比二氧化碳更少的一碳化合物上,它们与自养生物共享一些能量限制,但也可以被视为异养生物的一个特例,因为例如,甲烷既用作碳源,又用作能量来源)。异养生物可进一步分为:
- 专性异养生物obligate heterotrophs(只能异养生长)
- 兼性自养生物 facultative autotrophs(既能异养生长也能自养生长),
- 混合营养生物mixotrophs(同时进行异养和自养生长)
还存在其他混合代谢模式,例如,当异养生物(例如,以己糖为食)氧化无机电子供体时,就会出现这种情况——实际上有四种可能的结果:
1. 电子供体被氧化,而特定生长产量没有任何明显的增加。这表明该生物是异养的,不会从电子供体的无端氧化中获得能量,它可能只是在解毒或无意中氧化,而没有对电子进行有用的捕获。值得注意的是,这是批量培养中的常见观察结果,但在底物受限的恒化器中生长的相同生物体却会显示出结果4。
2. 电子供体的氧化和从中获取的能量的利用为二氧化碳固定提供燃料,同时进行异养生长。这将表明该生物体是我们已经提到的混合营养mixotroph。
3. 电子供体的氧化,特定生长产量适度增加,但没有二氧化碳固定,并且在提供电子供体时,静息细胞中没有任何 ATP 产生。这将表明该生物体没有从氧化中获得有用的能量,而是由于作为“电子供体”提供的化学物质作为抗氧化剂而产量略有增加。
4. 电子供体的氧化使特定生长产量大幅增加,但没有二氧化碳固定,尽管在提供电子供体时,静息细胞中会产生 ATP。这表明异养生长过程中的呼吸作用得到了来自电子供体的电子的补充,增加了质子动力,从而增加了 ATP 的产生,导致更高的特定生长产量——这种异养的特殊情况是化能无机异养chemolithoheterotrophy。