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文件:生长素合成途径.png

2024-08-16T12:38:43Z

LENDFUZ：

生长素合成途径

病毒分类整理

2024-04-11T07:15:18Z

LENDFUZ：

== 病毒进化史 ==
[[文件:进化史.png|缩略图|<ref>病毒进化史 <nowiki>https://www.bilibili.com/read/cv5205466/?from=readlist</nowiki> 来源：bilibili 作者：制御秘书长杜鹃</ref>]]
进化历史细则:1，类病毒与德尔塔病毒(以下简称丁肝病毒)繁殖方式一样，只是丁肝病毒多了一个德尔塔抗原。(蛇丁肝病毒多了一个疑似德尔塔棘突蛋白)

2，丁肝病毒的RNA是反义RNA，繁殖方式与反义RNA病毒一样(丁肝病毒：转录——德尔塔抗原催化RNA复制；反义RNA病毒：转录——基质蛋白催化RNA复制)

3，丁肝病毒生活需要细胞的DNA依赖的RNA聚合酶（主要是RNA聚合酶II——转录mRNA的RNA聚合酶）进行RNA复制（可见细胞的RNA聚合酶祖先是RNA依赖的RNA聚合酶）

4，正义RNA病毒、反义RNA病毒的RNA依赖的RNA聚合酶与逆转录病毒的逆转录酶拥有共同结构。

5，正义RNA病毒RNA复制时首先形成双链RNA，然后双链RNA转录形成正义RNA；双链RNA病毒首先进行转录形成正义RNA，最终正义RNA转录成为双链RNA，可谓是“师出同门”

6，正义RNA病毒复制时在细胞内形成小体，双链RNA病毒可直接作为小体

7，反义RNA病毒复制时不形成双链RNA，与正义RNA病毒完全不同

8，人体内有内源性博尔纳病毒基因(EBLN-1/2/3P)，而博尔纳病毒正是反义RNA病毒，可见反义RNA病毒可以整合在宿主DNA基因组中，这与逆转录病毒是一样的（可见，反义RNA病毒是逆转录病毒的祖先）

9，反义RNA病毒、逆转录病毒、拟逆转录病毒、单链DNA病毒与双链DNA病毒均可以通过内含子剪辑RNA来改变外显子的表达，这与细胞是一样的

10，逆转录病毒中的泡沫病毒有20%的概率会形成拥有双链DNA的病毒，这种病毒的生活方式与乙肝病毒一样（泡沫病毒中拥有双链DNA的病毒遗传信息流与乙肝病毒均为DNA→RNA→DNA，泡沫病毒中拥有双正义RNA的病毒遗传信息流为RNA→DNA→RNA）

11，乙肝病毒（DR1与DR2）、花椰菜花叶病毒（19S与35S）的DNA上均有两个正向重复序列（direct repeat），用以mRNA转录、pgRNA合成与病毒DNA合成。逆转录病毒的DNA上也有两个重复序列（long terminal repeat），用以mRNA转录、正义RNA合成与病毒DNA合成

12，无论是像HIV的逆转录病毒（retrovirus），还是像乙肝病毒的拟逆转录病毒（pararetrovirus），它们合成双链DNA的逆转录过程中，均会形成单链DNA，而且单链DNA也含有重复序列。而腺相关病毒这种无害的人细小病毒的单链DNA也含有重复序列（inverted repeat）

13，无论是拥有线型单链DNA的腺相关病毒，还是拥有环状单链DNA的M13噬菌体，它们均拥有重复序列以作为启动子

14，人体细胞内的DNA很多都是逆转录病毒（少数为反义RNA病毒）整合而来

15，反义RNA病毒的RNA依赖的RNA聚合酶与逆转录酶、DNA聚合酶和RNA聚合酶结构相似

16，非洲猪瘟病毒与原始细胞的DNA聚合酶均缺失外切酶修复校正功能，由此可知，原始细胞由原始双链DNA病毒进化而来。

17，原始DNA病毒的DNA聚合酶开始没有外切酶修复校正功能，修复校正功能是后期进化而来。原始细胞的DNA细胞的DNA聚合酶也是如此

18，最早出现的外切酶修复校正功能为3'→5'外切酶，最晚出现的外切酶修复校正功能为5'→3'外切酶。

19，真核细胞的染色体与现代双链DNA病毒的DNA均为线型，而细胞的末端为由重复序列组成的端粒，现代双链DNA病毒DNA的末端为重复序列。

20，真核细胞的端粒上有端粒酶用以合成替换引物的DNA，腺病毒的DNA末端有磷蛋白作为DNA复制的引物

<ref>病毒进化史 <nowiki>https://www.bilibili.com/read/cv5205466/?from=readlist</nowiki> 来源：bilibili 作者：制御秘书长杜鹃</ref>

== 病毒分类法 ==

=== ICTV 分类法 ===
国际病毒分类委员会（ICTV）是国际微生物学联合会发展、改进和维护通用病毒分类的唯一机构，在1966年建立起了一个病毒分类的通用系统和统一的命名法则。第七届 ICTV 会议首次规范化了病毒物种的概念，即病毒分类的分支层次中的最低分类单元。分类的主要依据是病毒颗粒的特性、抗原特性与生物特性。

到目前为止只有一小部分的病毒得到了研究，从来自人体的病毒样品中发现有20%的序列是未曾发现过的，而来自环境中（如海水、大洋沉积物等）的病毒样品则大部分的序列都是全新的。

病毒分类从域开始，结构如下，分类后缀在括号中：
:域 Realm（''-viria''）
::亚域 Subrealm（''-vira''）
:::界 Kingdom（''-viriae''）
::::亚界 Subkingdom（''-virites''）
:::::门 Phylum（''-viricota''）
::::::亚门 Subphylum（''-viricotina''）
:::::::纲 Class（''-viricetes''）
::::::::亚纲 Subclass（''-viricetidae''）
:::::::::目 Order（''-virales''）
::::::::::亚目 Suborder（''-virineae''）
:::::::::::科 Family（''-viridae''）
::::::::::::亚科 Subfamily（''-virinae''）
:::::::::::::属 Genus（''-virus''）
::::::::::::::亚属 Subgenus（''-virus''）
:::::::::::::::种 Species

ICTV 2020版分类表中总共有6个域、10个界、17个门、2个亚门、39个纲、59个目、8个亚目、189个科、136个亚科、2224个属、70个亚属与9110个种。除亚域、亚界和亚纲外，其他级别的分类单元都被使用。共有6个域、1个地位未定纲、19个地位未定科及2个地位未定属被承认。

=== 巴尔的摩分类法 ===
诺贝尔奖获得者生物学家戴维·巴尔的摩在1970年代提出了巴尔的摩分类系统。巴尔的摩分类法与ICTV分类法一起用于现代病毒的分类。

巴尔的摩分类法是基于病毒 mRNA 的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中，必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制，但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是单链或双链的 RNA 或 DNA，可以有也可以没有反转录酶。而且，单链RNA病毒可以是正义（+）或反义（-）。这一分类法将病毒分为7类：

*第一类是双链 DNA 病毒（如腺病毒、疱疹病毒、痘病毒）
*第二类是单链 DNA 病毒（+）DNA（如小 DNA 病毒）
*第三类是双链RNA病毒（如呼肠孤病毒）
*第四类是（+）单链RNA病毒（如微小核糖核酸病毒、披盖病毒、甲肝病毒、丙肝病毒、黄热病毒、鼻病毒、脊髓灰质炎病毒、风疹病毒）
*第五类是（-）单链RNA病毒（如正黏液病毒（流感病毒）、炮弹病毒）
*第六类是单链RNA反转录病毒（如反转录病毒、人类免疫缺陷病毒）
*第七类是双链 DNA 反转录病毒（如乙肝病毒）
举一个病毒分类的例子：水痘病毒，即带状疱疹病毒，属于疱疹病毒目，疱疹病毒科，甲型疱疹病毒亚科，水疱病毒属；同时，带状疱疹病毒是巴尔的摩分类法中的第一类，因为它是双链 DNA 病毒，且不含有反转录酶。
物种名称通常以[疾病]病毒的形式出现，尤其是高等动植物。
<ref>[https://zh.wikipedia.org/wiki/病毒分类表病毒分类表-维基百科]</ref>
== 卫星 ==
卫星（Satellite）是亚病毒因子的一类，不能单独存在，需要辅助病毒协助复制核酸，或者由辅助病毒提供衣壳蛋白来包被核酸。分为两大类：能利用自己核酸编码衣壳蛋白的为卫星病毒，不能的则称卫星核酸。如丁型肝炎病毒(HDV)必须利用乙型肝炎病毒的包膜蛋白才能完成复制周期，常见的卫星病毒还有腺联病毒(AAV)、卫星烟草花叶病毒(STMV)、卫星玉米白线花叶病毒(SMWLMV)、卫星稷子花叶病毒（SPMV)等。
== 类病毒 ==
类病毒（Viroid）是一种具有传染性的单链环状RNA病原体。它比病毒要小，且没有典型病毒所有的蛋白质外壳。类病毒为严格寄生物，专一性很强。目前所有已知的类病毒均为被子植物栖居者，且多数造成疾病；它们通常透过种子或花粉传播，且整合到细胞核内进行复制。
类病毒最早由在美国工作的瑞士学者迪纳（Theodor O. Diener）于1971年在马铃薯纺锤块茎病中发现。

== 拟病毒 ==
拟病毒又称类类病毒，使指一类包裹在真病毒粒中的有缺陷的类病毒。拟病毒极其微小，一般仅由裸露的RNA组成。与拟病毒“共生”的真病毒又称辅助病毒，拟病毒则成了它的“卫星”。拟病毒的复制必须依赖辅助病毒的协助。同时，拟病毒也可干扰辅助病毒的复制和减轻其对宿主的病害，因此，它可用于生物防治中。

== 朊病毒 ==
朊病毒是一种具感染性的致病因子，能引发哺乳动物的传染性海绵状脑病。朊毒体疾病（传染性海绵状脑病）和阿尔茨海默病、帕金森病同属于神经退行性疾病。最早发现于哺乳动物的传染性海绵状脑病，包括羊搔痒症、疯牛病、慢性消耗病，以及人类的克雅二氏病。它不是病毒，而是仅由蛋白质构成的致病因子。它虽然不含核酸，但可自我复制且具有感染性。朊病毒由错误折叠的朊蛋白（PrP）聚集组成。它能够诱导在神经细胞上原本是正常结构的朊蛋白转变为错误结构并进行聚集反应，借由这个机制引入新的朊蛋白，不断自我复制并传递至邻近细胞，最终扩散至整个脑部。

病毒分类整理

2024-04-08T08:50:32Z

LENDFUZ：

== 病毒进化史 ==
[[文件:进化史.png|缩略图|<ref>病毒进化史 <nowiki>https://www.bilibili.com/read/cv5205466/?from=readlist</nowiki> 来源：bilibili 作者：制御秘书长杜鹃</ref>]]
进化历史细则:1，类病毒与德尔塔病毒(以下简称丁肝病毒)繁殖方式一样，只是丁肝病毒多了一个德尔塔抗原。(蛇丁肝病毒多了一个疑似德尔塔棘突蛋白)

2，丁肝病毒的RNA是反义RNA，繁殖方式与反义RNA病毒一样(丁肝病毒：转录——德尔塔抗原催化RNA复制；反义RNA病毒：转录——基质蛋白催化RNA复制)

3，丁肝病毒生活需要细胞的DNA依赖的RNA聚合酶（主要是RNA聚合酶II——转录mRNA的RNA聚合酶）进行RNA复制（可见细胞的RNA聚合酶祖先是RNA依赖的RNA聚合酶）

4，正义RNA病毒、反义RNA病毒的RNA依赖的RNA聚合酶与逆转录病毒的逆转录酶拥有共同结构。

5，正义RNA病毒RNA复制时首先形成双链RNA，然后双链RNA转录形成正义RNA；双链RNA病毒首先进行转录形成正义RNA，最终正义RNA转录成为双链RNA，可谓是“师出同门”

6，正义RNA病毒复制时在细胞内形成小体，双链RNA病毒可直接作为小体

7，反义RNA病毒复制时不形成双链RNA，与正义RNA病毒完全不同

8，人体内有内源性博尔纳病毒基因(EBLN-1/2/3P)，而博尔纳病毒正是反义RNA病毒，可见反义RNA病毒可以整合在宿主DNA基因组中，这与逆转录病毒是一样的（可见，反义RNA病毒是逆转录病毒的祖先）

9，反义RNA病毒、逆转录病毒、拟逆转录病毒、单链DNA病毒与双链DNA病毒均可以通过内含子剪辑RNA来改变外显子的表达，这与细胞是一样的

10，逆转录病毒中的泡沫病毒有20%的概率会形成拥有双链DNA的病毒，这种病毒的生活方式与乙肝病毒一样（泡沫病毒中拥有双链DNA的病毒遗传信息流与乙肝病毒均为DNA→RNA→DNA，泡沫病毒中拥有双正义RNA的病毒遗传信息流为RNA→DNA→RNA）

11，乙肝病毒（DR1与DR2）、花椰菜花叶病毒（19S与35S）的DNA上均有两个正向重复序列（direct repeat），用以mRNA转录、pgRNA合成与病毒DNA合成。逆转录病毒的DNA上也有两个重复序列（long terminal repeat），用以mRNA转录、正义RNA合成与病毒DNA合成

12，无论是像HIV的逆转录病毒（retrovirus），还是像乙肝病毒的拟逆转录病毒（pararetrovirus），它们合成双链DNA的逆转录过程中，均会形成单链DNA，而且单链DNA也含有重复序列。而腺相关病毒这种无害的人细小病毒的单链DNA也含有重复序列（inverted repeat）

13，无论是拥有线型单链DNA的腺相关病毒，还是拥有环状单链DNA的M13噬菌体，它们均拥有重复序列以作为启动子

14，人体细胞内的DNA很多都是逆转录病毒（少数为反义RNA病毒）整合而来

15，反义RNA病毒的RNA依赖的RNA聚合酶与逆转录酶、DNA聚合酶和RNA聚合酶结构相似

16，非洲猪瘟病毒与原始细胞的DNA聚合酶均缺失外切酶修复校正功能，由此可知，原始细胞由原始双链DNA病毒进化而来。

17，原始DNA病毒的DNA聚合酶开始没有外切酶修复校正功能，修复校正功能是后期进化而来。原始细胞的DNA细胞的DNA聚合酶也是如此

18，最早出现的外切酶修复校正功能为3'→5'外切酶，最晚出现的外切酶修复校正功能为5'→3'外切酶。

19，真核细胞的染色体与现代双链DNA病毒的DNA均为线型，而细胞的末端为由重复序列组成的端粒，现代双链DNA病毒DNA的末端为重复序列。

20，真核细胞的端粒上有端粒酶用以合成替换引物的DNA，腺病毒的DNA末端有磷蛋白作为DNA复制的引物

<ref>病毒进化史 <nowiki>https://www.bilibili.com/read/cv5205466/?from=readlist</nowiki> 来源：bilibili 作者：制御秘书长杜鹃</ref>

== 病毒分类法 ==

=== ICTV 分类法 ===
国际病毒分类委员会（ICTV）是国际微生物学联合会发展、改进和维护通用病毒分类的唯一机构，在1966年建立起了一个病毒分类的通用系统和统一的命名法则。第七届 ICTV 会议首次规范化了病毒物种的概念，即病毒分类的分支层次中的最低分类单元。分类的主要依据是病毒颗粒的特性、抗原特性与生物特性。

到目前为止只有一小部分的病毒得到了研究，从来自人体的病毒样品中发现有20%的序列是未曾发现过的，而来自环境中（如海水、大洋沉积物等）的病毒样品则大部分的序列都是全新的。

病毒分类从域开始，结构如下，分类后缀在括号中：
:域 Realm（''-viria''）
::亚域 Subrealm（''-vira''）
:::界 Kingdom（''-viriae''）
::::亚界 Subkingdom（''-virites''）
:::::门 Phylum（''-viricota''）
::::::亚门 Subphylum（''-viricotina''）
:::::::纲 Class（''-viricetes''）
::::::::亚纲 Subclass（''-viricetidae''）
:::::::::目 Order（''-virales''）
::::::::::亚目 Suborder（''-virineae''）
:::::::::::科 Family（''-viridae''）
::::::::::::亚科 Subfamily（''-virinae''）
:::::::::::::属 Genus（''-virus''）
::::::::::::::亚属 Subgenus（''-virus''）
:::::::::::::::种 Species

ICTV 2020版分类表中总共有6个域、10个界、17个门、2个亚门、39个纲、59个目、8个亚目、189个科、136个亚科、2224个属、70个亚属与9110个种。除亚域、亚界和亚纲外，其他级别的分类单元都被使用。共有6个域、1个地位未定纲、19个地位未定科及2个地位未定属被承认。

=== 巴尔的摩分类法 ===
诺贝尔奖获得者生物学家戴维·巴尔的摩在1970年代提出了巴尔的摩分类系统。巴尔的摩分类法与ICTV分类法一起用于现代病毒的分类。

巴尔的摩分类法是基于病毒 mRNA 的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中，必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制，但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是单链或双链的 RNA 或 DNA，可以有也可以没有反转录酶。而且，单链RNA病毒可以是正义（+）或反义（-）。这一分类法将病毒分为7类：

*第一类是双链 DNA 病毒（如腺病毒、疱疹病毒、痘病毒）
*第二类是单链 DNA 病毒（+）DNA（如小 DNA 病毒）
*第三类是双链RNA病毒（如呼肠孤病毒）
*第四类是（+）单链RNA病毒（如微小核糖核酸病毒、披盖病毒、甲肝病毒、丙肝病毒、黄热病毒、鼻病毒、脊髓灰质炎病毒、风疹病毒）
*第五类是（-）单链RNA病毒（如正黏液病毒（流感病毒）、炮弹病毒）
*第六类是单链RNA反转录病毒（如反转录病毒、人类免疫缺陷病毒）
*第七类是双链 DNA 反转录病毒（如乙肝病毒）
举一个病毒分类的例子：水痘病毒，即带状疱疹病毒，属于疱疹病毒目，疱疹病毒科，甲型疱疹病毒亚科，水疱病毒属；同时，带状疱疹病毒是巴尔的摩分类法中的第一类，因为它是双链 DNA 病毒，且不含有反转录酶。
物种名称通常以[疾病]病毒的形式出现，尤其是高等动植物。
<ref>[https://zh.wikipedia.org/wiki/病毒分类表病毒分类表-维基百科]</ref>
== 卫星 ==
卫星（Satellite）是亚病毒因子的一类，不能单独存在，需要辅助病毒协助复制核酸，或者由辅助病毒提供衣壳蛋白来包被核酸。分为两大类：能利用自己核酸编码衣壳蛋白的为卫星病毒，不能的则称卫星核酸。如丁型肝炎病毒(HDV)必须利用乙型肝炎病毒的包膜蛋白才能完成复制周期，常见的卫星病毒还有腺联病毒(AAV)、卫星烟草花叶病毒(STMV)、卫星玉米白线花叶病毒(SMWLMV)、卫星稷子花叶病毒（SPMV)等。
== 类病毒 ==
类病毒（Viroid）是一种具有传染性的单链环状RNA病原体。它比病毒要小，且没有典型病毒所有的蛋白质外壳。类病毒为严格寄生物，专一性很强。目前所有已知的类病毒均为被子植物栖居者，且多数造成疾病；它们通常透过种子或花粉传播，且整合到细胞核内进行复制。
类病毒最早由在美国工作的瑞士学者迪纳（Theodor O. Diener）于1971年在马铃薯纺锤块茎病中发现。

== 朊病毒 ==
朊病毒是一种具感染性的致病因子，能引发哺乳动物的传染性海绵状脑病。朊毒体疾病（传染性海绵状脑病）和阿尔茨海默病、帕金森病同属于神经退行性疾病。最早发现于哺乳动物的传染性海绵状脑病，包括羊搔痒症、疯牛病、慢性消耗病，以及人类的克雅二氏病。它不是病毒，而是仅由蛋白质构成的致病因子。它虽然不含核酸，但可自我复制且具有感染性。朊病毒由错误折叠的朊蛋白（PrP）聚集组成。它能够诱导在神经细胞上原本是正常结构的朊蛋白转变为错误结构并进行聚集反应，借由这个机制引入新的朊蛋白，不断自我复制并传递至邻近细胞，最终扩散至整个脑部。

病毒分类整理

2024-04-08T08:48:19Z

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== 病毒进化史 ==
[[文件:进化史.png|缩略图|<ref>病毒进化史 <nowiki>https://www.bilibili.com/read/cv5205466/?from=readlist</nowiki> 来源：bilibili 作者：制御秘书长杜鹃</ref>]]
进化历史细则:1，类病毒与德尔塔病毒(以下简称丁肝病毒)繁殖方式一样，只是丁肝病毒多了一个德尔塔抗原。(蛇丁肝病毒多了一个疑似德尔塔棘突蛋白)

2，丁肝病毒的RNA是反义RNA，繁殖方式与反义RNA病毒一样(丁肝病毒：转录——德尔塔抗原催化RNA复制；反义RNA病毒：转录——基质蛋白催化RNA复制)

3，丁肝病毒生活需要细胞的DNA依赖的RNA聚合酶（主要是RNA聚合酶II——转录mRNA的RNA聚合酶）进行RNA复制（可见细胞的RNA聚合酶祖先是RNA依赖的RNA聚合酶）

4，正义RNA病毒、反义RNA病毒的RNA依赖的RNA聚合酶与逆转录病毒的逆转录酶拥有共同结构。

5，正义RNA病毒RNA复制时首先形成双链RNA，然后双链RNA转录形成正义RNA；双链RNA病毒首先进行转录形成正义RNA，最终正义RNA转录成为双链RNA，可谓是“师出同门”

6，正义RNA病毒复制时在细胞内形成小体，双链RNA病毒可直接作为小体

7，反义RNA病毒复制时不形成双链RNA，与正义RNA病毒完全不同

8，人体内有内源性博尔纳病毒基因(EBLN-1/2/3P)，而博尔纳病毒正是反义RNA病毒，可见反义RNA病毒可以整合在宿主DNA基因组中，这与逆转录病毒是一样的（可见，反义RNA病毒是逆转录病毒的祖先）

9，反义RNA病毒、逆转录病毒、拟逆转录病毒、单链DNA病毒与双链DNA病毒均可以通过内含子剪辑RNA来改变外显子的表达，这与细胞是一样的

10，逆转录病毒中的泡沫病毒有20%的概率会形成拥有双链DNA的病毒，这种病毒的生活方式与乙肝病毒一样（泡沫病毒中拥有双链DNA的病毒遗传信息流与乙肝病毒均为DNA→RNA→DNA，泡沫病毒中拥有双正义RNA的病毒遗传信息流为RNA→DNA→RNA）

11，乙肝病毒（DR1与DR2）、花椰菜花叶病毒（19S与35S）的DNA上均有两个正向重复序列（direct repeat），用以mRNA转录、pgRNA合成与病毒DNA合成。逆转录病毒的DNA上也有两个重复序列（long terminal repeat），用以mRNA转录、正义RNA合成与病毒DNA合成

12，无论是像HIV的逆转录病毒（retrovirus），还是像乙肝病毒的拟逆转录病毒（pararetrovirus），它们合成双链DNA的逆转录过程中，均会形成单链DNA，而且单链DNA也含有重复序列。而腺相关病毒这种无害的人细小病毒的单链DNA也含有重复序列（inverted repeat）

13，无论是拥有线型单链DNA的腺相关病毒，还是拥有环状单链DNA的M13噬菌体，它们均拥有重复序列以作为启动子

14，人体细胞内的DNA很多都是逆转录病毒（少数为反义RNA病毒）整合而来

15，反义RNA病毒的RNA依赖的RNA聚合酶与逆转录酶、DNA聚合酶和RNA聚合酶结构相似

16，非洲猪瘟病毒与原始细胞的DNA聚合酶均缺失外切酶修复校正功能，由此可知，原始细胞由原始双链DNA病毒进化而来。

17，原始DNA病毒的DNA聚合酶开始没有外切酶修复校正功能，修复校正功能是后期进化而来。原始细胞的DNA细胞的DNA聚合酶也是如此

18，最早出现的外切酶修复校正功能为3'→5'外切酶，最晚出现的外切酶修复校正功能为5'→3'外切酶。

19，真核细胞的染色体与现代双链DNA病毒的DNA均为线型，而细胞的末端为由重复序列组成的端粒，现代双链DNA病毒DNA的末端为重复序列。

20，真核细胞的端粒上有端粒酶用以合成替换引物的DNA，腺病毒的DNA末端有磷蛋白作为DNA复制的引物

<ref>病毒进化史 <nowiki>https://www.bilibili.com/read/cv5205466/?from=readlist</nowiki> 来源：bilibili 作者：制御秘书长杜鹃</ref>

== 病毒分类法 ==

=== ICTV 分类法 ===
国际病毒分类委员会（ICTV）是国际微生物学联合会发展、改进和维护通用病毒分类的唯一机构，在1966年建立起了一个病毒分类的通用系统和统一的命名法则。第七届 ICTV 会议首次规范化了病毒物种的概念，即病毒分类的分支层次中的最低分类单元。分类的主要依据是病毒颗粒的特性、抗原特性与生物特性。

到目前为止只有一小部分的病毒得到了研究，从来自人体的病毒样品中发现有20%的序列是未曾发现过的，而来自环境中（如海水、大洋沉积物等）的病毒样品则大部分的序列都是全新的。

病毒分类从域开始，结构如下，分类后缀在括号中：
:域 Realm（''-viria''）
::亚域 Subrealm（''-vira''）
:::界 Kingdom（''-viriae''）
::::亚界 Subkingdom（''-virites''）
:::::门 Phylum（''-viricota''）
::::::亚门 Subphylum（''-viricotina''）
:::::::纲 Class（''-viricetes''）
::::::::亚纲 Subclass（''-viricetidae''）
:::::::::目 Order（''-virales''）
::::::::::亚目 Suborder（''-virineae''）
:::::::::::科 Family（''-viridae''）
::::::::::::亚科 Subfamily（''-virinae''）
:::::::::::::属 Genus（''-virus''）
::::::::::::::亚属 Subgenus（''-virus''）
:::::::::::::::种 Species

ICTV 2020版分类表中总共有6个域、10个界、17个门、2个亚门、39个纲、59个目、8个亚目、189个科、136个亚科、2224个属、70个亚属与9110个种。除亚域、亚界和亚纲外，其他级别的分类单元都被使用。共有6个域、1个地位未定纲、19个地位未定科及2个地位未定属被承认。

=== 巴尔的摩分类法 ===
诺贝尔奖获得者生物学家戴维·巴尔的摩在1970年代提出了巴尔的摩分类系统。巴尔的摩分类法与ICTV分类法一起用于现代病毒的分类。

巴尔的摩分类法是基于病毒 mRNA 的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中，必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制，但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是单链或双链的 RNA 或 DNA，可以有也可以没有反转录酶。而且，单链RNA病毒可以是正义（+）或反义（-）。这一分类法将病毒分为7类：

*第一类是双链 DNA 病毒（如腺病毒、疱疹病毒、痘病毒）
*第二类是单链 DNA 病毒（+）DNA（如小 DNA 病毒）
*第三类是双链RNA病毒（如呼肠孤病毒）
*第四类是（+）单链RNA病毒（如微小核糖核酸病毒、披盖病毒、甲肝病毒、丙肝病毒、黄热病毒、鼻病毒、脊髓灰质炎病毒、风疹病毒）
*第五类是（-）单链RNA病毒（如正黏液病毒（流感病毒）、炮弹病毒）
*第六类是单链RNA反转录病毒（如反转录病毒、人类免疫缺陷病毒）
*第七类是双链 DNA 反转录病毒（如肝病毒）
举一个病毒分类的例子：水痘病毒，即带状疱疹病毒，属于疱疹病毒目，疱疹病毒科，甲型疱疹病毒亚科，水疱病毒属；同时，带状疱疹病毒是巴尔的摩分类法中的第一类，因为它是双链 DNA 病毒，且不含有反转录酶。
物种名称通常以[疾病]病毒的形式出现，尤其是高等动植物。
<ref>[https://zh.wikipedia.org/wiki/病毒分类表病毒分类表-维基百科]</ref>
== 卫星 ==
卫星（Satellite）是亚病毒因子的一类，不能单独存在，需要辅助病毒协助复制核酸，或者由辅助病毒提供衣壳蛋白来包被核酸。分为两大类：能利用自己核酸编码衣壳蛋白的为卫星病毒，不能的则称卫星核酸。如丁型肝炎病毒(HDV)必须利用乙型肝炎病毒的包膜蛋白才能完成复制周期，常见的卫星病毒还有腺联病毒(AAV)、卫星烟草花叶病毒(STMV)、卫星玉米白线花叶病毒(SMWLMV)、卫星稷子花叶病毒（SPMV)等。
== 类病毒 ==
类病毒（Viroid）是一种具有传染性的单链环状RNA病原体。它比病毒要小，且没有典型病毒所有的蛋白质外壳。类病毒为严格寄生物，专一性很强。目前所有已知的类病毒均为被子植物栖居者，且多数造成疾病；它们通常透过种子或花粉传播，且整合到细胞核内进行复制。
类病毒最早由在美国工作的瑞士学者迪纳（Theodor O. Diener）于1971年在马铃薯纺锤块茎病中发现。

== 朊病毒 ==
朊病毒是一种具感染性的致病因子，能引发哺乳动物的传染性海绵状脑病。朊毒体疾病（传染性海绵状脑病）和阿尔茨海默病、帕金森病同属于神经退行性疾病。最早发现于哺乳动物的传染性海绵状脑病，包括羊搔痒症、疯牛病、慢性消耗病，以及人类的克雅二氏病。它不是病毒，而是仅由蛋白质构成的致病因子。它虽然不含核酸，但可自我复制且具有感染性。朊病毒由错误折叠的朊蛋白（PrP）聚集组成。它能够诱导在神经细胞上原本是正常结构的朊蛋白转变为错误结构并进行聚集反应，借由这个机制引入新的朊蛋白，不断自我复制并传递至邻近细胞，最终扩散至整个脑部。

生态学人名规律整理

2024-04-03T02:20:55Z

LENDFUZ：/* 生态学人名规律整理 */

== 生态学人名规律整理 ==
{| class="wikitable"
|-
! 序号 || 中文 || 英文
!解释
|-
|1 || 利比希最小因子定律 || Liebig's Law of minimum
|低于某种生物需要的最小量的任何特定因子，是决定该种生物生存和分布的根本因素。其仅在严格稳定状态下，即在物质和能量的输入和输出处于平衡状态时，才能应用，且具体应用时还要注意生态因子之间的补偿作用。
|-
|2 ||布莱克曼限制因子定律
|Blackman's Law of limiting factors
|生态因子的最小和最大状态都具有限制性影响。
|-
|3 ||谢尔福德耐受性定律
|Shelford's Law of tolerance
|任何一个生态因子在数量上或质量上的不足或过多，即当其接近或达到某种生物的耐受限度时会使该种生物衰退或不能生存。
|-
|4 ||贝格曼规律
|Bergmann's rule
|形态上，来自寒冷气候的内温动物，往往比来自温暖气候的内温动物个体更大，导致相对表面积变小，使单位体重的热散失减少，有利于抗寒。
|-
|5
|反贝格曼规律
|Anti-Bergmann's rule
|外温动物在温暖气候中体型更大，寒冷气候中体型更小。一般而言，个体大，发育时间长的外温动物符合反贝格曼定律；而个体小，发育时间短的更符合贝格曼定律。例如：玉米螟雌雄蛹重和成虫的体长随着温度升高而变重变长。
|-
|6 ||阿伦规律
| Allen's rule
|寒冷地区内温动物身体的突出部分，如四肢、尾巴和外耳有变小变短的趋势。
|-
|7 ||约旦(乔丹）规律
|Jordan's rule
|鱼类的脊椎数目在低温水域中比在温暖水域中多。低温使鱼类的生长和发育速度变慢，因而延长了其性成熟时间，从而产生更大的个体，其脊椎骨的数目也较多。
|-
|8 ||威尔逊规律
|Wilson's rule
|在寒冷地区内温动物的皮毛厚度和皮下脂肪厚度有增加的趋势。
|-
|9
|戴耐尔规律
|Danielle's rule
|全北区哺乳动物的体重在冬季趋于降低。这是在恶劣的非繁殖期内小型哺乳动物减少食物需求的一个有效方式。
|-
|10
|霍普金斯规律
|Hopkins's rule
|在其它因素相同的条件下，北美温带地区，每向北移纬度1°向东移经度5°，或上升约122米，植物的阶段发育在春天和初夏将各延期四天；在晚夏和秋天则各提前四天。
|-
|11
|范特霍夫定律
|Van't Hoff's law
|又称Q10定律，即温度每升高10℃，化学反应速率增加2～4倍。Q10系数只有在一定的适宜范围内才是一个常数。
|-
|12
|克雷伯规律
|Kleiber's rule
|代谢率跟动物身体大小直接有关，即代谢率与体重的3/4次幂呈正比，符合异速关系，异速生长方程为y=axb（b≠1）。
|-
|13
|葛洛格规律
|Gloger's rule
|在干燥而寒冷的地方，动物的体色较淡；而在潮湿而温暖的地区，其体色较深。湿热地区动物毛色较深的原因，可能与色素的产生和酶的活动有关。较高的湿度能提高在代谢过程中产生色素的酶的活性。本质是水分的生态效应。
|-
|14
|阿利氏规律
|Allee's rule
|种群过密或过疏都是不利的，都可能对种群增长产生抑制性影响，动物种群有一个最适的种群密度。
|-
|15
|Yoda氏-3/2自疏法则
|Yoda's -3/2 law
|自疏导致密度与生物个体大小之间的关系在双对数图上具有典型的-3/2斜率。
|-
|16
|费希尔私奔模型
|Fisher's runaway model
|雄性的诱惑性特征开始被恣意的雌性所选择，并将继续进化，如果雌性基因对挑选特征编码，雄性也会对该特征编码。
|-
|17
|汉密尔顿法则
|Hamilton's law
|利他行为发生时，受益者的收益与亲缘系数的乘积必需大于损失。即Br＞C，也可以写成B/C＞r（给予者与自己后代）/r（给予者与受益者后代）。
|-
|18
|阿朔夫规律
|Aschoff's circadian rule
|对于夜出活动的动物而言，恒黑使其似昼夜周期缩短，而恒光使其似昼夜周期延长，并且随着光照强度的增强，其似昼夜周期的延长就更明显。相反，对昼行性动物来说，恒黑使其似昼夜周期延长，而恒光则使之缩短。并且随着光照强度的增强，其周期就缩短得更显著。
|-
|19
|科普定律
| rowspan="2" |Cope's rule
| rowspan="2" |许多类群在进化过程中有向体型增大发展的趋势，包括哺乳动物、爬行动物、节肢动物、软体动物。同时，这一假说正遭到众多古生物学家的挑战，并且由于人类对大型生物的过度捕杀，人类有推翻科普定律的可能。
|-
|20
|柯普法则
|-
|21
|多洛法则
|Dollo's law
|总体来说，进化是不可逆的，已经消失的器官不会在出现。但近期的研究表明，科学家让一种鸟类重新在胚胎期长出了牙齿原基（虽然这只鸟最后胎死腹中），向多洛法则提出了挑战。
|-
|22
|霍尔丹法则
|Haldane's rule
|生殖隔离中合子后隔离的杂种不育有时也包括杂种不活，常常限于异配性别（即XY型或ZW型），称为霍尔丹法则。
|-
|23
|柯立芝效应
|Coolidge effect
|新的可受孕的雌鼠能引发性满足的一夫多妻制的山地田鼠雄鼠恢复交配能力，称柯立芝效应。而单配制的草原田鼠缺乏此效应。
|-
|24
|布鲁斯效应
|Bruce effect
|指新受孕雌鼠因与陌生雄鼠直接接触或暴露于含有陌生雄鼠化学气味的环境中，而引起的妊娠阻断概率增加的现象。将刚交配受孕的雌鼠从它的配偶雄鼠处拿开，放进陌生雄鼠所处的笼中，该雌鼠的妊娠被阻断的可能性就会增加。如被阻断，通常在3天～4天之内，它会恢复发情．就像没有交配过那样。后续的研究证明了在实验室条件下多种啮齿类动物中存在布鲁斯效应。布鲁斯效应是否为实验室啮齿类动物中存在的普遍规律，尚无定论。
|-
|25
|麦克阿瑟平衡学说
|MacArthur equilibrium theory
|面积越大，种绝灭率越小，面积越大，生境多样性越大，大岛可以供给更多的种，因此种丰富度亦越大；隔离程度越高，种迁入率越低，种丰富度越低；面积大而隔离度又低的自然保护区具有较高的平衡种丰富度功能；面积小或隔离程度低的生境岛具有较高的种周转率；岛屿上的物种数是迁入与灭绝间的动态平衡的结果；物种数不随时间变化。
|-
|26
|朗克尔频度定律
|Raunkiaer's law of frequency
|频度在1%一20%的植物种归入A级，21%一40%者为B级，41%～60%者为C级，61%一80%者为D级，80%一100%者为E级。在他统计的8000多种植物中，频度属A级的植物种类占53%，属于B级者有14%，C级有9%，D级有8%，E级有16%，这样按其所占比例的大小，五个频度级的关系是：A>B>C≥D<E。群落中低频种的数目较高频种的数目多。群落的均匀性与A级和E级的大小成正比。E级愈高，群落的均匀性愈大。如若B、C、D级的比例增高时，说明群落中种的分布不均匀，暗示着植被分化和演替的趋势。
|-
|27
|费舍尔氏性比理论
|Fisher's sex ratio theory
|大多数种群性比倾向于1:1，雌雄两性投入相等。即雌雄性比不平衡时造成的雌雄不同的适合度会纠正性比偏差。
|-
|28
|汉密尔顿局域交配竞争理论
|Hamilton's local mate competition theory
|当环境中母代雌性仅有一只时，此时产下更多的雌性后代，产下的雄性后代数仅够与雌性交配，造成子代偏雌。
|-
|29
|高斯假说（竞争排斥原理）
|Gause's hypothesis
|即竞争排斥原理，由于竞争的结果，两个相似的物种不能占有相似的生态位，而是以某种方式彼此取代，使每一物种具有食性或其他生活方式上的特点，从而在生态位上发生分离的现象。比如大草履虫与双小核草履虫。
|-
|30
|奇蒂学说
|Chitty's theory
|认为是通过遗传调节种群密度，种群中存在遗传多型现象。第一型，适宜低密度，基因表达低进攻性行为，繁殖力高，留居倾向；第二型，适宜高密度，基因表达高进攻性行为，繁殖力低，外迁倾向。
|-
|31
|克里斯琴学说
|Christian's theory
|认为是通过内分泌调节种群密度，当种群密度上升时，社会压力导致体内激素紊乱，并导致败育。
|-
|32
|温-爱德华学说
|Wynne-Edwards theory
|认为是通过行为调节种群密度，种群中有不同类型的社会显示行为，对种群大小进行调节。增补+迁入=不可控制的丧失+迁出+社群死亡率。如鸟类的领域系统。
|-
|33
|科里奥利效应（地转偏向力效应）
|Coriolis effect
|地球的自转使北半球所有移动的物体（包括气团）朝右偏斜，南半球所有移动的物体朝左偏斜。
|}
<ref>由恺凌、月亮姐姐、渣黑和毛蕊花糖整理</ref>

[[Category:生态学]] [[Category:总结]] [[Category:生物]]

生态学人名规律整理

2024-04-01T03:07:45Z

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== 生态学人名规律整理 ==
{| class="wikitable"
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! 序号 || 中文 || 英文
!解释
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|1 || 利比希最小因子定律 || Liebig's Law of minimum
|低于某种生物需要的最小量的任何特定因子，是决定该种生物生存和分布的根本因素。其仅在严格稳定状态下，即在物质和能量的输入和输出处于平衡状态时，才能应用，且具体应用时还要注意生态因子之间的补偿作用。
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|2 ||布莱克曼限制因子定律
|Blackman's Law of limiting factors
|生态因子的最小和最大状态都具有限制性影响。
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|3 ||谢尔福德耐受性定律
|Shelford's Law of tolerance
|任何一个生态因子在数量上或质量上的不足或过多，即当其接近或达到某种生物的耐受限度时会使该种生物衰退或不能生存。
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|4 ||贝格曼规律
|Bergmann's rule
|形态上，来自寒冷气候的内温动物，往往比来自温暖气候的内温动物个体更大，导致相对表面积变小，使单位体重的热散失减少，有利于抗寒。
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|5
|反贝格曼规律
|Anti-Bergmann's rule
|外温动物在温暖气候中体型更大，寒冷气候中体型更小。一般而言，个体大，发育时间长的外温动物符合反贝格曼定律；而个体小，发育时间短的更符合贝格曼定律。例如：玉米螟雌雄蛹重和成虫的体长随着温度升高而变重变长。
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|6 ||阿伦规律
| Allen's rule
|寒冷地区内温动物身体的突出部分，如四肢、尾巴和外耳有变小变短的趋势。
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|7 ||约旦(乔丹）规律
|Jordan's rule
|鱼类的脊椎数目在低温水域中比在温暖水域中多。低温使鱼类的生长和发育速度变慢，因而延长了其性成熟时间，从而产生更大的个体，其脊椎骨的数目也较多。
|-
|8 ||威尔逊规律
|Wilson's rule
|在寒冷地区内温动物的皮毛厚度和皮下脂肪厚度有增加的趋势。
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|9
|戴耐尔规律
|Danielle's rule
|全北区哺乳动物的体重在冬季趋于降低。这是在恶劣的非繁殖期内小型哺乳动物减少食物需求的一个有效方式。
|-
|10
|霍普金斯规律
|Hopkins's rule
|在其它因素相同的条件下，北美温带地区，每向北移纬度1°向东移经度5°，或上升约122米，植物的阶段发育在春天和初夏将各延期四天；在晚夏和秋天则各提前四天。
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|11
|范特霍夫定律
|Van't Hoff's law
|又称Q10定律，即温度每升高10℃，化学反应速率增加2～4倍。Q10系数只有在一定的适宜范围内才是一个常数。
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|12
|克雷伯规律
|Kleiber's rule
|代谢率跟动物身体大小直接有关，即代谢率与体重的3/4次幂呈正比，符合异速关系，异速生长方程为y=axb（b≠1）。
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|13
|葛洛格规律
|Gloger's rule
|在干燥而寒冷的地方，动物的体色较淡；而在潮湿而温暖的地区，其体色较深。湿热地区动物毛色较深的原因，可能与色素的产生和酶的活动有关。较高的湿度能提高在代谢过程中产生色素的酶的活性。本质是水分的生态效应。
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|14
|阿利氏规律
|Allee's rule
|种群过密或过疏都是不利的，都可能对种群增长产生抑制性影响，动物种群有一个最适的种群密度。
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|15
|Yoda氏-3/2自疏法则
|Yoda's -3/2 law
|自疏导致密度与生物个体大小之间的关系在双对数图上具有典型的-3/2斜率。
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|16
|汉密尔顿法则
|Hamilton's law
|利他行为发生时，受益者的收益与亲缘系数的乘积必需大于损失。即Br＞C，也可以写成B/C＞r（给予者与自己后代）/r（给予者与受益者后代）。
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|17
|阿朔夫规律
|Aschoff's circadian rule
|对于夜出活动的动物而言，恒黑使其似昼夜周期缩短，而恒光使其似昼夜周期延长，并且随着光照强度的增强，其似昼夜周期的延长就更明显。相反，对昼行性动物来说，恒黑使其似昼夜周期延长，而恒光则使之缩短。并且随着光照强度的增强，其周期就缩短得更显著。
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|18
|科普定律
| rowspan="2" |Cope's rule
| rowspan="2" |许多类群在进化过程中有向体型增大发展的趋势，包括哺乳动物、爬行动物、节肢动物、软体动物。同时，这一假说正遭到众多古生物学家的挑战，并且由于人类对大型生物的过度捕杀，人类有推翻科普定律的可能。
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|19
|柯普法则
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|20
|多洛法则
|Dollo's law
|总体来说，进化是不可逆的，已经消失的器官不会在出现。但近期的研究表明，科学家让一种鸟类重新在胚胎期长出了牙齿原基（虽然这只鸟最后胎死腹中），向多洛法则提出了挑战。
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|21
|霍尔丹法则
|Haldane's rule
|生殖隔离中合子后隔离的杂种不育有时也包括杂种不活，常常限于异配性别（即XY型或ZW型），称为霍尔丹法则。
|-
|22
|柯立芝效应
|Coolidge effect
|新的可受孕的雌鼠能引发性满足的一夫多妻制的山地田鼠雄鼠恢复交配能力，称柯立芝效应。而单配制的草原田鼠缺乏此效应。
|-
|23
|布鲁斯效应
|Bruce effect
|指新受孕雌鼠因与陌生雄鼠直接接触或暴露于含有陌生雄鼠化学气味的环境中，而引起的妊娠阻断概率增加的现象。将刚交配受孕的雌鼠从它的配偶雄鼠处拿开，放进陌生雄鼠所处的笼中，该雌鼠的妊娠被阻断的可能性就会增加。如被阻断，通常在3天～4天之内，它会恢复发情．就像没有交配过那样。后续的研究证明了在实验室条件下多种啮齿类动物中存在布鲁斯效应。布鲁斯效应是否为实验室啮齿类动物中存在的普遍规律，尚无定论。
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|24
|麦克阿瑟平衡学说
|MacArthur equilibrium theory
|面积越大，种绝灭率越小，面积越大，生境多样性越大，大岛可以供给更多的种，因此种丰富度亦越大；隔离程度越高，种迁入率越低，种丰富度越低；面积大而隔离度又低的自然保护区具有较高的平衡种丰富度功能；面积小或隔离程度低的生境岛具有较高的种周转率；岛屿上的物种数是迁入与灭绝间的动态平衡的结果；物种数不随时间变化。
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|25
|朗克尔频度定律
|Raunkiaer's law of frequency
|频度在1%一20%的植物种归入A级，21%一40%者为B级，41%～60%者为C级，61%一80%者为D级，80%一100%者为E级。在他统计的8000多种植物中，频度属A级的植物种类占53%，属于B级者有14%，C级有9%，D级有8%，E级有16%，这样按其所占比例的大小，五个频度级的关系是：A>B>C≥D<E。群落中低频种的数目较高频种的数目多。群落的均匀性与A级和E级的大小成正比。E级愈高，群落的均匀性愈大。如若B、C、D级的比例增高时，说明群落中种的分布不均匀，暗示着植被分化和演替的趋势。
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|26
|费舍尔氏性比理论
|Fisher's sex ratio theory
|大多数种群性比倾向于1:1，雌雄两性投入相等。即雌雄性比不平衡时造成的雌雄不同的适合度会纠正性比偏差。
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|27
|汉密尔顿局域交配竞争理论
|Hamilton's local mate competition theory
|当环境中母代雌性仅有一只时，此时产下更多的雌性后代，产下的雄性后代数仅够与雌性交配，造成子代偏雌。
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|28
|高斯假说（竞争排斥原理）
|Gause's hypothesis
|即竞争排斥原理，由于竞争的结果，两个相似的物种不能占有相似的生态位，而是以某种方式彼此取代，使每一物种具有食性或其他生活方式上的特点，从而在生态位上发生分离的现象。比如大草履虫与双小核草履虫。
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|29
|奇蒂学说
|Chitty's theory
|认为是通过遗传调节种群密度，种群中存在遗传多型现象。第一型，适宜低密度，基因表达低进攻性行为，繁殖力高，留居倾向；第二型，适宜高密度，基因表达高进攻性行为，繁殖力低，外迁倾向。
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|30
|克里斯琴学说
|Christian's theory
|认为是通过内分泌调节种群密度，当种群密度上升时，社会压力导致体内激素紊乱，并导致败育。
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|31
|温-爱德华学说
|Wynne-Edwards theory
|认为是通过行为调节种群密度，种群中有不同类型的社会显示行为，对种群大小进行调节。增补+迁入=不可控制的丧失+迁出+社群死亡率。如鸟类的领域系统。
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|32
|科里奥利效应（地转偏向力效应）
|Coriolis effect
|地球的自转使北半球所有移动的物体（包括气团）朝右偏斜，南半球所有移动的物体朝左偏斜。
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<ref>由恺凌、月亮姐姐、渣黑和毛蕊花糖整理</ref>

[[Category:生态学]] [[Category:总结]] [[Category:生物]]