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生化分子细胞技术列表

2024-08-05T08:46:08Z

Rubisco：加了一点PCR

* 染色体构象捕获
** 3C
** 4C
** 5C
** Hi-C
** ChIP-loop
** ChIA-PET
* 蛋白质-蛋白质互作
** Y2H酵母双杂交
** CoIP免疫共沉淀
** pull down下拉实验
** FERT荧光共振能量转移
** BiFC双分子荧光互补
** SPR表面等离子共振
** ITC等温滴定量热法
* 蛋白质-RNA互作
** RIP-RNA结合蛋白免疫共沉淀：甲醛交联，裂解细胞，抗体沉淀特定蛋白，去交联获得RNA。
** RNA pull down：标记的诱饵RNA与细胞裂解物孵育；检测与诱饵RNA结合的蛋白
** MeRIP-RNA甲基化免疫沉淀：用甲基化RNA特异抗体沉淀并检测结合蛋白
* 染色质开放性检测
** MNase-seq
** FAIRE-seq
** DNase-seq
** ATAC-seq
* 各种印记
** western blotting：蛋白质
** northern blotting：RNA
** southern blotting：DNA
** eastern blotting：二维电泳蛋白质
** dot blotting ：不经电泳
** Southwestern blotting：DNA探针检测蛋白质电泳结果
** Far-western blotting：不用抗体而用可能互作的蛋白
** northwestern blotting：RNA探针检测蛋白质电泳结果
** middle eastern：DNA检测RNA
** far western：检测脂质
* 层析/色谱技术
** 凝胶过滤层析
** 亲和层析
*** IMAC
** 聚焦层析：固定相上有缓冲剂，酸性的层析液流过，从上到下被缓冲，形成ph梯度；蛋白质会在进入等电点以上的pH后吸附在层析柱上；随着层析液不断流入，层析柱缓冲能力被逐渐耗竭，pH梯度移动(原来某一pH的位置下移)，不同的蛋白就随等电点相应的梯度流出。
** 离子交换层析
** 疏水层析
** 反向层析
* 克隆某特定基因的办法
** 功能克隆：已知基因产物(蛋白质)，获得编码序列
** 定位克隆：已知基因位置，染色体步移
** 序列克隆：已知基因部分序列，获得全部序列
** 表型克隆：
* 基因克隆的具体技术
** 鸟枪克隆法：将基因组打成片段，转入受体，寻找相关表型变化
** 消减杂交：将两份cDNA混合，去除双链，剩余的可能是与表型差异有关的序列。
** 转座子标签：转座子插入使得基因突变，在有相关表型改变的个体中寻找转座子，就能找到被突变的基因。
** 图位克隆：染色体步移
* PCR万世同堂
** 一代PCR
** 二代PCR：实时荧光定量PCR（real-time PCR/qPCR）
** 三代PCR：微滴PCR（dPCR），常用数字微滴PCR（ddPCR）
** 特种PCR：
*** 易错PCR，可以应用于DNA序列的人工进化和SELEX等；
*** 原位PCR，即将FISH和PCR结合，在组织内部''in situ'' PCR；
*** 热启动PCR，目的简要概述为减少非特异性扩增，实现方法诸如发夹引物、琼脂包埋、抗体失活等等；
*** 重叠PCR（overlap PCR），采用跨模板片段作为引物扩增，运用了第一次的扩增产物作为长引物进行二次扩增；
*** 定点诱变PCR，可以大致分成两代：第一代是运用诱变引物在质粒上直接引入点突变，并且在筛选过程中运用了DpnI这一IV型酶，缺点是由于质粒比较大，扩增效率不高，而且筛选过程略微麻烦一点；第二代是运用线性片段和两组引物先分别进行扩增，再运用类似于overlap PCR的方法，利用长引物扩增得到目的片段；
*** 多突变PCR，有DNA洗牌技术和随机启动重组，主要是获得依托答辩一样序列混乱的DNA；
*** 不对称PCR，某一向引物比另一向多，扩增产物的量不对等，主要是获取探针和长引物；
*** 反向PCR，很简单了，其中有一个引伸技术质粒获救；
*** 反转录PCR，原理简单，引出来了一堆子技术如SMART、RACE、锚定PCR；
*** 巢式PCR，在克隆里面就叫染色体步移了，原理没甚区别，但讲起来费劲，不赘述；
*** TAIL-PCR，又称热不对称交错PCR，貌似除了朱玉贤院士的《现代分子生物学》没见谁讲过，有兴趣可参阅，原理复杂，不赘述；
*** cDNA差异分析，类似于运用PCR对两个不同样本的基因表达多少进行粗略比较，一个样本加引物的接头，一个不加，混合样本后进行扩增，线性扩增则量一致，指数则前大于后，扩增缓慢则后大于前，当然定量精确度差，应用实例较少。

被子植物各科介绍

2024-08-03T02:50:46Z

Rubisco：

本页面基本按照APG4顺序介绍重要的科的特征和与传统分类系统之间的变化。

== ANA ==

=== 最基部类群——无油樟 ===

=== 亚基部类群——睡莲目 ===

=== 次基部类群——木兰藤目 ===

== 单子叶植物 ==

=== 最基部类群——菖蒲目 ===
仅一科一属两种。因为有肉穗花序，以前被放在天南星科。

菖蒲的叶片，就像是鸢尾的叶片一样对折，愈合在一起

=== 肉穗花序——泽泻目天南星科 ===
典型特征：肉穗花序，最典型的，自下而上，雌花-中性花-雄花-附属物；有网状脉。

重要种：天南星，芋头，绿萝(网状脉见过吧)，大漂(浮水植物)，浮萍

失去的：菖蒲属

得到的：原独立的的浮萍科

=== 家道中落——百合目百合科 ===
原百合科有4000+种(不吉利)，如今的百合科仅剩十几个属，600多种。

特征：子房上位

重要种：百合，卷丹，郁金香（不是郁金），贝母。

失去的：（太多了）

=== 升起的新星——天门冬目 ===
在传统的系统中通常不设立天门冬目，在APG4中，天门冬目是一个人丁兴旺的类群。

==== 兰科 ====
原来被认为最进化的科，现在沦落到了天门冬目的基部。

关于其子房扭转：把你的五指张开，食指朝上，侧向抬平胳膊，现在你的胳膊就是兰科的子房，食指就是兰花的唇瓣——内轮、近轴的花被；现在，把手臂旋转，食指朝下，这时这枚原处于上方/近轴面的，形态最多样的唇瓣便朝下，适合昆虫停落。

传统上，分三个亚科：
{| class="wikitable"
|+兰科的三亚科
!亚科
!雄蕊数
!子房
!合蕊柱
|-
|假兰亚科
|3
|下位，三室，中轴胎座
|有
|-
|杓兰亚科
|2
|下位，一室，侧膜胎座
|有
|-
|兰亚科
|1
|下位，一室，侧膜胎座
|有
|}
重点特征：'''子房下位，侧膜胎座'''

重要种：各种兰；石斛；天麻(寄生植物)；白及

==== 鸢尾科 ====
重要特征：'''子房下位，雄蕊3'''，柱头3裂非常显著与雄蕊对生（说明内轮雄蕊消失），花被3+3.

此外，鸢尾的叶片叠合，其两侧木质部对生，像扁化茎。

==== 石蒜科 ====
重要特征：'''子房下位'''，雄蕊六，'''伞形花序'''。

重要种：石蒜/彼岸花（鬼灭片尾曲出现的那个），

获得的：原属百合科/葱科/石蒜科的葱属，终于带着上位子房和伞形花序，定居了石蒜科。

==== 天门冬科 ====
重要特征：子房（主要）上位。

重要种：麦冬

* 接下来介绍的目组成鸭跖草类：单子叶植物最顶端的一群，共衍征包括：细胞壁带荧光——等等

=== ——棕榈目棕榈科 ===
重要种：蒲葵（蒲扇的原料），棕榈，槟榔，省藤

=== 雄蕊痒痒的——姜目姜科 ===
整个姜目的雄蕊都很有意思，多是从六个丢失一个成为五个，有的丢失了远轴面的那一个，有的却丢失了近轴面的那个。更有意思的是现属于姜目的美人蕉，6片花冠大约只有1cm,几枚雄蕊却变得大，鲜艳，是观赏的主要部分。只有一枚可育雄蕊保留了原有的形态和功能。

具体到姜科而言，内轮仅一枚雄蕊可育，两枚雄蕊愈合，是花中最显著部分，称为唇瓣；外轮雄蕊剩两枚或全无，也是花瓣状。

（一想到那么美丽的花朵居然是雄性生殖器官……）

重要特征：'''子房下位'''

重要物种：郁金(不是郁金香)，砂仁，豆蔻(是豆蔻年华的豆蔻，不是肉豆蔻)

=== “草”——禾本目禾本科 ===
传统分：竹亚科——浆片3；禾亚科——浆片2

也有其他的分法。但是，分子生物学家会出手：
[[文件:禾本科系统发育.png|缩略图]]
关于禾本科的花发育：

== 木兰类 ==
木兰类分两类，一类是木兰目+樟目，一类是胡椒目+白樟目

=== 木兰目：木兰科、番荔枝科、肉豆蔻科 ===
木兰科的重要特征：托叶环痕

=== 樟目：樟科、腊梅科 ===
樟科的重要特征：'''雄蕊瓣裂'''（每个药室各自打开一扇“活版门”释放花粉），花部轮状排列。

重要的种：樟、楠、山胡椒(不是胡椒)、月桂、鳄梨/牛油果

=== 胡椒目：胡椒科、三白草科(鱼腥草)、马兜铃科 ===

== 金粟兰类 ==

== 金鱼藻+真双子叶植物 ==

=== 真双子叶姐妹群——金鱼藻目 ===

=== '''真双子叶基部类群——毛茛目毛茛科''' ===
举几个例子：

翠雀：又是个雄蕊花瓣状的

乌头：花萼鲜艳吸引昆虫，花瓣形成蜜腺。

雄蕊雌蕊螺旋形排列在花托上。

=== 核心真双子叶基部群——大叶草目 ===

=== 超蔷薇类基部群——虎耳草目 ===

=== 蔷薇类基部群——葡萄目 ===
* 接下来介绍的四个目组成了“固氮分支”，因为着其中包括了很多可以与根瘤菌共生固氮的植物——不仅是豆科。

=== 多样化的果实——蔷薇目蔷薇科 ===
传统上分为四个亚科：

* 绣线菊亚科：离生心皮，蓇葖果，上位子房，如：绣线菊，珍珠梅
* 蔷薇亚科：离生心皮，聚合瘦果/小核果，上位子房，如：玫瑰；各种莓（草莓树莓黑莓蛇莓覆盆子——不包括蓝莓，蔓越莓！）
* 李亚科：单心皮，核果，上位子房，如桃李杏梅樱
* 苹果亚科：合生心皮，梨果，下位子房，如苹果梨山楂花楸枇杷

其中认为绣线菊亚科和蔷薇亚科较原始，李亚科和苹果亚科较为进化。

但根据分子证据，四个亚科只有苹果亚科是单系群：原蔷薇亚科包含了仙女木和棣棠等“外人”，原李亚科由两个独立的单系群组成，而原绣线菊亚科乱得一塌糊涂。现在，分为三个亚科：

* 仙女木亚科：一个小亚科
* 蔷薇亚科：剔除了几个“外人”的原蔷薇亚科
* 桃亚科：原来的李亚科、苹果亚科、绣线菊亚科和几个被踢出来的类群（比如棣棠）组成。

三个亚科中哪两个亚科关系更近，尚没有定论。

* 关于蔷薇目剩下的科，有两支：
** 一支是原荨麻目（'''桑科'''、荨麻科、大麻科、榆科）
** 一支含有'''鼠李科'''，重要特征：一轮'''雄蕊对瓣'''，有'''花盘'''。重要种：枣。和胡颓子科，含有沙棘（吕梁野山坡）。

=== 蔷薇目桑科 ===
重要特征：含有乳汁和托叶环痕

=== 蛋白质女王——豆目豆科 ===
传统上分三个亚科：

* 含羞草亚科：花辐射对称，镊合状排列，雄蕊多数，如含羞草、合欢、金合欢、相思树。
* 苏木亚科=云实亚科：两侧对称，假蝶形花冠-上升覆瓦状-龙骨瓣在最外。如皂荚、紫荆、羊蹄甲、决明。
* 蝶形花亚科：两侧对称，蝶形花冠-下降覆瓦状-旗瓣在最外。如各种豆、甘草。槐树、花生、苜蓿、紫云英、黄芪、紫檀、黄檀、车轴草(三叶草)、葛、紫藤。

共有特征：'''单心皮，荚果'''。多是羽状复叶。

但根据分子证据，云实亚科不是单系群，而是豆科剔除掉两个单系群——蝶形花亚科和含羞草亚科后剩下的一个多系群。现在，分六个亚科：

* 紫荆亚科：独立自原云实亚科
* 甘豆亚科：独立自原云实亚科
* 山姜豆亚科：独立自原云实亚科
* 酸揽豆亚科：独立自原云实亚科
* 云实亚科：残留的云实亚科+含羞草亚科
* 蝶形花亚科：不变。

=== 坚果世家——胡桃目壳斗科 ===
重要特征：子房下位（胡桃目都是），总苞形成壳斗。单性花。

重要种：橡，栎，水青冈，栗子

胡桃科胡桃：果实为坚果，表面被花被形成的“青皮”包裹形成核果样。

胡桃科枫杨：果实的翅是两枚小苞片扩大形成的。

除此外，胡桃目还有桦木科(白桦、榛子)，杨梅科，木麻黄科。

=== '''瓜——葫芦目葫芦科''' ===
葫芦科原来和堇菜科等近缘，现在和秋海棠科等建立了葫芦目。

重要特征：'''子房下位，侧膜胎座，瓠果。'''
附带本站界面：[[APG IV]]

模式生物的种名

2024-07-30T05:58:56Z

Rubisco：

为什么说要背他们的种名呢？有这样的考题：介绍一基因OsXXX，然后说他在拟南芥中怎样怎样。实际上，基因前的“Os”代表Oryza sativa水稻，因此这个基因来自水稻。所以一定要记住——至少是首字母——这些模式生物的种名。

当然更逆天的题会直接问你“''Drosophila melanogaster''”是啥。

背吧，有利无害。

* 大肠杆菌——大肠埃希氏菌''Escherichia coli， E.coli''
* 枯草芽孢杆菌——''Bacillus subtilis，Bs''
* 酿酒酵母——面包酵母，啤酒酵母，''Saccharomyces cerevisiae''
* 秀丽隐杆线虫——''Caenorhabditis elegans , Ce''
* 黑腹果蝇——''Drosophila melanogaster， Dm''
* 小鼠——mouse/mice， ''Mus musculus , Mm''
* 大鼠——Rat, ''Rattus noivegicus''
* 家鸡——''Gallus gallus domesticus，''原鸡的亚种''。''
* 智人——''Homo sapiens'' ，Hs
* 拟南芥——阿拉伯芥，鼠耳芥，''Arabidopsis thaliana，At''
* 水稻——''Oryza sativa，''Os
* 拟黑曲霉——''Aspergillus niger，An''
* 二穗短柄草——''Brachypodium distachyon，Bd''
* 非洲爪蟾——''Xenopus laevis，Xl''
* 文昌鱼——''Branchiostoma lanceolatum，Bl''

提出你的问题

2024-07-17T03:42:39Z

Rubisco：

应该有不少生物竞赛的学生在访问这个网站。为此创建这样一个页面。

提问者：注册一个账号即可编辑，请在“未解答”栏目写下你学竞赛的问题，请注明身份。

回答者：大佬们可以访问这个页面来查看有没有新的问题。如果您可以解答，请在问题下方编辑（没有编辑按钮就去登录）好回答，并将该词条转移到“已解答”栏目。

或者也可以在这里提出您需要的整理。

=== 未解答 ===

石竹目胎座的演化关系？

fay and wu 的H 较tajima的d的优点？

请问表格里的图片怎么查看啊

请问你们是谁？英雄应当拥有姓名！哪里可以看到你们的介绍？我可以加入你们吗？

来自杨荣武《分子生物学》:DNAP4被用作修复，且在正常生长时被诱导合成，那么为何它“易错”？

来自丁明孝.等《细胞生物学》5th：为何此书上写CFTR突变体是"gain of function"?
=== 已解答 ===

植物学：

1.弹丝与假弹丝分别是几倍体：

除了吴国芳，马伟梁两本书上含混不清的阐述，我所见到全部其他资料都表示：弹丝，假弹丝都是二倍体。区别在于：弹丝是单细胞的，有螺纹的加厚，而假弹丝是多细胞连成的，无螺纹加厚。

2.水韭的形成层：

这是一个至今仍有争议的问题。一般认为水韭有形成层，但只形成韧皮部。[https://doi.org/10.1086/329874 参考文献]

''动物学：''

1.关于弓鳍鱼的鳞片：《普通动物学》“圆形硬鳞”；杨安峰《脊椎动物学》前后分别提到是圆鳞和硬鳞。应是哪个？

（这个网站竟然SSL证书过期了，导致只能用Markdown编辑，气）题主竟然还有上古书籍杨安峰脊椎动物，正好我也有，那就回答一下吧。应该是'''硬鳞'''。首先可以去搜维基百科，因为不太会用Markdown就不放链接了，直接搜弓鳍鱼的词条即可，是硬鳞。题主所说的圆鳞估计来自于杨安峰P84吧，上面说的多鳍鱼目是圆鳞或硬鳞，但是在弓鳍鱼目明确指出了是硬鳞。普通动物学圆形硬鳞本质也是硬鳞。
话说什么时候这个网站才能恢复https访问，现在编辑起来好麻烦。

2.来自刘凌云《普通动物学》：P221上方表明十腕目左侧第5腕特化为茎化腕，而下方却说右侧。到底为哪一侧？

任淑仙《无脊椎动物学》第二版p180:多数种类左侧（少数为右侧）第五腕，目前遇到的考试题大多表述为左侧第五腕，或许不严谨但一般也不算错

3.关于鸵鸟膀胱的类型：鸵鸟的膀胱是泄殖腔膀胱还是尿囊膀胱？

估计是尿囊，杨安峰《脊椎动物比较解剖学》应该写了。

''生物化学：''

1.from徐长法《生物化学》下册p90，真的有无脊椎动物体内存在乙醛酸循环吗？

解答：有。乙醛酸循环是植物和某些微生物（大肠杆菌、醋酸杆菌等）及一些无脊椎动物细胞内脂肪酸氧化分解为乙酰CoA之后，在乙醛酸循环体(glyoxysome)内生成琥珀酸、乙醛酸和苹果酸的过程。参见[https://baike.baidu.com/item/%E4%B9%99%E9%86%9B%E9%85%B8%E5%BE%AA%E7%8E%AF/619160 百度百科]（百度百科内容不一定正确，请辩证对待）
除了具有双功能融合 ICL-MS 基因的线虫，其他后生动物无。[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1630690 后生动物乙醛酸循环酶的进化]

2.求一个关于金属酶/金属蛋白的整理。比如质膜ATP酶以Na为辅酶，精氨酸酶以Mn作为辅酶等等

解答：先写了一点点。可以参考[https://zh.wikipedia.org/zh-hans/金属蛋白金属蛋白 ]
''细胞生物学：''

''分子生物学：''

1.想求证一下，“DNA复制执照因子假说”中“执照”因子主要成分是Mcm蛋白，这是否是那种DNA解旋酶？毕竟好像在信号通路那里曾出现过一个不是后期促进复合物的APC。

解答：单说Mcm应该是同一个家族。真核生物DNA复制所用到的Mcm2-10同时负责调控复制启动，Mcm不结合DNA也不会开始复制。关于Mcm是否是执照因子的讨论见下：

一个异议：杨荣武《生物化学原理》3rd中，执照因子应是Cdt10和Cdc6，这两者在之后的复制过程被回收或降解。在丁明孝.等《细胞生物学》5th中，细胞周期一章的图中，有对Cdt10和Cdc6的标注，并且和杨荣武书上的过程一致，因此，如果杨荣武改题，这个知识点可能会出现极大争议。

↑杨荣武分子生物学第二版说执照因子是Cdt1和Cdc6，至于是否包括Mcm，杨sir没有正面回答这个问题，仅说明这两种蛋白会首先结合Mcm。不过按照pre-RC的定义，应该不包括Mcm。联赛假如出了建议按杨sir来，因为他可以改题。

''细胞生物学：''

1.
from徐长法《生物化学》下册p153，“不同蛋白O-糖基化的起始起点并不一致，有的在内质网，有的在内质网-高尔基体中间结构，也有的在内侧高尔基体”，这句话准确吗？也就是说不是像翟中和《细胞生物学》那样只在高尔基体进行吗？

解答：这似乎是一个"有争议"的问题。观点一：①如题，但徐长法我没有看过不做评价（我看的是杨sir和王镜岩QwQ，大佬有看过的可以验证一下）。②有[https://zhuanlan.zhihu.com/p/213786542 这篇知乎文章]描述O-linked为大多发生在内质网，黏蛋白发生在高尔基体（这篇文章给出了参考文献，可以自行验证）。观点二：①翟中和描述的是N-linked在内质网和高尔基体发生，O-linked在高尔基体发生（但是他没有给出肯定的判断）。②杨sir分子生物学第二版P393说O-linked只发生在高尔基体，一个很直接的结论。个人认为应该只在高尔基体，因为相关的糖基转移酶分布在高尔基体上。（而且杨sir能改题，直接信杨sir啊）至于其它观点不知从何而来。至少我目前做过的题都是按照高尔基体来的。

补充一下答主的回答：其实O-linked在胞质也可进行（非典型O-linked，由N-GlcNAc连接至Ser上而成，这在丁明孝.等《细胞生物学》5th中有进行描述），而且不典型的/非翟中和的O-linked有很多形式，按糖的种类分可以包括O-GalNAc、O-GlcNAc、O-Gal、O-Man、O-Fuc、O-Glc，后三种在维基百科中提到了，而且这三种是在内质网进行的（O-Man是在内质网起始，在高尔基体完成），因此，说在内质网应该是OK的。

另外，朱斌还在他的书里写过Tyr的“O-linked”，杨荣武也曾在讲课的时候提到蛋白聚糖的“O-linked”，总之说法很多，有很多可拓展之处。（我把维基百科扒下来了，PDF自取：[[:文件:O-linked glycosylation.pdf|O-linked glycosylation---Wikipedia]]）

2.《细胞生物学》：

1.P62提到ABC超家族用于转运分子，而P66又说CFTR属于ABC超家族，是否矛盾？

解答：应该是翟中和的问题，他想说的小分子是小物质的意思，不是分子的意思。离子也可以。ABC超家族是很大一类蛋白，基本上什么类型的物质都能转运。

''生理学：''

1.朱大年《生理学》第九版P295表格中提到本体感觉属于Aα型神经纤维，但是P325却提到肌梭的传入神经包括Ia和II类纤维，其中花枝末梢是II类纤维的末梢且负责本体感觉。已知II类纤维属于Aβ类纤维，前后是否矛盾？John G. Nicholls等《神经生物学》第五版也有肌梭Ia型和II型纤维分别是“动态”和“静态”的传入纤维，是否可类比“肌梭长度感觉”和“本体感觉”？那朱P295表格是否表述不妥？

解答：ABC和 I II III IV是分别两个分类系统，其中ABC多用于传出纤维的分类，I II III IV 多用于传入纤维的分类（不绝对，多用于而已）这个地方就是Aα为支配梭外肌传出纤维、初级肌梭传入纤维（本体感觉）。题主所表述的II类纤维属于Aβ的表述是不妥的，因为根本不是一个分类系统。Aβ多为皮肤触压觉传入纤维。分类标准的话ABC主要按照传导速度，I II III IV主要按照纤维直径。关于分类[https://zhuanlan.zhihu.com/p/68321428 可见这里]，当然这些内容朱大年也写过。

追问《生理学》关于肌梭的传入纤维：抽象的是朱大年的表格上把两种分类系统对比了一下说Aα对应Ia和Ib，Aβ对应II……

解答：在肌紧张里面α运动神经纤维不就是Aα吗。首先注意朱大年是这么写的“I II III IV类纤维分别相当于Aα Aβ Aδ C类'''后根纤维'''，但又'''不完全等同'''”，所以先不要把两种分类混一起。Aα负责肌肉本体感觉应该是没有争议的。II类纤维朱大年只表述了“可能有关”。其实Ia类神经纤维也负责肌肉本体感觉。

''植物生理学''

1. 为什么植物细胞将质子泵出去，再让钾离子进来这一过程对细胞水势下降有贡献？理论上来说不是相同数量的钾离子进来后就进不来了吗？

追问《植物生理学》水势：我的意思是，假如泵出去10个质子，不是只会进来10个钾离子就结束了吗？和氯离子没有关系吧？

解答：在气孔打开时，H+-atp酶会将质子泵出去，氯离子会伴随着钾离子的大量吸收而吸收，于是会导致细胞水势下降。（可见王小菁第八版P25）

↑补充答主回答：质子对水势贡献不大，更多的是通过电荷把钾离子带进来。钾离子和蔗糖是对细胞水势有更大贡献的（见Taiz 5th）。因此相同电荷的质子出去，电荷的钾离子进来，电荷守恒的同时降低了细胞内的水势。答主所说的氯离子我暂时没有找到出处，暂留异议。

另：据苗健老师：玉米黄素并不是介导气孔开放的蓝光受体，应该是向光素介导的磷酸化途径。Taiz 7th已经删除了关于玉米黄素对气孔影响的文字，改成了向光素。但是因为国内教材都是抄的5th与6th所以都写的有玉米黄素。算是对水势的一个补充吧。这里有Taiz 7th的电子书（英文原版，'''856MB'''较大，建议开启浏览器自带多线程下载（不会自行百度）或使用IDM进行下载）：[https://cpucd.cpuikuns.top/s/GOia 分享-Plants Physi...]

追问植物生理学那个问题：“在标准压力下，溶液的渗透势等于溶液的水势，因为溶液的压力势为0MPa。溶液的的渗透势决定于溶液中溶质颗粒（分子或离子）总数。”
钾离子贡献更大，是因为质子可能与有机酸等结合，相对来说颗粒总数更少吗？

↑（个人见解，如有错误请佬指出）质子在此处的作用可以分为两部分：1）通过膜内外电位的改变使得钾离子通道开放，钾离子内流；2）质子-氯离子同向转运（见Taiz 5th，顺便解决了上一个补充回答的异议）。若是单纯质子的产生而不泵出显然无法做到这两点。所以，钾离子、质子、氯离子三者便均参与了水势的降低。另外，根据戈德曼方程可知虽然钾离子的浓度是胞内大于胞外，但电势是胞外大于胞内的。

讨论:丢失的五脏六腑

2024-07-17T03:28:05Z

Rubisco：创建页面，内容为“感谢！这正是我所需要的！”

感谢！这正是我所需要的！

提出你的问题

2024-07-02T13:21:16Z

Rubisco：

应该有不少生物竞赛的学生在访问这个网站。为此创建这样一个页面。

提问者：注册一个账号即可编辑，请在“未解答”栏目写下你学竞赛的问题，请注明身份。

回答者：大佬们可以访问这个页面来查看有没有新的问题。如果您可以解答，请在问题下方编辑（没有编辑按钮就去登录）好回答，并将该词条转移到“已解答”栏目。

或者也可以在这里提出您需要的整理。

=== 未解答 ===

来自杨荣武《分子生物学》:DNAP4被用作修复，且在正常生长时被诱导合成，那么为何它“易错”？

来自丁明孝.等《细胞生物学》5th：为何此书上写CFTR突变体是"gain of function"?
=== 已解答 ===

''动物学：''

1.关于弓鳍鱼的鳞片：《普通动物学》“圆形硬鳞”；杨安峰《脊椎动物学》前后分别提到是圆鳞和硬鳞。应是哪个？

（这个网站竟然SSL证书过期了，导致只能用Markdown编辑，气）题主竟然还有上古书籍杨安峰脊椎动物，正好我也有，那就回答一下吧。应该是'''硬鳞'''。首先可以去搜维基百科，因为不太会用Markdown就不放链接了，直接搜弓鳍鱼的词条即可，是硬鳞。题主所说的圆鳞大概来自于杨安峰P84吧，上面说的多鳍鱼目是圆鳞或硬鳞，但是在弓鳍鱼目明确指出了是硬鳞。普通动物学圆形硬鳞本质也是硬鳞。
话说什么时候这个网站才能恢复https访问，现在编辑起来好麻烦。

2.来自刘凌云《普通动物学》：P221上方表明十腕目左侧第5腕特化为茎化腕，而下方却说右侧。到底为哪一侧？

任淑仙《无脊椎动物学》第二版p180:多数种类左侧（少数为右侧）第五腕，目前遇到的考试题大多表述为左侧第五腕，或许不严谨但一般也不算错

3.关于鸵鸟膀胱的类型：鸵鸟的膀胱是泄殖腔膀胱还是尿囊膀胱？

估计是尿囊，杨安峰《脊椎动物比较解剖学》应该写了。

''生物化学：''

1.from徐长法《生物化学》下册p90，真的有无脊椎动物体内存在乙醛酸循环吗？

解答：有。乙醛酸循环是植物和某些微生物（大肠杆菌、醋酸杆菌等）及一些无脊椎动物细胞内脂肪酸氧化分解为乙酰CoA之后，在乙醛酸循环体(glyoxysome)内生成琥珀酸、乙醛酸和苹果酸的过程。参见[https://baike.baidu.com/item/%E4%B9%99%E9%86%9B%E9%85%B8%E5%BE%AA%E7%8E%AF/619160 百度百科]（百度百科内容不一定正确，请辩证对待）
除了具有双功能融合 ICL-MS 基因的线虫，其他后生动物无。[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1630690 后生动物乙醛酸循环酶的进化]

2.求一个关于金属酶/金属蛋白的整理。比如质膜ATP酶以Na为辅酶，精氨酸酶以Mn作为辅酶等等

解答：先写了一点点。可以参考[https://zh.wikipedia.org/zh-hans/金属蛋白金属蛋白 ]
''细胞生物学：''

''分子生物学：''

1.想求证一下，“DNA复制执照因子假说”中“执照”因子主要成分是Mcm蛋白，这是否是那种DNA解旋酶？毕竟好像在信号通路那里曾出现过一个不是后期促进复合物的APC。

解答：单说Mcm应该是同一个家族。真核生物DNA复制所用到的Mcm2-10同时负责调控复制启动，Mcm不结合DNA也不会开始复制。关于Mcm是否是执照因子的讨论见下：

一个异议：杨荣武《生物化学原理》3rd中，执照因子应是Cdt10和Cdc6，这两者在之后的复制过程被回收或降解。在丁明孝.等《细胞生物学》5th中，细胞周期一章的图中，有对Cdt10和Cdc6的标注，并且和杨荣武书上的过程一致，因此，如果杨荣武改题，这个知识点可能会出现极大争议。

↑杨荣武分子生物学第二版说执照因子是Cdt1和Cdc6，至于是否包括Mcm，杨sir没有正面回答这个问题，仅说明这两种蛋白会首先结合Mcm。不过按照pre-RC的定义，应该不包括Mcm。联赛假如出了建议按杨sir来，因为他可以改题。

''细胞生物学：''

1.
from徐长法《生物化学》下册p153，“不同蛋白O-糖基化的起始起点并不一致，有的在内质网，有的在内质网-高尔基体中间结构，也有的在内侧高尔基体”，这句话准确吗？也就是说不是像翟中和《细胞生物学》那样只在高尔基体进行吗？

解答：这似乎是一个"有争议"的问题。观点一：①如题，但徐长法我没有看过不做评价（我看的是杨sir和王镜岩QwQ，大佬有看过的可以验证一下）。②有[https://zhuanlan.zhihu.com/p/213786542 这篇知乎文章]描述O-linked为大多发生在内质网，黏蛋白发生在高尔基体（这篇文章给出了参考文献，可以自行验证）。观点二：①翟中和描述的是N-linked在内质网和高尔基体发生，O-linked在高尔基体发生（但是他没有给出肯定的判断）。②杨sir分子生物学第二版P393说O-linked只发生在高尔基体，一个很直接的结论。个人认为应该只在高尔基体，因为相关的糖基转移酶分布在高尔基体上。（而且杨sir能改题，直接信杨sir啊）至于其它观点不知从何而来。至少我目前做过的题都是按照高尔基体来的。

补充一下答主的回答：其实O-linked在胞质也可进行（非典型O-linked，由N-GlcNAc连接至Ser上而成，这在丁明孝.等《细胞生物学》5th中有进行描述），而且不典型的/非翟中和的O-linked有很多形式，按糖的种类分可以包括O-GalNAc、O-GlcNAc、O-Gal、O-Man、O-Fuc、O-Glc，后三种在维基百科中提到了，而且这三种是在内质网进行的（O-Man是在内质网起始，在高尔基体完成），因此，说在内质网应该是OK的。

另外，朱斌还在他的书里写过Tyr的“O-linked”，杨荣武也曾在讲课的时候提到蛋白聚糖的“O-linked”，总之说法很多，有很多可拓展之处。（我把维基百科扒下来了，PDF自取：[[:文件:O-linked glycosylation.pdf|O-linked glycosylation---Wikipedia]]）

2.《细胞生物学》：P62提到ABC超家族用于转运分子，而P66又说CFTR属于ABC超家族，是否矛盾？

解答：应该是翟中和的问题，他想说的小分子是小物质的意思，不是分子的意思。离子也可以。ABC超家族是很大一类蛋白，基本上什么类型的物质都能转运。

''生理学：''

1.朱大年《生理学》第九版P295表格中提到本体感觉属于Aα型神经纤维，但是P325却提到肌梭的传入神经包括Ia和II类纤维，其中花枝末梢是II类纤维的末梢且负责本体感觉。已知II类纤维属于Aβ类纤维，前后是否矛盾？John G. Nicholls等《神经生物学》第五版也有肌梭Ia型和II型纤维分别是“动态”和“静态”的传入纤维，是否可类比“肌梭长度感觉”和“本体感觉”？那朱P295表格是否表述不妥？

解答：ABC和 I II III IV是分别两个分类系统，其中ABC多用于传出纤维的分类，I II III IV 多用于传入纤维的分类（不绝对，多用于而已）这个地方就是Aα为支配梭外肌传出纤维、初级肌梭传入纤维（本体感觉）。题主所表述的II类纤维属于Aβ的表述是不妥的，因为根本不是一个分类系统。Aβ多为皮肤触压觉传入纤维。分类标准的话ABC主要按照传导速度，I II III IV主要按照纤维直径。关于分类[https://zhuanlan.zhihu.com/p/68321428 可见这里]，当然这些内容朱大年也写过。

追问《生理学》关于肌梭的传入纤维：抽象的是朱大年的表格上把两种分类系统对比了一下说Aα对应Ia和Ib，Aβ对应II……

解答：在肌紧张里面α运动神经纤维不就是Aα吗。首先注意朱大年是这么写的“I II III IV类纤维分别相当于Aα Aβ Aδ C类'''后根纤维'''，但又'''不完全等同'''”，所以先不要把两种分类混一起。Aα负责肌肉本体感觉应该是没有争议的。II类纤维朱大年只表述了“可能有关”。其实Ia类神经纤维也负责肌肉本体感觉。

''植物生理学''

1. 为什么植物细胞将质子泵出去，再让钾离子进来这一过程对细胞水势下降有贡献？理论上来说不是相同数量的钾离子进来后就进不来了吗？

追问《植物生理学》水势：我的意思是，假如泵出去10个质子，不是只会进来10个钾离子就结束了吗？和氯离子没有关系吧？

解答：在气孔打开时，H+-atp酶会将质子泵出去，氯离子会伴随着钾离子的大量吸收而吸收，于是会导致细胞水势下降。（可见王小菁第八版P25）

↑补充答主回答：质子对水势贡献不大，更多的是通过电荷把钾离子带进来。钾离子和蔗糖是对细胞水势有更大贡献的（见Taiz 5th）。因此相同电荷的质子出去，电荷的钾离子进来，电荷守恒的同时降低了细胞内的水势。答主所说的氯离子我暂时没有找到出处，暂留异议。

另：据苗健老师：玉米黄素并不是介导气孔开放的蓝光受体，应该是向光素介导的磷酸化途径。Taiz 7th已经删除了关于玉米黄素对气孔影响的文字，改成了向光素。但是因为国内教材都是抄的5th与6th所以都写的有玉米黄素。算是对水势的一个补充吧。这里有Taiz 7th的电子书（英文原版，'''856MB'''较大，建议开启浏览器自带多线程下载（不会自行百度）或使用IDM进行下载）：[https://cpucd.cpuikuns.top/s/GOia 分享-Plants Physi...]

追问植物生理学那个问题：“在标准压力下，溶液的渗透势等于溶液的水势，因为溶液的压力势为0MPa。溶液的的渗透势决定于溶液中溶质颗粒（分子或离子）总数。”
钾离子贡献更大，是因为质子可能与有机酸等结合，相对来说颗粒总数更少吗？

↑（个人见解，如有错误请佬指出）质子在此处的作用可以分为两部分：1）通过膜内外电位的改变使得钾离子通道开放，钾离子内流；2）质子-氯离子同向转运（见Taiz 5th，顺便解决了上一个补充回答的异议）。若是单纯质子的产生而不泵出显然无法做到这两点。所以，钾离子、质子、氯离子三者便均参与了水势的降低。另外，根据戈德曼方程可知虽然钾离子的浓度是胞内大于胞外，但电势是胞外大于胞内的。

初级内共生新知

2024-06-21T03:44:23Z

Rubisco：创建页面，内容为“ = “三人行” = '''''Pseudoblepharisma tenue'''''德国菌株有两种细菌共生体，一种是粉色的，一种是绿色的。2…”

= “三人行” =

'''''Pseudoblepharisma tenue'''''德国菌株有两种细菌共生体，一种是粉色的，一种是绿色的。2021 年，两种共生体都被证实具有光合作用：一种是''Chlorella'' sp. K10（小球藻），早些时候被发现是''Hydra viridissima''的共生体；另一种是 Ca. ''Thiodictyon'' ''intracellulare''（硫网菌属），这是一种紫色硫细菌，其基因组仅为其已知与其亲缘关系最近的物种的一半，并且已经失去了对氮和硫代谢至关重要的基因，以及利用硫化氢作为光合作用电子供体的能力。这种“三人行”对科学界来说是新奇的。


= 质体的”姐妹” =

'''''Gloeomargarita lithophora'''''是一种蓝藻，似乎与''Synechococcus''（聚球藻菌属）分支有关，是真核生物群Archaeplastida（古质体）中内共生质体的姐妹。''Gloeomargarita''的亲缘种可能在 19 亿至 14 亿年前的一次内共生事件中最终进化祖先古质体。该物种属于最近发现的蓝藻谱系，广泛分布于淡水微生物群和菌毯中。该谱系的生态分布为光合真核生物出现的环境条件提供了新的见解——很可能是在陆地-淡水环境中。第一个分化的古质体谱系——灰藻仅存在于淡水生态系统中，红藻的最基干进化枝 Cyanidiales 也是如此，这一事实进一步证实了这一假设。因此，质体不仅在蓝藻中很早就出现了，而且第一批光合真核生物很可能是在陆地-淡水环境中进化而来的，而不是像人们通常认为的那样在海洋中进化而来。


= “最近”的内共生 =

'''''Paulinella'''''属隶属于有孔虫界丝足虫门，至少有 11 个种，包括淡水和海洋种。像许多丝足虫一样，它被一排排硅质鳞片覆盖，并使用丝状伪足在底栖带的基质上爬行。它最著名的成员是三种光合作用物种''P. chromatophora''，''P. micropora''和''P. longichromatophora''，前两种是淡水形式，第三种是海洋形式，它们最近吞噬了蓝细菌为内共生体。结果它们失去了吞噬能力。由此产生的细胞器是一种光合质体，这是已知的光合蓝藻唯一其他初级内共生事件。内共生事件发生于约 9000 万至 1.4 亿年前，来自一种α-蓝藻（而非古质体中的质体起源于的β-蓝藻）。其基因组经历了大幅减少，现在只有与其最接近的自由生活种基因组的三分之一大小，但仍比大多数质体基因组大 10 倍。减少的基因有的丢失了，有的则转移到了核基因组中，这其中许多基因通过逆转录大幅扩增以满足代谢需要。

= 真核也能固氮 =

'''Nitroplast'''是在某些藻类（如定鞭藻门普林藻纲的''Braarudosphaera bigelowii''）中发现的细胞器，它在固氮过程中发挥着至关重要的作用，这是人们首次发现真核生物的固氮作用，此前这一过程被认为是细菌或古菌独有的。

用户讨论:Yzqzss

2024-05-19T23:20:17Z

Rubisco：

呼叫管理！出现大量垃圾广告界面！！

收到收到。

--[[用户:Yzqzss|Yzqzss]]（[[用户讨论:Yzqzss|讨论]]） 2024年3月20日 (三) 11:14 (CST)

请问如何上传大量图片，我转载的几篇文章中还有很多图片没有上传
PS：今天偶然上号发现网站竟然活了，每天都有人，而且出现了管理~hh
——Yunzizhi

网站证书过期了捏。

用户:Rubisco

2024-05-14T09:50:30Z

Rubisco：

*'''语文老师'''：不学语文，你是中国人吗？
*'''我'''：不学生物，你是人吗？
'''欢迎各位生竞巨佬交流、吐槽，分享心得！'''

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2024-05-10T13:06:37Z

Rubisco：/* 未解答 */

应该有不少生物竞赛的学生在访问这个网站。为此创建这样一个页面。

提问者：注册一个账号即可编辑，请在“未解答”栏目写下你学竞赛的问题，请注明身份。

回答者：大佬们可以访问这个页面来查看有没有新的问题。如果您可以解答，请在问题下方编辑（没有编辑按钮就去登录）好回答，并将该词条转移到“已解答”栏目。

或者也可以在这里提出您需要的整理。

=== 未解答 ===
朱大年《生理学》第九版P295表格中提到本体感觉属于Aα型神经纤维，但是P325却提到肌梭的传入神经包括Ia和II类纤维，其中花枝末梢是II类纤维的末梢且负责本体感觉。已知II类纤维属于Aβ类纤维，前后是否矛盾？John G. Nicholls等《神经生物学》第五版也有肌梭Ia型和II型纤维分别是“动态”和“静态”的传入纤维，是否可类比“肌梭长度感觉”和“本体感觉”？那朱P295表格是否表述不妥？

=== 已解答 ===
''生物化学：''

1.from徐长法《生物化学》下册p90，真的有无脊椎动物体内存在乙醛酸循环吗？

解答：有。乙醛酸循环是植物和某些微生物（大肠杆菌、醋酸杆菌等）及一些无脊椎动物细胞内脂肪酸氧化分解为乙酰CoA之后，在乙醛酸循环体(glyoxysome)内生成琥珀酸、乙醛酸和苹果酸的过程。参见[https://baike.baidu.com/item/%E4%B9%99%E9%86%9B%E9%85%B8%E5%BE%AA%E7%8E%AF/619160 百度百科]（百度百科内容不一定正确，请辩证对待）
除了具有双功能融合 ICL-MS 基因的线虫，其他后生动物无。[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1630690 后生动物乙醛酸循环酶的进化]

2.求一个关于金属酶/金属蛋白的整理。比如质膜ATP酶以Na为辅酶，精氨酸酶以Mn作为辅酶等等

解答：先写了一点点。可以参考[https://zh.wikipedia.org/zh-hans/金属蛋白金属蛋白 ]
''细胞生物学：''

''分子生物学：''

1.想求证一下，“DNA复制执照因子假说”中“执照”因子主要成分是Mcm蛋白，这是否是那种DNA解旋酶？毕竟好像在信号通路那里曾出现过一个不是后期促进复合物的APC。

解答：单说Mcm应该是同一个家族。真核生物DNA复制所用到的Mcm2-10同时负责调控复制启动，Mcm不结合DNA也不会开始复制。关于Mcm是否是执照因子的讨论见下：

一个异议：杨荣武《生物化学原理》3rd中，执照因子应是Cdt10和Cdc6，这两者在之后的复制过程被回收或降解。在丁明孝.等《细胞生物学》5th中，细胞周期一章的图中，有对Cdt10和Cdc6的标注，并且和杨荣武书上的过程一致，因此，如果杨荣武改题，这个知识点可能会出现极大争议。

↑杨荣武分子生物学第二版说执照因子是Cdt1和Cdc6，至于是否包括Mcm，杨sir没有正面回答这个问题，仅说明这两种蛋白会首先结合Mcm。不过按照pre-RC的定义，应该不包括Mcm。联赛假如出了建议按杨sir来，因为他可以改题。

''细胞生物学：''

1.
from徐长法《生物化学》下册p153，“不同蛋白O-糖基化的起始起点并不一致，有的在内质网，有的在内质网-高尔基体中间结构，也有的在内侧高尔基体”，这句话准确吗？也就是说不是像翟中和《细胞生物学》那样只在高尔基体进行吗？

解答：这似乎是一个"有争议"的问题。观点一：①如题，但徐长法我没有看过不做评价（我看的是杨sir和王镜岩QwQ，大佬有看过的可以验证一下）。②有[https://zhuanlan.zhihu.com/p/213786542 这篇知乎文章]描述O-linked为大多发生在内质网，黏蛋白发生在高尔基体（这篇文章给出了参考文献，可以自行验证）。观点二：①翟中和描述的是N-linked在内质网和高尔基体发生，O-linked在高尔基体发生（但是他没有给出肯定的判断）。②杨sir分子生物学第二版P393说O-linked只发生在高尔基体，一个很直接的结论。个人认为应该只在高尔基体，因为相关的糖基转移酶分布在高尔基体上。（而且杨sir能改题，直接信杨sir啊）至于其它观点不知从何而来。至少我目前做过的题都是按照高尔基体来的。

补充一下答主的回答：其实O-linked在胞质也可进行（非典型O-linked，由N-GlcNAc连接至Ser上而成，这在丁明孝.等《细胞生物学》5th中有进行描述），而且不典型的/非翟中和的O-linked有很多形式，按糖的种类分可以包括O-GalNAc、O-GlcNAc、O-Gal、O-Man、O-Fuc、O-Glc，后三种在维基百科中提到了，而且这三种是在内质网进行的（O-Man是在内质网起始，在高尔基体完成），因此，说在内质网应该是OK的。

另外，朱斌还在他的书里写过Tyr的“O-linked”，杨荣武也曾在讲课的时候提到蛋白聚糖的“O-linked”，总之说法很多，有很多可拓展之处。（我把维基百科扒下来了，PDF自取：[[:文件:O-linked glycosylation.pdf|O-linked glycosylation---Wikipedia]]）

用户:Rubisco

2024-05-10T09:47:56Z

Rubisco：

*'''语文老师'''：不学语文，你是中国人吗？
*'''我'''：不学生物，你是人吗？
'''祝愿诸位联赛大吉！'''

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2024-05-09T13:09:15Z

Rubisco：/* 未解答 */

应该有不少生物竞赛的学生在访问这个网站。为此创建这样一个页面。

提问者：注册一个账号即可编辑，请在“未解答”栏目写下你学竞赛的问题，请注明身份。

回答者：大佬们可以访问这个页面来查看有没有新的问题。如果您可以解答，请在问题下方编辑（没有编辑按钮就去登录）好回答，并将该词条转移到“已解答”栏目。

或者也可以在这里提出您需要的整理。

=== 未解答 ===

from徐长法《生物化学》下册p153，“不同蛋白O-糖基化的起始起点并不一致，有的在内质网，有的在内质网-高尔基体中间结构，也有的在内侧高尔基体”，这句话准确吗？也就是说不是像翟中和《细胞生物学》那样只在高尔基体进行吗？
=== 已解答 ===
''生物化学：''

1.from徐长法《生物化学》下册p90，真的有无脊椎动物体内存在乙醛酸循环吗？

解答：有。乙醛酸循环是植物和某些微生物（大肠杆菌、醋酸杆菌等）及一些无脊椎动物细胞内脂肪酸氧化分解为乙酰CoA之后，在乙醛酸循环体(glyoxysome)内生成琥珀酸、乙醛酸和苹果酸的过程。参见[https://baike.baidu.com/item/%E4%B9%99%E9%86%9B%E9%85%B8%E5%BE%AA%E7%8E%AF/619160 百度百科]（百度百科内容不一定正确，请辩证对待）
除了具有双功能融合 ICL-MS 基因的线虫，其他后生动物无。[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1630690 后生动物乙醛酸循环酶的进化]

2.求一个关于金属酶/金属蛋白的整理。比如质膜ATP酶以Na为辅酶，精氨酸酶以Mn作为辅酶等等

解答：先写了一点点。可以参考[https://zh.wikipedia.org/zh-hans/金属蛋白金属蛋白 ]

''细胞生物学：''

1.想求证一下，“DNA复制执照因子假说”中“执照”因子主要成分是Mcm蛋白，这是否是那种DNA解旋酶？毕竟好像在信号通路那里曾出现过一个不是后期促进复合物的APC。

解答：单说Mcm应该是同一个家族。真核生物DNA复制所用到的Mcm2-10同时负责调控复制启动，Mcm不结合DNA也不会开始复制。关于Mcm是否是执照因子的讨论见下：

一个异议：杨荣武《生物化学原理》3rd中，执照因子应是Cdt10和Cdc6，这两者在之后的复制过程被回收或降解。在丁明孝.等《细胞生物学》5th中，细胞周期一章的图中，有对Cdt10和Cdc6的标注，并且和杨荣武书上的过程一致，因此，如果杨荣武改题，这个知识点可能会出现极大争议。

↑杨荣武分子生物学第二版说执照因子是Cdt1和Cdc6，至于是否包括Mcm，杨sir没有正面回答这个问题，仅说明这两种蛋白会首先结合Mcm。不过按照pre-RC的定义，应该不包括Mcm。联赛假如出了建议按杨sir来，因为他可以改题。

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2024-05-09T09:27:03Z

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韦伯氏器到底是三块骨头还是四块骨头？在杨安峰《脊椎动物学》中，韦伯氏器被描述为三块骨头，但是也有说法认为另包括一块闩骨。

=== 已解答 ===
''生物化学：''

1.from徐长法《生物化学》下册p90，真的有无脊椎动物体内存在乙醛酸循环吗？

解答：有。乙醛酸循环是植物和某些微生物（大肠杆菌、醋酸杆菌等）及一些无脊椎动物细胞内脂肪酸氧化分解为乙酰CoA之后，在乙醛酸循环体(glyoxysome)内生成琥珀酸、乙醛酸和苹果酸的过程。参见[https://baike.baidu.com/item/%E4%B9%99%E9%86%9B%E9%85%B8%E5%BE%AA%E7%8E%AF/619160 百度百科]（百度百科内容不一定正确，请辩证对待）
除了具有双功能融合 ICL-MS 基因的线虫，其他后生动物无。[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1630690 后生动物乙醛酸循环酶的进化]

2.求一个关于金属酶/金属蛋白的整理。比如质膜ATP酶以Na为辅酶，精氨酸酶以Mn作为辅酶等等

解答：先写了一点点。可以参考[https://zh.wikipedia.org/zh-hans/金属蛋白金属蛋白 ]

''细胞生物学：''

1.想求证一下，“DNA复制执照因子假说”中“执照”因子主要成分是Mcm蛋白，这是否是那种DNA解旋酶？毕竟好像在信号通路那里曾出现过一个不是后期促进复合物的APC。

解答：应该是同一个家族。真核生物DNA复制所用到的Mcm2-10同时负责调控复制启动，Mcm不结合DNA就不会开始复制。同一个缩写的有很多，记住主要的。比如PPP既可以指磷酸戊糖途径也可以指磷脂交换蛋白，但是以磷酸戊糖途径为主。

一个异议：杨荣武《生物化学原理》3rd中，执照因子应是Cdt10和Cdc6，这两者在之后的复制过程被回收或降解。在丁明孝.等《细胞生物学》5th中，细胞周期一章的图中，有对Cdt10和Cdc6的标注，并且和杨荣武书上的过程一致，因此，如果杨荣武改题，这个知识点可能会出现极大争议。

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2024-05-09T09:23:25Z

Rubisco：

应该有不少生物竞赛的学生在访问这个网站。为此创建这样一个页面。

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回答者：大佬们可以访问这个页面来查看有没有新的问题。如果您可以解答，请在问题下方编辑（没有编辑按钮就去登录）好回答，并将该词条转移到“已解答”栏目。

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=== 未解答 ===

=== 已解答 ===
''生物化学：''

1.from徐长法《生物化学》下册p90，真的有无脊椎动物体内存在乙醛酸循环吗？

解答：有。乙醛酸循环是植物和某些微生物（大肠杆菌、醋酸杆菌等）及一些无脊椎动物细胞内脂肪酸氧化分解为乙酰CoA之后，在乙醛酸循环体(glyoxysome)内生成琥珀酸、乙醛酸和苹果酸的过程。参见[https://baike.baidu.com/item/%E4%B9%99%E9%86%9B%E9%85%B8%E5%BE%AA%E7%8E%AF/619160 百度百科]（百度百科内容不一定正确，请辩证对待）
除了具有双功能融合 ICL-MS 基因的线虫，其他后生动物无。[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1630690 后生动物乙醛酸循环酶的进化]

2.求一个关于金属酶/金属蛋白的整理。比如质膜ATP酶以Na为辅酶，精氨酸酶以Mn作为辅酶等等

解答：先写了一点点。可以参考[https://zh.wikipedia.org/zh-hans/金属蛋白金属蛋白 ]

''细胞生物学：''

1.想求证一下，“DNA复制执照因子假说”中“执照”因子主要成分是Mcm蛋白，这是否是那种DNA解旋酶？毕竟好像在信号通路那里曾出现过一个不是后期促进复合物的APC。

解答：应该是同一个家族。真核生物DNA复制所用到的Mcm2-10同时负责调控复制启动，Mcm不结合DNA就不会开始复制。同一个缩写的有很多，记住主要的。比如PPP既可以指磷酸戊糖途径也可以指磷脂交换蛋白，但是以磷酸戊糖途径为主。

一个异议：杨荣武《生物化学原理》3rd中，执照因子应是Cdt10和Cdc6，这两者在之后的复制过程被回收或降解。在丁明孝.等《细胞生物学》5th中，细胞周期一章的图中，有对Cdt10和Cdc6的标注，并且和杨荣武书上的过程一致，因此，如果杨荣武改题，这个知识点可能会出现极大争议。

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2024-05-09T07:13:26Z

Rubisco：

应该有不少生物竞赛的学生在访问这个网站。为此创建这样一个页面。

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回答者：大佬们可以访问这个页面来查看有没有新的问题。如果您可以解答，请在问题下方编辑（没有编辑按钮就去登录）好回答，并将该词条转移到“已解答”栏目。

或者也可以在这里提出您需要的整理。

=== 未解答 ===

=== 已解答 ===
''生物化学：''

1.from徐长法《生物化学》下册p90，真的有无脊椎动物体内存在乙醛酸循环吗？

解答：有。乙醛酸循环是植物和某些微生物（大肠杆菌、醋酸杆菌等）及一些无脊椎动物细胞内脂肪酸氧化分解为乙酰CoA之后，在乙醛酸循环体(glyoxysome)内生成琥珀酸、乙醛酸和苹果酸的过程。参见[https://baike.baidu.com/item/%E4%B9%99%E9%86%9B%E9%85%B8%E5%BE%AA%E7%8E%AF/619160 百度百科]（百度百科内容不一定正确，请辩证对待）
除了具有双功能融合 ICL-MS 基因的线虫，其他后生动物无。[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1630690 后生动物乙醛酸循环酶的进化]

2.求一个关于金属酶/金属蛋白的整理。比如质膜ATP酶以Na为辅酶，精氨酸酶以Mn作为辅酶等等

解答：先写了一点点。可以参考[https://zh.wikipedia.org/zh-hans/金属蛋白金属蛋白 ]

''细胞生物学：''

1.想求证一下，“DNA复制执照因子假说”中“执照”因子主要成分是Mcm蛋白，这是否是那种DNA解旋酶？毕竟好像在信号通路那里曾出现过一个不是后期促进复合物的APC。

解答：应该是同一个家族。真核生物DNA复制所用到的Mcm2-10同时负责调控复制启动，Mcm不结合DNA就不会开始复制。同一个缩写的有很多，记住主要的。比如PPP既可以指磷酸戊糖途径也可以指磷脂交换蛋白，但是以磷酸戊糖途径为主。

Bio index

2024-05-09T07:09:31Z

Rubisco：/* 任务 */

== 二级导航页面 ==

* '''[[无脊椎动物比较]]'''（未完成）

== 提问页面 ==

=== · [[提出你的问题]] ===

==任务==
以下为编辑意向的任务
*'''[[两栖动物的皮肤及其衍生物]]'''''(未完成）''
* '''[[昆虫的标本制作]]'''''（基本完成）''
*'''[[2023诺贝尔生理学或医学奖简介]]'''''(未完成）''
*'''[[生物信息数据库及工具简介整理]]'''''（未完成）''
*'''[[报告基因整理]]'''''（未完成）''
*'''[[生物缩写]]'''''（未完成）''
*'''[[糖酵解]]'''''（未完成）''
*'''[[细胞死亡方式整理]]'''''（未完成）''
*'''[[生化过程抑制剂整理]]''' ''( 基本完成 )''
*'''[[常见动物生理学抑制剂整理]]''' ''(未完成)''
*'''[[全国中学生生物学联赛试题|全国中学生生物学联赛试题及答案]]''' ''(未完成)''
*'''[[重要的同源器官]]'''（未完成）
*'''[[RNA的生物合成]]''' ''(未完成)''
*'''[[维生素与辅酶]]''' ''（未完成）''
*'''[[金属酶]]''' ''（未完成）''

==现有条目==

*动物生理学
** [[常见动物生理学抑制剂整理|'''常见动物生理学抑制剂整理''']]
** [[器官的神经调控|'''器官的神经调控''']]
**'''[[内分泌整理]]'''
**'''[[脊椎动物的泌尿和生殖系统]]'''
**'''[[止血和凝血]]'''
**'''[[血型]]'''
**'''[[先天免疫系统]]'''
**'''[[哺乳动物的适应性免疫系统]]'''

*植物生理学
**'''[[植物生长物质整理]]'''
**'''[[植物矿质元素整理]]'''
**'''[[植物抗逆生理整理]]'''
**'''[[植物的矿质生理学]]'''
**'''[[环境因素对植物发育的影响]]'''
*动物学
**'''[[动物学人名结构整理]]'''
**[https://life.scnu.edu.cn/biology/jingpin/dwx/course_learn/chapter_20/chapter_2/learn/default.htm 动物地理区系划分]
**'''[[肺鱼特征整理]]'''
**'''[[鸟的趾整理]]'''
**'''[[无脊椎动物幼虫整理]]'''
**'''[[脊椎动物的心脏]]'''
**'''[[昆虫的外部解剖]]'''
**'''[[昆虫的变态整理]]'''
**[[昆虫特征分类]]
**'''[[脊椎动物的皮肤]]'''
**[[脊椎动物的骨骼系统]]
**'''[[脊椎动物的循环系统]]'''
**'''[[脊椎动物的呼吸系统]]'''
**[[蛇|蛇的重要考点]]
**[[脑神经整理|人脑神经整理]]
*植物学
**'''[[藻类分类整理]]'''
**'''[[APG IV]]'''
**'''[[裸子植物]]'''
**'''[[苔藓植物]]'''
**'''[[花]]'''
**'''[[维管植物的结构]]'''
*生态学
**'''[[生态学人名规律整理]]'''
**'''[[生物的地理分区]]'''
**'''[[人名拟态的典例整理]]'''
*动物行为学
**'''[[动物行为学术语]]'''
*遗传学
**'''[[表观遗传疾病]]'''
*进化生物学
**'''[[构建系统发生树常用方法]]'''
*细胞生物学
**'''[[癌]]'''
**[[糖基化区分]]
*生物化学
**'''[[氨基酸性质整理]]'''
*分子生物学
**'''[[DNA聚合酶]]'''
**'''[[DNA解链酶]]'''
**'''[[western blot条带结果分析整理]]'''
**'''[[调控RNA]]'''
*微生物学
**'''[[常见抑制剂整理|常见抗生素抑制剂整理]]'''
**'''[[病毒分类整理]]'''
**'''[[病毒的结构]]'''
**'''[[低等真核生物]]'''
**'''[[衣原体]]'''
**'''[[细菌染色法]]'''

== 题目 ==

* '''[[题目分类]]'''

[[分类:生物|index]]

金属酶

2024-05-09T07:08:44Z

Rubisco：先写一点点

==Zn==
锌是人类和其他动植物的必需微量元素。超过300种酶和1000种转录因子的功能需要锌，它是人体中仅次于铁的第二丰富的微量金属，也是唯一出现在所有六大酶类中的金属元素。以下是一些含有锌或以锌作为辅因子的酶和蛋白质的例子：
*碳酸酐酶
*羧肽酶A
*乙醇脱氢酶
*一氧化碳脱氢酶
*碱性磷酸酶
*基质金属蛋白酶
*超氧化物歧化酶
*DNA 和 RNA 聚合酶
*甲硫氨酸-S-甲基转移酶
*S1核酸酶
*所有含有锌指结构域的转录因子

提出你的问题

2024-05-08T13:11:44Z

Rubisco：/* 已解答 */

应该有不少生物竞赛的学生在访问这个网站。为此创建这样一个页面。

提问者：注册一个账号即可编辑，请在“未解答”栏目写下你学竞赛的问题，请注明身份。

回答者：大佬们可以访问这个页面来查看有没有新的问题。如果您可以解答，请在问题下方编辑（没有编辑按钮就去登录）好回答，并将该词条转移到“已解答”栏目。

或者也可以在这里提出您需要的整理。

=== 未解答 ===

=== 已解答 ===
1.from徐长法《生物化学》下册p90，真的有无脊椎动物体内存在乙醛酸循环吗？

解答：有。乙醛酸循环是植物和某些微生物（大肠杆菌、醋酸杆菌等）及一些无脊椎动物细胞内脂肪酸氧化分解为乙酰CoA之后，在乙醛酸循环体(glyoxysome)内生成琥珀酸、乙醛酸和苹果酸的过程。参见[https://baike.baidu.com/item/%E4%B9%99%E9%86%9B%E9%85%B8%E5%BE%AA%E7%8E%AF/619160 百度百科]（百度百科内容不一定正确，请辩证对待）
除了具有双功能融合 ICL-MS 基因的线虫，其他后生动物无。[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1630690 后生动物乙醛酸循环酶的进化]

调控RNA

2024-05-08T10:05:12Z

Rubisco：新增circRNA

== 总论 ==
* 调控RNA（Regulatory RNA）控制RNA的翻译，也有其它功能。

== 细菌的sRNA ==
[[File:104.PNG|thumb|220x220px|图1：顺式反义RNA的工作机制]]
[[File:105.png|thumb|325x325px|图2：反式反义RNA的工作机制]]
[[File:106.png|thumb|220x220px|图3：核开关的工作机制]]
[[File:107.png|thumb|222x222px|图4：常见的核开关]]

=== sRNA的功能 ===
* sRNA既可与其它RNA互补（称为反义RNA（Antisense RNA）），也可与蛋白质结合，发挥功能。
* 古菌、真核生物也有反义RNA。
* sRNA本身可监测温度、某种物质浓度等环境因子。
* 根据反义RNA与其影响的RNA是否完全配对，将反义RNA分为顺式（Cis-encoded）和反式（Trans-encoded）两种。
* 编码顺式反义RNA的基因出现在细菌染色体、质粒、噬菌体、转位子中。
** 它控制质粒的复制、接合。
** 它决定噬菌体是否将宿主裂解。
** 它控制转位子转位的频率。
** 它控制（通常是有毒的）蛋白合成。
* 顺式反义RNA的工作机制：（图1）
** 与mRNA结合，阻止核糖体翻译mRNA。
** 促进mRNA降解，通常由RNase III水解。
** 与mRNA结合，掩盖切割位点，防止mRNA被水解。
** 转录弱化（Transcription Attenuation），只出现在革兰氏阳性细菌。
** 转录干扰（Transcriptional Interference）。
** “伪结”干扰（Pseudoknot Formation Interference）。
** 启动子干扰。
* 反式反义RNA在数量、功能、工作机制上都较丰富。
* 有些反式反义RNA同时是mRNA。
* 很多反式反义RNA需要Hfq蛋白（一种分子伴侣）的帮助才能和RNA结合。
* 反式反义RNA的工作机制：（图2）
** 抑制、促进翻译。
** 促进mRNA降解。
** 抑制翻译，同时促进mRNA降解。
** 稳定mRNA。
** 促进mRNA的后加工。
** RNA陷阱（RNA Trapping）。
* 古菌、真核生物也有“反义RNA”，但功能仅限于与mRNA互补，物理干扰mRNA翻译。

=== 转录弱化 ===
* mRNA存在两种可能二级结构，其中一种有转录终止柄环（Transcriptional Terminator Stem-loop）结构。
* 未完成转录的mRNA与反义RNA结合时，形成有转录终止环的二级结构。
* 转录终止环使mRNA转录提前终止，称为转录弱化现象。

=== 转录干扰 ===
* 转录干扰现象至今只观察到一例。
* 某细菌染色体有ubiGmccBA基因，其下游有一个反义RNA的启动子。
* 从该启动子可转录出四种反义RNA。
* 细胞中甲硫氨酸较高时，转录出的反义RNA最短，不干扰ubiGmccBA的转录。
* 细胞中甲硫氨酸越低，转录出的反义RNA越长，通过积累正超螺旋抑制ubiGmccBA的转录，称为转录干扰现象。

=== “伪结”干扰 ===
* 翻译某个mRNA需要它有个“伪结”结构。
* 必须先合成repY，再合成repZ，由repZ干扰mRNA的一个柄环结构，才能形成伪结结构。
* 反义RNA既抑制repY的翻译，也抑制伪结结构的形成，称为伪结干扰现象。

=== 启动子干扰 ===
* 某些质粒复制时需复制原点有一个启动子RNAII。
* 对应的反义RNA（RNAI）与RNAII结合，阻止质粒复制，称为启动子干扰现象。

=== RNA陷阱 ===
* ChiX是某细菌中的一种反式反义RNA。
* 一般情况下，ChiX抑制chiP（一种mRNA）的翻译并促进它降解。（但ChiX本身不被降解）
* 细菌细胞内出现某种物质时，细胞转录一种陷阱mRNA，与ChiX结合，二者同时被降解。
* ChiX被降解后，chiP得以翻译。

=== 与蛋白质结合的sRNA ===

==== 6S RNA ====
* 细菌在营养不足时，产生6S RNA。
* 6S RNA与σ70转录因子结合，抑制相关基因转录。
* 细菌同时产生σS转录因子，6S RNA帮助细菌过渡到新转录因子。

==== CsrB ====
* CsrA是一种蛋白质，通过翻译调控促进糖酵解，抑制糖异生。
* CsrB是一种sRNA，通过与CsrA结合，抑制CsrA的功能。

=== 监测环境因子的sRNA（图3、4） ===
* 核开关（Riboswitch）能监测细胞中的环境因子。
* 核开关有时是mRNA的一部分。
* 温度或与某物质非共价结合能使核开关的二级结构改变。
* 二级结构的改变既可调控转录也可调控翻译。

== 细菌和古菌的CRISPR ==
[[File:108.png|thumb|220x220px|图5：CRISPR的结构]]
[[File:109.png|thumb|220x220px|图6：与CRISPR功能相关的基因]]
[[File:110.png|thumb|220x220px|图7：感染细菌的噬菌体或质粒的一部分被写入CRISPR]]
[[File:111.png|thumb|220x220px|图8：crRNA的工作机制]]
* 大部分细菌和古菌的基因组中有结构如图5所示的CRISPR（Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats）结构。
* 每个基因组中可以有不止一个CRISPR结构。
* CRISPR是原核生物的免疫系统。
* CRISPR由高度保守的Repeat序列和高度自由的Spacer序列交替构成。
* Repeat和Spacer的长度都约为30 bp。
* CRISPR的一端有Leader序列，长约500 bp，富含A-T。
* 在Leader序列方向有若干编码蛋白质的基因，这些蛋白质与CRISPR功能有关。
* 上述基因中最保守的是cas1和cas2。
* 细菌被噬菌体或质粒感染时，感染者DNA的一部分（靠近一种叫PAM的序列）被写入靠近Leader序列的一端。
* CRISPR结构的转录启动子在Leader序列内。
* 整个CRISPR结构被转录为一个RNA，称为pre-crRNA。
* pre-crRNA被切割为若干crRNA。
* 每个crRNA的5'端为8个Repeat序列的碱基，中间为一个Spacer序列，3'端为下一个Repeat序列剪去8个碱基。
* crRNA随后与一个蛋白质复合体结合，识别外来核酸。如配对正确，则蛋白质复合体将外来核酸在配对处切开。
* CRISPR系统中的Cas9蛋白可用于一切生物的基因组编辑。

== 真核生物的RNA干扰（RNA Interference，RNAi） ==
[[File:112.PNG|thumb|220x220px|图9：RNAi的工作机制]]
[[File:113.PNG|thumb|220x220px|图10：miRNA既可出现于外显子，也可出现于内含子，呈柄环结构]]
[[File:114.PNG|thumb|220x220px|图11：pre-miRNA]]
[[File:115.png|thumb|841x841px|图12：Dicer酶]]
[[File:116.PNG|thumb|220x220px|图13：植物与动物细胞内miRNA生成机制比较]]
[[File:117.PNG|thumb|220x220px|图14：Argonaute酶]]
[[File:118.PNG|thumb|220x220px|图15：Argonaute蛋白抑制翻译的工作机制]]
[[File:119.PNG|thumb|220x220px|图16：piRNA与CRISPR系统比较]]
* 真核生物的部分非编码RNA通过RNA干扰机制调控基因表达。（图9）
* 若上述RNA与mRNA结合紧密，则mRNA被立刻水解。
* “结合紧密”的关键是RNA的第9~11个核苷酸。
* 若上述RNA与mRNA结合不紧密，则mRNA先被抑制翻译，然后被水解。
* 若上述RNA与正在转录的RNA结合，则引起DNA构象改变，抑制其转录。
* 上述RNA有三类：siRNA、miRNA、piRNA，长度均约为20 nt，统称为小RNA（Small RNA，注意不是sRNA）。（piRNA略长）

=== miRNA ===
* miRNA参与细胞自身基因表达调控。
* miRNA由pri-miRNA经两次剪切产生。
* 绝大部分pri-miRNA源于基因的内含子或外显子，由RNA聚合酶II转录，此时pri-miRNA是mRNA。
* 基因组中5'端有Alu元素、MWIR元素、tRNA的pri-miRNA由RNA聚合酶III转录。
* miRNA在pri-miRNA中呈柄环结构。（图10、11）
* 每个pri-miRNA可含1~6个miRNA。
* 细胞核中，pri-miRNA被DGCR8蛋白（无脊椎动物中称为Pasha蛋白）识别，然后被Drosha酶（属于RNase III）将柄环结构剪切为pre-miRNA。
* DGCR8蛋白和Drosha酶共同构成“微处理”复合体（Microprocessor Complex）。
* pre-miRNA长约为70 nt。
* miRNA出现于柄环结构中柄的上半部分。
* pre-miRNA利用Exportin-5通过核孔进入细胞质。
* 细胞质内，Dicer酶将pre-miRNA从中间切下22 nt左右，切下部分为dsRNA。（下文暂称此RNA为pro-miRNA）
* pre-miRNA和pro-miRNA的每条链的3'端多出2个核苷酸。（RNase III切割的特征）
* 如果pre-miRNA富含G，可能形成G四联体结构，则不被Dicer酶处理。
* 植物细胞中产生miRNA的过程与上述略有不同，见图13。（它们的进化起源可能不同）
** 植物的miRNA处理不经过Drosha酶切。
** 植物的miRNA通常不在基因内，动物的miRNA通常在内含子内。
** 动物的miRNA主要与mRNA的3'端不翻译区结合，次要与外显子结合，少数与内含子结合。
** 植物的miRNA一般与外显子结合。
* RISC复合体结合Dicer酶切下的dsRNA，使它变性，抛弃其中一条链，另一条链成为miRNA，此过程称为RISC复合体的成熟（Maturation）。
* 若切下的dsRNA只有一条链成为miRNA，此链称为Guide Strand，另一条链称为Passenger Strand。（也可能两条链都成为miRNA）

=== siRNA ===
* siRNA帮助细胞抵抗外来RNA。
* siRNA绝大部分产生于外源的dsRNA，极少数产生于细胞转录的dsRNA。
* siRNA是双链结构，而pre-miRNA是发夹结构。（区分siRNA和miRNA的唯一标准）
* Dicer酶处理dsRNA产生新的dsRNA（暂称为pro-siRNA），它与RISC复合体结合。（类似于pro-miRNA）

=== Dicer酶（图12） ===
* Dicer酶由2个RNase III亚基、1个PAZ亚基组成。
* Dicer酶既可切割发夹结构，也可切割双链结构，但每条链一3'端要多出2个核苷酸。
* PAZ亚基固定3'端的2个核苷酸。
* 两个RNase III的切割位点距离PAZ亚基约20个核苷酸长，从而切下的dsRNA每条链也约为此长度。

=== piRNA ===
* piRNA只出现于动物细胞内，帮助细胞抑制转位子。（植物用siRNA对抗转位子）
* piRNA几乎只在生殖细胞中表达。
* piRNA源于细胞转录出的ssRNA，具体产生过程尚不清楚，但Dicer酶一定不参与。
* piRNA的5‘端一般是U，3'端磷酸基团的3'羟基一般变为氧甲基。
* 细胞核内也有piRNA，作用不明。

=== RISC复合体及其它 ===
* 5'端的核苷酸以A或U为主的链更容易被选为Guide Strand。
* RISC复合体的核心是Argonaute酶。
* Argonaute酶将与Guide Strand紧密配对的RNA剪断，从而阻止翻译。（图14）
* Argonaute酶亦可抑制RNA翻译。（图15）
* 植物（包括真菌）、低等动物（不包括果蝇）的细胞内有以RNA为模板的RNA聚合酶（RdRP）。
* 未与RISC复合体结合的小RNA可直接与mRNA结合，此时RdRP以小RNA为引物，合成一条链，组成dsRNA。
* 上述dsRNA可被Dicer酶处理，形成新小RNA，从而放大RNAi现象。

=== RNAi与生物技术 ===
* 转基因技术中，导入同一基因的多个拷贝会引起共抑制现象（Cosuppresion）。
* 共抑制现象原因尚不清楚，但转录组研究显示细胞产生了对应于多拷贝基因的miRNA。
* RNAi被用于人工基因表达调控：
** 最早，先在试管内合成特定dsRNA，然后注入秀丽隐杆线虫细胞。
** 随后，发现直接将秀丽隐杆线虫浸泡在dsRNA溶液里也能注入dsRNA。（但哺乳动物细胞不行）
** 后来，先将dsRNA对应的DNA导入大肠杆菌的质粒，使大肠杆菌产生dsRNA，然后给线虫喂食大肠杆菌。
** 哺乳动物细胞中，以上方法成功率都不高，因为较长的dsRNA易引起干扰素（Interferon）反应，进而细胞凋亡。
** 现代，先将构造的DNA序列导入动物细胞的基因组中，该序列转录产生自动折叠为柄环结构的RNA（shRNA），模仿pre-RNA的功能。
** 此方法可使线虫的全部细胞永久具有该dsRNA的干扰效果。

== 真核生物的长非编码RNA（lncRNA） ==
* lncRNA指长度大于200 nt的非编码RNA。
* lncRNA的功能非常复杂，包括：
** 抑制或激活特定基因的转录；
** 控制通用转录因子（General Transcription Factor）或RNA聚合酶本身；（此类lncRNA多由RNA聚合酶III转录）
** 控制mRNA剪接（Slicing）；
** 控制mRNA翻译；（此现象在神经细胞中尤为明显）
** 控制表观遗传。（典型：Xist控制形成巴氏小体，见下文）

=== Xist ===
* 雌性胎盘动物（后兽亚纲和真兽亚纲）在胚胎有32~64个细胞时，每个细胞中两条X染色体中任意一条变为异染色质（失活），称为巴氏小体（Barr's Body）。
* 若失活的X染色体来自父方（母方），则该细胞分裂产生的所有细胞中失活的X染色体都来自父方（母方）。
* 正常的X染色体记作Xa，失活的X染色体记作Xi。
* 后兽亚纲动物中，总是来自父方的X染色体变为异染色质。
* 老鼠胚胎有2~4个细胞时，来自父方的X染色体因染色体印记而失活，但在囊胚早期此染色体复活。（但胚外组织，包括胎盘，其细胞中此X染色体永久失活）
* X染色体上有XIC区域（X-inactivation Center）。
* XIC区域包含4个基因：Xist、Tsix、Jpx、Ftx。
* Xist和Tsix互为反义RNA，互相抑制转录。
* 胚胎初期，所有细胞少量转录Xist。
* 胚胎达到32细胞时，每个细胞中其中一个X染色体不再转录Xist，另一个大量转录Xist。
* Xist有3'端多聚A，要经历剪接，但不编码蛋白质，属于伪基因（Pseudogene）。
* Xist是唯一Xa不表达，Xi大量表达的基因。
* Xist先逐步包裹转录出它的X染色体。（尚不清楚为何不包裹另一条X染色体）
* Xist吸引其它蛋白质（如PRC2）对X染色体进行修饰。
* X染色体失活修饰包括：高DNA甲基化、低组蛋白乙酰化、低H3K4甲基化、高H3K9甲基化。
* 只有失活X染色体中出现一种罕见组蛋白macroH2A（又名H2AFY），替代正常组蛋白H2A。
* 将XIC区域移入其它染色体，该染色体也会出现上述失活现象。

== 环状RNA（Circular RNA） ==

* 环状RNA（或circRNA）是一种单链RNA，与线性RNA不同，它形成共价闭合的连续环。在环状 RNA 中， RNA 分子中通常存在的3' 和 5' 末端已连接在一起。许多类型的环状 RNA 均源自蛋白质编码基因。一些环状RNA已被证明可以编码蛋白质。某些类型的环状 RNA 最近也显示出调节基因表达的潜力。大多数环状RNA的生物学功能尚不清楚。由于环状 RNA 没有 5' 或 3' 末端，因此它们能够抵抗核酸外切酶介导的降解，并且可能比细胞中大多数线性 RNA 更稳定。环状RNA与癌症等一些疾病有关。
* 大多数circRNA来自非规范性剪接，如外显子乱序。外显子乱序，也称为外显子改组，描述了外显子以“非规范”（非典型）顺序剪接的事件。外显子乱序可以通过三种方式发生：
*# 基因组中的串联外显子重复，通常发生在癌症中。
*# 反式剪接，其中两个 RNA 转录物融合，产生包含外显子的线性转录物，例如，该外显子可能源自两条不同染色体上编码的基因。反式剪接在秀丽隐杆线虫中非常常见。
*# 剪接供体位点与初级转录本上游的剪接受体位点连接，产生环状转录本。

* 大多数circRNA的低丰度和缺乏序列保守性支持了环化转录本是不完美剪接的副产物的观点，但也受到了挑战。
* 除此之外，Alu序列的存在被认为对于circRNA的形成是有帮助的。与形成circRNA的第一个和最后一个外显子相邻的蛋白质编码基因的侧翼内含子中Alu元件的存在可通过RNA互补的方式促进环化。RNA编辑也可以影响这一过程，从A到I的编辑可能由于互补配对的因素减少circRNA的形成。
* circRNA已被发现可以充当miRNA海绵，一个典型的例子便是CDR1as/CiRS-7，CDR1as/CiRS-7在人类基因组CDR1位点反义编码（因此称为CDR1as），并靶向miR-7（因此称为CiRS-7-miR-7的圆形RNA海绵）。它具有超过60个miR-7结合位点，远远多于任何已知的线性miRNA海绵。另一种值得注意的圆形miRNA海绵是SRY。 SRY在小鼠睾丸中高度表达，起到miR-138海绵的作用。在基因组中，SRY两侧是长度超过15.5kb的长反向重复序列（IR）。当删除一个或两个IR时，不会发生环化。正是这一发现引入了反向重复序列实现环化的想法。由于环状RNA海绵具有高表达水平、稳定性和大量miRNA结合位点的特点，因此它们可能是比线性RNA更有效的海绵。
* circRNA的其他潜在功能如：
** 与RNA 结合蛋白（RBP）和除miRNA外的 RNA结合，形成 RNA-蛋白质复合物。这些复合物可以调节RBP和RNA与基因或病毒感染的典型线性转录物的相互作用。
** 蛋白质翻译。含有IRES（内部核糖体进入位点）的合成circRNA在体外可以产生蛋白质产物，而没有IRES的合成circRNA则不会，但包含翻译“起始密码子”的天然circRNA均未与核糖体结合，这表明许多circRNA可能无法在体内翻译。
** 在细胞内运输miRNA。CiRS-7可以被miR-671切割的事实表明可能存在一个在适当的时间释放“负载”miRNA的系统。
** 通过有限的碱基配对调节细胞中的mRNA。
* 需要注意的是，很多单链RNA分子（如类病毒、丁型肝炎病毒等）也被认为属于circRNA这一类分子。我们所熟知的II类内含子在剪接过程中会产生套索样内含子RNA，通常，内含子会脱支并迅速降解。然而，脱支失败可能导致环状内含子长非编码RNA（也称为 ciRNA）的形成。CiRNA与circRNA不同，因为它们主要存在于细胞核而不是细胞质中。此外，这些分子含有很少（如果有的话）的miRNA结合位点。ciRNA似乎不是充当海绵，而是调节其亲代基因的表达（有关类病毒的知识，敬请参阅[[病毒分类整理]]）。

== 参考文献 ==
* 《Molecular Biology of the Cell》第7章
* 《Molecular Biology of the Gene》第20章
*Circular RNA -- Wikipedia

重要的同源器官

2024-05-05T08:06:56Z

Rubisco：/* 脊椎动物 */

==脊椎动物==
===骨===
====咽颅====
{| class="wikitable sortable"
|-
!
!软骨鱼类
!硬骨鱼类!!两栖类!!爬行类!!鸟类!!哺乳类
|-
|第一咽弓
（颌弓）
|腭方软骨（上颌）
麦氏软骨（下颌）
|腭骨与方骨
关节骨
|腭骨与方骨
关节骨
|腭骨与方骨
关节骨
|腭骨与方骨
关节骨
|方骨变为砧骨
关节骨变为锤骨

腭骨与前颌骨、颌骨变为假颚
|-
|第二咽弓
（舌弓）
|舌颌软骨
角舌软骨

基舌软骨
|舌颌骨和续骨
角舌骨

基舌骨
|耳柱骨
角舌骨

基舌骨
|耳柱骨
角舌骨

基舌骨
|耳柱骨
角舌骨

基舌骨
|镫骨
角舌骨

基舌骨
|-
|第三咽弓
|鳃弓
|鳃弓||舌骨||舌骨||舌骨||舌骨
|-
|第四咽弓
|鳃弓
|鳃弓
|舌骨
|舌骨
|舌骨
|甲状软骨
|-
|第五咽弓
|鳃弓
|鳃弓
|喉头软骨
|喉头软骨
|喉头软骨
|喉头软骨
|-
|第六咽弓
|鳃弓
|鳃弓
|消失
|消失
|消失
|消失
|-
|第七咽弓
|鳃弓
|鳃弓
|消失
|消失
|消失
|消失
|-
|}
'''咽囊'''

演化中的咽囊（pharyngeal pouches）来自胚胎发育过程中的原肠胚期之后的结构形成阶段。在脊椎动物胚胎发育的第四周左右，原始咽（pharyngeal arches）区域会经历复杂的形态变化。在这个阶段，随着前肠头部的扩大并形成背腹扁平的结构，咽部两侧会外凸出多个成对的囊状结构，这些就是咽囊。

咽囊的形成与鳃弓（branchial arches）的发育紧密相关，它们共同参与了呼吸系统、循环系统、消化系统以及某些内分泌器官的起源。

- 在人类和其他陆生脊椎动物中，虽然鳃弓和咽囊原本与鳃的形成有关，但在进化过程中，大多数直接与鳃功能相关的结构退化，而转变成了其他适应陆地生活的器官。

因此，咽囊并非来源于现存的成人解剖结构，而是胚胎早期发育阶段的原始结构，并在此基础上演化出了多种多样成熟的器官。

在演化的过程中，咽囊经历了显著的变化。首先，原始咽头端有口咽膜封闭，尾段与食管相通。随着时间的推移，咽的两侧壁内胚层向外膨出，形成了5对咽囊，这些咽囊与鳃沟相对应。

具体来看每一对咽囊的演化：

第一对咽囊：外侧份膨大，形成中耳鼓室；内侧份伸长，演化为咽鼓管。这对咽囊的演化与听觉器官的形成密切相关。

第二对咽囊：外侧份退化；内侧份残留的浅窝演化为腭扁桃体窝，其内胚层上皮分化为扁桃体的表面上皮。腭扁桃体在免疫系统中扮演着重要角色。

第三对咽囊：腹侧份上皮参与形成胸腺原基，分化为胸腺的上皮性网状细胞；背侧份分化为下一对甲状旁腺。这对咽囊的演化与内分泌和免疫系统的发育有关。

第四对咽囊：腹侧份退化；背侧份分化为上一对甲状旁腺。这进一步强调了咽囊在内分泌系统发育中的重要性。

第五对咽囊：形成后鳃体，其部分细胞迁入甲状腺内，分化为滤泡旁细胞。这体现了咽囊在甲状腺发育中的贡献。

此外，咽囊的内胚层和鳃沟的外胚层互相贴附，并形成双层薄膜——鳃膜，以致将咽囊和鳃沟分隔开。这种结构在咽囊的演化过程中起到了重要作用。

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表观遗传疾病

2024-03-17T05:03:09Z

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== 总论 ==
* 一般地，有性生殖中子代基因的表达不受基因来自父方或母方的影响。
* 但是，根据基因的表观修饰，细胞仍然能分辨基因来自父方还是母方，对少数基因细胞会根据此信息调节其表达。
* 表观修饰参与多种疾病，主要方式有：
*# 父方或母方不正确地修饰基因，造成某一基因表达过多或过少。
*# 表观修饰抑制了同一基因的父方拷贝或母方拷贝的表达，此时若另一拷贝是隐性突变，则它变为显性突变。

== 普拉德-威利综合征和天使症候群 ==
* 普拉德-威利综合征（Prader-Willi Syndrome，PWS）和天使症候群（Angelman Syndrome，AS）都是由于15号染色体长臂的一段表达异常，但前者源于父方拷贝异常，后者源于母方拷贝异常。
* 细胞识别此段基因来源的依据是DNA甲基化。
* PWS的症状主要都是中枢神经（特别是下丘脑）发育不完善引起的，如身材矮小、暴饮暴食（感受不到饱）、性发育滞后、松软儿（肌张力低下）、智力低下。
* AS的主要症状是智力严重低下，目光呆滞，行为像木偶。（但肌张力升高，无暴饮暴食和性发育滞后）
* AS患者常有舌头伸出大笑的表情。
* AS一般认为是UBE3A基因引起的，它在脑中只有母方拷贝表达；PWS一般认为是多种基因共同作用的结果。
* 两种疾病中，70%的患者是由于15q11-13丢失，而剩下的30%发病原因复杂，主要有：
** 单亲二体（Uniparental Disomy）：两条15号染色体都来自父方或都来自母方，相当于另一方的拷贝丢失。
** 15号染色体的印迹中心（Imprinting Center）丢失：
*** 带有此类亲代印记的基因通常三五成群。
*** 每个群体有一小段特殊的序列，称为印迹中心。
*** 亲代的印迹中心丢失，会造成产生生殖细胞时整个群体的基因不被甲基化。
** UBE3A本身变异产生AS。（此发现使人们最终确定UBE3A是造成AS的元凶；而对PWS从未发现唯一的产生疾病的变异，因此认为它是多种基因共同作用的结果）

== 新生儿短暂性糖尿病 ==
* 部分婴儿出生时胰岛不能产生胰岛素，导致高血糖，而出生几周至几个月后胰岛恢复正常，到中年时又出现轻微糖尿病（不需治疗），此疾病称为新生儿短暂性糖尿病（Transient Neonatal Diabetes Mellitus，TNDM）。
* TNDM既可能是偶发的也可能是遗传的，偶发病例几乎都是6号染色体单亲二体引起的。
* 遗传病例中，只有父方能将此疾病传给后代。
* 研究显示，TNDM的遗传基础是来自父方的6q24中的一段重复。
* 这一段中包含基因ZAC，它的主要功能是抑制肿瘤细胞生长，ZAC基因重复时会抑制部分正常细胞分裂。

== Beckwith-Wiedmann综合征（BWS） ==
* BWS的主要症状是胎儿生长过速、器官肥大、易产生肿瘤、巨舌（Macroglossia）、脐突出（Omphalocele）
* BWS主要发病原因是11p15的两个拷贝都被细胞认为源于父方。（此区域包含胰岛素样生长因子II（IGF2），它的过量表达是生长过速主要原因）
* 类似上文，一种原因是11号染色体单亲二体。
* 类似PWS/AS，细胞识别基因来源的方式仍是根据DNA甲基化，控制甲基化的方式仍是利用印迹中心。
* 11p15处有两个印迹中心，分别在H19基因的上游（控制H19 DMR）和KCNQ1基因的内含子中（控制KvDMR1）。
* H19印迹中心在母方无甲基化，有绝缘子（Insulator）的功能。（绝缘子，即能阻止强化子与启动子结合的序列）；它在父方被甲基化，失去此功能。
* 母方的H19印迹中心能和CTCF蛋白结合，抑制IGF2基因的表达，但不影响H19基因的表达。
* 父方的H19印迹中心被甲基化，会直接抑制H19基因表达，但它不和CTCF蛋白结合，因而不影响IGF2基因表达。
* KvDMR1印迹群的基因较多，其工作方式尚未被确定。
* 两个印迹中心的异常对应两种BWS，只有第一种容易产生肿瘤。

== 假性甲状旁腺功能减退及相关疾病 ==
* 假性甲状旁腺功能减退（Pseudohypoparathyroidism，PHPT）和糖尿病类似，它是细胞对甲状旁腺激素不反应引起的，患者血浆中甲状旁腺激素很高，但仍然低血钙。（参考[[钙磷激素]]）
* PHPT的相关疾病有PHPT1a、PHPT1b、PHPT1c、PPHPT、PHPT2、AHO等。
* PHPT的发病原因主要是甲状旁腺激素受体所需的一种G蛋白亚基Gsα表达异常。
* Gsα所在的基因是GNAS，位于20q13，与该亚基偶联的酶是腺苷酸环化酶（Adenylyl Cyclase）。
* GNAS基因结构极为复杂，有4个启动子，第一个外显子的切割方式也不同，导致产物不同。
* 从最上游的启动子转录，会产生NESP55蛋白（和Gsα完全无关，因为剪切时Gsα的序列被作为内含子切去了），只有母方拷贝表达。（父方拷贝中此启动子被甲基化）
* 从第二个启动子转录，会产生XLαs蛋白，它是Gsα在N端加上一段肽链，与NESP55恰好相反，只在父方拷贝表达。（母方拷贝中此启动子被甲基化）
* G蛋白亚基使用第三个启动子，一般组织中两个拷贝都可表达，在甲状腺中主要是母方表达，在肾的近端小管、垂体、卵巢中几乎只有母方表达，这一区分是由与第一个外显子结合的核小体的H3K4甲基化程度不同引起的。
* 此外还有2个启动子，转录的RNA分别称为A/B和反义GNAS，都只在父方拷贝表达。
* GNAS基因区域的印迹中心在第三个启动子上游。
* 若任意一个Gsα的拷贝变异，则出现AHO（Albright's Hereditary Osteodystrophy，奥耳布赖特氏遗传性骨失养症），症状有又矮又胖、短指（趾）（Brachydactyly）、皮下骨化（Subcutaneous Ossification）、神经缺陷、血红细胞（一般组织）中Gsα表达下降。
* 若变异的拷贝来自母方，则不但出现AHO，还出现PHPT，此疾病称为PHPT1a。
* 若变异的拷贝来自父方，则出现AHO但不出现PHPT，此疾病称为PPHPT（Pseudopseudohypoparathyroidism，双假性甲状旁腺功能减退）。
* 若由于单亲二体、印迹中心丢失（更常见）等原因，细胞把两个拷贝都当成源自父方，则一般组织中Gsα表达正常，不出现AHO，但少数组织中Gsα不表达，出现PHPT，此疾病称为PHPT1b。
* 部分PHPT患者症状与PHPT1a一致，但血红细胞中Gsα表达正常，原因被认为是C端丢失若干个残基，影响Gsα与受体的其它亚基结合，此疾病称为PHPT1c，有人认为应将它归入PHPT1a。
* 部分PHPT患者的发病原因不是GNAS基因出现问题，而是甲状旁腺激素信号通路下游出现问题，此疾病称为PHPT2。

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细菌染色法

2024-03-17T04:57:41Z

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== 总论 ==
* 细菌有多种染色方法，其中最重要的是革兰氏染色法（Gram's Stain）。
* 染色可分为正染（Positive Staining）和负染（Negative Staining）：
** 正染：对细菌的细胞进行染色，环境不被染色。
** 负染：对细菌生活的环境进行染色，细胞不被染色。
* 正染的染料与细胞可通过离子键、共价键、疏水键结合。
* 最常用的正染染料通过离子键与细胞结合，分为酸性染料、碱性染料。
** 酸性染料：伊红（Eosin）、二碘曙红（玫瑰红，Rose Bengal）、酸性品红（Acid Fuchsin）。
** 碱性染料：亚甲蓝（Methylene Blue）、碱性品红（Basic Fuchsin）、结晶紫（龙胆紫，Crystal Violet）、番红（Safranin）、品绿（孔雀绿，Malachite Green）。
* 只使用一种染料的染色方法称为简单染色（Simple Stain）。
* 使用多种染料分类染色的方法称为分化染色（Differential Stain）。
* 常见的分化染色：革兰氏染色、抗酸染色（Acid-fast Stain）。
* 有些染色方法专门用于染色特定结构：
** 荚膜染色法（Capsule Staining）：用墨汁（India Ink）或苯胺黑（Nigrosin）染色，背景比荚膜染色较深，属于负染。（观察硫细菌细胞内的硫颗粒亦可用此法）
** 芽孢染色法（Endospore Staining）：一般用Schaeffer-Fulton法。将细菌与品绿共热，用水脱染，用番红复染，属于正染，分化染色。
** 鞭毛染色法（Flagellate Staining）：用铝钾矾（硫酸铝钾）或鞣酸（Tannic Acid）包裹鞭毛（增粗），然后用副蔷薇苯胺（副玫瑰红，Pararosaniline）或碱性品红染色，属于正染。

== 固定细胞 ==
* 给细菌染色的第一步是固定细胞。
* 固定细胞的方法有：热固定法（Heat Fixation）、化学固定法（Chemical Fixation）。
* 热固定法：将细胞薄层在本生灯（Bunsen Burner）上微热，会破坏细胞内部结构。（较常用）
* 化学固定法：在细胞薄层上滴加乙醇、乙酸、氯化汞、乙醛或戊二醛，不会破坏细胞内部结构。

== 革兰氏染色 ==
由Gram发明，用于区别革兰氏阴性和阳性菌。
=== 实验过程 ===
# 用革兰氏阳性菌（如葡萄球菌）或革兰氏阴性菌（如大肠杆菌）接种
# 等待载玻片风干。（约5-10分钟，不能加热，否则破坏细菌）
# 载玻片干后，用镊子夹住载玻片快速通过本生灯火焰2-3次，微热固定细菌。（载玻片底部摸起来不能烫）
# 初染：将载玻片用结晶紫完全覆盖，静置6-30 s，倒掉染料，用蒸馏水冲洗5秒。（细菌已被固定，不需担心细菌流失）
# 媒染：将载玻片用碘液完全覆盖，静置12-60 s，倒掉染料，用蒸馏水冲洗5秒。（革兰氏阳性菌中，碘和结晶紫组成复合体，卡在细胞壁和内膜之间）
# 脱染：将载玻片用镊子斜45°夹住，滴加丙酮或乙醇，至不再滴出紫色染料，立刻用蒸馏水冲洗。（本步时间很关键，最好1-2 s，最多5 s）
# 复染：将载玻片用番红或其它染料完全覆盖，静置10-30 s，倒掉染料，用蒸馏水冲洗。
# 用纸巾吸去载玻片上的水。（但不能擦拭）
# 在显微镜下观察结果。（最好用油浸润显微镜）

=== 实验结果 ===
* 被染成紫色的细菌称为革兰氏阳性菌（Gram-positive Bacteria）。
* 被染成红色的细菌称为革兰氏阴性菌（Gram-negative Bacteria）。
* 大多数革兰氏阳性菌属于厚壁菌门（Firmicutes）和放线菌门（Actinobacteria）。
* 支原体（Mycoplasma）属于厚壁菌门，却是革兰氏阴性菌。
* 奇异球菌（Deinococcus）不属于上述两个门，却是革兰氏阳性菌。
* 实验结果错误的三个关键原因：
** 细菌培养时间过长，革兰氏阳性菌会变成阴性菌。（原因不明）
** 脱染时间过长，革兰氏阳性菌会呈现阴性菌。
** 被染色的细菌悬浮液过浓，染色会不均匀。（培养基中的悬浮液一般很稀，不用担心此问题）

== 抗酸染色法 ==

=== 实验过程 ===
# 在载玻片上准备材料，参考革兰氏染色。
# 初染：将载玻片用碳酸复红（Carbofuchsin）覆盖3-5 min，不用加热，然后冲洗。
# 脱染：滴加酒精-HCl溶液，10-30 s后冲洗。
# 复染：滴加甲基蓝，20-30 s后冲洗。
# 干燥后在油浸润显微镜下观察。

=== 实验结果 ===
* 分枝杆菌、诺卡氏菌被染为粉红色，其它细菌被染为蓝色。

== 细菌细胞结构染色法 ==

=== 荚膜染色法 ===
* 在载玻片上滴一滴细菌悬浮液，再滴一滴墨汁。
* 推片
* 在显微镜下寻找，可找到黑色背景下荚膜呈现白色。
* 因为这个过程不会杀死细菌，观察结束后要高温处理载玻片。

=== 芽孢染色法 ===
* 常规涂片，待干燥后，在火焰上过3次以固定。
* 滴加3-4滴A液于已固定的涂片上。
* 用木夹夹住载玻片在火焰上持续加热6-8s，使染液冒蒸汽且不会沸腾。
* 待玻片冷却后，倾去染液，水洗至不再褪色为止。
* 用B液复染1min，水洗至水为无色。待干燥后，至油镜观察，芽孢呈绿色，菌体呈红色。

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2023诺贝尔生理学或医学奖简介

2024-03-16T14:57:30Z

Rubisco：

Karikó 和 Weissman 因证明⽤修饰的核苷碱基产⽣的 mRNA 可以逃避先天免疫识别并改善蛋⽩质表达，对mRNA疫苗的生产起到了巨大的贡献，被授予2023诺贝尔生理学或医学奖。

== 疫苗的分类 ==

目前的疫苗可分为以下几种：

* 减毒疫苗：透过减少病原体的毒力，但仍保持它活性的疫苗。其采用感染因子，借由改变使病毒变得无害或降低毒性。
* 灭活疫苗：即将病原微生物灭活后保留全微生物体做成的疫苗。
* 类毒素疫苗：病原体毒素经热处理或化学处理后被破坏或弱化，进而制成疫苗。
* 结合型疫苗是一种将弱抗原以强抗原作为载体结合制成的疫苗。混合两者的目的是使免疫系统对弱抗原产生更强的反应。
* 核酸疫苗：最初，DNA 疫苗被认为⽐ mRNA 疫苗更有前景，因为 DNA 更稳定。然⽽进展缓慢。⼀个可能的原因是注射的 DNA 必须穿过质膜和核膜这两个屏障，才能到达发⽣转录的细胞核。相⽐之下，基于 mRNA 的疫苗只需要进⼊发⽣翻译的细胞质，从⽽使递送更容易。

== mRNA疫苗的优点 ==

mRNA 不会整合到基因组中，从而消除了对插入突变的担忧。mRNA 疫苗可以以无细胞方式制造，从而实现快速、可扩展且经济高效的生产。例如，一个5升生物反应器可以在一次反应中生产近一百万剂 mRNA 疫苗。此外，单一 mRNA 疫苗可以编码多种抗原，增强针对弹性病原体的免疫反应，并能够用单一制剂靶向多种微生物或病毒变体。mRNA 疫苗的序列可以很容易进行改造，因此可以快速针对新出现的病毒变异株开发新的疫苗。

== mRNA设计和合成原理 ==

mRNA 疫苗包含合成的 mRNA 分子，可指导产生免疫反应的抗原。体外转录 (IVT) mRNA 模仿内源 mRNA 的结构，有五个部分，从 5′到 3′：5′帽子、5′非翻译区 (UTR)、编码抗原的开放阅读框、3′UTR 和poly (A) 尾部。与哺乳动物一样，5' 端的第一个或第二个核苷酸在核糖的 2' 羟基上被甲基化（2'- O-甲基化），这可以防止病毒 RNA 被胞质传感器识别，从而防止意外的免疫反应。来自高度表达基因（例如 α 和 β 珠蛋白基因）的天然 UTR 是合成 mRNA 的首选。这些工程化的 UTR 序列通过排除 3' UTR 中的miRNA 结合位点和 AU 丰富区域，最大限度地减少 mRNA 降解。此外，它们还最大限度地减少了阻止核糖体扫描 mRNA 转录物的区域，例如 5' UTR 中具有二级和三级结构（例如发夹）的序列。

为了最大化翻译，mRNA 序列通常掺入修饰的核苷，例如假尿苷、N1-甲基假尿苷或其他核苷类似物。由于所有天然 mRNA 都包含修饰的核苷，因此免疫系统已经进化到能够识别未修饰的单链 RNA，这是病毒感染的标志。具体而言，未修饰的 mRNA 可被模式识别受体识别，例如 Toll 样受体 3 (TLR3)、TLR7 和 TLR8，以及视黄酸诱导基因 I (RIGI) 受体。TLR7 和 TLR8 受体与 mRNA 中富含鸟苷或尿苷的区域结合，触发 I 型干扰素（例如 IFNα）的产生，从而阻断 mRNA 翻译。使用修饰的核苷，特别是修饰的尿苷，可防止模式识别受体的识别，从而实现足够水平的翻译以产生预防量的蛋白质。

IVT mRNA 的一种变异，即自扩增 mRNA，也包含编码 RNA 依赖性 RNA 聚合酶的复制酶基因。病毒衍生的聚合酶在细胞内扩增 mRNA 转录物，从而能够以更少的 mRNA 剂量表达大量抗原。

(1) 一旦病原体的基因组被测序，就可以设计目标抗原的序列并将其插入质粒 DNA 构建体中。(2) 质粒 DNA 在体外通过T7噬菌体RNA聚合酶（也可以使用T3和SP6聚合酶）转录为 mRNA，(3) 通过高效液相色谱 (HPLC) 纯化 mRNA 转录物以去除污染物和反应物。(4)纯化的mRNA与脂质在微流体混合器中混合，形成脂质纳米颗粒。快速混合导致脂质瞬间封装 mRNA 并沉淀为自组装纳米颗粒。(5)透析或过滤纳米颗粒溶液以除去非水溶剂和任何未封装的mRNA，(6)将过滤的mRNA疫苗溶液储存在无菌小瓶中。

== mRNA 疫苗的递送载体 ==

由于 mRNA 较大且带负电荷，因此无法穿过细胞膜的阴离子脂质双层。此外，在体内，它被先天免疫系统的细胞吞噬并被核酸酶降解。包括电穿孔、基因枪和离体转染在内的各种技术可以在培养皿中在细胞内递送mRNA。然而，体内应用需要使用转染免疫细胞的mRNA递送载体，而不会引起毒性或不需要的免疫原性。我们有如下方法：

=== 脂质纳米颗粒 ===

基于脂质的纳米颗粒是临床上最先进的 mRNA 递送载体。截至 2021 年 6 月，所有正在开发或批准用于临床的 SARS-CoV-2 mRNA 疫苗均采用脂质纳米颗粒 (LNP)。LNP 为 mRNA 递送提供了许多好处，包括易于配制、模块化、生物相容性和大 mRNA 有效负载能力。除了RNA药物之外，LNP通常还包括四种成分：可电离脂质（最为重要）、胆固醇、辅助磷脂和聚乙二醇化脂质，它们一起封装并保护脆弱的mRNA核心。可电离脂质如含有多环金刚烷尾部（例如 11-AM）或含有环状咪唑头（例如 93-O17S）的脂质已被设计用于靶向体内 T 细胞。辅助脂质通过促进脂质相变来调节纳米颗粒的流动性并增强功效，从而有助于与胞内体的膜融合。聚乙二醇化脂质成分由与锚定脂质（例如 DMPE 或 DMG）缀合的聚乙二醇 (PEG) 组成。亲水性 PEG 可以稳定 LNP，通过限制脂质融合来调节纳米颗粒尺寸并通过减少与巨噬细胞的非特异性相互作用来延长纳米颗粒半衰期。

=== 聚合复合物和聚合物纳米颗粒 ===

尽管不如 LNP 先进，但聚合物具有与脂质类似的优势，并能有效递送 mRNA 。阳离子聚合物将核酸凝结成复合物，称为聚合复合物，其具有各种形状和大小，可以通过内吞作用被吸收到细胞中。聚乙烯亚胺是研究最广泛的核酸递送聚合物。尽管其功效非常出色，但其应用受到毒性的限制。

=== 基于肽的输送系统 ===

除了基于脂质和聚合物的载体之外，肽还可以将 mRNA 递送到细胞中，这要归功于其主链和侧链中的阳离子或两亲基团（例如精氨酸残基），这些基团与 mRNA 静电结合并形成纳米复合物。例如，含有重复精氨酸-丙氨酸-亮氨酸-丙氨酸（RALA）基序的融合细胞穿透肽可将 mRNA 递送至树突状细胞（免疫系统的专业抗原呈递细胞）以引发 T 细胞介导的免疫。还有一种市售的细胞穿透肽 PepFect14，可将 mRNA 递送至小鼠异种移植模型中的卵巢癌细胞。

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*生物化学
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*微生物学
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== 题目 ==

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2023诺贝尔生理学或医学奖简介

2024-03-16T14:55:36Z

Rubisco：/* 脂质纳米颗粒 */

= 2023诺贝尔生理学或医学奖简介 =

Karikó 和 Weissman 因证明⽤修饰的核苷碱基产⽣的 mRNA 可以逃避先天免疫识别并改善蛋⽩质表达，对mRNA疫苗的生产起到了巨大的贡献，被授予2023诺贝尔生理学或医学奖。

== 疫苗的分类 ==

目前的疫苗可分为以下几种：

* 减毒疫苗：透过减少病原体的毒力，但仍保持它活性的疫苗。其采用感染因子，借由改变使病毒变得无害或降低毒性。
* 灭活疫苗：即将病原微生物灭活后保留全微生物体做成的疫苗。
* 类毒素疫苗：病原体毒素经热处理或化学处理后被破坏或弱化，进而制成疫苗。
* 结合型疫苗是一种将弱抗原以强抗原作为载体结合制成的疫苗。混合两者的目的是使免疫系统对弱抗原产生更强的反应。
* 核酸疫苗：最初，DNA 疫苗被认为⽐ mRNA 疫苗更有前景，因为 DNA 更稳定。然⽽进展缓慢。⼀个可能的原因是注射的 DNA 必须穿过质膜和核膜这两个屏障，才能到达发⽣转录的细胞核。相⽐之下，基于 mRNA 的疫苗只需要进⼊发⽣翻译的细胞质，从⽽使递送更容易。

== mRNA疫苗的优点 ==

mRNA 不会整合到基因组中，从而消除了对插入突变的担忧。mRNA 疫苗可以以无细胞方式制造，从而实现快速、可扩展且经济高效的生产。例如，一个5升生物反应器可以在一次反应中生产近一百万剂 mRNA 疫苗。此外，单一 mRNA 疫苗可以编码多种抗原，增强针对弹性病原体的免疫反应，并能够用单一制剂靶向多种微生物或病毒变体。mRNA 疫苗的序列可以很容易进行改造，因此可以快速针对新出现的病毒变异株开发新的疫苗。

== mRNA设计和合成原理 ==

mRNA 疫苗包含合成的 mRNA 分子，可指导产生免疫反应的抗原。体外转录 (IVT) mRNA 模仿内源 mRNA 的结构，有五个部分，从 5′到 3′：5′帽子、5′非翻译区 (UTR)、编码抗原的开放阅读框、3′UTR 和poly (A) 尾部。与哺乳动物一样，5' 端的第一个或第二个核苷酸在核糖的 2' 羟基上被甲基化（2'- O-甲基化），这可以防止病毒 RNA 被胞质传感器识别，从而防止意外的免疫反应。来自高度表达基因（例如 α 和 β 珠蛋白基因）的天然 UTR 是合成 mRNA 的首选。这些工程化的 UTR 序列通过排除 3' UTR 中的miRNA 结合位点和 AU 丰富区域，最大限度地减少 mRNA 降解。此外，它们还最大限度地减少了阻止核糖体扫描 mRNA 转录物的区域，例如 5' UTR 中具有二级和三级结构（例如发夹）的序列。

为了最大化翻译，mRNA 序列通常掺入修饰的核苷，例如假尿苷、N1-甲基假尿苷或其他核苷类似物。由于所有天然 mRNA 都包含修饰的核苷，因此免疫系统已经进化到能够识别未修饰的单链 RNA，这是病毒感染的标志。具体而言，未修饰的 mRNA 可被模式识别受体识别，例如 Toll 样受体 3 (TLR3)、TLR7 和 TLR8，以及视黄酸诱导基因 I (RIGI) 受体。TLR7 和 TLR8 受体与 mRNA 中富含鸟苷或尿苷的区域结合，触发 I 型干扰素（例如 IFNα）的产生，从而阻断 mRNA 翻译。使用修饰的核苷，特别是修饰的尿苷，可防止模式识别受体的识别，从而实现足够水平的翻译以产生预防量的蛋白质。

IVT mRNA 的一种变异，即自扩增 mRNA，也包含编码 RNA 依赖性 RNA 聚合酶的复制酶基因。病毒衍生的聚合酶在细胞内扩增 mRNA 转录物，从而能够以更少的 mRNA 剂量表达大量抗原。

(1) 一旦病原体的基因组被测序，就可以设计目标抗原的序列并将其插入质粒 DNA 构建体中。(2) 质粒 DNA 在体外通过T7噬菌体RNA聚合酶（也可以使用T3和SP6聚合酶）转录为 mRNA，(3) 通过高效液相色谱 (HPLC) 纯化 mRNA 转录物以去除污染物和反应物。(4)纯化的mRNA与脂质在微流体混合器中混合，形成脂质纳米颗粒。快速混合导致脂质瞬间封装 mRNA 并沉淀为自组装纳米颗粒。(5)透析或过滤纳米颗粒溶液以除去非水溶剂和任何未封装的mRNA，(6)将过滤的mRNA疫苗溶液储存在无菌小瓶中。

== mRNA 疫苗的递送载体 ==

由于 mRNA 较大且带负电荷，因此无法穿过细胞膜的阴离子脂质双层。此外，在体内，它被先天免疫系统的细胞吞噬并被核酸酶降解。包括电穿孔、基因枪和离体转染在内的各种技术可以在培养皿中在细胞内递送mRNA。然而，体内应用需要使用转染免疫细胞的mRNA递送载体，而不会引起毒性或不需要的免疫原性。我们有如下方法：

=== 脂质纳米颗粒 ===

基于脂质的纳米颗粒是临床上最先进的 mRNA 递送载体。截至 2021 年 6 月，所有正在开发或批准用于临床的 SARS-CoV-2 mRNA 疫苗均采用脂质纳米颗粒 (LNP)。LNP 为 mRNA 递送提供了许多好处，包括易于配制、模块化、生物相容性和大 mRNA 有效负载能力。除了RNA药物之外，LNP通常还包括四种成分：可电离脂质（最为重要）、胆固醇、辅助磷脂和聚乙二醇化脂质，它们一起封装并保护脆弱的mRNA核心。可电离脂质如含有多环金刚烷尾部（例如 11-AM）或含有环状咪唑头（例如 93-O17S）的脂质已被设计用于靶向体内 T 细胞。辅助脂质通过促进脂质相变来调节纳米颗粒的流动性并增强功效，从而有助于与胞内体的膜融合。聚乙二醇化脂质成分由与锚定脂质（例如 DMPE 或 DMG）缀合的聚乙二醇 (PEG) 组成。亲水性 PEG 可以稳定 LNP，通过限制脂质融合来调节纳米颗粒尺寸并通过减少与巨噬细胞的非特异性相互作用来延长纳米颗粒半衰期。

=== 聚合复合物和聚合物纳米颗粒 ===

尽管不如 LNP 先进，但聚合物具有与脂质类似的优势，并能有效递送 mRNA 。阳离子聚合物将核酸凝结成复合物，称为聚合复合物，其具有各种形状和大小，可以通过内吞作用被吸收到细胞中。聚乙烯亚胺是研究最广泛的核酸递送聚合物。尽管其功效非常出色，但其应用受到毒性的限制。

=== 基于肽的输送系统 ===

除了基于脂质和聚合物的载体之外，肽还可以将 mRNA 递送到细胞中，这要归功于其主链和侧链中的阳离子或两亲基团（例如精氨酸残基），这些基团与 mRNA 静电结合并形成纳米复合物。例如，含有重复精氨酸-丙氨酸-亮氨酸-丙氨酸（RALA）基序的融合细胞穿透肽可将 mRNA 递送至树突状细胞（免疫系统的专业抗原呈递细胞）以引发 T 细胞介导的免疫。还有一种市售的细胞穿透肽 PepFect14，可将 mRNA 递送至小鼠异种移植模型中的卵巢癌细胞。

2023诺贝尔生理学或医学奖简介

2024-03-16T14:55:20Z

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= 2023诺贝尔生理学或医学奖简介 =

Karikó 和 Weissman 因证明⽤修饰的核苷碱基产⽣的 mRNA 可以逃避先天免疫识别并改善蛋⽩质表达，对mRNA疫苗的生产起到了巨大的贡献，被授予2023诺贝尔生理学或医学奖。

== 疫苗的分类 ==

目前的疫苗可分为以下几种：

* 减毒疫苗：透过减少病原体的毒力，但仍保持它活性的疫苗。其采用感染因子，借由改变使病毒变得无害或降低毒性。
* 灭活疫苗：即将病原微生物灭活后保留全微生物体做成的疫苗。
* 类毒素疫苗：病原体毒素经热处理或化学处理后被破坏或弱化，进而制成疫苗。
* 结合型疫苗是一种将弱抗原以强抗原作为载体结合制成的疫苗。混合两者的目的是使免疫系统对弱抗原产生更强的反应。
* 核酸疫苗：最初，DNA 疫苗被认为⽐ mRNA 疫苗更有前景，因为 DNA 更稳定。然⽽进展缓慢。⼀个可能的原因是注射的 DNA 必须穿过质膜和核膜这两个屏障，才能到达发⽣转录的细胞核。相⽐之下，基于 mRNA 的疫苗只需要进⼊发⽣翻译的细胞质，从⽽使递送更容易。

== mRNA疫苗的优点 ==

mRNA 不会整合到基因组中，从而消除了对插入突变的担忧。mRNA 疫苗可以以无细胞方式制造，从而实现快速、可扩展且经济高效的生产。例如，一个5升生物反应器可以在一次反应中生产近一百万剂 mRNA 疫苗。此外，单一 mRNA 疫苗可以编码多种抗原，增强针对弹性病原体的免疫反应，并能够用单一制剂靶向多种微生物或病毒变体。mRNA 疫苗的序列可以很容易进行改造，因此可以快速针对新出现的病毒变异株开发新的疫苗。

== mRNA设计和合成原理 ==

mRNA 疫苗包含合成的 mRNA 分子，可指导产生免疫反应的抗原。体外转录 (IVT) mRNA 模仿内源 mRNA 的结构，有五个部分，从 5′到 3′：5′帽子、5′非翻译区 (UTR)、编码抗原的开放阅读框、3′UTR 和poly (A) 尾部。与哺乳动物一样，5' 端的第一个或第二个核苷酸在核糖的 2' 羟基上被甲基化（2'- O-甲基化），这可以防止病毒 RNA 被胞质传感器识别，从而防止意外的免疫反应。来自高度表达基因（例如 α 和 β 珠蛋白基因）的天然 UTR 是合成 mRNA 的首选。这些工程化的 UTR 序列通过排除 3' UTR 中的miRNA 结合位点和 AU 丰富区域，最大限度地减少 mRNA 降解。此外，它们还最大限度地减少了阻止核糖体扫描 mRNA 转录物的区域，例如 5' UTR 中具有二级和三级结构（例如发夹）的序列。

为了最大化翻译，mRNA 序列通常掺入修饰的核苷，例如假尿苷、N1-甲基假尿苷或其他核苷类似物。由于所有天然 mRNA 都包含修饰的核苷，因此免疫系统已经进化到能够识别未修饰的单链 RNA，这是病毒感染的标志。具体而言，未修饰的 mRNA 可被模式识别受体识别，例如 Toll 样受体 3 (TLR3)、TLR7 和 TLR8，以及视黄酸诱导基因 I (RIGI) 受体。TLR7 和 TLR8 受体与 mRNA 中富含鸟苷或尿苷的区域结合，触发 I 型干扰素（例如 IFNα）的产生，从而阻断 mRNA 翻译。使用修饰的核苷，特别是修饰的尿苷，可防止模式识别受体的识别，从而实现足够水平的翻译以产生预防量的蛋白质。

IVT mRNA 的一种变异，即自扩增 mRNA，也包含编码 RNA 依赖性 RNA 聚合酶的复制酶基因。病毒衍生的聚合酶在细胞内扩增 mRNA 转录物，从而能够以更少的 mRNA 剂量表达大量抗原。

(1) 一旦病原体的基因组被测序，就可以设计目标抗原的序列并将其插入质粒 DNA 构建体中。(2) 质粒 DNA 在体外通过T7噬菌体RNA聚合酶（也可以使用T3和SP6聚合酶）转录为 mRNA，(3) 通过高效液相色谱 (HPLC) 纯化 mRNA 转录物以去除污染物和反应物。(4)纯化的mRNA与脂质在微流体混合器中混合，形成脂质纳米颗粒。快速混合导致脂质瞬间封装 mRNA 并沉淀为自组装纳米颗粒。(5)透析或过滤纳米颗粒溶液以除去非水溶剂和任何未封装的mRNA，(6)将过滤的mRNA疫苗溶液储存在无菌小瓶中。

== mRNA 疫苗的递送载体 ==

由于 mRNA 较大且带负电荷，因此无法穿过细胞膜的阴离子脂质双层。此外，在体内，它被先天免疫系统的细胞吞噬并被核酸酶降解。包括电穿孔、基因枪和离体转染在内的各种技术可以在培养皿中在细胞内递送mRNA。然而，体内应用需要使用转染免疫细胞的mRNA递送载体，而不会引起毒性或不需要的免疫原性。我们有如下方法：

=== 脂质纳米颗粒 ===

于脂质的纳米颗粒是临床上最先进的 mRNA 递送载体。截至 2021 年 6 月，所有正在开发或批准用于临床的 SARS-CoV-2 mRNA 疫苗均采用脂质纳米颗粒 (LNP)。LNP 为 mRNA 递送提供了许多好处，包括易于配制、模块化、生物相容性和大 mRNA 有效负载能力。除了RNA药物之外，LNP通常还包括四种成分：可电离脂质（最为重要）、胆固醇、辅助磷脂和聚乙二醇化脂质，它们一起封装并保护脆弱的mRNA核心。可电离脂质如含有多环金刚烷尾部（例如 11-AM）或含有环状咪唑头（例如 93-O17S）的脂质已被设计用于靶向体内 T 细胞。辅助脂质通过促进脂质相变来调节纳米颗粒的流动性并增强功效，从而有助于与胞内体的膜融合。聚乙二醇化脂质成分由与锚定脂质（例如 DMPE 或 DMG）缀合的聚乙二醇 (PEG) 组成。亲水性 PEG 可以稳定 LNP，通过限制脂质融合来调节纳米颗粒尺寸并通过减少与巨噬细胞的非特异性相互作用来延长纳米颗粒半衰期。

=== 聚合复合物和聚合物纳米颗粒 ===

尽管不如 LNP 先进，但聚合物具有与脂质类似的优势，并能有效递送 mRNA 。阳离子聚合物将核酸凝结成复合物，称为聚合复合物，其具有各种形状和大小，可以通过内吞作用被吸收到细胞中。聚乙烯亚胺是研究最广泛的核酸递送聚合物。尽管其功效非常出色，但其应用受到毒性的限制。

=== 基于肽的输送系统 ===

除了基于脂质和聚合物的载体之外，肽还可以将 mRNA 递送到细胞中，这要归功于其主链和侧链中的阳离子或两亲基团（例如精氨酸残基），这些基团与 mRNA 静电结合并形成纳米复合物。例如，含有重复精氨酸-丙氨酸-亮氨酸-丙氨酸（RALA）基序的融合细胞穿透肽可将 mRNA 递送至树突状细胞（免疫系统的专业抗原呈递细胞）以引发 T 细胞介导的免疫。还有一种市售的细胞穿透肽 PepFect14，可将 mRNA 递送至小鼠异种移植模型中的卵巢癌细胞。

用户讨论:毛蕊花糖

2024-03-16T00:37:08Z

Rubisco：

您好！这个网站还在运作吗？给我带来很大的帮助
* 唔，最近疏于管理，之后会整理整理吧--[[用户:毛蕊花糖|毛蕊花糖]]（[[用户讨论:毛蕊花糖|讨论]]） 2023年3月30日 (四) 23:19 (CST)

哈哈，刚看到您的回复，虽然我已经退役了，非常感谢以您为代表的生竞人对建设生竞的贡献，热爱就是永恒的动力呀

== Q：请问建设这个网站有什么要求吗？：） ==

想要出一份绵薄之力

==最近出现了恶意创建与生物无关的带有广告性质的词条的现象==
[[Pig head for sale‎]]；[[Pork ruffle fat‎]]；[[Best seo service provider in india‎‎]]。
相关编辑人：BestBacklinkservice

维生素与辅酶

2024-03-13T12:41:01Z

Rubisco：

维生素(vitamins)是动物维持正常功能所必需的一类有机化合物，需要量极小，但动物本身不能合成或合成量不足，必须从消化道中获得。各种维生素在化学结构上并无共同性，有脂肪族、芳香族、脂环族、杂环和甾类化合物等。

目前已知为人体所必需的维生素有 14 种，根据溶解度不同分脂溶性维生素和水溶性维生素两类。脂溶性维生素有维生素 A、维生素 D、维生素 E、维生素 K；水溶性维生素有硫胺素（B1）、核黄素（B2）、尼克酸（B3）、泛酸（B5）、吡哆醇（B6）、生物素（B7）、叶酸（B9）、钴胺素（B12）、硫辛酸和维生素 C。

==脂溶性维生素==

脂溶性维生素（fat-soluble vitamins）A、D、E、K 均是异戊二烯或异戊烯的衍生物。它们不溶于水，而溶于脂肪及有机溶剂中，均可在肝、脂肪等组织中贮存，因此只有长期摄入不足才会发生相应的缺乏症。食物中的脂溶性维生素通常与脂质共存，必须和脂类一起吸收，因此影响脂类消化吸收的因素（如胆汁酸缺乏）均可造成脂溶性维生素吸收减少，甚至引起缺乏症。
{| class="wikitable"
|+
!维生素
!别名
!结构
!化学本质
!来源
!功能
!机理
!缺乏症
|-
|VitA
|抗干眼病维生素，视黄醇
|[[文件:维生素A.png|缩略图|180x180像素|(图片来自于网络，侵删)]]
|类异戊二烯，由β-胡萝卜素合成而来
|① 主要来自动物性食物，其中'''肝脏'''(特别是鱼的肝脏)、'''乳制品'''和'''蛋黄'''中含量较多
② 植物不含VA，但含有β-胡萝卜素，以小肠黏膜处经β-胡萝卜素双加氧酶作用下，可生成 2分子视黄醇。但β-胡萝卜素在体内利用率较低
|① 构成与暗视觉相关的感觉物质成分
② 具有脂溶性激素的特性

③ 维持上皮细胞的完整性

④ 促进生长发育和维持生殖功能

⑤ 促进免疫功能

⑥ 抗氧化和抗癌作用

⑦ 参与铁的转动
|②与胞内受体结合，启动某些基因的表达，调节细胞生长分化，抑制角蛋白的合成
③参与糖蛋白和黏多糖的合成，对上皮细胞膜起稳定作用

④参与类固醇激素的合成，促进生长发育

⑤VA与核受体结合后对基因表达的调节可促进B细胞产生抗体、T细胞分泌淋巴因子

⑥VA和β-胡萝卜素都具有氧化作用，能清除自由基

⑦VA控制转铁蛋白的合成，从而控制铁从肝细胞转动至其他细胞
|'''夜盲症'''
|-
|VitD
|抗佝偻病维生素
|[[文件:维生素D.jpg|缩略图|(图片来自于网络，侵删)]]
|类固醇衍生物
有两种形式:VD2(麦角钙化醇)和VD3(胆钙化醇)
|① 动物性食物，植物性食物基本不含VD
② 酵母和植物油中含有能被人体吸收的麦角固醇，经紫外线照射后能转变为VD2

③ 人体内的胆固醇可转变成7-脱氢胆固醇，在皮下经紫外线照射后转化为VD3
|①提高机体对'''钙、磷的吸收'''，使血浆钙和血浆磷的水平达到饱和程度。

②促进'''生长'''和'''骨骼钙化'''，促进'''牙齿健全'''；

③通过'''肠壁'''增加磷的吸收，并通过'''肾小管'''增加磷的再吸收；

④维持血液中'''柠檬酸盐'''的正常水平；

⑤'''防止氨基酸通过肾脏损失'''。　
|①1,25-(OH)2-VitD3与胞内受体(VDR)结合，受体入核，启动下游转录。
②维生素D3能诱导许多动物的肠黏膜产生一种专一的钙结合蛋白(CaBP)，增加动物肠粘膜对钙离子的通透性，促进钙在肠内的吸收。
|'''佝偻病'''
|-
|VitE
|生育酚
|[[文件:维生素Epng.png|缩略图|180x180像素|(图片来自于网络，侵删)]]
|一种酚类物质
|豆类、蔬菜、植物油中含量丰富
|
|
|因VitE含量丰富，不易出现缺乏症. 认为一些'''贫血'''与'''血小板增多症'''与维生素E缺乏有关.
|-
|VitK
|凝血维生素
|[[文件:维生素K.png|缩略图|180x180像素|(图片来自于网络，侵删)]]
|苯骈二氢吡喃的衍生物
|
|
|
|不易出现缺乏症，缺乏时'''易出血'''
|}
==水溶性维生素==

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2024-02-14T01:14:36Z

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==任务==
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用户:Rubisco

2023-11-11T09:23:00Z

Rubisco：创建页面，内容为“*'''语文老师'''：不学语文，你是中国人吗？ *'''我'''：不学生物，你是人吗？”

*'''语文老师'''：不学语文，你是中国人吗？
*'''我'''：不学生物，你是人吗？

RNA的生物合成

2023-07-12T00:42:12Z

Rubisco：/* 分类 */

=概述=
*转录具有选择性和不对称性，一条链为RNA的合成提供模板，称为'''模板链'''(又称无意义链或Waston链)。另一条链与RNA编码信息一致，称为'''编码链'''（又称有意义链和Crick链）
*以四种NTP为原料，还需要镁离子（一个镁离子同NTP进入活性中心，进行静电屏蔽）
*转录不需要引物
*转录方向为5'→3'
*转录的忠实性低于复制，但在特定因子作用下可以发挥校对功能（RNS聚合酶通常无3'外切酶活性）
*有高度的进行性
=RNA聚合酶=
RNA聚合酶是负责在生物体内催化RNA合成的酶，具体信息如下：

==依赖于DNA的RNA聚合酶==
===细菌的RNA聚合酶===
细菌只有一种RNA聚合酶。
*组成：由'''核心酶'''和'''σ因子'''组成全酶。σ因子有种属特异性和条件特异性，以大肠杆菌为例，σ70因子起始大多数转录物的转录，用于大多数启动子的识别，但在特殊情况（如热激情况下，σ24,σ32起始相关基因转录）由其他σ因子起始转录。
*抑制剂：'''利福平（利福霉素）'''作用于β亚基，抑制起始；'''利（迪）链霉素'''作用于β亚基，抑制延伸。
===真核的RNA聚合酶===
====分类====
真核生物的RNA聚合酶可分为三类，分别为'''RNA聚合酶I'''、'''RNA聚合酶II'''和'''RNA聚合酶III'''，另外还有'''细胞器RNA聚合酶'''。
*RNA聚合酶I：位于核仁，起始5.8SrRNA、28SrRNA、18SrRNA（以45SrRNA的形式转录），对α-鹅膏蕈碱不敏感，对放线菌素D高度敏感。
*RNA聚合酶II：位于核质，起始mRNA，lncRNA，多数miRNA，具有帽子结构的snRNA与snoRNA的转录，对α-鹅膏蕈碱最敏感，对放线菌素D轻度敏感。
*RNA聚合酶III：位于核质，起始tRNA，5SrRNA和多种小RNA转录，对α-鹅膏蕈碱中度敏感，对放线菌素D轻度敏感。
*线粒体RNA聚合酶：单体酶，与T7噬菌体同源，由核基因编码，负责mt内全部RNA的合成。
*叶绿体RNA聚合酶：分两种：一种是由核基因编码的单体酶，负责管家基因（包括rRNA）的转录；一种是由cp基因编码的多聚酶，负责光合链上cp自身合成的亚基基因的转录。
细胞器RNA聚合酶对α-鹅膏蕈碱不敏感，对放线菌素D敏感。
*此外，植物细胞还有两种特化的RNA聚合酶II，为RNA聚合酶IV和V，负责转录lncRNA，介导RNA引导的DNA甲基化。
====抑制剂====
*α-鹅膏蕈碱：见上；
*放线菌素D：见上，作用机制为插入DNA双螺旋中的GC碱基对，阻止聚合酶移动。

无脊椎动物比较

2023-05-21T04:15:34Z

Rubisco：/* 节肢动物 */

==神经系统与感觉器官==
===原生动物===
无
===多孔（海绵）动物===
无（存在原始的神经细胞：芒状细胞）
===刺胞（腔肠）动物===
上皮具有神经一样的传导功能，存在非神经的传导。由二极和多极神经细胞组成。腔肠动物没有神经中枢，神经的传导一般是无定向的，因此称为扩散神经系统，传导速度较慢，体现了这种神经系统的原始性。水螅纲的水母形有平衡囊。钵水母纲为触手囊。
===扁形动物===
神经细胞向前集中形成“脑”，向后分出若干纵神经索。纵神经索之间有横神经相连。在高等的种类，纵神经所减少，只有一对腹神经发达，其中有横神经连接如梯形，故称为梯形神经系统。扁形动物出现了原始的神经中枢。（注意：吸虫和绦虫虽然营寄生生活，神经系统退化，但并不是没有。这一点联赛考过！）
*涡虫纲：感觉器官和神经系统较发达，能对外界环境如光线，水流及食物等迅速反应，感觉器官包括眼、耳突、触角、平衡囊等。耳突触角分布有丰富的触觉、化学、水流感受器。平衡囊存在于一些原始的种类，包含在“脑”中。高等的种类中神经索数目减少，两条腹神经所最为发达，和“脑”形成原始的中枢神经系统。

*吸虫纲：神经、感觉器官趋于退化：神经系统由神经节、神经纤维及围绕食道的神经环组成，并有神经支对称分布于虫体各部。

*绦虫纲：头节上的神经节不发达，由此发出的神经索贯穿整个节片，最大的一对神经索是在两纵型排泄管的外侧，节片边缘之内测。没有特殊的感觉器官。

===线虫动物===
体前端存在一个围咽神经环及与之相连的神经节，由围咽神经环向前后各发出若干条神经索，向前的到前端的感觉器，向后端有背、腹、侧神经所其中，以被神经所和副神经所最为发达，分别埋在背线和腹线中。所有的神经索均埋于上皮层中。腰神经节发出尾神经至尾感器。体前端有司触觉的乳突和头感器（化感器，寄生种类常退化），体后端有尾感器。
*无尾感器纲：没有尾感器。

*尾感器纲：全部具有尾感器。

===环节动物===
神经细胞更为集中，中枢神经系统包括一对脑神经节（咽上神经节）、一对围咽神经与一对以愈合的咽下神经节组成。咽下神经节后连腹神经索（有两条纵行的腹神经合并而成）。环节动物的神经系统形似锁链，故又称索式神经系统。环节动物出现了交感神经系统。脑神经节控制全身感觉和运动，又分化为：①前脑：支配口前叶的感受器；②中脑：支配眼和口前叶的触手或触须，还分出交感神经到消化管，控制吻、咽的活动；③后脑：支配化学感受器（项器）。大多数环节动物的腹神经索中存在一种电阻低、兴奋传导快的大直径的巨纤维，可使虫体快速缩短，以逃避敌害，用于逃避反应。环节动物还具有神经分泌细胞（常为单极神经元。），沙蚕脑神经节的分泌细胞能分泌保幼激素，蚯蚓的神经分泌细胞能分泌肾上腺素和奴佛卡因等，对动物的生命活动进行调控。
*多毛纲：大多数具有愈合的一腹神经索，较原始的种类具有双腹神经索和每节一对神经节，在不同种类有不同程度的愈合。

*寡毛纲：感觉器官不发达，体壁上有小凸起一样的体表感觉乳突，有触觉功能；分布在口腔的口腔感觉器有味觉和嗅觉功能；光感受器分布于体表上皮细胞间，在口前叶及前端几节较多，可分辨光的强弱。

*蛭纲：体前、后端神经节愈合，一般前端5对神经节愈合形成咽上神经节和咽下神经节，腹神经索由21对神经节组成，构成躯干神经索，后端的7对神经节愈合形成尾神经节。神经元数目相对少，细胞体较大。

===软体动物===
原始的种类无分化显著的神经节，高等种类的中枢神经系统由脑神经节、足神经节、侧神经节、脏神经节四对神经节及其神经连索组成，这些神经节分别发生神经到身体各处，完成感觉、运动等功能。有些种类的主要神经节集中在一起，形成脑。软体动物还分化出触角、眼、嗅检器、平衡囊、磁受体等感觉器官。
*无板纲：软体动物中最原始的类型，神经系统梯子状，神经节不发达。

*单板纲：神经系统由围食道神经环及向后伸出的侧神经和足神经组成。无眼和嗅检器等器官，体前具一对平衡囊（适应海底生活）。

*多板纲：神经系统较不发达，类似单板类，由围食道神经环与向后伸出的侧神经索和足神经索组成。多数种类在外套腔后端、肛门附近有一对嗅检器。

*腹足纲：腹足类的神经系统包括脑、足、侧、脏'''4'''对基本的神经节。脑神经节位于口球之后，食道背面，由它发出神经支配触手、眼、口等；又分出一对口球神经节，支配口腔及齿舌的运动。足神经节位于食道腹侧、内脏团与足交界处，支配足的运动，两足神经节间有神经索相连，且有神经索与脑神经节相连。侧神经节位于脑后食道两侧，较小，主要支配外套膜及闭壳肌的收缩，也有神经索与脑相连。食道神经节较小。位于侧神经之后，食道的背腹两侧。位于食道之上的称为食道上食经节；食道之下的为食道下神经节。脏神经节位于内脏囊内，侧脏神经节之间有神经索相连，侧脏神经索上还有周缘神经节。脏神经节发出神经支配内脏。身体每侧的脑神经节、侧神经节、足神经节间均有神经连索相互连接，一般将侧神经节经食道神经节连接脏神经节的神经称为侧脏神经连索。前鳃亚纲侧脏神经连索在食道上下左右交叉形成“8”字形（经历了扭转），而后鳃亚纲和肺螺亚纲因经历了反扭转，侧脏神经连索在食道上下左右'''不'''交叉形成“8”字形。感觉器官有：触角、眼、嗅检器、平衡囊一对。平衡囊位于足神经节内侧，由纤毛上皮内陷形成，囊内有一细小的钙质耳石位于纤毛之上，由脑神经节发出的神经支配，维持身体平衡。嗅检器是化学感受器，位于外套腔前部，靠近鳃的游离端，由食道神经节发出的神经支配。此外，在足的边缘、出水管和入水管处还分布着许多化学感受器。

*双壳纲（斧足纲/瓣鳃纲）：有'''3'''对神经节：脑神经节（脑侧神经节）一对，很小，位于前闭壳肌下方、食道两侧，由脑神经节和侧神经节合并而成。足神经节一对，位于足的前1/3处、足与内脏团交界处，左右两足神经节结合在一起。脏神经节一对，成蝶状，位于后闭合肌的腹侧的上皮内，较大。这些神经节之间有神经连索相连接。足神经节附近有一平衡囊，脏，神经节的上皮为感觉上皮，相当于腹足类的嗅检器。

*头足纲：适应快速游动的需要，神经系统发达，由中枢神经系统，周围神经系统组成。中枢神经系统高度集中，主要有食道周围的脑神经节、侧脏神经节和足神经节等三对神经节，组成食道背侧为一对侧脑神经节，腹侧为一对足神经节和一对侧脏神经节，两者前后排列。周围神经系统由中枢神经发出的神经和神经节组成。感官十分发达，有眼平衡囊，化学感受器等（注意：无嗅检器，联赛考过）。头足纲被认为是最聪明的无脊椎动物，因为它们有高度发展的知觉和较大的脑。它们的脑比腹足纲和双壳纲都来的大。除了鹦鹉螺之外，头足纲的表皮拥有一种特殊的色素细胞，使他们能够经由变色来进行沟通和伪装（2023年联赛详细考察过，是该年唯一一道无脊椎题目）。

===节肢动物===
链状神经系统，脑更加发达，神经节有愈合趋势，感觉器官复杂。
*软甲纲：脑在食道上方，由前脑、中脑、后脑三对神经节合成，分别发出神经至复眼、触角等处。后脑以围食道神经节和腹面的食道下神经节相连，该神经节由头后部3对神经节和胸前部3对神经节合成。腹神经链上有5个胸神经节和6个腹神经节。感觉器官复杂，有眼、平衡囊、触角等。
*蛛形纲：神经系统很集中，脑在食道上方发出神经至眼和螯肢，还有一对围咽神经连接食道下神经节。体表有许多由表皮生成的各类感觉毛，毛的肌肉与神经相连，能感觉细微的震动。须肢、口周围和步足表皮末端有许多中空的、端部有孔的毛，是化学感受器，有嗅觉和味觉功能。视觉器官为3~5个单眼（无复眼），通常视力很弱。蜘蛛无触角。
*昆虫纲：

===棘皮动物===

==消化系统==
==循环系统==
==呼吸系统==
==排泄系统==
==生殖系统==
==生活史==

Bio index

2023-05-21T04:04:31Z

Rubisco：/* 任务 */

==任务==
以下为编辑意向的任务

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*'''[[生物信息数据库及工具简介整理]]'''''（未完成）''
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*'''[[生化过程抑制剂整理]]''' ''( 基本完成 )''
*'''[[全国中学生生物学联赛试题]]''' ''(未完成)''
*'''[[重要的同源器官]]'''（未完成）
*'''[[无脊椎动物比较]]'''（未完成）

==现有条目==
*'''[[器官的神经调控]]'''
*'''[[生态学人名规律整理]]'''
*'''[[构建系统发生树常用方法]]'''
*'''[[DNA聚合酶]]'''
*'''[[生物的地理分区]]'''
*'''[[动物学人名结构整理]]'''
*'''[[肺鱼特征整理]]'''
*'''[[鸟的趾整理]]'''
*'''[[植物生长物质整理]]'''
*'''[[植物矿质元素整理]]'''
*'''[[植物抗逆生理整理]]'''
*'''[[藻类分类整理]]'''
*'''[[无脊椎动物幼虫整理]]'''
*'''[[内分泌整理]]'''
*'''[[常见抑制剂整理]]'''
*'''[[常见受体阻断与激动剂]]'''
*'''[[DNA解链酶]]'''
*'''[[人名拟态的典例整理]]'''
*'''[[western blot条带结果分析整理]]
*'''[[病毒分类整理]]'''
*'''[[生物的地理分区]]'''

== 题目 ==

* '''[[题目分类]]'''

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无脊椎动物比较

2023-05-21T04:03:47Z

Rubisco：创建页面，内容为“==神经系统与感觉器官== ===原生动物=== 无 ===多孔（海绵）动物=== 无（存在原始的神经细胞：芒状细胞） ===刺胞（腔肠）动物…”

==神经系统与感觉器官==
===原生动物===
无
===多孔（海绵）动物===
无（存在原始的神经细胞：芒状细胞）
===刺胞（腔肠）动物===
上皮具有神经一样的传导功能，存在非神经的传导。由二极和多极神经细胞组成。腔肠动物没有神经中枢，神经的传导一般是无定向的，因此称为扩散神经系统，传导速度较慢，体现了这种神经系统的原始性。水螅纲的水母形有平衡囊。钵水母纲为触手囊。
===扁形动物===
神经细胞向前集中形成“脑”，向后分出若干纵神经索。纵神经索之间有横神经相连。在高等的种类，纵神经所减少，只有一对腹神经发达，其中有横神经连接如梯形，故称为梯形神经系统。扁形动物出现了原始的神经中枢。（注意：吸虫和绦虫虽然营寄生生活，神经系统退化，但并不是没有。这一点联赛考过！）
*涡虫纲：感觉器官和神经系统较发达，能对外界环境如光线，水流及食物等迅速反应，感觉器官包括眼、耳突、触角、平衡囊等。耳突触角分布有丰富的触觉、化学、水流感受器。平衡囊存在于一些原始的种类，包含在“脑”中。高等的种类中神经索数目减少，两条腹神经所最为发达，和“脑”形成原始的中枢神经系统。

*吸虫纲：神经、感觉器官趋于退化：神经系统由神经节、神经纤维及围绕食道的神经环组成，并有神经支对称分布于虫体各部。

*绦虫纲：头节上的神经节不发达，由此发出的神经索贯穿整个节片，最大的一对神经索是在两纵型排泄管的外侧，节片边缘之内测。没有特殊的感觉器官。

===线虫动物===
体前端存在一个围咽神经环及与之相连的神经节，由围咽神经环向前后各发出若干条神经索，向前的到前端的感觉器，向后端有背、腹、侧神经所其中，以被神经所和副神经所最为发达，分别埋在背线和腹线中。所有的神经索均埋于上皮层中。腰神经节发出尾神经至尾感器。体前端有司触觉的乳突和头感器（化感器，寄生种类常退化），体后端有尾感器。
*无尾感器纲：没有尾感器。

*尾感器纲：全部具有尾感器。

===环节动物===
神经细胞更为集中，中枢神经系统包括一对脑神经节（咽上神经节）、一对围咽神经与一对以愈合的咽下神经节组成。咽下神经节后连腹神经索（有两条纵行的腹神经合并而成）。环节动物的神经系统形似锁链，故又称索式神经系统。环节动物出现了交感神经系统。脑神经节控制全身感觉和运动，又分化为：①前脑：支配口前叶的感受器；②中脑：支配眼和口前叶的触手或触须，还分出交感神经到消化管，控制吻、咽的活动；③后脑：支配化学感受器（项器）。大多数环节动物的腹神经索中存在一种电阻低、兴奋传导快的大直径的巨纤维，可使虫体快速缩短，以逃避敌害，用于逃避反应。环节动物还具有神经分泌细胞（常为单极神经元。），沙蚕脑神经节的分泌细胞能分泌保幼激素，蚯蚓的神经分泌细胞能分泌肾上腺素和奴佛卡因等，对动物的生命活动进行调控。
*多毛纲：大多数具有愈合的一腹神经索，较原始的种类具有双腹神经索和每节一对神经节，在不同种类有不同程度的愈合。

*寡毛纲：感觉器官不发达，体壁上有小凸起一样的体表感觉乳突，有触觉功能；分布在口腔的口腔感觉器有味觉和嗅觉功能；光感受器分布于体表上皮细胞间，在口前叶及前端几节较多，可分辨光的强弱。

*蛭纲：体前、后端神经节愈合，一般前端5对神经节愈合形成咽上神经节和咽下神经节，腹神经索由21对神经节组成，构成躯干神经索，后端的7对神经节愈合形成尾神经节。神经元数目相对少，细胞体较大。

===软体动物===
原始的种类无分化显著的神经节，高等种类的中枢神经系统由脑神经节、足神经节、侧神经节、脏神经节四对神经节及其神经连索组成，这些神经节分别发生神经到身体各处，完成感觉、运动等功能。有些种类的主要神经节集中在一起，形成脑。软体动物还分化出触角、眼、嗅检器、平衡囊、磁受体等感觉器官。
*无板纲：软体动物中最原始的类型，神经系统梯子状，神经节不发达。

*单板纲：神经系统由围食道神经环及向后伸出的侧神经和足神经组成。无眼和嗅检器等器官，体前具一对平衡囊（适应海底生活）。

*多板纲：神经系统较不发达，类似单板类，由围食道神经环与向后伸出的侧神经索和足神经索组成。多数种类在外套腔后端、肛门附近有一对嗅检器。

*腹足纲：腹足类的神经系统包括脑、足、侧、脏'''4'''对基本的神经节。脑神经节位于口球之后，食道背面，由它发出神经支配触手、眼、口等；又分出一对口球神经节，支配口腔及齿舌的运动。足神经节位于食道腹侧、内脏团与足交界处，支配足的运动，两足神经节间有神经索相连，且有神经索与脑神经节相连。侧神经节位于脑后食道两侧，较小，主要支配外套膜及闭壳肌的收缩，也有神经索与脑相连。食道神经节较小。位于侧神经之后，食道的背腹两侧。位于食道之上的称为食道上食经节；食道之下的为食道下神经节。脏神经节位于内脏囊内，侧脏神经节之间有神经索相连，侧脏神经索上还有周缘神经节。脏神经节发出神经支配内脏。身体每侧的脑神经节、侧神经节、足神经节间均有神经连索相互连接，一般将侧神经节经食道神经节连接脏神经节的神经称为侧脏神经连索。前鳃亚纲侧脏神经连索在食道上下左右交叉形成“8”字形（经历了扭转），而后鳃亚纲和肺螺亚纲因经历了反扭转，侧脏神经连索在食道上下左右'''不'''交叉形成“8”字形。感觉器官有：触角、眼、嗅检器、平衡囊一对。平衡囊位于足神经节内侧，由纤毛上皮内陷形成，囊内有一细小的钙质耳石位于纤毛之上，由脑神经节发出的神经支配，维持身体平衡。嗅检器是化学感受器，位于外套腔前部，靠近鳃的游离端，由食道神经节发出的神经支配。此外，在足的边缘、出水管和入水管处还分布着许多化学感受器。

*双壳纲（斧足纲/瓣鳃纲）：有'''3'''对神经节：脑神经节（脑侧神经节）一对，很小，位于前闭壳肌下方、食道两侧，由脑神经节和侧神经节合并而成。足神经节一对，位于足的前1/3处、足与内脏团交界处，左右两足神经节结合在一起。脏神经节一对，成蝶状，位于后闭合肌的腹侧的上皮内，较大。这些神经节之间有神经连索相连接。足神经节附近有一平衡囊，脏，神经节的上皮为感觉上皮，相当于腹足类的嗅检器。

*头足纲：适应快速游动的需要，神经系统发达，由中枢神经系统，周围神经系统组成。中枢神经系统高度集中，主要有食道周围的脑神经节、侧脏神经节和足神经节等三对神经节，组成食道背侧为一对侧脑神经节，腹侧为一对足神经节和一对侧脏神经节，两者前后排列。周围神经系统由中枢神经发出的神经和神经节组成。感官十分发达，有眼平衡囊，化学感受器等（注意：无嗅检器，联赛考过）。头足纲被认为是最聪明的无脊椎动物，因为它们有高度发展的知觉和较大的脑。它们的脑比腹足纲和双壳纲都来的大。除了鹦鹉螺之外，头足纲的表皮拥有一种特殊的色素细胞，使他们能够经由变色来进行沟通和伪装（2023年联赛详细考察过，是该年唯一一道无脊椎题目）。

===节肢动物===

===棘皮动物===

==消化系统==
==循环系统==
==呼吸系统==
==排泄系统==
==生殖系统==
==生活史==

全国中学生生物学联赛试题

2023-05-21T00:03:56Z

Rubisco：

参见：
*[[2019年全国中学生生物学联赛试题]]
*[[2020年全国中学生生物学联赛试题]]
*[[2021年全国中学生生物学联赛试题]]
*[[2022年全国中学生生物学联赛试题]]
*[[:文件:2023年全国中学生生物学联赛试题.doc|2023年全国中学生生物学联赛真题]]
*[[:文件:《全国中学生生物学联赛真题（2001-2020）》.pdf|全国中学生生物学联赛真题（2001-2020），侵权立删]]

Bio index

2023-05-01T03:22:20Z

Rubisco：/* 任务 */

==任务==
以下为编辑意向的任务

* '''[[昆虫的变态整理]]'''''（基本完成）''

*'''[[生物信息数据库及工具简介整理]]'''''（未完成）''
*'''[[报告基因整理]]'''''（未完成）''
*'''[[生物缩写]]'''''（未完成）''
*'''[[糖酵解]]'''''（未完成）''
*'''[[细胞死亡方式整理]]'''''（未完成）''
*'''[[生化过程抑制剂整理]]''' ''(未完成)''
*'''[[全国中学生生物学联赛试题]]''' ''(未完成)''

==现有条目==
*'''[[器官的神经调控]]'''
*'''[[生态学人名规律整理]]'''
*'''[[构建系统发生树常用方法]]'''
*'''[[DNA聚合酶]]'''
*'''[[生物的地理分区]]'''
*'''[[动物学人名结构整理]]'''
*'''[[肺鱼特征整理]]'''
*'''[[鸟的趾整理]]'''
*'''[[植物生长物质整理]]'''
*'''[[植物矿质元素整理]]'''
*'''[[植物抗逆生理整理]]'''
*'''[[藻类分类整理]]'''
*'''[[无脊椎动物幼虫整理]]'''
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*'''[[常见抑制剂整理]]'''
*'''[[常见受体阻断与激动剂]]'''
*'''[[DNA解链酶]]'''
*'''[[人名拟态的典例整理]]'''
*'''[[western blot条带结果分析整理]]
*'''[[病毒分类整理]]'''
== 题目 ==

* '''[[题目分类]]'''

[[分类:生物|index]]

全国中学生生物学联赛试题

2023-05-01T03:21:25Z

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参见：
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病毒分类整理

2023-05-01T01:04:37Z

Rubisco：

== 病毒进化史 ==
[[文件:进化史.png|缩略图|<ref>病毒进化史 <nowiki>https://www.bilibili.com/read/cv5205466/?from=readlist</nowiki> 来源：bilibili 作者：制御秘书长杜鹃</ref>]]
进化历史细则:1，类病毒与德尔塔病毒(以下简称丁肝病毒)繁殖方式一样，只是丁肝病毒多了一个德尔塔抗原。(蛇丁肝病毒多了一个疑似德尔塔棘突蛋白)

2，丁肝病毒的RNA是反义RNA，繁殖方式与反义RNA病毒一样(丁肝病毒：转录——德尔塔抗原催化RNA复制；反义RNA病毒：转录——基质蛋白催化RNA复制)

3，丁肝病毒生活需要细胞的DNA依赖的RNA聚合酶（主要是RNA聚合酶II——转录mRNA的RNA聚合酶）进行RNA复制（可见细胞的RNA聚合酶祖先是RNA依赖的RNA聚合酶）

4，正义RNA病毒、反义RNA病毒的RNA依赖的RNA聚合酶与逆转录病毒的逆转录酶拥有共同结构。

5，正义RNA病毒RNA复制时首先形成双链RNA，然后双链RNA转录形成正义RNA；双链RNA病毒首先进行转录形成正义RNA，最终正义RNA转录成为双链RNA，可谓是“师出同门”

6，正义RNA病毒复制时在细胞内形成小体，双链RNA病毒可直接作为小体

7，反义RNA病毒复制时不形成双链RNA，与正义RNA病毒完全不同

8，人体内有内源性博尔纳病毒基因(EBLN-1/2/3P)，而博尔纳病毒正是反义RNA病毒，可见反义RNA病毒可以整合在宿主DNA基因组中，这与逆转录病毒是一样的（可见，反义RNA病毒是逆转录病毒的祖先）

9，反义RNA病毒、逆转录病毒、拟逆转录病毒、单链DNA病毒与双链DNA病毒均可以通过内含子剪辑RNA来改变外显子的表达，这与细胞是一样的

10，逆转录病毒中的泡沫病毒有20%的概率会形成拥有双链DNA的病毒，这种病毒的生活方式与乙肝病毒一样（泡沫病毒中拥有双链DNA的病毒遗传信息流与乙肝病毒均为DNA→RNA→DNA，泡沫病毒中拥有双正义RNA的病毒遗传信息流为RNA→DNA→RNA）

11，乙肝病毒（DR1与DR2）、花椰菜花叶病毒（19S与35S）的DNA上均有两个正向重复序列（direct repeat），用以mRNA转录、pgRNA合成与病毒DNA合成。逆转录病毒的DNA上也有两个重复序列（long terminal repeat），用以mRNA转录、正义RNA合成与病毒DNA合成

12，无论是像HIV的逆转录病毒（retrovirus），还是像乙肝病毒的拟逆转录病毒（pararetrovirus），它们合成双链DNA的逆转录过程中，均会形成单链DNA，而且单链DNA也含有重复序列。而腺相关病毒这种无害的人细小病毒的单链DNA也含有重复序列（inverted repeat）

13，无论是拥有线型单链DNA的腺相关病毒，还是拥有环状单链DNA的M13噬菌体，它们均拥有重复序列以作为启动子

14，人体细胞内的DNA很多都是逆转录病毒（少数为反义RNA病毒）整合而来

15，反义RNA病毒的RNA依赖的RNA聚合酶与逆转录酶、DNA聚合酶和RNA聚合酶结构相似

16，非洲猪瘟病毒与原始细胞的DNA聚合酶均缺失外切酶修复校正功能，由此可知，原始细胞由原始双链DNA病毒进化而来。

17，原始DNA病毒的DNA聚合酶开始没有外切酶修复校正功能，修复校正功能是后期进化而来。原始细胞的DNA细胞的DNA聚合酶也是如此

18，最早出现的外切酶修复校正功能为3'→5'外切酶，最晚出现的外切酶修复校正功能为5'→3'外切酶。

19，真核细胞的染色体与现代双链DNA病毒的DNA均为线型，而细胞的末端为由重复序列组成的端粒，现代双链DNA病毒DNA的末端为重复序列。

20，真核细胞的端粒上有端粒酶用以合成替换引物的DNA，腺病毒的DNA末端有磷蛋白作为DNA复制的引物

<ref>病毒进化史 <nowiki>https://www.bilibili.com/read/cv5205466/?from=readlist</nowiki> 来源：bilibili 作者：制御秘书长杜鹃</ref>

== 病毒分类法 ==

=== ICTV 分类法 ===
国际病毒分类委员会（ICTV）是国际微生物学联合会发展、改进和维护通用病毒分类的唯一机构，在1966年建立起了一个病毒分类的通用系统和统一的命名法则。第七届 ICTV 会议首次规范化了病毒物种的概念，即病毒分类的分支层次中的最低分类单元。分类的主要依据是病毒颗粒的特性、抗原特性与生物特性。

到目前为止只有一小部分的病毒得到了研究，从来自人体的病毒样品中发现有20%的序列是未曾发现过的，而来自环境中（如海水、大洋沉积物等）的病毒样品则大部分的序列都是全新的。

病毒分类从域开始，结构如下，分类后缀在括号中：
:域 Realm（''-viria''）
::亚域 Subrealm（''-vira''）
:::界 Kingdom（''-viriae''）
::::亚界 Subkingdom（''-virites''）
:::::门 Phylum（''-viricota''）
::::::亚门 Subphylum（''-viricotina''）
:::::::纲 Class（''-viricetes''）
::::::::亚纲 Subclass（''-viricetidae''）
:::::::::目 Order（''-virales''）
::::::::::亚目 Suborder（''-virineae''）
:::::::::::科 Family（''-viridae''）
::::::::::::亚科 Subfamily（''-virinae''）
:::::::::::::属 Genus（''-virus''）
::::::::::::::亚属 Subgenus（''-virus''）
:::::::::::::::种 Species

ICTV 2020版分类表中总共有6个域、10个界、17个门、2个亚门、39个纲、59个目、8个亚目、189个科、136个亚科、2224个属、70个亚属与9110个种。除亚域、亚界和亚纲外，其他级别的分类单元都被使用。共有6个域、1个地位未定纲、19个地位未定科及2个地位未定属被承认。

=== 巴尔的摩分类法 ===
诺贝尔奖获得者生物学家戴维·巴尔的摩在1970年代提出了巴尔的摩分类系统。巴尔的摩分类法与ICTV分类法一起用于现代病毒的分类。

巴尔的摩分类法是基于病毒 mRNA 的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中，必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制，但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是单链或双链的 RNA 或 DNA，可以有也可以没有反转录酶。而且，单链RNA病毒可以是正义（+）或反义（-）。这一分类法将病毒分为7类：

*第一类是双链 DNA 病毒（如腺病毒、疱疹病毒、痘病毒）
*第二类是单链 DNA 病毒（+）DNA（如小 DNA 病毒）
*第三类是双链RNA病毒（如呼肠孤病毒）
*第四类是（+）单链RNA病毒（如微小核糖核酸病毒、披盖病毒）
*第五类是（-）单链RNA病毒（如正黏液病毒、炮弹病毒）
*第六类是单链RNA反转录病毒（如反转录病毒）
*第七类是双链 DNA 反转录病毒（如肝病毒）
举一个病毒分类的例子：水痘病毒，即带状疱疹病毒，属于疱疹病毒目，疱疹病毒科，甲型疱疹病毒亚科，水疱病毒属；同时，带状疱疹病毒是巴尔的摩分类法中的第一类，因为它是双链 DNA 病毒，且不含有反转录酶。
物种名称通常以[疾病]病毒的形式出现，尤其是高等动植物。
<ref>[https://zh.wikipedia.org/wiki/病毒分类表病毒分类表-维基百科]</ref>
== 卫星 ==
卫星（Satellite）是亚病毒因子的一类，不能单独存在，需要辅助病毒协助复制核酸，或者由辅助病毒提供衣壳蛋白来包被核酸。分为两大类：能利用自己核酸编码衣壳蛋白的为卫星病毒，不能的则称卫星核酸。如丁型肝炎病毒(HDV)必须利用乙型肝炎病毒的包膜蛋白才能完成复制周期，常见的卫星病毒还有腺联病毒(AAV)、卫星烟草花叶病毒(STMV)、卫星玉米白线花叶病毒(SMWLMV)、卫星稷子花叶病毒（SPMV)等。
== 类病毒 ==
类病毒（Viroid）是一种具有传染性的单链环状RNA病原体。它比病毒要小，且没有典型病毒所有的蛋白质外壳。类病毒为严格寄生物，专一性很强。目前所有已知的类病毒均为被子植物栖居者，且多数造成疾病；它们通常透过种子或花粉传播，且整合到细胞核内进行复制。
类病毒最早由在美国工作的瑞士学者迪纳（Theodor O. Diener）于1971年在马铃薯纺锤块茎病中发现。

== 朊病毒 ==
朊病毒是一种具感染性的致病因子，能引发哺乳动物的传染性海绵状脑病。朊毒体疾病（传染性海绵状脑病）和阿尔茨海默病、帕金森病同属于神经退行性疾病。最早发现于哺乳动物的传染性海绵状脑病，包括羊搔痒症、疯牛病、慢性消耗病，以及人类的克雅二氏病。它不是病毒，而是仅由蛋白质构成的致病因子。它虽然不含核酸，但可自我复制且具有感染性。朊病毒由错误折叠的朊蛋白（PrP）聚集组成。它能够诱导在神经细胞上原本是正常结构的朊蛋白转变为错误结构并进行聚集反应，借由这个机制引入新的朊蛋白，不断自我复制并传递至邻近细胞，最终扩散至整个脑部。

病毒分类整理

2023-05-01T01:03:39Z

Rubisco：

== 病毒进化史 ==
[[文件:进化史.png|缩略图|<ref>病毒进化史 <nowiki>https://www.bilibili.com/read/cv5205466/?from=readlist</nowiki> 来源：bilibili 作者：制御秘书长杜鹃</ref>]]
进化历史细则:1，类病毒与德尔塔病毒(以下简称丁肝病毒)繁殖方式一样，只是丁肝病毒多了一个德尔塔抗原。(蛇丁肝病毒多了一个疑似德尔塔棘突蛋白)

2，丁肝病毒的RNA是反义RNA，繁殖方式与反义RNA病毒一样(丁肝病毒：转录——德尔塔抗原催化RNA复制；反义RNA病毒：转录——基质蛋白催化RNA复制)

3，丁肝病毒生活需要细胞的DNA依赖的RNA聚合酶（主要是RNA聚合酶II——转录mRNA的RNA聚合酶）进行RNA复制（可见细胞的RNA聚合酶祖先是RNA依赖的RNA聚合酶）

4，正义RNA病毒、反义RNA病毒的RNA依赖的RNA聚合酶与逆转录病毒的逆转录酶拥有共同结构。

5，正义RNA病毒RNA复制时首先形成双链RNA，然后双链RNA转录形成正义RNA；双链RNA病毒首先进行转录形成正义RNA，最终正义RNA转录成为双链RNA，可谓是“师出同门”

6，正义RNA病毒复制时在细胞内形成小体，双链RNA病毒可直接作为小体

7，反义RNA病毒复制时不形成双链RNA，与正义RNA病毒完全不同

8，人体内有内源性博尔纳病毒基因(EBLN-1/2/3P)，而博尔纳病毒正是反义RNA病毒，可见反义RNA病毒可以整合在宿主DNA基因组中，这与逆转录病毒是一样的（可见，反义RNA病毒是逆转录病毒的祖先）

9，反义RNA病毒、逆转录病毒、拟逆转录病毒、单链DNA病毒与双链DNA病毒均可以通过内含子剪辑RNA来改变外显子的表达，这与细胞是一样的

10，逆转录病毒中的泡沫病毒有20%的概率会形成拥有双链DNA的病毒，这种病毒的生活方式与乙肝病毒一样（泡沫病毒中拥有双链DNA的病毒遗传信息流与乙肝病毒均为DNA→RNA→DNA，泡沫病毒中拥有双正义RNA的病毒遗传信息流为RNA→DNA→RNA）

11，乙肝病毒（DR1与DR2）、花椰菜花叶病毒（19S与35S）的DNA上均有两个正向重复序列（direct repeat），用以mRNA转录、pgRNA合成与病毒DNA合成。逆转录病毒的DNA上也有两个重复序列（long terminal repeat），用以mRNA转录、正义RNA合成与病毒DNA合成

12，无论是像HIV的逆转录病毒（retrovirus），还是像乙肝病毒的拟逆转录病毒（pararetrovirus），它们合成双链DNA的逆转录过程中，均会形成单链DNA，而且单链DNA也含有重复序列。而腺相关病毒这种无害的人细小病毒的单链DNA也含有重复序列（inverted repeat）

13，无论是拥有线型单链DNA的腺相关病毒，还是拥有环状单链DNA的M13噬菌体，它们均拥有重复序列以作为启动子

14，人体细胞内的DNA很多都是逆转录病毒（少数为反义RNA病毒）整合而来

15，反义RNA病毒的RNA依赖的RNA聚合酶与逆转录酶、DNA聚合酶和RNA聚合酶结构相似

16，非洲猪瘟病毒与原始细胞的DNA聚合酶均缺失外切酶修复校正功能，由此可知，原始细胞由原始双链DNA病毒进化而来。

17，原始DNA病毒的DNA聚合酶开始没有外切酶修复校正功能，修复校正功能是后期进化而来。原始细胞的DNA细胞的DNA聚合酶也是如此

18，最早出现的外切酶修复校正功能为3'→5'外切酶，最晚出现的外切酶修复校正功能为5'→3'外切酶。

19，真核细胞的染色体与现代双链DNA病毒的DNA均为线型，而细胞的末端为由重复序列组成的端粒，现代双链DNA病毒DNA的末端为重复序列。

20，真核细胞的端粒上有端粒酶用以合成替换引物的DNA，腺病毒的DNA末端有磷蛋白作为DNA复制的引物

<ref>病毒进化史 <nowiki>https://www.bilibili.com/read/cv5205466/?from=readlist</nowiki> 来源：bilibili 作者：制御秘书长杜鹃</ref>

== 病毒分类法 ==

=== ICTV 分类法 ===
国际病毒分类委员会（ICTV）是国际微生物学联合会发展、改进和维护通用病毒分类的唯一机构，在1966年建立起了一个病毒分类的通用系统和统一的命名法则。第七届 ICTV 会议首次规范化了病毒物种的概念，即病毒分类的分支层次中的最低分类单元。分类的主要依据是病毒颗粒的特性、抗原特性与生物特性。

到目前为止只有一小部分的病毒得到了研究，从来自人体的病毒样品中发现有20%的序列是未曾发现过的，而来自环境中（如海水、大洋沉积物等）的病毒样品则大部分的序列都是全新的。

病毒分类从域开始，结构如下，分类后缀在括号中：
:域 Realm（''-viria''）
::亚域 Subrealm（''-vira''）
:::界 Kingdom（''-viriae''）
::::亚界 Subkingdom（''-virites''）
:::::门 Phylum（''-viricota''）
::::::亚门 Subphylum（''-viricotina''）
:::::::纲 Class（''-viricetes''）
::::::::亚纲 Subclass（''-viricetidae''）
:::::::::目 Order（''-virales''）
::::::::::亚目 Suborder（''-virineae''）
:::::::::::科 Family（''-viridae''）
::::::::::::亚科 Subfamily（''-virinae''）
:::::::::::::属 Genus（''-virus''）
::::::::::::::亚属 Subgenus（''-virus''）
:::::::::::::::种 Species

ICTV 2020版分类表中总共有6个域、10个界、17个门、2个亚门、39个纲、59个目、8个亚目、189个科、136个亚科、2224个属、70个亚属与9110个种。除亚域、亚界和亚纲外，其他级别的分类单元都被使用。共有6个域、1个地位未定纲、19个地位未定科及2个地位未定属被承认。

=== 巴尔的摩分类法 ===
诺贝尔奖获得者生物学家戴维·巴尔的摩在1970年代提出了巴尔的摩分类系统。巴尔的摩分类法与ICTV分类法一起用于现代病毒的分类。

巴尔的摩分类法是基于病毒 mRNA 的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中，必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制，但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是单链或双链的 RNA 或 DNA，可以有也可以没有反转录酶。而且，单链RNA病毒可以是正义（+）或反义（-）。这一分类法将病毒分为7类：

*第一类是双链 DNA 病毒（如腺病毒、疱疹病毒、痘病毒）
*第二类是单链 DNA 病毒（+）DNA（如小 DNA 病毒）
*第三类是双链RNA病毒（如呼肠孤病毒）
*第四类是（+）单链RNA病毒（如微小核糖核酸病毒、披盖病毒）
*第五类是（-）单链RNA病毒（如正黏液病毒、炮弹病毒）
*第六类是单链RNA反转录病毒（如反转录病毒）
*第七类是双链 DNA 反转录病毒（如肝病毒）
举一个病毒分类的例子：水痘病毒，即带状疱疹病毒，属于疱疹病毒目，疱疹病毒科，甲型疱疹病毒亚科，水疱病毒属；同时，带状疱疹病毒是巴尔的摩分类法中的第一类，因为它是双链 DNA 病毒，且不含有反转录酶。
物种名称通常以[疾病]病毒的形式出现，尤其是高等动植物。
<ref>[https://zh.wikipedia.org/wiki/病毒分类法病毒分类表-维基百科]</ref>
== 卫星 ==
卫星（Satellite）是亚病毒因子的一类，不能单独存在，需要辅助病毒协助复制核酸，或者由辅助病毒提供衣壳蛋白来包被核酸。分为两大类：能利用自己核酸编码衣壳蛋白的为卫星病毒，不能的则称卫星核酸。如丁型肝炎病毒(HDV)必须利用乙型肝炎病毒的包膜蛋白才能完成复制周期，常见的卫星病毒还有腺联病毒(AAV)、卫星烟草花叶病毒(STMV)、卫星玉米白线花叶病毒(SMWLMV)、卫星稷子花叶病毒（SPMV)等。
== 类病毒 ==
类病毒（Viroid）是一种具有传染性的单链环状RNA病原体。它比病毒要小，且没有典型病毒所有的蛋白质外壳。类病毒为严格寄生物，专一性很强。目前所有已知的类病毒均为被子植物栖居者，且多数造成疾病；它们通常透过种子或花粉传播，且整合到细胞核内进行复制。
类病毒最早由在美国工作的瑞士学者迪纳（Theodor O. Diener）于1971年在马铃薯纺锤块茎病中发现。

== 朊病毒 ==
朊病毒是一种具感染性的致病因子，能引发哺乳动物的传染性海绵状脑病。朊毒体疾病（传染性海绵状脑病）和阿尔茨海默病、帕金森病同属于神经退行性疾病。最早发现于哺乳动物的传染性海绵状脑病，包括羊搔痒症、疯牛病、慢性消耗病，以及人类的克雅二氏病。它不是病毒，而是仅由蛋白质构成的致病因子。它虽然不含核酸，但可自我复制且具有感染性。朊病毒由错误折叠的朊蛋白（PrP）聚集组成。它能够诱导在神经细胞上原本是正常结构的朊蛋白转变为错误结构并进行聚集反应，借由这个机制引入新的朊蛋白，不断自我复制并传递至邻近细胞，最终扩散至整个脑部。