https://osm.bio/api.php?action=feedcontributions&feedformat=atom&user=Sofia 2026-04-07T03:29:13Z 用户贡献 MediaWiki 1.45.1 https://osm.bio/index.php?title=%E7%AC%AC2%E7%AB%A0_%E7%B3%BB%E7%BB%9F%E5%AD%A6%E3%80%81%E7%B3%BB%E7%BB%9F%E5%8F%91%E7%94%9F%E4%B8%8E%E5%88%86%E7%B1%BB&diff=11782 2025-08-27T11:38:19Z

<p>Sofia：​自动添加 Sofia 模板和分类</p> <hr /> <div>&lt;blockquote&gt;&quot;''同一类群所有生物的亲缘关系有时被比喻为一棵大树……芽会通过生长生出新芽，而这些新芽如果生机勃勃，就会长出新枝，覆盖四周许多较弱的枝条，因此我相信，生命之树的世代相传也是如此，它用枯死和折断的枝条填满地壳，用不断生长的美丽枝条覆盖地表。''&quot;<br /> <br /> --Charles Darwin,《物种起源》,1859&lt;/blockquote&gt;系统学是研究生物多样性及其起源的学科。系统学家识别和区分物种，描述和命名新的分类群，提供工具帮助其他人识别标本，推断物种和更高分类群之间的进化关系，进行生物地理分析，并建立反映进化历史的分类系统。系统研究的这些阶段以高度迭代的方式重叠和循环。总之，系统学的作用是记录和了解地球的生物多样性，重建生物多样性的历史，并制定现存和灭绝生物的自然（进化）分类。<br /> <br /> 正如您的家族随时间而不断壮大，您与父母和祖父母之间也存在联系一样，地球上曾生活过的所有生物都通过遗传上的血统相互关联。'''系统发育树'''（Phylogenetic trees）是由分支和节点组成的图表，描绘了遗传信息随时间推移发生的流动，以说明生物之间的关系。由于所有生物都彼此相关，因此只有一棵生命之树，其分支模式反映了地球上所有物种之间的进化关系（达尔文的“伟大的生命之树”）。然而，由于多细胞生命已经在地球上进化了数亿年，而且我们无法穿越时空，所以我们无法确定树上的所有分支是如何相互关联的。也就是说，并没有一份自生命伊始起，便记载了遗传血统模式的普遍记录。但是，这种模式的痕迹存在于当今地球上所有生物的解剖结构和基因组中，甚至存在于一些已不复存在的生物中（例如，化石可以进行解剖学研究，古代 DNA 使我们能够研究一些一百多万年前灭绝的生物的基因组）。系统学家试图揭示这些痕迹，以建立生物和物种间如何相互关联的假设。他们通过创建和分析生物之间同源解剖或遗传特征（称之为'''性状'''，character）的数据矩阵来实现这一点。随着新数据的出现并添加到分析中，树会被修改并更新。正如我们将在本书中看到的那样，许多关于动物关系的长期观点最近已被 DNA 序列数据的分析改变（甚至推翻）。在本章中，我们将介绍系统发育分析和分类构建的基础。<br /> <br /> === 系统发生、单系、并系与多系 ===<br /> 系统发育树是一种描述生物体相互关系的分支图''（图 2.1）''。它是一种表达物种或其他分类群之间关系（或遗传连通性）的图形方式，实际上是一组嵌套的进化枝。理解'''进化枝，或单系群'''（monophyletic group，or clade）的概念对于正确解读系统发育树至关重要。单系群或进化枝是一组物种，包括共同祖先和该共同祖先的所有后代——也就是说，它是生命之树中一个独特的分支。单系群可以通过切割一次单个分支与生命之树的其余部分分开。如果你能走到生命之树前，砍下一根树枝，任何树枝，并将修剪下来的树枝拿在手中，你就得到了一个单系群''（图 2.1）''。单系群是一组彼此是近亲的分类群。你和你的直系亲属（你、你的父母和你的兄弟姐妹）就是单系群的一个例子。<br /> <br /> 文献中发表的大多数树（以及本文中）都是有根的，有根的树不仅显示了关系模式，而且还表明了时间沿着树枝移动的方向——无论树如何绘制，总是从树的根（最老）到树的尖端（最年轻）''（图 2.2）''。因此，有根的树描绘了祖先-后代的关系。<br /> <br /> 如果我们确切地知道生命之树的形状，那么系统学家只会建立单系群''（图 2.3A）''。但由于我们尚未完全了解树的形状，有时系统学家会错误地创建并系群或多系群。这些类型的非单系分类群或物种群如''图 2.3B'' 所示。<br /> <br /> 一个群体，其成员物种都是共同祖先的后代，但不包含从该祖先传下来的所有物种，则称为'''并系群'''（paraphyletic group）''（图 2.3B，O + P 群）''。并系群意味着由于某种原因，自然群体中的一个或多个成员被分离出来并放置在不同的组中。正如我们将看到的，当今的动物分类中存在许多并系群。&lt;sup&gt;1&lt;/sup&gt;<br /> <br /> &lt;small&gt;&lt;sup&gt;1&lt;/sup&gt;一些生物学家认为并系群是单系群的一个子集，使用术语“全系群”来表示严格的单系群。然而，这些术语的这种替代用法并不常见，我们在本书中不使用它。&lt;/small&gt;<br /> <br /> '''多系群'''（polyphyletic group）是指其成员物种来自两个或多个不同的直系祖先的群体。由于对所讨论的分类群与其他分类群的关系了解不足，因此提出了这种复合群''（图 2.3B，Q + R 群）''。多系群的建立通常是由于用以识别和确认该群体的特征或性状并非同源，而是进化趋同的结果。&lt;sup&gt;2&lt;/sup&gt;系统学家的主要目标之一是发现这种多系或“人工”分类群，并通过仔细研究，将其成员重新归类为适当的单系分类群。<br /> <br /> &lt;small&gt;&lt;sup&gt;2&lt;/sup&gt;有许多以前建立的群体现在已知或怀疑是多系群的例子。例如，古老的拟环虫门（Gephyrea）包含我们现在分为三个不同分类单元的物种，它们彼此之间只有远亲关系——星虫（Sipuncula）、Thalassematidae科（现属螠虫--译者注） 和 Priapula（现应归属曳鳃动物门Priapulida，抑或两者为同一类群--译者注）（前两个现在属于环节动物门，但关系并不密切）。另一个例子是古老的辐射对称动物，它包括所有具有辐射对称性的动物（例如，刺胞动物、栉水母和棘皮动物）。最近，分子系统发育学表明，体节动物(Articulata)，包含环节动物和节肢动物（及其亲属），是多系群。多系群通常因用于识别和确认它们的特征或性状是不同谱系进化趋同的结果而被建立。趋同进化通常只能通过仔细的比较胚胎学或解剖学研究来理解，有时需要几代专家的努力。例如，环节动物和节肢动物节段发育之间可能的趋同性，其复杂本质尚未完全阐明。（有关Articulata一词的其他相关信息详见“讨论”页面。--译者注）&lt;/small&gt;<br /> <br /> === 同源性 ===<br /> 如前所述，系统学家通过比较可遗传的特征（称为性状）来推断系统发生，他们将性状分解为性状状态，以获取他们所研究的分类群中该性状的形式变化。在实际使用中，“性状”和“性状状态”这两个术语经常互换使用。这种做法可能有点令人困惑。当在讨论两个或多个同源物（这里的原文为homologues,直译为“同源物”，个人认为可理解为同源性状--译者注）时，“性状”一词通常与“性状状态”具有相同的含义。性状和性状状态（通常是形态学或分子学的）被组装成数据矩阵（图 2.4），其中每个性状相当于同源性的假设。<br /> <br /> 同源性状具有共同的祖先。也就是说，它们是存在于两个或多个分类群中并从其共同祖先那里遗传下来的特征。同源性状具有共同的进化历史。伴随着变异的进化传承过程产生了一种同源性的等级模式，可以通过现存生物的谱系来追溯。我们利用这种模式来重建生命的历史。同源结构的功能可能相似或不同，但这与所涉及结构的底层同源性无关。我们识别解剖同源物的能力通常依赖于发育或胚胎学证据、解剖结构的相对位置或核酸、蛋白质序列中的核苷酸或氨基酸。<br /> <br /> {{:Molecular Population Genetics}}<br /> <br /> {{学科分类}}<br /> <br /> [[Category:遗传学]]</div>

Sofia https://osm.bio/index.php?title=%E7%AC%AC%E5%8D%81%E4%B9%9D%E7%AB%A0_%E7%BA%BF%E8%99%AB%E5%8A%A8%E7%89%A9%EF%BC%9A%E7%BA%BF%E8%99%AB%E5%8A%A8%E7%89%A9%E9%97%A8%E5%92%8C%E7%BA%BF%E5%BD%A2%E5%8A%A8%E7%89%A9%E9%97%A8&diff=11781 2025-08-27T11:37:28Z

<p>Sofia：​自动添加《Invertebrates（Brusca）Fourth Edition 重制版》章节导航</p> <hr /> <div>八个蜕皮动物门分为三个亚群：有颚动物（动吻曳鳃铠甲），泛节肢动物（有爪缓步节支），线虫动物（线虫和线形）。<br /> <br /> 两门的成虫都有特殊的角质层，绝大多数不含几丁质（几丁质只见于线虫的咽部角质层和线形的幼虫角质层），两个门都没有原肾管（protonephridia），没有环肌。表皮有表皮索，而且背腹两条表皮索似乎是线虫+线性的祖先特征。表皮索中有纵向神经索。这两个门的雄性都有泄殖腔，但海洋线虫Nectonema  属除外，它们的肠道后部缩小，因此无法形成泄殖腔。然而，雌性线虫的生殖口与肛门分开，通常位于身体中部，远离肛门。另一个相应的特征是精子细胞中缺乏纤毛，尽管这两个分类群的精子都经过了高度改良，结构上彼此不可比拟，而且缺乏纤毛在陆生动物中很常见。与其他蜕皮动物类群一样，线虫缺乏可动的表皮纤毛。<br /> <br /> 线虫在发育过程中会蜕皮三到四次；成虫前期与成虫大体相似，因此被称为juveniles（尽管“larva”一词也经常使用，尤其是寄生物种）。线形只观察到一次蜕皮，即寄生生活结束时。线性有真正的幼虫，它是微观的（&lt;  1  毫米），形态与成虫完全不同。<br /> <br /> == 线虫动物门 ==<br /> <br /> === 线虫门的分类 ===<br /> Chitwood  和  Chitwood  在  1933  年基于解剖学的蛔虫分类法一直盛行，将线虫动物门分为无尾感器纲和尾感器纲；后分别改称腺肾纲和胞管肾纲（侧尾腺纲）。后来发现，尾感器纲较为进化，而无尾感器纲可能是并系。<br /> <br /> 分子研究区分了三个纲： Chromadorea、、Enoplia、  Dorylaimia。<br /> <br /> '''CHROMADOREA：有孔状/裂隙状化感器，从唇上的孔或裂隙，以至于唇后方的复杂的螺旋；角质层有环，有时饰有突起和刚毛；有或没有phasmids，通常位于后部。食管通常分为球'''<br /> <br /> '''状，有  3  至  5  个食管腺；排泄系统呈腺状或管状，雌性有  1  或  2  个卵巢。'''<br /> <br /> '''ENOPLIA：有口袋状化感器，不是螺旋状，通常位于唇后，角质层光滑或有细条纹。'''<br /> <br /> <br /> '''线虫的体型呈现'''<br /> <br /> '''体壁，支撑和运动'''<br /> <br /> '''与其他蜕皮动物一样，身体被一层发育良好的角质层覆盖，角质层由表皮分泌，而这表皮便缺乏可动的纤毛。角质层主要由lipids and proteins associated with mucopolysaccharides组成。胶原蛋白，一种结构蛋白，是主要成分(&gt;80%).除了某些物种的咽部，线虫角质层缺乏几丁质。此外，卵壳中也有几丁质。角质层是半透性的，除了作为纵向肌肉收缩的拮抗剂外，还起到分泌排泄或物质吸收的作用。'''<br /> <br /> '''新的蜕皮后角质层通常具有表皮褶皱（皱襞），新的角质层在其上变得高度卷曲，使得蠕虫在蜕皮后能够以手风琴状的方式增加长度。'''<br /> <br /> '''表皮随着类群的变化而变化，从单细胞到合胞体。通常加厚形成背、腹、侧索。背腹索包含不成对的纵神经，侧索包含排泄管和神经元。表皮内侧一层纵肌，是斜纹肌。'''<br /> <br /> {{:Invertebrates Fourth Edition 译文版}}<br /> <br /> {{学科分类}}<br /> <br /> [[Category:动物学]]<br /> <br /> {{:Invertebrates（Brusca）Fourth Edition 重制版}}</div>

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<p>Sofia：​自动添加《Invertebrates（Brusca）Fourth Edition 重制版》章节导航</p> <hr /> <div>[[文件:海绵的卵裂.jpg|缩略图|从上往下：Trichimella、Calciblastula、Amphiblastula、Cinctoblastula、Disphaerula、直接发育、Parenchymella；从左往右：卵裂阶段、囊胚阶段、形态发生阶段、幼虫阶段。]]<br /> <br /> === 繁殖与个体发育 ===<br /> 多数研究者认为海绵的原始卵裂形式是辐射卵裂，这种卵裂方式存在于许多寻常海绵中，即是其他的三个纲中都未见到辐射卵裂。还有三种全裂方式：混乱卵裂(chaotic)，又叫安那其(anarchic)卵裂[我超，安！]。混乱卵裂没有特定·的图式，看起来是随机的，是许多寻常海绵的特点。Table palintomy[暂未找到译名]，卵裂沟斜斜地穿过动物-植物轴，这存在于一些钙质海绵中（石灰海绵亚纲Calcaronea）。这种卵裂方式令人想起团藻[对，那个绿藻]和几种群体原生动物。然而，钙质海绵亚纲也有及其独特的翻转过程，使得一些研究者认为palintomy是一种异常的卵裂。多极卵裂Polyaxial cleavage是''Halisarca''属的特点，可能也是Calcinea (Calcarea)的特点。其以8细胞期至16细胞期之间形成垂直于表面的卵裂沟为特征，对称轴从中心以一定角度辐射出去。然而，16细胞期后，卵裂变为混乱的。<br /> <br /> <br /> 已经识别了七种幼虫：<br /> <br /> Trichimella（六放海绵Hexactinellida）<br /> <br /> Calciblastula（钙质海绵: 钙质海绵亚纲Calcinea）<br /> <br /> 两囊幼虫amphiblastula (钙质海绵: 石灰海绵亚纲Calcaronea)<br /> <br /> cinctoblastula (同骨海绵纲Homoscleromorpha),<br /> <br /> disphaerula (寻常海绵纲: Halisarcidae),<br /> <br /> 直接发育(寻常海绵纲、四射海绵目的Tetilla)<br /> <br /> 实胚幼虫parenchymella (大多数寻常海绵纲).<br /> <br /> <br /> 游泳的海绵幼虫（例如，两囊幼虫、cinctoblastula、实胚幼虫）前端具纤毛的一极推测对应于其他后生动物幼虫的动物极，正是这个幼虫区域产生了内部领细胞层，而后端的阿米巴样细胞产生了成体海绵的外层（扁细胞层）。<br /> <br /> ==== 钙质海绵纲 ====<br /> 据了解，所有钙质海绵都是胎生的。在 钙质海绵亚纲中，卵母细胞在中胶层内发育并增大（通过吞噬邻近的变形细胞）。胚胎也在中胶层中发育，完全等裂产生腔囊胚。某些物种的腔囊胚有两种类型的细胞：具纤毛外部细胞和一两个后部颗粒细胞。在幼虫释放后，幼虫附着在基质之前，在某些物种中，一些细胞会失去纤毛并通过内移（ingression）进入囊胚腔。<br /> <br /> 在石灰海绵亚纲中，卵母细胞从领细胞分化并进入中胶层。经过一段时间的生长后，它们会迁移到海绵的外围。完全等裂，前三次分裂是经向的。第四次（至少在 ''Leucosolenia'' 中）是倾斜的，几乎与群体绿藻 团藻''Volvox'' 中的卵裂完全相同——一种被称为table palintomy的卵裂（见上文）。由此产生的胚胎是一个杯状的囊胚，在最靠近领细胞层的一侧有一个小开口。虽然大多数细胞继续在同一方式分裂，形成单层上皮，但少数直接位于领细胞层下的细胞则不会;这些细胞仍然比其他细胞大得多，它们的细胞质充满了大卵黄颗粒。石灰海绵亚纲的胚胎最不寻常的特征是纤毛，它发生于小卵裂球上，伸入囊胚腔内部（其他海绵都伸向外部），这被称为 stomoblastula。为了抵达最终的取向，胚胎从内而外翻转过来。最后形成前部有纤毛细胞、后部有颗粒细胞、内部有富含营养的变形细胞的两囊幼虫。<br /> <br /> ==== 六放海绵纲 ====<br /> 32细胞期前是不同步的完全等裂，第一次经裂，第二次要么是赤道面卵裂equatorial，要么是旋转的rotational。16-32细胞期时，形成空心的囊胚。接下来的卵裂时不等的，形成小细胞排列在外部，大细胞富含卵黄排列在内部。大细胞不等卵裂，渐渐填充了囊胚腔，最后包被了外部的小细胞。很独特的，大细胞会互相融合，形成一个多核体，即新生的trabecular syncytium。小细胞保持分离，形成最后的领细胞；领细胞是多纤毛的，也和其他海绵不同。<br /> <br /> ==== 寻常海绵纲 ====<br /> 完全卵裂，相等或不等，往往是混乱卵裂，某些物种的卵裂球有大有小。小卵裂球产生纤毛，最终大小卵裂球分层，具纤毛的小细胞覆盖整个胚胎表面。这被称为多极分层multipolar delamination。这时可能是空心的或者实心的。<br /> <br /> ''Halisarca''属十分独特。完全缺乏骨针，有混合的发育途径。全部雌雄异体，胎生。完全等裂，空心囊胚。细胞通过单极和多极内移进入囊胚腔。外部细胞产生纤毛，内部细胞成为原细胞archaeocytes。此时的胚胎可以产生三种不同的幼虫（即使是同一个个体的子代）：第一个是个腔囊胚，单层细胞围绕着一个小腔。第二个是实胚幼虫，外部一层细胞，包裹着内部一团变形细胞。第三种具有两层上皮细胞，围绕着一个小腔，这种幼虫称为disphaerula。三种幼虫在外部有纤毛表示极性，以 left-handed方向旋转。<br /> <br /> ==== 同骨海绵纲 ====<br /> 同骨海绵是均黄卵isolecithal，rich in yolk inclusions，被一层来自亲本的内扁细胞和共生细菌包裹。全裂等裂，第三次后变得不规则，不同步，形成一个桑椹胚。64细胞期，外层分化。接近表面的卵裂球分裂变快，而内部的细胞迁移到表层，最后胚胎变成单层细胞，内部包裹着亲本细胞和共生细菌。细胞由内而外的迁移，不仅是海绵中独一份，在整个后生动物中也是独一份。这被称为multipolar egression多极外移。<br /> <br /> 同骨海绵的幼虫曾被称为两囊幼虫，因为他看起来一部分有纤毛，而另一部分没有，与真正的两囊幼虫类似；然而它们的形态发生完全不同，并且实际上是完全覆盖纤毛的。这种幼虫被称为cinctoblastula，描述了其细胞核内的类结晶体。这种类结晶体形成了围绕后端的一个环。观察过的幼虫都以left-handed方式旋转。<br /> <br /> <br /> '''水沟系'''<br /> <br /> * 单沟型：表层扁细胞直接特化为孔细胞，水经孔细胞直接进入中央腔，因为扁细胞内部有肌丝可以轻微的活动，所以孔细胞可以对水孔大小进行调节。<br /> * 双沟型：单沟型海绵向外突出，于是外界凹进去的部分形成流入管，内部凹进去的部分形成辐射管（还有鞭毛室，鞭毛管等名）。进入辐射管的孔叫做前幽门孔，离开辐射管的孔叫做后幽门孔，双沟型后幽门孔直通中央腔。部分种群的中胶层发达，扁细胞增殖，导致整个海绵更肿大，最终形成一个更小的中央腔和更多的皮层孔，这有利于增大水流量。<br /> * 复沟型：两个幽门孔变深形成前后幽门管，并具有中央细胞可以控制后幽门管的开闭，调节水量。皮层孔进一步发展，进而产生皮下腔。鞭毛室的总截面积更大，导致水流经鞭毛室的流速更低，便于领鞭毛细胞进食。中央腔挤压成管状，不唯一。<br /> <br /> {{:Invertebrates Fourth Edition 译文版}}<br /> <br /> <br /> {{学科分类}}<br /> <br /> [[Category:动物学]]<br /> <br /> {{:Invertebrates（Brusca）Fourth Edition 重制版}}</div>

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<p>Sofia：​自动添加《Molecular Population Genetics》章节导航</p> <hr /> <div>&lt;blockquote&gt;&quot;''同一类群所有生物的亲缘关系有时被比喻为一棵大树……芽会通过生长生出新芽，而这些新芽如果生机勃勃，就会长出新枝，覆盖四周许多较弱的枝条，因此我相信，生命之树的世代相传也是如此，它用枯死和折断的枝条填满地壳，用不断生长的美丽枝条覆盖地表。''&quot;<br /> <br /> --Charles Darwin,《物种起源》,1859&lt;/blockquote&gt;系统学是研究生物多样性及其起源的学科。系统学家识别和区分物种，描述和命名新的分类群，提供工具帮助其他人识别标本，推断物种和更高分类群之间的进化关系，进行生物地理分析，并建立反映进化历史的分类系统。系统研究的这些阶段以高度迭代的方式重叠和循环。总之，系统学的作用是记录和了解地球的生物多样性，重建生物多样性的历史，并制定现存和灭绝生物的自然（进化）分类。<br /> <br /> 正如您的家族随时间而不断壮大，您与父母和祖父母之间也存在联系一样，地球上曾生活过的所有生物都通过遗传上的血统相互关联。'''系统发育树'''（Phylogenetic trees）是由分支和节点组成的图表，描绘了遗传信息随时间推移发生的流动，以说明生物之间的关系。由于所有生物都彼此相关，因此只有一棵生命之树，其分支模式反映了地球上所有物种之间的进化关系（达尔文的“伟大的生命之树”）。然而，由于多细胞生命已经在地球上进化了数亿年，而且我们无法穿越时空，所以我们无法确定树上的所有分支是如何相互关联的。也就是说，并没有一份自生命伊始起，便记载了遗传血统模式的普遍记录。但是，这种模式的痕迹存在于当今地球上所有生物的解剖结构和基因组中，甚至存在于一些已不复存在的生物中（例如，化石可以进行解剖学研究，古代 DNA 使我们能够研究一些一百多万年前灭绝的生物的基因组）。系统学家试图揭示这些痕迹，以建立生物和物种间如何相互关联的假设。他们通过创建和分析生物之间同源解剖或遗传特征（称之为'''性状'''，character）的数据矩阵来实现这一点。随着新数据的出现并添加到分析中，树会被修改并更新。正如我们将在本书中看到的那样，许多关于动物关系的长期观点最近已被 DNA 序列数据的分析改变（甚至推翻）。在本章中，我们将介绍系统发育分析和分类构建的基础。<br /> <br /> === 系统发生、单系、并系与多系 ===<br /> 系统发育树是一种描述生物体相互关系的分支图''（图 2.1）''。它是一种表达物种或其他分类群之间关系（或遗传连通性）的图形方式，实际上是一组嵌套的进化枝。理解'''进化枝，或单系群'''（monophyletic group，or clade）的概念对于正确解读系统发育树至关重要。单系群或进化枝是一组物种，包括共同祖先和该共同祖先的所有后代——也就是说，它是生命之树中一个独特的分支。单系群可以通过切割一次单个分支与生命之树的其余部分分开。如果你能走到生命之树前，砍下一根树枝，任何树枝，并将修剪下来的树枝拿在手中，你就得到了一个单系群''（图 2.1）''。单系群是一组彼此是近亲的分类群。你和你的直系亲属（你、你的父母和你的兄弟姐妹）就是单系群的一个例子。<br /> <br /> 文献中发表的大多数树（以及本文中）都是有根的，有根的树不仅显示了关系模式，而且还表明了时间沿着树枝移动的方向——无论树如何绘制，总是从树的根（最老）到树的尖端（最年轻）''（图 2.2）''。因此，有根的树描绘了祖先-后代的关系。<br /> <br /> 如果我们确切地知道生命之树的形状，那么系统学家只会建立单系群''（图 2.3A）''。但由于我们尚未完全了解树的形状，有时系统学家会错误地创建并系群或多系群。这些类型的非单系分类群或物种群如''图 2.3B'' 所示。<br /> <br /> 一个群体，其成员物种都是共同祖先的后代，但不包含从该祖先传下来的所有物种，则称为'''并系群'''（paraphyletic group）''（图 2.3B，O + P 群）''。并系群意味着由于某种原因，自然群体中的一个或多个成员被分离出来并放置在不同的组中。正如我们将看到的，当今的动物分类中存在许多并系群。&lt;sup&gt;1&lt;/sup&gt;<br /> <br /> &lt;small&gt;&lt;sup&gt;1&lt;/sup&gt;一些生物学家认为并系群是单系群的一个子集，使用术语“全系群”来表示严格的单系群。然而，这些术语的这种替代用法并不常见，我们在本书中不使用它。&lt;/small&gt;<br /> <br /> '''多系群'''（polyphyletic group）是指其成员物种来自两个或多个不同的直系祖先的群体。由于对所讨论的分类群与其他分类群的关系了解不足，因此提出了这种复合群''（图 2.3B，Q + R 群）''。多系群的建立通常是由于用以识别和确认该群体的特征或性状并非同源，而是进化趋同的结果。&lt;sup&gt;2&lt;/sup&gt;系统学家的主要目标之一是发现这种多系或“人工”分类群，并通过仔细研究，将其成员重新归类为适当的单系分类群。<br /> <br /> &lt;small&gt;&lt;sup&gt;2&lt;/sup&gt;有许多以前建立的群体现在已知或怀疑是多系群的例子。例如，古老的拟环虫门（Gephyrea）包含我们现在分为三个不同分类单元的物种，它们彼此之间只有远亲关系——星虫（Sipuncula）、Thalassematidae科（现属螠虫--译者注） 和 Priapula（现应归属曳鳃动物门Priapulida，抑或两者为同一类群--译者注）（前两个现在属于环节动物门，但关系并不密切）。另一个例子是古老的辐射对称动物，它包括所有具有辐射对称性的动物（例如，刺胞动物、栉水母和棘皮动物）。最近，分子系统发育学表明，体节动物(Articulata)，包含环节动物和节肢动物（及其亲属），是多系群。多系群通常因用于识别和确认它们的特征或性状是不同谱系进化趋同的结果而被建立。趋同进化通常只能通过仔细的比较胚胎学或解剖学研究来理解，有时需要几代专家的努力。例如，环节动物和节肢动物节段发育之间可能的趋同性，其复杂本质尚未完全阐明。（有关Articulata一词的其他相关信息详见“讨论”页面。--译者注）&lt;/small&gt;<br /> <br /> === 同源性 ===<br /> 如前所述，系统学家通过比较可遗传的特征（称为性状）来推断系统发生，他们将性状分解为性状状态，以获取他们所研究的分类群中该性状的形式变化。在实际使用中，“性状”和“性状状态”这两个术语经常互换使用。这种做法可能有点令人困惑。当在讨论两个或多个同源物（这里的原文为homologues,直译为“同源物”，个人认为可理解为同源性状--译者注）时，“性状”一词通常与“性状状态”具有相同的含义。性状和性状状态（通常是形态学或分子学的）被组装成数据矩阵（图 2.4），其中每个性状相当于同源性的假设。<br /> <br /> 同源性状具有共同的祖先。也就是说，它们是存在于两个或多个分类群中并从其共同祖先那里遗传下来的特征。同源性状具有共同的进化历史。伴随着变异的进化传承过程产生了一种同源性的等级模式，可以通过现存生物的谱系来追溯。我们利用这种模式来重建生命的历史。同源结构的功能可能相似或不同，但这与所涉及结构的底层同源性无关。我们识别解剖同源物的能力通常依赖于发育或胚胎学证据、解剖结构的相对位置或核酸、蛋白质序列中的核苷酸或氨基酸。<br /> <br /> {{:Molecular Population Genetics}}</div>

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<p>Sofia：​自动更新《Molecular Population Genetics》章节索引模板</p> <hr /> <div>&lt;includeonly&gt;<br /> &lt;div style=&quot;width: 100%; margin: 1em 0; border: 1px solid #a2a9b1; background-color: #f8f9fa; font-size: 95%; line-height: 1.5em; box-sizing: border-box;&quot;&gt;<br /> &lt;div style=&quot;text-align: center; font-size: 125%; font-weight: bold; padding: 0.4em; background: #ececec; border-bottom: 1px solid #a2a9b1;&quot;&gt;Molecular Population Genetics&lt;/div&gt;<br /> &lt;div style=&quot;display: flex; flex-wrap: wrap; justify-content: center; padding: 0.5em;&quot;&gt;<br /> &lt;div style=&quot;flex: 1; min-width: 300px; padding: 0.5em; text-align: center;&quot;&gt;<br /> [[第一章 进化的模型]]&lt;br&gt;<br /> [[第2章 系统学、系统发生与分类]]&lt;br&gt;<br /> [[第三章 描述变异]]&lt;br&gt;<br /> [[第五章 种群结构]]&lt;br&gt;<br /> [[第六章 溯祖]]&lt;br&gt;<br /> [[第八章 连锁选择]]<br /> &lt;/div&gt;<br /> &lt;/div&gt;<br /> &lt;div style=&quot;text-align: center; font-size: 90%; padding: 0.5em; border-top: 1px solid #a2a9b1; background: #ececec;&quot;&gt;<br /> [[生物]]<br /> &lt;/div&gt;<br /> &lt;/div&gt;<br /> &lt;/includeonly&gt;<br /> &lt;noinclude&gt;<br /> == 模板说明 ==<br /> 这是《Molecular Population Genetics》的章节索引模板<br /> &lt;/noinclude&gt;</div>

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<p>Sofia：​自动添加 Sofia 模板和分类</p> <hr /> <div>八个蜕皮动物门分为三个亚群：有颚动物（动吻曳鳃铠甲），泛节肢动物（有爪缓步节支），线虫动物（线虫和线形）。<br /> <br /> 两门的成虫都有特殊的角质层，绝大多数不含几丁质（几丁质只见于线虫的咽部角质层和线形的幼虫角质层），两个门都没有原肾管（protonephridia），没有环肌。表皮有表皮索，而且背腹两条表皮索似乎是线虫+线性的祖先特征。表皮索中有纵向神经索。这两个门的雄性都有泄殖腔，但海洋线虫Nectonema  属除外，它们的肠道后部缩小，因此无法形成泄殖腔。然而，雌性线虫的生殖口与肛门分开，通常位于身体中部，远离肛门。另一个相应的特征是精子细胞中缺乏纤毛，尽管这两个分类群的精子都经过了高度改良，结构上彼此不可比拟，而且缺乏纤毛在陆生动物中很常见。与其他蜕皮动物类群一样，线虫缺乏可动的表皮纤毛。<br /> <br /> 线虫在发育过程中会蜕皮三到四次；成虫前期与成虫大体相似，因此被称为juveniles（尽管“larva”一词也经常使用，尤其是寄生物种）。线形只观察到一次蜕皮，即寄生生活结束时。线性有真正的幼虫，它是微观的（&lt;  1  毫米），形态与成虫完全不同。<br /> <br /> == 线虫动物门 ==<br /> <br /> === 线虫门的分类 ===<br /> Chitwood  和  Chitwood  在  1933  年基于解剖学的蛔虫分类法一直盛行，将线虫动物门分为无尾感器纲和尾感器纲；后分别改称腺肾纲和胞管肾纲（侧尾腺纲）。后来发现，尾感器纲较为进化，而无尾感器纲可能是并系。<br /> <br /> 分子研究区分了三个纲： Chromadorea、、Enoplia、  Dorylaimia。<br /> <br /> '''CHROMADOREA：有孔状/裂隙状化感器，从唇上的孔或裂隙，以至于唇后方的复杂的螺旋；角质层有环，有时饰有突起和刚毛；有或没有phasmids，通常位于后部。食管通常分为球'''<br /> <br /> '''状，有  3  至  5  个食管腺；排泄系统呈腺状或管状，雌性有  1  或  2  个卵巢。'''<br /> <br /> '''ENOPLIA：有口袋状化感器，不是螺旋状，通常位于唇后，角质层光滑或有细条纹。'''<br /> <br /> <br /> '''线虫的体型呈现'''<br /> <br /> '''体壁，支撑和运动'''<br /> <br /> '''与其他蜕皮动物一样，身体被一层发育良好的角质层覆盖，角质层由表皮分泌，而这表皮便缺乏可动的纤毛。角质层主要由lipids and proteins associated with mucopolysaccharides组成。胶原蛋白，一种结构蛋白，是主要成分(&gt;80%).除了某些物种的咽部，线虫角质层缺乏几丁质。此外，卵壳中也有几丁质。角质层是半透性的，除了作为纵向肌肉收缩的拮抗剂外，还起到分泌排泄或物质吸收的作用。'''<br /> <br /> '''新的蜕皮后角质层通常具有表皮褶皱（皱襞），新的角质层在其上变得高度卷曲，使得蠕虫在蜕皮后能够以手风琴状的方式增加长度。'''<br /> <br /> '''表皮随着类群的变化而变化，从单细胞到合胞体。通常加厚形成背、腹、侧索。背腹索包含不成对的纵神经，侧索包含排泄管和神经元。表皮内侧一层纵肌，是斜纹肌。'''<br /> <br /> {{:Invertebrates Fourth Edition 译文版}}<br /> <br /> {{学科分类}}<br /> <br /> [[Category:动物学]]<br /> <br /> {{:Invertebrates（Brusca）Fourth Edition 重制版}}<br /> <br /> {{学科分类}}<br /> <br /> [[Category:动物学]]</div>

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<p>Sofia：​自动添加 Sofia 模板和分类</p> <hr /> <div>[[文件:海绵的卵裂.jpg|缩略图|从上往下：Trichimella、Calciblastula、Amphiblastula、Cinctoblastula、Disphaerula、直接发育、Parenchymella；从左往右：卵裂阶段、囊胚阶段、形态发生阶段、幼虫阶段。]]<br /> <br /> === 繁殖与个体发育 ===<br /> 多数研究者认为海绵的原始卵裂形式是辐射卵裂，这种卵裂方式存在于许多寻常海绵中，即是其他的三个纲中都未见到辐射卵裂。还有三种全裂方式：混乱卵裂(chaotic)，又叫安那其(anarchic)卵裂[我超，安！]。混乱卵裂没有特定·的图式，看起来是随机的，是许多寻常海绵的特点。Table palintomy[暂未找到译名]，卵裂沟斜斜地穿过动物-植物轴，这存在于一些钙质海绵中（石灰海绵亚纲Calcaronea）。这种卵裂方式令人想起团藻[对，那个绿藻]和几种群体原生动物。然而，钙质海绵亚纲也有及其独特的翻转过程，使得一些研究者认为palintomy是一种异常的卵裂。多极卵裂Polyaxial cleavage是''Halisarca''属的特点，可能也是Calcinea (Calcarea)的特点。其以8细胞期至16细胞期之间形成垂直于表面的卵裂沟为特征，对称轴从中心以一定角度辐射出去。然而，16细胞期后，卵裂变为混乱的。<br /> <br /> <br /> 已经识别了七种幼虫：<br /> <br /> Trichimella（六放海绵Hexactinellida）<br /> <br /> Calciblastula（钙质海绵: 钙质海绵亚纲Calcinea）<br /> <br /> 两囊幼虫amphiblastula (钙质海绵: 石灰海绵亚纲Calcaronea)<br /> <br /> cinctoblastula (同骨海绵纲Homoscleromorpha),<br /> <br /> disphaerula (寻常海绵纲: Halisarcidae),<br /> <br /> 直接发育(寻常海绵纲、四射海绵目的Tetilla)<br /> <br /> 实胚幼虫parenchymella (大多数寻常海绵纲).<br /> <br /> <br /> 游泳的海绵幼虫（例如，两囊幼虫、cinctoblastula、实胚幼虫）前端具纤毛的一极推测对应于其他后生动物幼虫的动物极，正是这个幼虫区域产生了内部领细胞层，而后端的阿米巴样细胞产生了成体海绵的外层（扁细胞层）。<br /> <br /> ==== 钙质海绵纲 ====<br /> 据了解，所有钙质海绵都是胎生的。在 钙质海绵亚纲中，卵母细胞在中胶层内发育并增大（通过吞噬邻近的变形细胞）。胚胎也在中胶层中发育，完全等裂产生腔囊胚。某些物种的腔囊胚有两种类型的细胞：具纤毛外部细胞和一两个后部颗粒细胞。在幼虫释放后，幼虫附着在基质之前，在某些物种中，一些细胞会失去纤毛并通过内移（ingression）进入囊胚腔。<br /> <br /> 在石灰海绵亚纲中，卵母细胞从领细胞分化并进入中胶层。经过一段时间的生长后，它们会迁移到海绵的外围。完全等裂，前三次分裂是经向的。第四次（至少在 ''Leucosolenia'' 中）是倾斜的，几乎与群体绿藻 团藻''Volvox'' 中的卵裂完全相同——一种被称为table palintomy的卵裂（见上文）。由此产生的胚胎是一个杯状的囊胚，在最靠近领细胞层的一侧有一个小开口。虽然大多数细胞继续在同一方式分裂，形成单层上皮，但少数直接位于领细胞层下的细胞则不会;这些细胞仍然比其他细胞大得多，它们的细胞质充满了大卵黄颗粒。石灰海绵亚纲的胚胎最不寻常的特征是纤毛，它发生于小卵裂球上，伸入囊胚腔内部（其他海绵都伸向外部），这被称为 stomoblastula。为了抵达最终的取向，胚胎从内而外翻转过来。最后形成前部有纤毛细胞、后部有颗粒细胞、内部有富含营养的变形细胞的两囊幼虫。<br /> <br /> ==== 六放海绵纲 ====<br /> 32细胞期前是不同步的完全等裂，第一次经裂，第二次要么是赤道面卵裂equatorial，要么是旋转的rotational。16-32细胞期时，形成空心的囊胚。接下来的卵裂时不等的，形成小细胞排列在外部，大细胞富含卵黄排列在内部。大细胞不等卵裂，渐渐填充了囊胚腔，最后包被了外部的小细胞。很独特的，大细胞会互相融合，形成一个多核体，即新生的trabecular syncytium。小细胞保持分离，形成最后的领细胞；领细胞是多纤毛的，也和其他海绵不同。<br /> <br /> ==== 寻常海绵纲 ====<br /> 完全卵裂，相等或不等，往往是混乱卵裂，某些物种的卵裂球有大有小。小卵裂球产生纤毛，最终大小卵裂球分层，具纤毛的小细胞覆盖整个胚胎表面。这被称为多极分层multipolar delamination。这时可能是空心的或者实心的。<br /> <br /> ''Halisarca''属十分独特。完全缺乏骨针，有混合的发育途径。全部雌雄异体，胎生。完全等裂，空心囊胚。细胞通过单极和多极内移进入囊胚腔。外部细胞产生纤毛，内部细胞成为原细胞archaeocytes。此时的胚胎可以产生三种不同的幼虫（即使是同一个个体的子代）：第一个是个腔囊胚，单层细胞围绕着一个小腔。第二个是实胚幼虫，外部一层细胞，包裹着内部一团变形细胞。第三种具有两层上皮细胞，围绕着一个小腔，这种幼虫称为disphaerula。三种幼虫在外部有纤毛表示极性，以 left-handed方向旋转。<br /> <br /> ==== 同骨海绵纲 ====<br /> 同骨海绵是均黄卵isolecithal，rich in yolk inclusions，被一层来自亲本的内扁细胞和共生细菌包裹。全裂等裂，第三次后变得不规则，不同步，形成一个桑椹胚。64细胞期，外层分化。接近表面的卵裂球分裂变快，而内部的细胞迁移到表层，最后胚胎变成单层细胞，内部包裹着亲本细胞和共生细菌。细胞由内而外的迁移，不仅是海绵中独一份，在整个后生动物中也是独一份。这被称为multipolar egression多极外移。<br /> <br /> 同骨海绵的幼虫曾被称为两囊幼虫，因为他看起来一部分有纤毛，而另一部分没有，与真正的两囊幼虫类似；然而它们的形态发生完全不同，并且实际上是完全覆盖纤毛的。这种幼虫被称为cinctoblastula，描述了其细胞核内的类结晶体。这种类结晶体形成了围绕后端的一个环。观察过的幼虫都以left-handed方式旋转。<br /> <br /> <br /> '''水沟系'''<br /> <br /> * 单沟型：表层扁细胞直接特化为孔细胞，水经孔细胞直接进入中央腔，因为扁细胞内部有肌丝可以轻微的活动，所以孔细胞可以对水孔大小进行调节。<br /> * 双沟型：单沟型海绵向外突出，于是外界凹进去的部分形成流入管，内部凹进去的部分形成辐射管（还有鞭毛室，鞭毛管等名）。进入辐射管的孔叫做前幽门孔，离开辐射管的孔叫做后幽门孔，双沟型后幽门孔直通中央腔。部分种群的中胶层发达，扁细胞增殖，导致整个海绵更肿大，最终形成一个更小的中央腔和更多的皮层孔，这有利于增大水流量。<br /> * 复沟型：两个幽门孔变深形成前后幽门管，并具有中央细胞可以控制后幽门管的开闭，调节水量。皮层孔进一步发展，进而产生皮下腔。鞭毛室的总截面积更大，导致水流经鞭毛室的流速更低，便于领鞭毛细胞进食。中央腔挤压成管状，不唯一。<br /> <br /> {{:Invertebrates Fourth Edition 译文版}}<br /> <br /> {{:Invertebrates（Brusca）Fourth Edition 重制版}}<br /> <br /> {{学科分类}}<br /> <br /> [[Category:动物学]]</div>

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<p>Sofia：​自动添加《Invertebrates（Brusca）Fourth Edition 重制版》章节导航</p> <hr /> <div>八个蜕皮动物门分为三个亚群：有颚动物（动吻曳鳃铠甲），泛节肢动物（有爪缓步节支），线虫动物（线虫和线形）。<br /> <br /> 两门的成虫都有特殊的角质层，绝大多数不含几丁质（几丁质只见于线虫的咽部角质层和线形的幼虫角质层），两个门都没有原肾管（protonephridia），没有环肌。表皮有表皮索，而且背腹两条表皮索似乎是线虫+线性的祖先特征。表皮索中有纵向神经索。这两个门的雄性都有泄殖腔，但海洋线虫Nectonema  属除外，它们的肠道后部缩小，因此无法形成泄殖腔。然而，雌性线虫的生殖口与肛门分开，通常位于身体中部，远离肛门。另一个相应的特征是精子细胞中缺乏纤毛，尽管这两个分类群的精子都经过了高度改良，结构上彼此不可比拟，而且缺乏纤毛在陆生动物中很常见。与其他蜕皮动物类群一样，线虫缺乏可动的表皮纤毛。<br /> <br /> 线虫在发育过程中会蜕皮三到四次；成虫前期与成虫大体相似，因此被称为juveniles（尽管“larva”一词也经常使用，尤其是寄生物种）。线形只观察到一次蜕皮，即寄生生活结束时。线性有真正的幼虫，它是微观的（&lt;  1  毫米），形态与成虫完全不同。<br /> <br /> == 线虫动物门 ==<br /> <br /> === 线虫门的分类 ===<br /> Chitwood  和  Chitwood  在  1933  年基于解剖学的蛔虫分类法一直盛行，将线虫动物门分为无尾感器纲和尾感器纲；后分别改称腺肾纲和胞管肾纲（侧尾腺纲）。后来发现，尾感器纲较为进化，而无尾感器纲可能是并系。<br /> <br /> 分子研究区分了三个纲： Chromadorea、、Enoplia、  Dorylaimia。<br /> <br /> '''CHROMADOREA：有孔状/裂隙状化感器，从唇上的孔或裂隙，以至于唇后方的复杂的螺旋；角质层有环，有时饰有突起和刚毛；有或没有phasmids，通常位于后部。食管通常分为球'''<br /> <br /> '''状，有  3  至  5  个食管腺；排泄系统呈腺状或管状，雌性有  1  或  2  个卵巢。'''<br /> <br /> '''ENOPLIA：有口袋状化感器，不是螺旋状，通常位于唇后，角质层光滑或有细条纹。'''<br /> <br /> <br /> '''线虫的体型呈现'''<br /> <br /> '''体壁，支撑和运动'''<br /> <br /> '''与其他蜕皮动物一样，身体被一层发育良好的角质层覆盖，角质层由表皮分泌，而这表皮便缺乏可动的纤毛。角质层主要由lipids and proteins associated with mucopolysaccharides组成。胶原蛋白，一种结构蛋白，是主要成分(&gt;80%).除了某些物种的咽部，线虫角质层缺乏几丁质。此外，卵壳中也有几丁质。角质层是半透性的，除了作为纵向肌肉收缩的拮抗剂外，还起到分泌排泄或物质吸收的作用。'''<br /> <br /> '''新的蜕皮后角质层通常具有表皮褶皱（皱襞），新的角质层在其上变得高度卷曲，使得蠕虫在蜕皮后能够以手风琴状的方式增加长度。'''<br /> <br /> '''表皮随着类群的变化而变化，从单细胞到合胞体。通常加厚形成背、腹、侧索。背腹索包含不成对的纵神经，侧索包含排泄管和神经元。表皮内侧一层纵肌，是斜纹肌。'''<br /> <br /> {{:Invertebrates Fourth Edition 译文版}}<br /> <br /> {{学科分类}}<br /> <br /> [[Category:动物学]]<br /> <br /> {{:Invertebrates（Brusca）Fourth Edition 重制版}}</div>

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