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氨基酸的化学反应
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= 氨基酸的化学反应 = == 一、α-NH<sub>2</sub>参与的反应 == === 1. 伯胺特征的反应:黄色反应 === C<sub>α</sub>-NH<sub>2</sub> + HNO<sub>2</sub> → C<sub>α</sub>—oh + H<sub>2</sub>O + N<sub>2</sub>↑ 每分子N<sub>2</sub>中有一个原子来自α-NH<sub>2</sub>,此反应是Van-Slyke[定氮]法测量氨基酸含量的基础。Lys和AECys的伯胺基也可发生此反应,但相对较慢。 === 2. 酰基化反应:去质子化的—NH<sub>2</sub>与酰氯或酸酐反应 === 机理:氨基氮对亲电的羰基碳的进攻。 ==== a. 与丹磺酰氯(DNS-Cl)反应 ==== 产物DNS-aa是强烈的荧光分子。若使用DNS-Cl代替DNFB进行Sanger反应,则为DNS-Cl-Sanger法,仅需微量样品即可测定肽链的N端aa残基。 ==== b. 其他 ==== 常见的还有苄氧酰氯酯(Z-酯)、邻苯二甲酸酐等。保护剂Boc-酯(酸性下脱去)、Fmoc酯(碱脱)用于肽的固相合成。 === 3. 烃基化反应 === 机理:氨基氮对亲电的C—X进攻,取代反应。 ==== a. 与DNFB/FDNB(2, 4-二硝基氟苯) ==== 与DNFB/FDNB(2, 4-二硝基氟苯)即Sanger试剂反应,生成黄色的DNP-aa。做正相层析分离,然后和标准DNP-aa做对比,可知N端aa。 ==== b. 与PITC(苯异硫氰酸酯)反应 ==== 与PITC在pH = 8.3形成PTC-aa,然后在无水强酸中环化为PTH-aa。PTH-aa即可分析。 如果肽链的N端氨基参与了PITC反应,生成PTH-肽,那么它可以在无水HF中进行环化断裂,生成PTH-aa和N端少一个氨基酸的肽链。抽提PTH-aa后可重复反应,即为Edman降解法。 已有自动化的Edman降解法测序仪,速率约40 min/aa,每轮转化率可达99.9%,约能测50个aa残基。 === 4. 与醛类的加成 === ---NH<sub>2</sub> + HOC--- → ---CH=N--- ==== a. 与甲醛的反应 ==== ---NH<sub>3</sub><sup>+</sup> → ---NH<sub>2</sub> + H<sup>+</sup> --<sup>HCHO</sup>→ ---NHCH<sub>2</sub>oh --<sup>HCHO</sup>→ ---N(CH<sub>2</sub>OH)<sub>2</sub> 氨基酸的α-COOH和α-NH<sub>2</sub>的p''K''值偏离常见指示剂太远,不容易滴定。当加入过量甲醛时,平衡右移,n(H<sup>+</sup>) = n(---NH<sub>3</sub><sup>+</sup>)<sub>0</sub>,此时的α-NH<sub>2</sub>表观p''K''值刚好落在酚酞的指示范围内,可以通过滴定H<sup>+</sup>测量原游离氨基的浓度,进而判读肽链水解或合成的速度。 ==== b. 与PLP反应:转氨基反应的重要原理 ==== === 5. 脱氨基反应 === 反应形成α-酮酸,是aa分解的一个重要步骤。 === 6. 与荧光胺反应 === 生成产物具有强烈荧光性质,可分析ng级别的aa。 == 二、α-COOH参与的反应 == === 1. 成酯/成盐反应 === 当---COOH与钠、钾成盐或称短脂肪酸酯时,其反应活性降低而α-氨基活性升高,用于羧基的保护和氨基的活化。(因此,涉及α-NH<sub>2</sub>的反应大多在碱性下进行,一方面是因为碱性环境下氨基的亲核性能变好,另一方面则出于此乎) === 2. 成酰氯/叠氮化反应 === 当氨基被保护,羧基可与PCl<sub>5</sub>或二氯亚砜等反应生成酰氯,或者通过其他方式被叠氮化,即被活化,可用于肽的固相合成等。 == 三、α-COOH和α-NH<sub>2</sub>共同参与的反应 == === 1. 与水合茚三酮反应 === 水合茚三酮 + <sup>+</sup>H<sub>3</sub>'''NCRC'''OO<sup>--</sup> ---<sup>Δ</sup>→ '''N'''H<sub>3</sub>↑ + '''C'''O<sub>2</sub>↑ + '''RC'''HO + H<sup>+</sup> + 还原茚三酮 '''N'''H<sub>3</sub> + 还原茚三酮 + 水合茚三酮 → '''紫色共振复合物''' 可测量570 nm处的吸收峰检验aa含量。Pro&Hyp在第一步即生成黄色化合物,并无法进行第二步。 === 2. 成肽 === ==== a. 2Gly ---<sup>热乙二醇</sup>→二酮吡嗪 ==== ==== b. 肽的固相合成 ==== 如图(包括作者手写文本和AI生成的.svg文件截出的位图)。常用的保护基就是Fmoc基、Boc基等。 [[文件:肽固相合成示意图.png|缩略图|肽固相合成示意图]] == 四、R基参与的反应 == === 1. Tyr:酚基 === ==== a. 邻位亲电取代 ==== 碘化、硝化,如形成甲腺原氨酸。 ==== b. Pauly反应 ==== 邻位上和对氨基苯磺酸的重氮盐形成橘黄色化合物。(His也行) ==== c. Millon反应 ==== 与热的Hg(NO<sub>3</sub>)<sub>2</sub>的亚硝酸溶液反应,生成红色化合物。 ==== d. Ehrlich反应 ==== 与对二甲基氨基苯醛的盐酸溶液反应,生成蓝色化合物。 ==== e. Salkowski黄蛋白反应 ==== 与沸浓硝酸形成黄色化合物。(Phe也可) === 2. His:咪唑基 === ==== a. Pauly反应 ==== 与重氮苯磺酸形成红色化合物。*(Tyr也行) <nowiki>*</nowiki>:据杨荣武老师的数字资源,这反应的产物是樱红色的,不过某老师讲义认为是棕红色的。但大约没有神经病会在这种地方设题。 ==== b. 配位 ==== 组氨酸的咪唑氮具有孤对电子,可与空电子轨道配位,例如Ni<sup>+</sup>(此即固定化金属阳离子层析的原理),或其他某些过渡金属离子。 === 3. Arg:胍基 === ==== a. Sakaguchi(坂口)反应 ==== 与α-萘酚和次氯酸钠/次溴酸钠生成桃红色物质。 ==== b. 与环己二酮反应 ==== 与环己二酮可逆缩合。 === 4. Met:甲硫基 === ==== a. 与一碘甲烷反应 ==== ---S---CH<sub>3</sub> + CH<sub>3</sub>I → ---S(CH<sub>3</sub>)<sub>2</sub>(可逆地生成锍盐。若用标记的CH<sub>3</sub>I进行此反应,则一轮可逆反应后标记的C有50%的可能留在Met中,可以用于标记Met) === 5. Trp/Tyr:Floin-Ciocalteu反应/Folin-酚反应 === 还原磷钨酸盐和磷钼酸盐,产生蓝色的钨蓝和钼蓝。 === 6. Trp:吲哚基 === ==== a. 水合乙醛酸反应/Hopkins-Cole反应 ==== 与水合乙醛酸的硫酸溶液反应,生成紫色物质。 ==== b. 与对二甲基氨基苯甲醛反应 ==== 生成蓝色物质。 === 7. Phe === ==== a. Salkowski黄蛋白反应 ==== 与沸浓硝酸形成黄色化合物。 === 8. Cys:巯基 === ==== a. 电离:活化 ==== ==== b. 硫醇-二硫化物交换 ==== ==== c. 与氮丙啶(乙撑亚胺)反应 ==== 生成AECys,具有ε-氨基,可被胰蛋白酶切割。 ==== d. 配位 ==== 例如一些R-Hg<sup>+</sup>型一价有机汞试剂,可使一些Cys硫蛋白变性。 ===== e. 氧化 ===== ====== i. 空气氧化:—SH + —SH → —S—S— ====== ====== ii. 强氧化剂氧化:—SH or —S—S— → —SO<sub>3</sub><sup>—</sup>(磺基丙氨酸) ====== ===== f. 烃基化:与卤代烃及其衍生物反应 ===== 例:---S<sup>--</sup> + ICH<sub>2</sub>CH<sub>3</sub> → ---SCH<sub>2</sub>CH<sub>3</sub> + I<sup>--</sup>。 本文主要参考了作者的大脑(这很不靠谱)、王镜岩等的《生物化学》上册第三版、杨荣武主编的《生物化学原理》第四版。 P.S. 由于作者非常菜,并且化学非常不好,机理之类属实无能为力,有问题在所难免,麻烦大家纠正。 图片使用了Times New Roman和Google和Adobe开发的思源宋体。
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