染色质构象捕获 - 版本历史

YYX：/* ChIA-PET(Chromatin Interaction Analysis by Paired-End Tag Sequencing) */

2025-10-03T02:07:19Z

ChIA-PET(Chromatin Interaction Analysis by Paired-End Tag Sequencing)

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	=== ChIP-loop ===		=== ChIP-loop ===
	ChIP+~~3C，确定已知蛋白质P是否参与已知片段A和片段B之间的互作。~~		ChIP+3C，确定已知蛋白质P是否参与已知片段A和片段B之间的互作。也称one-step ChIP-loop）结合了染色质免疫沉淀和3C技术，用于检测目的蛋白介导的两个特定基因区域间的互作。与ChIA-PET相比，ChIP-loop技术更侧重于验证特定假设，而非全基因组发现，但其实验流程相对简单，适用于针对性研究

	=== ChIA-PET(Chromatin Interaction Analysis by Paired-End Tag Sequencing) ===		=== ChIA-PET(Chromatin Interaction Analysis by Paired-End Tag Sequencing) ===
			[[文件:实际结果图.webp\|缩略图\|506x506像素\|实际结果]]
			将染色质免疫沉淀(ChIP)与配对末端标签测序相结合的技术，能够全基因组范围检测特定蛋白质介导的染色质相互作用。ChIA-PET的实验流程包括：甲醛交联固定蛋白质-DNA复合物，染色质片段化，使用特异性抗体免疫沉淀目标蛋白质及其结合的DNA片段，连接桥接接头，构建配对末端标签文库，最后进行高通量测序。

野狼君卡共和：/* 3C（chromosome conformation capture） */

2025-07-09T00:16:30Z

3C（chromosome conformation capture）

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	=== 3C（chromosome conformation capture） ===		=== 3C（chromosome conformation capture） ===
	[[文件:各种C（2）.webp\|缩略图\|538x538像素]]		[[文件:各种C（2）.webp\|缩略图\|538x538像素]]
	最基本的技术，用于探究已知的片段A和片段B时间是否有接近。两条PCR引物分别来自片段A和片段B，如果有产物，说明存在A与B的连接，也就证明了A和B的接近。		最基本的技术，用于探究已知的片段A和片段B之间是否有接近。两条PCR引物分别来自片段A和片段B，如果有产物，说明存在A与B的连接，也就证明了A和B的接近。

	=== 4C（circular chromosome conformation capture） ===		=== 4C（circular chromosome conformation capture） ===

2025年2月18日 (二) 03:25 长河

2025-02-18T03:25:20Z

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	=== 3C（chromosome conformation capture） ===		=== 3C（chromosome conformation capture） ===
			[[文件:各种C（2）.webp\|缩略图\|538x538像素]]
	最基本的技术，用于探究已知的片段A和片段B时间是否有接近。两条PCR引物分别来自片段A和片段B，如果有产物，说明存在A与B的连接，也就证明了A和B的接近。		最基本的技术，用于探究已知的片段A和片段B时间是否有接近。两条PCR引物分别来自片段A和片段B，如果有产物，说明存在A与B的连接，也就证明了A和B的接近。

长河：创建页面，内容为“染色质构象捕获的基本过程染色质在细胞核中以折叠盘曲的形式存在，使得相距遥远的片段可能会彼此接近，承担着潜在的功能。为了检测哪些片段是彼此接近的，用到染色质构象捕获技术（chromosome conformation capture）。第一步，将相互靠近的DNA之间交联，保持其联系。有两种办…”

2024-08-05T17:07:17Z

创建页面，内容为“缩略图|500x500像素|染色质构象捕获的基本过程染色质在细胞核中以折叠盘曲的形式存在，使得相距遥远的片段可能会彼此接近，承担着潜在的功能。为了检测哪些片段是彼此接近的，用到染色质构象捕获技术（chromosome conformation capture）。第一步，将相互靠近的DNA之间交联，保持其联系。有两种办…”

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[[文件:Chromosome Conformation Capture Technology (zh-cn).svg.png|缩略图|500x500像素|染色质构象捕获的基本过程]]
染色质在细胞核中以折叠盘曲的形式存在，使得相距遥远的片段可能会彼此接近，承担着潜在的功能。为了检测哪些片段是彼此接近的，用到染色质构象捕获技术（chromosome conformation capture）。

第一步，将相互靠近的DNA之间交联，保持其联系。有两种办法：甲醛，或者紫外线。但甲醛的交联是可逆的（加热即可），而紫外线交联不可逆。因此一般用甲醛。

第二步，将DNA打碎为片段。然后，用DNA连接酶将被交联的片段末端连接，这样，两个相互接近的片段就首尾相连了。

第三步，解除交联，根据需要，将被连接的片段PCR、测序。
[[文件:各种C.jpg|缩略图|500x500像素]]

=== 3C（chromosome conformation capture） ===
最基本的技术，用于探究已知的片段A和片段B时间是否有接近。两条PCR引物分别来自片段A和片段B，如果有产物，说明存在A与B的连接，也就证明了A和B的接近。

=== 4C（circular chromosome conformation capture） ===
环状-3C技术；用于探究哪些片段会和已知片段A接近。先将片段A-片段X连成环状，再利用反向PCR扩增出各种各样的片段X，然后再利用高通量测序技术探究到底有哪些片段接近了片段A。

=== 5C（Chromosome conformation capture carbon copy） ===
碳拷贝-3C技术；用于探究一定区域内（<1Mb）所有的相互接近的片段。
[[文件:Hic.webp|缩略图|500x500像素]]
在这个区域内，设计大量的、带有已知接头(T7、T3)的引物，将他们退火到解交联的文库上，如果两个引物恰好相邻，就会被Taq连接酶连接在一起；

用已知接头进行高通量测序，就能知道在这区域内相靠近的所有片段。

=== Hi-C ===
可以用来探究全基因组内全部的相互接近的片段。

用hindⅢ切割交联的片段，用有生物素标记的核苷酸补平粘性末端；

连接平末端，用亲和素纯化经过连接的片段；

用T4DNA聚合酶的外切活性去除所有未经连接、具有开放末端的DNA；

添加接头，高通量测序。

=== ChIP-loop ===
ChIP+3C，确定已知蛋白质P是否参与已知片段A和片段B之间的互作。

=== ChIA-PET(Chromatin Interaction Analysis by Paired-End Tag Sequencing) ===

染色质构象捕获 - 版本历史

YYX：​/* ChIA-PET(Chromatin Interaction Analysis by Paired-End Tag Sequencing) */

野狼君卡共和：​/* 3C（chromosome conformation capture） */

2025年2月18日 (二) 03:25 长河

YYX：/* ChIA-PET(Chromatin Interaction Analysis by Paired-End Tag Sequencing) */

野狼君卡共和：/* 3C（chromosome conformation capture） */