2026年4月26日 (日) 13:50 彧

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	一．核酸数据库（一下三个数据库合作，每日交换信息，组成INSDC)		一．核酸数据库（一下三个数据库合作，每日交换信息，组成INSDC)

	1.GenBank数据库（由NCBI提供）		1.GenBank数据库（由NCBI提供）
	~~核苷酸序列数据库：EST数据库，GSS数据库~~
	~~蛋白质结构数据库：PDB~~		核苷酸序列数据库：EST数据库，GSS数据库
	~~参考序列数据库：RefSeq数据库~~
	~~第三方注释数据：TPA~~		蛋白质结构数据库：PDB

			参考序列数据库：RefSeq数据库

			第三方注释数据：TPA

	2.欧洲核酸档案EDA（由EMBL提供，原EMBL-Bank发展而来）		2.欧洲核酸档案EDA（由EMBL提供，原EMBL-Bank发展而来）
	~~序列片段归档SRA，Trace归档（收录高通量测序获得的短读段及测序质量）~~
	~~EMBL~~-Bank（收录核酸序列及相关信息）		序列片段归档SRA，Trace归档（收录高通量测序获得的短读段及测序质量）

			EMBL-Bank（收录核酸序列及相关信息）

	3.DDBJ数据库（由NIG日本国立遗传学研究所提供）		3.DDBJ数据库（由NIG日本国立遗传学研究所提供）

	二．蛋白质序列数据库		二．蛋白质序列数据库
	1.PIR数据库（由NBRF创建）
			1.PIR数据库（由NBRF创建）

	iProClass数据库（整合各种蛋白质数据，是一个全面的蛋白质信息数据库）		iProClass数据库（整合各种蛋白质数据，是一个全面的蛋白质信息数据库）

	PIRSF数据库（提供蛋白质家族分类信息，反应蛋白质进化关系）		PIRSF数据库（提供蛋白质家族分类信息，反应蛋白质进化关系）
	2.Swiss-Prot数据库（由EBI创建，并入UniProt）
	Swiss-Prot数据库（高质量的，手工注释的，非冗余的蛋白质序列数据库）		2.Swiss-Prot数据库（由EBI创建，并入UniProt）
	TrEMBL数据库（计算机注释的蛋白质数据库，包含编码序列翻译的蛋白质序列）
			Swiss-Prot数据库（高质量的，手工注释的，非冗余的蛋白质序列数据库）

			TrEMBL数据库（计算机注释的蛋白质数据库，包含编码序列翻译的蛋白质序列）

	3.UnitProt数据库（universal protein resource通用蛋白质资源库，整合了上文三个数据库）		3.UnitProt数据库（universal protein resource通用蛋白质资源库，整合了上文三个数据库）
	1.UnitProt知识库（UnitProtKB)
	UnitProtKB/Swiss-Prot（手工注释，已检查）		1.UnitProt知识库（UnitProtKB)
	UnitProtKB/TrEMBL（计算机注释，未检查）
			UnitProtKB/Swiss-Prot（手工注释，已检查）

			UnitProtKB/TrEMBL（计算机注释，未检查）

	2.UnitProt档案（UnitParc）		2.UnitProt档案（UnitParc）
	综合性非冗余数据库，包含所有主要的，公开的蛋白质序列
	3.UnitProt参考资料库（UnitRef）		综合性非冗余数据库，包含所有主要的，公开的蛋白质序列
	对UnitProtKB与UnitParc中一些数据提供聚类信息
			3.UnitProt参考资料库（UnitRef）

			对UnitProtKB与UnitParc中一些数据提供聚类信息

	三．蛋白质结构数据库		三．蛋白质结构数据库
	1.蛋白质结构数据库PDB
			1.蛋白质结构数据库PDB

	存储实验测定的生物大分子三维结构（90%蛋白质，也包括核酸，核酸复合物）		存储实验测定的生物大分子三维结构（90%蛋白质，也包括核酸，核酸复合物）
	2.蛋白质结构分类数据库SCOP
			2.蛋白质结构分类数据库SCOP

	对已知三维结构的蛋白质分类，描述结构与进化关系，工作需人工完成		对已知三维结构的蛋白质分类，描述结构与进化关系，工作需人工完成

	基于类（class），折叠（fold），超家族（superfamily），家族（family），蛋白质结构域（protein domains），物种（species）		基于类（class），折叠（fold），超家族（superfamily），家族（family），蛋白质结构域（protein domains），物种（species）
	3.蛋白质二级结构数据库DSSP
			3.蛋白质二级结构数据库DSSP

	对蛋白质结构中的氨基酸残基进行二级结构构想分类的标准化算法，根据PDB数据库中的三维结构推导出二级结构		对蛋白质结构中的氨基酸残基进行二级结构构想分类的标准化算法，根据PDB数据库中的三维结构推导出二级结构

			from：彧

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一．核酸数据库（一下三个数据库合作，每日交换信息，组成INSDC)
1.GenBank数据库（由NCBI提供）
核苷酸序列数据库：EST数据库，GSS数据库
蛋白质结构数据库：PDB
参考序列数据库：RefSeq数据库
第三方注释数据：TPA
2.欧洲核酸档案EDA（由EMBL提供，原EMBL-Bank发展而来）
序列片段归档SRA，Trace归档（收录高通量测序获得的短读段及测序质量）
EMBL-Bank（收录核酸序列及相关信息）
3.DDBJ数据库（由NIG日本国立遗传学研究所提供）
二．蛋白质序列数据库
1.PIR数据库（由NBRF创建）
iProClass数据库（整合各种蛋白质数据，是一个全面的蛋白质信息数据库）
PIRSF数据库（提供蛋白质家族分类信息，反应蛋白质进化关系）
2.Swiss-Prot数据库（由EBI创建，并入UniProt）
Swiss-Prot数据库（高质量的，手工注释的，非冗余的蛋白质序列数据库）
TrEMBL数据库（计算机注释的蛋白质数据库，包含编码序列翻译的蛋白质序列）
3.UnitProt数据库（universal protein resource通用蛋白质资源库，整合了上文三个数据库）
1.UnitProt知识库（UnitProtKB)
UnitProtKB/Swiss-Prot（手工注释，已检查）
UnitProtKB/TrEMBL（计算机注释，未检查）
2.UnitProt档案（UnitParc）
综合性非冗余数据库，包含所有主要的，公开的蛋白质序列
3.UnitProt参考资料库（UnitRef）
对UnitProtKB与UnitParc中一些数据提供聚类信息
三．蛋白质结构数据库
1.蛋白质结构数据库PDB
存储实验测定的生物大分子三维结构（90%蛋白质，也包括核酸，核酸复合物）
2.蛋白质结构分类数据库SCOP
对已知三维结构的蛋白质分类，描述结构与进化关系，工作需人工完成
基于类（class），折叠（fold），超家族（superfamily），家族（family），蛋白质结构域（protein domains），物种（species）
3.蛋白质二级结构数据库DSSP
对蛋白质结构中的氨基酸残基进行二级结构构想分类的标准化算法，根据PDB数据库中的三维结构推导出二级结构

生物信息数据库（简略概要，欢迎补充） - 版本历史

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