https://osm.bio/index.php?action=history&feed=atom&title=%E8%AE%A8%E8%AE%BA%3A%E7%94%9F%E7%89%A9%E7%BD%91%E4%B8%8A%E8%B5%84%E6%BA%90 2026-04-07T11:52:58Z 本wiki上该页面的版本历史 MediaWiki 1.45.1 https://osm.bio/index.php?title=%E8%AE%A8%E8%AE%BA:%E7%94%9F%E7%89%A9%E7%BD%91%E4%B8%8A%E8%B5%84%E6%BA%90&diff=379&oldid=prev 2020-05-11T07:19:15Z

<p>毛蕊花糖移动页面<a href="/index.php?title=%E8%AE%A8%E8%AE%BA:%E7%BC%96%E8%80%85%E8%AF%AD%EF%BC%9A%E6%9C%89%E5%93%AA%E4%BA%9B%E7%94%9F%E7%89%A9%E7%BD%91%E4%B8%8A%E8%B5%84%E6%BA%90%EF%BC%9F&amp;action=edit&amp;redlink=1" class="new" title="讨论:编者语：有哪些生物网上资源？（页面不存在）">讨论:编者语：有哪些生物网上资源？</a>至<a href="/%E8%AE%A8%E8%AE%BA:%E7%94%9F%E7%89%A9%E7%BD%91%E4%B8%8A%E8%B5%84%E6%BA%90" title="讨论:生物网上资源">讨论:生物网上资源</a>，不留重定向</p> <table style="background-color: #fff; color: #202122;" data-mw="interface"> <tr class="diff-title" lang="zh-Hans-CN"> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;">←上一版本</td> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;">2020年5月11日 (一) 15:19的版本</td> </tr><tr><td colspan="2" class="diff-notice" lang="zh-Hans-CN"><div class="mw-diff-empty">（没有差异）</div> </td></tr></table>

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<p>导入1个版本：导入01</p> <table style="background-color: #fff; color: #202122;" data-mw="interface"> <tr class="diff-title" lang="zh-Hans-CN"> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;">←上一版本</td> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;">2020年5月11日 (一) 15:00的版本</td> </tr><tr><td colspan="2" class="diff-notice" lang="zh-Hans-CN"><div class="mw-diff-empty">（没有差异）</div> </td></tr></table>

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<p></p> <p><b>新页面</b></p><div>生物学课本只是信息来源的一个方面。要想追上日新月异的生物学前沿， 还需要善于利用网上的生物学资源。本文整理了若干编者学习过程中发现的生物学资料库，都可以免费查阅。有些网站可能要翻墙访问。<br /> <br /> == NCBI ==<br /> 全称：National Center for Biotechnology Information（美国国立生物技术信息中心）<br /> <br /> 网址：[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ http://www.ncbi.nlm.nih.gov]<br /> <br /> NCBI不是一个数据库，而是很多数据库汇集在一个网站上。<br /> <br /> === Taxonomy ===<br /> Taxonomy是NCBI中的生物分类数据库。它采用根据分子生物学的最新发现建立的生物进化关系树，因此跟一般生物课本上介绍的生物分类都不太一样。它收录得非常全，只要是目前能测定部分DNA，建立与其它物种关系的物种，都有收录。<br /> <br /> === GenBank ===<br /> GenBank是NCBI最重要的数据库，但对于中学阶段而言比较“鸡肋”。它收录的是已经测定的所有DNA片段的数据。当然对于绝大多数物种，我们还没有测定它的基因组。我们只是获取了其中比较重要的部分，比如核糖体（特别是16S、18S）序列。GenBank的数据可以以FASTA格式下载。GenBank有两个子库：dbEST和dbGSS。<br /> <br /> dbEST是表达序列标签数据库。<br /> <br /> dbGSS是单端测序中的短片段数据库，将来用于拼成完整的序列。<br /> <br /> === Gene ===<br /> Gene收录各种基因的相关资料。比如在基因组中的位置、常见变异及其产生的表现型，等等。<br /> <br /> === Genome ===<br /> Genome是基因组数据库，比如人的基因组测定结果可以在上面下载。<br /> <br /> === dbSNP ===<br /> dbSNP是单核苷酸变异数据库。<br /> <br /> === SRA和Trace ===<br /> SRA和Trace是和GenBank紧密关联的两个数据库。它们收录测序过程中产生的原始数据。<br /> <br /> == OMIM ==<br /> 全称：Online Mendelian Inheritance in Man（人类孟德尔式遗传数据库）<br /> <br /> 网址：[http://www.omim.org/ http://www.omim.org]<br /> <br /> OMIM是人类遗传病数据库，既可以用基因名搜，也可以用症状搜。但是很多遗传病还没有确定控制它的基因。<br /> <br /> == KEGG、MetaCyc、Reactome ==<br /> KEGG网址：[http://www.kegg.jp/ http://www.kegg.jp]<br /> <br /> MetaCyc网址：[http://metacyc.org/ http://metacyc.org]<br /> <br /> Reactome网址：[http://www.reactome.org/ http://www.reactome.org]<br /> <br /> 之所以把这三个放在一起是因为它们都是生物反应和通路数据库。KEGG和MetaCyc比较老成，Reactome则是EMBL（欧洲分子生物学中心）推出的新秀。KEGG比较传统，收录的是常见通路在不同物种中的细节不同。MetaCyc收录了很多不常见的通路，比如胆固醇合成的完整过程，包括形成羊毛固醇后的15步反应。Reactome主要收录细胞生物学通路，也有很多不常见通路，比如新发现的细胞程序性坏死（Necroptosis）的过程。<br /> <br /> == UniProt ==<br /> 网址：[http://www.uniprot.org/ http://www.uniprot.org]<br /> <br /> UniProt是EMBL推出的蛋白质数据库，事无巨细地收录了我们对每个蛋白质掌握的每个细节，包括序列、三维结构、细胞中的位置、残基修饰、相关疾病，等等。<br /> <br /> == Rfam ==<br /> 网址：[http://rfam.xfam.org/ http://rfam.xfam.org]<br /> <br /> Rfam是EMBL推出的非编码RNA数据库，收录RNA的结果、功能、表达的物种等。<br /> <br /> == dbPTM ==<br /> 全称：Database of Post-Translational Modifications（蛋白质翻译后修饰数据库）<br /> <br /> 网址：[http://dbptm.mbc.nctu.edu.tw/ http://dbptm.mbc.nctu.edu.tw]<br /> <br /> dbPTM是蛋白质残基修饰数据库，整合了多个数据库的资料，比UniProt略全。<br /> <br /> == TCDB ==<br /> 全称：Transporter Classification Database（跨膜转运器分类数据库）<br /> <br /> 网址：[http://www.tcdb.org/ http://www.tcdb.org]<br /> <br /> TCDB是跨膜转运器的数据库，包括原核生物和真核生物的转运器。<br /> <br /> == IUPHAR ==<br /> 全称：International Union of Basic and Clinical Pharmacology（国际基础与临床药理学学会）<br /> <br /> 网址：[http://www.guidetopharmacology.org/ http://www.guidetopharmacology.org]<br /> <br /> IUPHAR主要收录人和哺乳动物细胞内能作为药物目标（“靶”）的蛋白质、以及它们对应的药物。<br /> <br /> == Drugs、PDR ==<br /> PDR全称：Physicians&#039; Desk Reference（医师案头手册）<br /> <br /> Drugs网址：http://www.drugs.com<br /> <br /> PDR网址：http://www.pdr.net<br /> <br /> 这两个网站都是收录药物信息的。<br /> <br /> == IntEnz ==<br /> 全称：Integrated Relational Enzyme Database（酶的关系型数据库）<br /> <br /> 网址：http://www.ebi.ac.uk/intenz/<br /> <br /> 该数据库也是EMBL推出的，收录各种酶的信息。它是“关系型数据库”，也就是可以根据酶的特征反查酶，比如可以列出所有需要某种辅酶的酶，或所有需要某个底物的酶。<br /> <br /> == GeneMANIA ==<br /> 全称：Gene Multiple Association Network Integration Algorithm（基因多种联系网络构建算法）<br /> <br /> 网址：http://genemania.org<br /> <br /> 该数据库是多伦多大学开发的基于MANIA算法的蛋白质联系数据库。它是世界最大的蛋白质联系数据库，收集了9个模式物种的蛋白质的超过一亿种联系。这些联系可分类为：直接物理联系（配体和受体、酶和抑制蛋白……）、共激活联系（具有相同的调控因子）、功能联系（在AmiGO数据库中记录有参与相同生物过程）等。</div>

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