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生态学小汇总(2):修订间差异

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==生物多样性类型及其测度方法==
==生物多样性类型及其测度方法==
生物多样性通常分为四个层次:'''遗传多样性'''、'''物种多样性'''、'''生态系统多样性'''和'''功能多样性'''。每个层次有不同的测度指标,具体如下:
'''1. 遗传多样性(Genetic Diversity)'''
'''定义''':同一物种内不同个体或种群间的遗传变异。
'''测度指标''':
* '''等位基因数目(Number of Alleles)''':特定基因座上不同等位基因的数量。
* '''杂合度(Heterozygosity)''':
** '''预期杂合度(He''He''​)''':根据哈迪-温伯格平衡计算的杂合度,He=1−∑pi2''He''​=1−∑''pi''2​,其中pi''pi''​为等位基因频率。
** '''观测杂合度(Ho''Ho''​)''':实际观测到的杂合个体比例。
* '''核苷酸多样性(π,Pi)''':衡量DNA序列中平均每对核苷酸的差异数,适用于分子数据。
* '''有效种群大小(Ne''Ne''​)''':反映种群遗传多样性的维持能力,Ne''Ne''​越大,多样性越高。
'''应用场景''':
* 濒危物种保护(如评估华南虎的遗传瓶颈);
* 农作物种质资源评价(如水稻抗病基因多样性分析)。
'''2. 物种多样性(Species Diversity)'''
'''定义''':特定区域内物种的丰富程度及其分布均匀性,通常分为三个层次:
'''(1) α多样性(Alpha Diversity)'''
'''测度指标''':
* '''物种丰富度(Species Richness)''':区域内的物种总数,最基础指标。
* '''香农-维纳指数(Shannon-Wiener Index, H')''':
H′=−∑i=1Spiln⁡pi''H''′=−''i''=1∑''S''​''pi''​ln''pi''​
** S''S''为物种数,pi''pi''​为第i''i''种的个体比例。
** 值越大,多样性越高,对稀有物种敏感。
* '''辛普森指数(Simpson Index, D)''':
D=1−∑i=1Spi2''D''=1−''i''=1∑''S''​''pi''2​
** 值越大,多样性越高,强调优势种的作用。
* '''均匀度(Evenness)''':
J′=H′ln⁡S''J''′=ln''SH''′​
** 反映各物种个体分布的均匀程度。
'''应用场景''':
* 森林群落调查(如热带雨林与温带森林的多样性对比);
* 保护区管理效果评估。
'''(2) β多样性(Beta Diversity)'''
'''测度指标''':
* '''Bray-Curtis相异度(Bray-Curtis Dissimilarity)'''
** BC=∑∣xi−yi∣∑(xi+yi)
** ''xi''​和''yi''​为两个群落中第i''i''种的个体数。
** 值范围0(完全相同)到1(完全不同)。
**
* '''Jaccard指数(Jaccard Index)''':
** ''J''=A/(''A''+''B''+''C)''
** A''A''为两群落共有种数,B''B''和C''C''为独有种数。
**
* '''Sørensen指数''':类似Jaccard,但计算方式为2A/(2A+B+C)
*
'''应用场景''':
* 比较不同生境间的物种组成差异(如湿地与草原);
* 评估环境梯度对群落的影响。
'''(3) γ多样性(Gamma Diversity)'''
'''测度指标''':
* '''区域总物种数''':大地理范围内(如整个山脉)的所有物种数目。
* '''α与β多样性的乘积''':γ=α×β''γ''=''α''×''β''(Whittaker公式)。
'''应用场景''':
* 生物地理区划(如全球生物多样性热点区识别);
* 区域生态保护规划。
'''3. 生态系统多样性(Ecosystem Diversity)'''
'''定义''':不同生态系统类型及其结构、功能的多样性。
'''测度指标''':
* '''生态系统类型数''':区域内森林、湿地、草原等类型的数量。
* '''景观异质性指数''':
** '''斑块密度(Patch Density)''':单位面积内的斑块数量。
** '''香农景观多样性指数''':类似物种多样性,反映景观类型丰富度与均匀度。
* '''生态过程指标''':如生产力、养分循环速率、抵抗力稳定性。
'''应用场景''':
* 国家公园生态系统分类管理;
* 评估土地利用变化对生态服务的影响。
'''4. 功能多样性(Functional Diversity)'''
'''定义''':物种功能性状(如体型、食性、生长速率)的差异及其对生态系统功能的贡献。
'''测度指标''':
* '''功能丰富度(Functional Richness)''':功能性状空间被占据的体积。
* '''功能均匀度(Functional Evenness)''':功能性状分布的均匀性。
* '''功能离散度(Functional Divergence)''':物种性状偏离群落平均的程度。
* '''功能分散度(Functional Dispersion)''':加权平均的性状差异。
'''应用场景''':
* 预测生态系统功能(如碳储量、抗干扰能力);
* 农业多样化种植设计(如混合种植不同根系深度的作物)。
'''5. 系统发育多样性(Phylogenetic Diversity)'''
'''定义''':基于物种进化历史的多样性,反映物种间的遗传差异时间。
'''测度指标''':
* '''Faith’s PD指数''':系统发育树上所有分支长度的总和。
* '''净亲缘关系指数(NRI)''':群落内物种亲缘关系与随机期望的偏差。
'''应用场景''':
* 保护优先区划定(如优先保护古老孑遗物种);
* 解析群落构建机制(如环境过滤 vs. 竞争排斥)。

2025年5月6日 (二) 12:47的版本

生物多样性类型及其测度方法

生物多样性通常分为四个层次:遗传多样性物种多样性生态系统多样性功能多样性。每个层次有不同的测度指标,具体如下:


1. 遗传多样性(Genetic Diversity)

定义:同一物种内不同个体或种群间的遗传变异。

测度指标

  • 等位基因数目(Number of Alleles):特定基因座上不同等位基因的数量。
  • 杂合度(Heterozygosity)
    • 预期杂合度(HeHe​):根据哈迪-温伯格平衡计算的杂合度,He=1−∑pi2He​=1−∑pi2​,其中pipi​为等位基因频率。
    • 观测杂合度(HoHo​):实际观测到的杂合个体比例。
  • 核苷酸多样性(π,Pi):衡量DNA序列中平均每对核苷酸的差异数,适用于分子数据。
  • 有效种群大小(NeNe​):反映种群遗传多样性的维持能力,NeNe​越大,多样性越高。

应用场景

  • 濒危物种保护(如评估华南虎的遗传瓶颈);
  • 农作物种质资源评价(如水稻抗病基因多样性分析)。


2. 物种多样性(Species Diversity)

定义:特定区域内物种的丰富程度及其分布均匀性,通常分为三个层次:

(1) α多样性(Alpha Diversity)

测度指标

  • 物种丰富度(Species Richness):区域内的物种总数,最基础指标。
  • 香农-维纳指数(Shannon-Wiener Index, H')

H′=−∑i=1Spiln⁡piH′=−i=1∑Spi​lnpi

    • SS为物种数,pipi​为第ii种的个体比例。
    • 值越大,多样性越高,对稀有物种敏感。
  • 辛普森指数(Simpson Index, D)

D=1−∑i=1Spi2D=1−i=1∑Spi2​

    • 值越大,多样性越高,强调优势种的作用。
  • 均匀度(Evenness)

J′=H′ln⁡SJ′=lnSH′​

    • 反映各物种个体分布的均匀程度。

应用场景

  • 森林群落调查(如热带雨林与温带森林的多样性对比);
  • 保护区管理效果评估。

(2) β多样性(Beta Diversity)

测度指标

  • Bray-Curtis相异度(Bray-Curtis Dissimilarity)
    • BC=∑∣xi−yi∣∑(xi+yi)
    • xi​和yi​为两个群落中第ii种的个体数。
    • 值范围0(完全相同)到1(完全不同)。
  • Jaccard指数(Jaccard Index)
    • J=A/(A+B+C)
    • AA为两群落共有种数,BB和CC为独有种数。
  • Sørensen指数:类似Jaccard,但计算方式为2A/(2A+B+C)

应用场景

  • 比较不同生境间的物种组成差异(如湿地与草原);
  • 评估环境梯度对群落的影响。

(3) γ多样性(Gamma Diversity)

测度指标

  • 区域总物种数:大地理范围内(如整个山脉)的所有物种数目。
  • α与β多样性的乘积:γ=α×βγ=α×β(Whittaker公式)。

应用场景

  • 生物地理区划(如全球生物多样性热点区识别);
  • 区域生态保护规划。


3. 生态系统多样性(Ecosystem Diversity)

定义:不同生态系统类型及其结构、功能的多样性。

测度指标

  • 生态系统类型数:区域内森林、湿地、草原等类型的数量。
  • 景观异质性指数
    • 斑块密度(Patch Density):单位面积内的斑块数量。
    • 香农景观多样性指数:类似物种多样性,反映景观类型丰富度与均匀度。
  • 生态过程指标:如生产力、养分循环速率、抵抗力稳定性。

应用场景

  • 国家公园生态系统分类管理;
  • 评估土地利用变化对生态服务的影响。


4. 功能多样性(Functional Diversity)

定义:物种功能性状(如体型、食性、生长速率)的差异及其对生态系统功能的贡献。

测度指标

  • 功能丰富度(Functional Richness):功能性状空间被占据的体积。
  • 功能均匀度(Functional Evenness):功能性状分布的均匀性。
  • 功能离散度(Functional Divergence):物种性状偏离群落平均的程度。
  • 功能分散度(Functional Dispersion):加权平均的性状差异。

应用场景

  • 预测生态系统功能(如碳储量、抗干扰能力);
  • 农业多样化种植设计(如混合种植不同根系深度的作物)。


5. 系统发育多样性(Phylogenetic Diversity)

定义:基于物种进化历史的多样性,反映物种间的遗传差异时间。

测度指标

  • Faith’s PD指数:系统发育树上所有分支长度的总和。
  • 净亲缘关系指数(NRI):群落内物种亲缘关系与随机期望的偏差。

应用场景

  • 保护优先区划定(如优先保护古老孑遗物种);
  • 解析群落构建机制(如环境过滤 vs. 竞争排斥)。