生态学小汇总(2):修订间差异
外观
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'''等位基因数目(Number of Alleles)''':特定基因座上不同等位基因的数量。 | |||
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'''预期杂合度(He''He'')''':根据哈迪-温伯格平衡计算的杂合度,He=1−∑pi2''He''=1−∑''pi''2,其中pi''pi''为等位基因频率。 | |||
'''观测杂合度(Ho''Ho'')''':实际观测到的杂合个体比例。 | |||
'''核苷酸多样性(π,Pi)''':衡量DNA序列中平均每对核苷酸的差异数,适用于分子数据。 | |||
'''有效种群大小(Ne''Ne'')''':反映种群遗传多样性的维持能力,Ne''Ne''越大,多样性越高。 | |||
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濒危物种保护(如评估华南虎的遗传瓶颈); | |||
农作物种质资源评价(如水稻抗病基因多样性分析)。 | |||
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'''物种丰富度(Species Richness)''':区域内的物种总数,最基础指标。 | |||
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H′=−∑i=1Spilnpi''H''′=−''i''=1∑''S''''pi''ln''pi'' | H′=−∑i=1Spilnpi''H''′=−''i''=1∑''S''''pi''ln''pi'' | ||
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值越大,多样性越高,对稀有物种敏感。 | |||
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值越大,多样性越高,强调优势种的作用。 | |||
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反映各物种个体分布的均匀程度。 | |||
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森林群落调查(如热带雨林与温带森林的多样性对比); | |||
保护区管理效果评估。 | |||
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比较不同生境间的物种组成差异(如湿地与草原); | |||
评估环境梯度对群落的影响。 | |||
'''(3) γ多样性(Gamma Diversity)''' | '''(3) γ多样性(Gamma Diversity)''' | ||
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'''区域总物种数''':大地理范围内(如整个山脉)的所有物种数目。 | |||
'''α与β多样性的乘积''':γ=α×β''γ''=''α''×''β''(Whittaker公式)。 | |||
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生物地理区划(如全球生物多样性热点区识别); | |||
区域生态保护规划。 | |||
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'''生态系统类型数''':区域内森林、湿地、草原等类型的数量。 | |||
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'''斑块密度(Patch Density)''':单位面积内的斑块数量。 | |||
'''香农景观多样性指数''':类似物种多样性,反映景观类型丰富度与均匀度。 | |||
'''生态过程指标''':如生产力、养分循环速率、抵抗力稳定性。 | |||
'''应用场景''': | '''应用场景''': | ||
国家公园生态系统分类管理; | |||
评估土地利用变化对生态服务的影响。 | |||
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'''测度指标''': | '''测度指标''': | ||
'''功能丰富度(Functional Richness)''':功能性状空间被占据的体积。 | |||
'''功能均匀度(Functional Evenness)''':功能性状分布的均匀性。 | |||
'''功能离散度(Functional Divergence)''':物种性状偏离群落平均的程度。 | |||
'''功能分散度(Functional Dispersion)''':加权平均的性状差异。 | |||
'''应用场景''': | '''应用场景''': | ||
预测生态系统功能(如碳储量、抗干扰能力); | |||
农业多样化种植设计(如混合种植不同根系深度的作物)。 | |||
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'''Faith’s PD指数''':系统发育树上所有分支长度的总和。 | |||
'''净亲缘关系指数(NRI)''':群落内物种亲缘关系与随机期望的偏差。 | |||
'''应用场景''': | '''应用场景''': | ||
保护优先区划定(如优先保护古老孑遗物种); | |||
解析群落构建机制(如环境过滤 vs. 竞争排斥)。 | |||
2025年5月6日 (二) 12:52的版本
生物多样性类型及其测度方法
生物多样性通常分为四个层次:遗传多样性、物种多样性、生态系统多样性和功能多样性。每个层次有不同的测度指标,具体如下:
1. 遗传多样性(Genetic Diversity)
定义:同一物种内不同个体或种群间的遗传变异。
测度指标:
等位基因数目(Number of Alleles):特定基因座上不同等位基因的数量。 杂合度(Heterozygosity): 预期杂合度(HeHe):根据哈迪-温伯格平衡计算的杂合度,He=1−∑pi2He=1−∑pi2,其中pipi为等位基因频率。 观测杂合度(HoHo):实际观测到的杂合个体比例。 核苷酸多样性(π,Pi):衡量DNA序列中平均每对核苷酸的差异数,适用于分子数据。 有效种群大小(NeNe):反映种群遗传多样性的维持能力,NeNe越大,多样性越高。
应用场景:
濒危物种保护(如评估华南虎的遗传瓶颈); 农作物种质资源评价(如水稻抗病基因多样性分析)。
2. 物种多样性(Species Diversity)
定义:特定区域内物种的丰富程度及其分布均匀性,通常分为三个层次:
(1) α多样性(Alpha Diversity)
测度指标:
物种丰富度(Species Richness):区域内的物种总数,最基础指标。 香农-维纳指数(Shannon-Wiener Index, H'):
H′=−∑i=1SpilnpiH′=−i=1∑Spilnpi
SS为物种数,pipi为第ii种的个体比例。 值越大,多样性越高,对稀有物种敏感。 辛普森指数(Simpson Index, D):
D=1−∑i=1Spi2D=1−i=1∑Spi2
值越大,多样性越高,强调优势种的作用。 均匀度(Evenness):
J′=H′lnSJ′=lnSH′
反映各物种个体分布的均匀程度。
应用场景:
森林群落调查(如热带雨林与温带森林的多样性对比); 保护区管理效果评估。
(2) β多样性(Beta Diversity)
测度指标:
Bray-Curtis相异度(Bray-Curtis Dissimilarity) BC=∑∣xi−yi∣∑(xi+yi) xi和yi为两个群落中第ii种的个体数。 值范围0(完全相同)到1(完全不同)。
Jaccard指数(Jaccard Index): J=A/(A+B+C) AA为两群落共有种数,BB和CC为独有种数。
Sørensen指数:类似Jaccard,但计算方式为2A/(2A+B+C)
应用场景:
比较不同生境间的物种组成差异(如湿地与草原); 评估环境梯度对群落的影响。
(3) γ多样性(Gamma Diversity)
测度指标:
区域总物种数:大地理范围内(如整个山脉)的所有物种数目。 α与β多样性的乘积:γ=α×βγ=α×β(Whittaker公式)。
应用场景:
生物地理区划(如全球生物多样性热点区识别); 区域生态保护规划。
3. 生态系统多样性(Ecosystem Diversity)
定义:不同生态系统类型及其结构、功能的多样性。
测度指标:
生态系统类型数:区域内森林、湿地、草原等类型的数量。 景观异质性指数: 斑块密度(Patch Density):单位面积内的斑块数量。 香农景观多样性指数:类似物种多样性,反映景观类型丰富度与均匀度。 生态过程指标:如生产力、养分循环速率、抵抗力稳定性。
应用场景:
国家公园生态系统分类管理; 评估土地利用变化对生态服务的影响。
4. 功能多样性(Functional Diversity)
定义:物种功能性状(如体型、食性、生长速率)的差异及其对生态系统功能的贡献。
测度指标:
功能丰富度(Functional Richness):功能性状空间被占据的体积。 功能均匀度(Functional Evenness):功能性状分布的均匀性。 功能离散度(Functional Divergence):物种性状偏离群落平均的程度。 功能分散度(Functional Dispersion):加权平均的性状差异。
应用场景:
预测生态系统功能(如碳储量、抗干扰能力); 农业多样化种植设计(如混合种植不同根系深度的作物)。
5. 系统发育多样性(Phylogenetic Diversity)
定义:基于物种进化历史的多样性,反映物种间的遗传差异时间。
测度指标:
Faith’s PD指数:系统发育树上所有分支长度的总和。 净亲缘关系指数(NRI):群落内物种亲缘关系与随机期望的偏差。
应用场景:
保护优先区划定(如优先保护古老孑遗物种); 解析群落构建机制(如环境过滤 vs. 竞争排斥)。