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自用

== 杂的笔记 ==

=== 细胞生物学 ===

*脂锚定膜蛋白的例子
**v-Src：N端共价结合的豆蔻酸插入脂双层
**Ras、Rab：由烃链共价结合膜蛋白C段Cys残基、另一条烃链/脂肪酸链共价结合近C端的其他Cys残基【双重锚定】
**蛋白聚糖：膜蛋白-磷酸己醇胺（寡糖链）-肌醇（PI）【GPI锚定】
*锇酸能固定&染脂类，戊二醛固定蛋白，柠檬酸铅染蛋白，乙酸双氧铀染核酸
*mTOR类别
**mTORC1：
***包含蛋白质raptor，对雷帕霉素敏感；
***主要参与细胞生长的调控，感知营养状况（如氨基酸、能量状态）来调节自噬等过程（营养充足时抑制自噬；营养缺乏时活性降低，诱导自噬复合体的形成）；
***与ULK1等蛋白的相互作用，调控自噬体的形成。
**mTORC2：
***包含蛋白质rictor，对雷帕霉素不敏感；
***主要参与细胞存活的调控（eg通过激活Akt来促进细胞存活）；
***通过调节Rho家族GTP酶影响细胞骨架的动态变化。
*[[载体蛋白和通道蛋白]]
*[[G蛋白偶联受体及其信号转导]]
*
=== 生物化学 ===

* '''几型几型的酶啊：'''
** 己糖激酶：四种同工酶I～IV型
*** II：肌细胞；对Glc高度亲和
*** IV：肝；也称葡糖激酶；不受产物G6P抑制，而受F6P由葡糖激酶调节蛋白（核蛋白）介导的抑制作用（通过把葡糖激酶拉入核内）
** 磷酸果糖激酶
*** 1：F6P→F-1,6-BP
**** A：心肌&骨骼；对磷酸肌酸、柠檬酸、无肌磷酸的抑制作用最敏感
**** B：肝&红细胞；对2,3-BPG的抑制作用最敏感
**** C：脑；对腺嘌呤核苷酸的作用最敏感
*** 2：F6P→F-2,6-BP
** 醛缩酶
*** I型：高等动植物中；有4个亚基；催化机制：涉及Lys的ε氨基、质子化希夫碱
**** 醛缩酶A：肌肉
**** 醛缩酶B：肝脏
**** 醛缩酶C：脑组织
*** II型：细菌、酵母、真菌、藻类中；需要2价金属离子和K+
** 肉碱脂酰转位酶
*** I：线粒体外膜上；脂酰CoA+肉碱→脂酰肉碱+CoA
*** II：线粒体内膜内侧；脂酰肉碱+CoA→脂酰CoA+肉碱
** 氨甲酰磷酸合成酶
*** I：线粒体；尿素合成：氨+HCO<sub>3</sub><sup>-</sup>+2ATP→氨甲酰磷酸+2ADP+Pi
*** II：细胞质；嘧啶核苷酸合成：Gln+HCO<sub>3</sub><sup>-</sup>+2ATP→Glu+氨甲酰磷酸+2ADP+Pi
*[[从PPi学生化]]
*新生儿一夜之间突然死亡，称为婴儿猝死综合症（SIDS）；可能是中长链脂酰脱氢酶的缺欠
*牙买加呕吐病：惊厥后剧烈呕吐，随后昏迷、死亡；未熟的西非荔枝果（<small>和阿开木果是一个东西吗？</small>）有降糖氨酸A→甲叉环丙基乙酰CoA→脂酰CoA脱氢酶的FAD辅基被修饰→酶钝化
*DEPC：与RNase中心His结合，抑制其活性；PMSF：抑制Ser和巯基蛋白酶；DIPF：抑制Ser蛋白酶；碘代乙酸：抑制巯基蛋白酶
*羟基磷灰石可分离单链DNA和双链DNA
*黄嘌呤氧化酶辅因子是Mo
*[[生化过程抑制剂整理]]
*β-氧化中的β-羟脂酰CoA为L型，而脂肪酸合成中的为D型；酮体代谢产生的β-羟丁酸为D型，糖酵解产生的乳酸为L型
*

=== 分子生物学 ===

*电泳指示剂：二甲苯菁4kbp、溴酚蓝300bp、橙黄G 50bp
*核苷酸切除修复：损伤识别-损伤切除-修复合成-切口缝合，NER中的TCR（转录偶联性NER）损伤识别由RNA聚合酶完成（RNA聚合酶转录受阻，TCR系统启动）
*[[常见抑制剂整理]]

=== 生物技术 ===

* '''离子交换树脂：'''
** 阳离子交换树脂（含酸性基团）
*** 强酸性～
**** 活性基团：-SO<sub>3</sub>H（磺酸基）、-CH<sub>2</sub>SO<sub>3</sub>H（次甲基磺酸基）
**** pH1～14，选择性差，应用广泛
*** 弱酸性～
**** 活性基团：-COOH、-OCH<sub>2</sub>COOH、-C<sub>6</sub>H<sub>5</sub>OH
**** pH>7，选择性好
** 阴离子交换树脂（含碱性基团）
*** 强碱性～
**** 活性基团：季胺（eg三甲胺基）
**** pH1～14，选择性差，应用广泛
*** 弱碱性～
**** 活性基团：伯胺、仲胺
**** pH<7，选择性好
* '''琼脂糖凝胶电泳：'''
** 指示染料
*** 溴酚蓝       300bp DNA
*** 二甲苯青    4000bp DNA
** DNA染料
*** 溴化乙锭（EB）（致癌）、SYBR Green
** 速度：超螺旋DNA>线性DNA>开环DNA
* 体外实验/直接相互作用：GST pull down；体内实验/间接相互作用：IP、Co-IP、酵母双杂交…
* 通过OD<sub>260</sub>/OD<sub>280</sub>推算核酸纯度：纯DNA OD<sub>260</sub>/OD<sub>280</sub>约=1.8，>1.9有RNA污染，<1.7有蛋白质、酚等污染，>2.0可能有异硫氰酸残留
* 对于纯DNA，1个OD<sub>260</sub>=50微g/mL双链DNA或35微g/mL单链DNA；对于纯RNA，1个OD<sub>260</sub>=40微g/mL RNA
* 磺基水杨酸可提取Pro
* 2,6-二氯酚靛酚：可滴定维生素C（氧化还原）
* DNA提取跑胶时拖尾的可能原因：
*# rRNA污染：100bp以下/200～300bp（较小，在后方拖尾）
*# 胶质量不好
*# 样品有沉淀
*# 基因组DNA污染（较大，在前方拖尾）
*PCR反应无结果的可能原因：Mg<sup>2+</sup>加多了→跟dNTP反应形成dNTPMg（MgHPO<sub>4</sub>不溶，Mg(H<sub>2</sub>PO<sub>4</sub>)<sub>2</sub>溶）
*硅基质膜吸附DNA：高盐、低pH→破坏水化层，有利于硅膜&RNA形成氢键

=== 植物学与植物生理学 ===

*顶端分生组织形成理论：
**组织原学说：适用于根；表皮原→表皮、皮层原→皮层、中柱原→维管柱&髓（若有）
**原套-原体学说：适用于被子植物茎；原套→一层或几层、只进行垂周分裂→表面生长，原体→多层、平周分裂&各方向→体积增加；认为顶端分生组织组成上没有预先决定的组织分区（除表皮始终来源于原套的表面细胞层）
**细胞学分区概念：适用于裸子植物茎；顶端原始细胞群→中央母细胞→髓分生
*番红能染上的结构：木质部（呈暗红色）、韧皮射线（呈亮红色）、角质层（呈亮红色）
*显微镜下准确鉴别C3和C4的小技巧：C3叶肉分布均匀、C4叶肉分布在维管束周围；一些不符合传统方法的特例：梨为C4植物但无花环结构，水稻为C3植物但主脉维管束鞘2层、小叶脉1层，不同产地的芦苇有C3有C4
*真蕨亚门次生壁有颜色（天然（为红棕/黑色）
*奇妙小蕨类合集：
**木贼有3类气腔：髓腔、嵴腔、槽腔（字是这么写的吗？
**卷柏孢子囊不成群，单生；
**卷柏科翠云草有桥细胞连接中柱、皮层；
**海金沙有凯氏点；
**贯众网状中柱（长得非常奇妙（）
*奇妙被子植物的花：
**合冠花的雄蕊长在花冠上（花丝基部与花冠形成联合）；雄蕊与花冠往往互生
**白花败酱草：苞片宿存，发育为果的翅
**唇形科、马鞭草科、菊科、旋花科：萼片高度愈合，但K(5)C(5)
**唇形科雄蕊的杠杆是药隔的延伸
**唇形科、紫草科：2心皮形成的合生子房分为独立的4室
**伞形科、茜草科、忍冬科、绣球科、菊科：一个花序可有2种花
**卫矛科、鼠李科、葡萄科：子房半陷入花盘内但不愈合→子房上位，具下位花盘
**合欢雄蕊合生：上部分离，基部联合；夹竹桃科的络石：花药和柱头靠合而非联合
*交替氧化酶：含Fe；受水杨基羟肟酸、n-丙基没食子酸抑制；为二聚体，之间以二硫键连接，氧化态-S-S-，还原态-SH HS-，还原型活性为氧化型4～5倍
*植物线粒体内膜特有：半乳糖基-γ-内酯脱氢酶，氧化半乳糖内酯，生成抗坏血酸
*非线粒体末端氧化酶：
**酚氧化酶：含Cu，存在于质体、微体，将酚类氧化为醌类
***单酚氧化酶
***多酚氧化酶
**抗坏血酸氧化酶：含Cu，催化抗坏血酸形成脱氢抗坏血酸，其中脱去的H传递给O生成H2O
**乙醇酸氧化酶：光呼吸；同时，形成的H2O2可在过氧化氢酶作用下产生具有强氧化活性的新生态氧，在根周围形成一层氧化圈，使水稻根系周围保持较高的氧化态，抑制土壤中还原性物质eg:H2S、Fe2+等的毒害
**过氧化物酶和过氧化氢酶（=触酶）：含铁卟啉，催化H2O2对芳香族/酚类化合物的氧化作用，消除H2O2的毒害
*GA1主营养生长，控制植物茎节伸长生长；GA4主生殖生长，同时也可促进营养生长
*GA对于花性别分化：对于葫芦科，促进雄花分化（通过抑制乙烯合成实现）；对于玉米，促进雌花分化
*验证蓝光对气孔开闭的影响是否独立于光合作用：
*#红光饱和的情况下照蓝光
*#用与“微弱到无法启动光合的红光”相同光强的蓝光照
*#去叶绿体实验
*

=== 微生物学 ===

*紫色细菌中的光合机构（脱镁叶绿素-醌型）：'''P870→P870*→BPheo→Q→Cyt bc1复合体【形成质子梯度】→Cyt c2→'''
*#一个单反应中心（P870）&围绕它的天线色素系统
*#细胞色素bc1电子传递复合体
*#ATP合酶
*

=== 动物学与动物生理学 ===

*[[动物中首次出现的结构]]
*秋水仙碱可以治疗痛风，但无法缓解尿酸积累；别嘌呤醇可以缓解尿酸积累和痛风，但对神经疾病症状无效。
*一些俗名：干贝-栉孔扇贝后闭壳肌干制品，（江）瑶柱-栉江瑶，蚝豉-牡蛎干制品，蚝油-牡蛎汤浓缩。
*无齿蚌胃周围有一对葡萄状的褐色肝脏（消化盲囊），分泌淀粉酶、蔗糖酶。
*环毛蚓：环带14～16体节， 精巢囊10、11体节，贮精囊11、12体节，雄孔18体节，卵巢13体节前部，卵漏斗13体节后部，受精囊6/7、7/8、8/9体节，雌孔14体节（1个）
*水螅：分层，水螅纲大部分：内移；乌贼：外包，头足纲大部分：内转
*咽弓（来自yc）（从左往右软骨鱼类-硬骨鱼类-两栖类&爬行类&鸟类-哺乳类）
**第一咽弓（颌弓）：腭方软骨-颚骨&方骨-方骨-砧骨，麦氏软骨-关节骨-关节骨-锤骨
**第二咽弓（舌弓）：舌颌软骨-舌颌骨-耳柱骨-镫骨，角舌软骨、基舌软骨-舌骨
**第三咽弓（第一鳃弓）：鳃弓-鳃弓-舌骨-舌骨
**第四咽弓（第二鳃弓）：鳃弓-鳃弓-舌骨-甲状软骨
**第五咽弓（第三鳃弓）：鳃弓-鳃弓-喉头软骨-喉头软骨
**第六咽弓（第四鳃弓）：鳃弓-鳃弓-消失-会厌软骨
**第七咽弓（第五鳃弓）：鳃弓-鳃弓-消失-杓状软骨
*两栖类续骨不清晰（但能找到同源结构）；有鳞目、喙头目中续骨清晰可见
*硬骨鱼中舌颌骨与听软骨囊相接，续骨与方骨相接
*硬骨鱼3块翼骨中，1块属于软骨原骨，2块属于膜原骨
*锥体形式
**双锥体型（块椎型）：总鳍鱼&最古老的两栖类
**古代两栖类 始椎型（侧椎体和间椎体相等大小）、全椎型（侧椎体消失）
**早期爬行类 一个大的侧椎体形成主体，间椎体退化成一块小的楔形骨
**现代羊膜类 间椎体完全消失，仅侧椎体
*[[寄生动物总结]]
*上皮类型
**单层扁平上皮
***内皮：心、血管、淋巴管
***间皮（体腔上皮）：胸、腹、心包膜
***其他：肺泡、肾小囊壁
**单层柱状上皮：胃、肠、子宫、输卵管、腺体导管
**单层立方上皮：肾小管、甲状腺、滤泡
**假复层纤毛柱状上皮：气管
**复层扁平上皮
***角质化：皮肤
***未角质化：口腔、食道、阴道
**复层柱状上皮：眼睑、男性尿道、肛门
**变移上皮：胃、肠、膀胱
*PTH（甲状旁腺激素）、CT（降钙素）主要作用于肾脏、骨骼，维生素D对小肠也有作用；维生素D抑制PTH通路，PTH诱导维生素D合成
*抗心律失常药物： Ⅰ类（钠通道阻滞剂）（eg利多卡因、奎尼丁）、Ⅱ类（β受体阻滞剂）、Ⅲ类（钾通道阻滞剂）、Ⅳ类（钙通道阻滞剂）（eg维拉帕米）
*阻塞性/限制性肺病
**阻塞性肺病：主要是气道阻塞。eg：慢性阻塞性肺疾病（COPD）包括慢性支气管炎（由气道炎症和黏液分泌增加引起）和肺气肿（小气道塌陷和弹性组织破坏导致气道闭合），以及哮喘（气道高反应性和可逆性狭窄）。 FEV1/FVC比值：显著降低，通常小于70%（气道阻塞导致呼气困难，患者需要更长时间才能呼出气体）。
**限制性肺病：主要是肺部或胸廓的扩张受限导致肺容积减少。eg：肺纤维化（肺组织纤维化和弹性下降导致肺无法充分扩张）。胸廓畸形（如脊柱侧弯）或胸膜疾病（如纤维性胸膜炎）也可能导致限制性肺病。 FEV1/FVC比值：正常或接近正常（肺部扩张受限，但气道通畅）。
*[[常见动物生理学抑制剂整理]]
*平滑肌细胞Ca2+浓度调控
**电-机械偶联：在化学信号或牵张刺激作用下产生动作电位→通过兴奋-收缩偶联Ca2+↑（主要来源于胞外
**药物-机械偶联：不产生动作电位，通过胞外化学信号→通过GPCR-PLC-IP3生成IP3→激活SR膜中的IP3R→SR内Ca2+释放到胞质内
*

=== 生态学与动物行为学 ===

*动物不同阶段不同分布型：蝗虫成虫散居相随机分布、群居相集群分布，若虫随机分布；蚜虫成虫无翅蚜集群分布（孤雌生殖）、有翅蚜随机分布，若虫随机分布
*[[生态学小汇总（1）]]

=== 遗传学与演化生物学 ===

*常用遗传学材料染色体数：
**蚕豆 2n=12
**大蒜、洋葱、大葱 2n=16
**玉米 2n=20
**蝗虫雌性 2n=24、雄性 2n=23
**番茄 2n=24
**小麦 2n=6x=42
*[[Molecular Population Genetics]]
*性别决定：
**XY
**ZW：鳞翅目、鸟类
**XO：直翅目
**性指数X/A：果蝇
**玉米：基因决定
***Ba__Ts__ 雌雄同株 顶端长雄花、叶腋长雌花
***Ba__tsts 雌 顶端和叶腋长雌花
***babaTs__ 雄 顶端长雄花、叶腋不长花
***babatsts 雌 顶端长雌花、叶腋不长花
**小茧蜂：雌性X染色体为杂合，雄性为纯合
**酸模：X和Y的比
***18A+XX+YY（X:Y=1:1）雌雄同株
***18A+XX+Y  （X:Y=2:1）雌株
***18A+X+YY  （X:Y=1:2）雄株
**环境因素：龟鳖类、鳄鱼（温度），螠虫（掉到雌虫吻上是雄性、掉到地上是雌性、先掉雌虫上再掉地上是间性）
*人类进化
*#腊玛古猿（不能证明是人科祖先）
*#南方古猿（阿法南猿Lucy最早直立人科化石）
*#能人（早期猿人）
*#直立人（晚期猿人）eg蓝田人、元谋人
*#智人
{| class="wikitable"
|+
!
!南方古猿
!能人
!直立人
! colspan="2" |智人
|-
|又称
|
|早期猿人
|晚期猿人
|早期（古人）
|晚期（新人）
|-
|距今年代
|420万～100万年
|200万～175万年
|200万～20万年
|20万～5万年
|5万～1万年
|-
|主要代表
|汤恩幼儿、露西
|非洲能人
|北京直立人、爪哇直立人
|尼安德特人、丁村人、马坝人
|克罗马人、山顶洞人
|-
|体质特征
|脑容量450～530mL，两足直立行走
|脑容量约680mL，两足直立行走
|脑容量约1088mL，行走姿势类似现代人
|脑容量与现代人相似，完全直立行走，头骨介于猿人与晚期智人间
|脑颅增大，下颌突出
|-
|文化
|
|砾石工具
|石器全，会用火
|有骨器，会人工取火
|长矛、标枪、绘画、雕刻
|}
*
*[[构建系统发生树常用方法]]

=== 生物信息学 ===

*BLAST：
**p查蛋白
**n查核酸
**t翻译数据库
**x翻译自己（提交序列）
*

=== 生物统计学 ===

*F检验中，较大的方差放在分子上
*（由于比较完整且冗长，开了个新页面，正在慢慢填…[[生物统计漫谈]]