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[[氨基酸性质整理|色氨酸]]代谢主要有三种途径：

=== 犬鸟氨酸途径 ===
色氨酸在两种酶的催化下形成N-甲酰犬尿氨酸，这两种酶分别是吲哚胺2,3-双加氧酶（IDO）与色氨酸2,3-双加氧酶（TDO），IDO主要存在于为免疫细胞、大脑等，其活性受到炎症信号（如干扰素-γ）强烈引导，TDO存在于肝脏，受糖皮质激素和色氨酸本身水平调节。N-甲酰犬尿氨酸迅速为犬尿氨酸，其在不同酶的作用下，①转化为3-羟基犬尿氨酸到3-羟基邻氨基苯甲酸，再到喹啉酸，喹啉酸 是NMDA受体的激动剂，具有神经兴奋毒性，与多种神经系统疾病（如亨廷顿病、阿尔茨海默病）相关。

=== -羟色胺途径 ===

=== 微生物途径 ===