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* 染色体构象捕获
** 3C
** 4C
** 5C
** Hi-C
** ChIP-loop
** ChIA-PET
* 蛋白质-蛋白质互作
** Y2H酵母双杂交
** CoIP免疫共沉淀
** pull down下拉实验
** FERT荧光共振能量转移
** BiFC双分子荧光互补
** SPR表面等离子共振
** ITC等温滴定量热法
* 蛋白质-RNA互作
** RIP-RNA结合蛋白免疫共沉淀：甲醛交联，裂解细胞，抗体沉淀特定蛋白，去交联获得RNA。
** RNA pull down：标记的诱饵RNA与细胞裂解物孵育；检测与诱饵RNA结合的蛋白
** MeRIP-RNA甲基化免疫沉淀：用甲基化RNA特异抗体沉淀并检测结合蛋白
* 染色质开放性检测
** MNase-seq
** FAIRE-seq
** DNase-seq
** ATAC-seq
* 各种印记
** western blotting：蛋白质
** northern blotting：RNA
** southern blotting：DNA
** eastern blotting：二维电泳蛋白质
** dot blotting ：不经电泳
** Southwestern blotting：DNA探针检测蛋白质电泳结果
** Far-western blotting：不用抗体而用可能互作的蛋白
** northwestern blotting：RNA探针检测蛋白质电泳结果
** middle eastern：DNA检测RNA
** far western：检测脂质