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* 染色体构象捕获 ** 3C ** 4C ** 5C ** Hi-C ** ChIP-loop ** ChIA-PET * 蛋白质-蛋白质互作 ** Y2H酵母双杂交 ** CoIP免疫共沉淀 ** pull down下拉实验 ** FERT荧光共振能量转移 ** BiFC双分子荧光互补 ** SPR表面等离子共振 ** ITC等温滴定量热法 * 蛋白质-RNA互作 ** RIP-RNA结合蛋白免疫共沉淀:甲醛交联,裂解细胞,抗体沉淀特定蛋白,去交联获得RNA。 ** RNA pull down:标记的诱饵RNA与细胞裂解物孵育;检测与诱饵RNA结合的蛋白 ** MeRIP-RNA甲基化免疫沉淀:用甲基化RNA特异抗体沉淀并检测结合蛋白 * 染色质开放性检测 ** MNase-seq ** FAIRE-seq ** DNase-seq ** ATAC-seq * 各种印记 ** western blotting:蛋白质 ** northern blotting:RNA ** southern blotting:DNA ** eastern blotting:二维电泳蛋白质 ** dot blotting :不经电泳 ** Southwestern blotting:DNA探针检测蛋白质电泳结果 ** Far-western blotting:不用抗体而用可能互作的蛋白 ** northwestern blotting:RNA探针检测蛋白质电泳结果 ** middle eastern:DNA检测RNA ** far western:检测脂质 * 层析/色谱技术 ** 凝胶过滤层析 ** 亲和层析 *** IMAC ** 聚焦层析:固定相上有缓冲剂,酸性的层析液流过,从上到下被缓冲,形成ph梯度;蛋白质会在进入等电点以上的pH后吸附在层析柱上;随着层析液不断流入,层析柱缓冲能力被逐渐耗竭,pH梯度移动(原来某一pH的位置下移),不同的蛋白就随等电点相应的梯度流出。 ** 离子交换层析 ** 疏水层析 ** 反向层析 * 克隆某特定基因的办法 ** 功能克隆:已知基因产物(蛋白质),获得编码序列 ** 定位克隆:已知基因位置,染色体步移 ** 序列克隆:已知基因部分序列,获得全部序列 ** 表型克隆: * 基因克隆的具体技术 ** 鸟枪克隆法:将基因组打成片段,转入受体,寻找相关表型变化 ** 消减杂交:将两份cDNA混合,去除双链,剩余的可能是与表型差异有关的序列。 ** 转座子标签:转座子插入使得基因突变,在有相关表型改变的个体中寻找转座子,就能找到被突变的基因。 ** 图位克隆:染色体步移
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