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'''（欢迎加🛰！或许可以开一个生竞的wx群吗（）'''

微生物很烂，可能会写错的有点多

== 杂乱知识点 ==

=== 生物化学 ===
关于细古真的甘油构型：

甘油本身无手性。甘油磷酸构型才是差异之处。

* '''细菌/真核：D型甘油-3-磷酸'''
* '''古菌：L型甘油-1-磷酸'''
G250（游离465/结合595）比R250多两个甲基。R250更灵敏，但不用于定量（背景容易混淆）

=== 分子生物学 ===
细菌：-35TTGACA  -10TAATAT

TFII'''H'''磷酸化CTD→启动子清空

线粒体DNA pol与T3、T7噬菌体高度同源（均为单亚基），需转录因子TFAM、TFB2M（哺乳动物）

* T3、T7不需转录因子（自带RNA pol）
* 要转录且依赖宿主pol的，λ、T4需宿主σ+自带转录因子
色氨酸操纵子：3、4构成终止子

=== 细胞生物学 ===
层粘连蛋白：IV型胶原

核纤层蛋白：V型中间丝

钒酸盐抑制P型泵<!-- 其实挺好理解，和磷酸像嘛 -->

MAP2：树突

tau：轴突

EB1结合维管正极（稳定维管）

stathmin结合α/β二聚体负极（稳定单体）

核仁中'''纤维中心电子密度最高'''

=== 微生物学 ===
胃八叠球菌：纤维素厚壁

固氮酶类型：铁-铁、锌-铁、钒-铁

Park：五肽尾+NAM+UDP'''（无NAG）'''

=== 植物学 ===
通气组织属于薄壁组织

花粉胚珠比：闭花受精<专性自交<兼性自交<兼性异交<专性自交

红藻：有单细胞种类，淡水种类多

褐藻：无单细胞种类，淡水种类少

间苯二酚蓝/苯胺蓝：胼胝质

盐酸间苯三酚：木质素

被子植物多数是同株异花

原核RecA→植物Rad51

动物CDK1/2→植物CDKA

玉米雄小穗：2雄花、各3雄蕊

野生水稻有芒。无芒水稻是驯化的结果。

青蒿素：环状倍半萜。青蒿不含/极少含有青蒿素，青蒿素提取自黄花蒿<!-- 那为什么要叫青蒿素啊喂:) -->

尼古丁：在烟草根部合成，通过木质部运输至叶片（储存在液泡中）

天然橡胶：顺式-1,4-聚异戊二烯。韧皮部乳管细胞合成，受伤时通过乳管破裂分泌

萝藦科有合蕊柱、花粉块，'''无唇瓣'''


ABA可促使一些短植物如浮萍、红藜、草莓在长日条件下开花，同时对长日植物的开花有抑制作用

外施IAA会抑制短日植物如苍耳成花，一些长日植物如天仙子、毒麦等的成花受外源IAA的促进

（但一般来说，高浓度生长素处理对植物成花都表现为抑制效应）

=== 植物生理学 ===
导管流速：泊肃叶方程Q=πr<sup>4</sup>·Δq/8ηL

=== 动物学 ===
海盘属于海蛇尾（无皮鳃）

圆口纲鳃篮软骨条9横4纵

人肾为平滑多乳头，似猪（牛有沟多乳头，兔平滑单乳头）

观察果蝇唾腺染色体取用果蝇三龄'''雌'''幼虫

=== 动物生理学 ===
血红素氧合酶HO：血红素→胆绿素+Fe<sup>2+</sup>+CO

=== 遗传学 ===
人'''编码序列'''（并非基因）占全基因组1.5%

=== 生态学 ===
地面火对植被破坏更小（相比林冠火）

=== 进化生物学 ===
'''蓝氏贾第虫'''：研究细胞核起源。'''有双层核膜，无核仁'''

== 新研究/与书上不符 ==

=== 生物化学 ===

* 核磁共振：多维核磁共振应用范围不被分子大小限制

=== 微生物学 ===

* 真核细胞固氮：The nitroplast: A nitrogen-fixing organelle

首次证实海洋单细胞藻类Braarudosphaera bigelowii中存在由蓝细菌UCYN-A内共生演化而来的硝质体（nitroplast），这是首个被发现的真核生物固氮细胞器，其复制分裂与宿主细胞高度同步，且依赖宿主编码的蛋白完成核心功能，完全符合细胞器的定义。

* 固氮酶新增钒-铁类型

==== 植物学 ====

* 草莓：内生菌根（书上为内外生菌根）

* 柑橘属：裂溶生'''先裂后溶'''（书上为溶生型）

== ''生物化学'' ==

=== 肠道细菌可以合成的维生素 ===
所有B、K₂

=== 环的整理 ===

=== 含氮杂环 ===

==== '''吡啶'''：六元环，5C1N ====
B3、B6

===== 吡咯：五元环，4C1N =====
4吡咯＝1卟啉（血红素、叶绿素、细胞色素）

4吡咯＝1咕啉（'''比卟啉少一个亚甲基桥'''）（B12）

苯环＋吡咯＝吲哚环

===== 吡咯烷：饱和吡咯（无双键） =====
脯氨酸

===== 咪唑：五元环，3C2N =====
组氨酸

===== 吲哚：苯环+吡咯 =====
色氨酸

===== 嘧啶：六元环，4C2N =====
B1、B2（异咯嗪环）

===== 嘌呤：嘧啶＋咪唑 =====

===== 蝶啶：嘧啶＋吡嗪 =====
B9

===== 异咯嗪：苯环＋嘧啶＋吡嗪稠合 =====
B2

===== 噻唑环：五元芳香环，3C1N1S =====
B1

==== 纯碳环/碳氧环 ====

===== 苯环 =====

===== 萘环：2苯环稠合 =====
K（萘醌）

===== 菲环：3苯环稠合 =====
环戊烷多氢菲（所有甾醇类的母体）

===== 色原烷环：苯环＋吡喃环 =====
E（生育酚）

== ''分子生物学'' ==

=== 关于“某某子”之类调控元件 ===
{| class="wikitable"
|+
|
!原核
!古核
!真核
!病毒
|-
!启动子
|✅
|✅
|✅
|✅
|-
!终止子
|✅
|✅
|✅
|✅
|-
!增强子
|❌
|❌
|✅
|✅
|-
!沉默子
|❌
|❌
|✅
|✅（部分）
|-
!衰减子（弱化子）
|✅
|❌
|❌
|❌
|-
!操纵子
|✅
|✅
|❌
|❌
|-
!绝缘子
|❌
|❌
|✅
|❌
|}

=== σ类型 ===
70：正常

'''54：氮饥饿'''

'''32：热休克'''

== ''微生物学'' ==
（微生物实在是太差，故有很多单开的链接

=== [[上课去了の细菌染色整理]] ===

=== [[上课去了の微生物结构整理]] ===

=== IMViC ===
'''I：吲哚试验'''

'''M：甲基红试验'''

'''V：V-P试验'''

'''C：枸橼酸盐利用试验'''
{| class="wikitable"
|+
|
!原理
!阳性
!阴性
|-
!I吲哚
|色氨酸酶产生吲哚+'''对二甲基氨基苯甲醛'''
|红色
|无色
|-
!M甲基红
|分解葡萄糖大量产酸
|红色
|黄色
|-
!V-P
|分解葡萄糖产生'''乙酰甲基甲酯'''，'''碱性'''下氧化
|红色
|无色
|-
!C枸橼酸盐
|以枸橼酸为唯一碳源生长产生碱，溴麝香草酚蓝变色
|蓝色
|绿色
|}

=== 微生物计数法 ===

* '''比浊法'''（浊度计比色法/光电比浊法）：测OD<sub>600</sub>

总菌数。快、简便、无损、可连续测生长曲线

细菌生长动态监测

* '''血球计数板法'''

总菌数。直观、快、能看形态

酵母菌、霉菌孢子、单细胞微生物

* '''平板菌落计数法'''

活菌数。慢、操作繁杂、稀释易造成误差

食品/水/样品活菌定量、药敏、菌种计数

=== 病原体类型 ===

==== 细菌 ====
肺结核、百日咳、白喉、猩红热、伤寒、副伤寒、霍乱、破伤风、炭疽、淋病、梅毒、鼠疫、败血症

==== 病毒 ====
麻疹、风疹、水痘、带状疱疹、流行性腮腺炎、传染性单核细胞增多症、手足口病、艾滋病、狂犬病、登革热、脊髓灰质炎

=== 细菌抗药性机制 ===

* 外排泵：四环素、喹诺酮类

* 结核分枝杆菌→异烟肼

katG（过氧化氢酶-过氧化物酶）突变，异烟肼无法被激活

* 四环素

结合30S亚基的S12蛋白，阻止氨酰tRNA结合核糖体

=== 群体聚集现象 ===

* '''G+：AIP（寡肽类自诱导多肽）'''
* '''G-：高丝氨酸内酯'''<!-- 费氏发光弧菌 -->

== ''植物学'' ==
===自交不亲和识别位点===

* SSI孢子体：柱头乳突细胞
'''十字花科、菊科、旋花科'''
* GSI配子体：花柱上端/胚囊
'''蔷薇科、茄科、豆科、禾本科、芸香科'''

=== 缠绕茎类型 ===
左旋：牵牛、马兜铃、菜豆

右旋：忍冬、葎草

中性：何首乌

=== 藻类世代交替 ===

==== 红藻 ====
紫菜成熟的配子体上会形成精子囊和顶端有受精丝的'''果孢'''n，精子与果胞受精形成合子，合子发育为'''果孢子'''2n，成熟后长成丝状体即'''壳斑藻'''2n，壳班藻通过减数分裂产生'''壳孢子'''n，再由壳孢子萌发为紫菜，完成一次世代交替

=== 维管植物起源 ===

==== 莱尼蕨 ====
中志留纪出现（425Ma）→中泥盆纪灭绝

* 二叉分枝。无其他器官（具假根）
* 孢子囊顶生。

* 木质部内始式
* 大型配子体（化石证据和孢子体同型）

'''大莱尼蕨：'''曾经为莱尼蕨类代表→被归入'''前维管植物'''

化石证据中央疏导组织未加厚，类似苔藓植物导水细胞。

==== 工蕨 ====
泥盆纪出现（408～360Ma）

* 无叶。二叉分枝
* 孢子囊侧生
* 木质部外始式
* '''现代石松类祖先'''（孢子囊侧生、木质部外始式）

==== 三相蕨 ====
'''可能由莱尼蕨演化而来'''

早泥盆纪出现→中泥盆纪灭绝（历时20Ma）

* 无叶。分枝更复杂，侧枝系统多样
* 孢子囊侧生
* 木质部内始式

=== 传统分类 松杉柏 ===
{| class="wikitable"
|+
|
!松科
!杉科
!柏科
|-
!叶形
|针形、条形
|披针形、钻形、鳞形、'''条形'''
|鳞形、刺形
|-
!叶着生方式
|针形：2、3、5针一束，簇生于短枝
条形：螺旋状互生/单生
|螺旋状互生/单生（水杉：对生）
|鳞形：对生/轮生，紧贴小枝
刺形：3叶轮生
|-
!珠鳞和苞鳞
|离生
|半合生（下部愈合）
|合生
|-
!球果
|木质，成熟开裂
|木质，成熟开裂
|木质，成熟开裂/肉质浆果状，不开裂
|-
!种子
|长翅
|窄翅
|窄翅/无翅
|-
!气囊
|有
|无
|无
|}

=== 木质素类型 ===

* '''H：p-香豆醇（对羟基苯基）'''
* '''G：松柏醇（愈创木基）'''
* '''S：芥子醇（紫丁香基）'''

蕨类：H

裸子：G

双子叶：G+S

单子叶：G+S+H

=== 被子花粉粒类型 ===

* 2细胞型：大多数被子
* 3细胞型：'''禾本科、十字花科、菊科'''

=== 细胞学分区：茎尖分生组织SAM ===

* '''中心区CZ：'''分裂频率低，保持未分化状态
* '''周缘区PZ：'''分裂旺盛。根据位置信息分化形成叶原基/花原基，外侧细胞分化为皮层
* '''肋状区RZ：'''分化成髓、维管组织原始细胞

所需基因：'''STM、WUS、CLAVATA1 2 3（CLV1 2 3）'''

== 植物生理学 ==

=== 光能分配 ===

* 状态I：用主要被PS I吸收的光，激发能向PS II分配增加
* 状态II：用主要被PS II吸收的光，激发能向PS I分配增加

光、Mg<sup>2+</sup>、ATP→LHC II磷酸化→状态II

PS II优先激发→PQ还原→LHC II激酶活化→LHC II磷酸化

状态'''II'''：b6f向'''非垛叠区'''分配

=== Rubisco ===
560kDa

最丰富的'''可溶性'''蛋白质（最丰富不可溶蛋白质为LHCP）

'''8大亚基'''（56kDa）'''8小亚基'''（14kDa）

大476AA 小123AA

* 每个大亚基1催化位点1调节位点。2个大亚基为一组，Mg<sup>2+</sup>作为连接桥
* 小亚基仅调节
'''光诱导：'''

* 大小亚基转录。光敏色素参与
* 翻译后修饰：钝化or锐化

钝化：暗中RuBP结合Rubisco

锐化：

# 光激活Rubisco活化酶（核基因编码）ATPase类似伴侣蛋白
# 结合ATP，14～16个活化酶多肽自聚合
# 结合Rubisco，ATP水解
# 多肽解聚，Rubisco构象变化，释放RuBP

== ''动物生理学'' ==

=== γ/α僵直 ===
'''易化区'''：前庭核、小脑前叶两侧＆后叶中间部

'''抑制区'''：大脑皮层运动区、纹状体、小脑前叶蚓部

* '''γ僵直：'''中脑上下丘之间切断脑干（大脑运动区＆纹状体失衡）

解除：切断腰骶部后根

* '''α僵直：'''γ僵直+切除小脑前叶蚓部（易化区通过前庭脊髓束直接兴奋α）

解除：切断VIII听神经

== 生物统计学 ==

=== GWAS ===

* 实验组：患病
* 对照组：健康

'''预期值'''E=(行合计×列合计)÷总合计

'''卡方'''χ²=Σ[(观测值-预期值)²÷预期值]

'''优势比'''OR=(病例×对照)÷ (病例×对照)

'''相对危险度'''RR=病例组暴露率÷对照组暴露率

暴露：携带某种与疾病可能连锁的SNP概率

'''归因危险度'''AR=病例组暴露率−对照组暴露率

'''自由度'''df=(行数-1)×(列数-1)

=== 诊断试验 ===
'''灵敏度'''=真阳性数÷(真阳性数+假阴性数)

'''特异度'''=真阴性数÷(真阴性数+假阳性数)

'''假阳性率'''=假阳性数÷(真阴性数+假阳性数) 

'''假阴性率'''=假阴性数÷(真阳性数+假阴性数)

'''约登指数'''=灵敏度+特异度-1

'''阳性预测值'''=真阳性数÷(真阳性数+假阳性数)

'''阴性预测值'''=真阴性数÷(真阴性数+假阴性数)

'''符合率'''=(真阳性数+真阴性数)÷总例数