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* '''[[染色质构象捕获]]''' ** 3C ** 4C ** 5C ** Hi-C ** ChIP-loop ** ChIA-PET * '''蛋白质-蛋白质互作''' ** Y2H酵母双杂交 ** CoIP免疫共沉淀 ** pull down下拉实验 ** FERT荧光共振能量转移 ** BiFC双分子荧光互补 ** SPR表面等离子共振 ** ITC等温滴定量热法 * '''蛋白质-RNA互作''' ** RIP-RNA结合蛋白免疫共沉淀:甲醛交联,裂解细胞,抗体沉淀特定蛋白,去交联获得RNA。 ** RNA pull down:标记的诱饵RNA与细胞裂解物孵育;检测与诱饵RNA结合的蛋白 ** MeRIP-RNA甲基化免疫沉淀:用甲基化RNA特异抗体沉淀并检测结合蛋白 * '''[[染色质开放性检测技术|染色质开放性检测]]''' ** [[染色质开放性检测技术|MNase-seq]] ** [[染色质开放性检测技术|FAIRE-seq]] ** [[染色质开放性检测技术|DNase-seq]] ** [[染色质开放性检测技术|ATAC-seq]] * '''各种印记''' ** western blotting:蛋白质 ** northern blotting:RNA ** southern blotting:DNA ** eastern blotting:二维电泳蛋白质 ** dot blotting :不经电泳 ** Southwestern blotting:DNA探针检测蛋白质电泳结果 ** Far-western blotting:不用抗体而用可能互作的蛋白 ** northwestern blotting:RNA探针检测蛋白质电泳结果 ** middle eastern:DNA检测RNA ** far western:检测脂质 * '''层析/色谱技术''' ** 凝胶过滤层析 ** 亲和层析 *** IMAC ** 聚焦层析:固定相上有缓冲剂,酸性的层析液流过,从上到下被缓冲,形成ph梯度;蛋白质会在进入等电点以上的pH后吸附在层析柱上;随着层析液不断流入,层析柱缓冲能力被逐渐耗竭,pH梯度移动(原来某一pH的位置下移),不同的蛋白就随等电点相应的梯度流出。 ** 离子交换层析 ** 疏水层析 ** 反向层析 * '''克隆某特定基因的办法''' ** 功能克隆:已知基因产物(蛋白质),获得编码序列 ** 定位克隆:已知基因位置,染色体步移 ** 序列克隆:已知基因部分序列,获得全部序列 ** 表型克隆: * '''基因克隆的具体技术''' ** 鸟枪克隆法:将基因组打成片段,转入受体,寻找相关表型变化 ** 消减杂交:将两份cDNA混合,去除双链,剩余的可能是与表型差异有关的序列。 ** 转座子标签:转座子插入使得基因突变,在有相关表型改变的个体中寻找转座子,就能找到被突变的基因。 ** 图位克隆:染色体步移 * '''PCR万世同堂''' ** 一代PCR ** 二代PCR:实时荧光定量PCR(real-time PCR/qPCR) ** 三代PCR:微滴PCR(dPCR),常用数字微滴PCR(ddPCR) ** 特种PCR: *** 易错PCR,可以应用于DNA序列的人工进化和SELEX等; *** 原位PCR,即将FISH和PCR结合,在组织内部''in situ'' PCR; *** 热启动PCR,目的简要概述为减少非特异性扩增,实现方法诸如发夹引物、琼脂包埋、抗体失活等等; *** 重叠PCR(overlap PCR),采用跨模板片段作为引物扩增,运用了第一次的扩增产物作为长引物进行二次扩增; *** 定点诱变PCR,可以大致分成两代:第一代是运用诱变引物在质粒上直接引入点突变,并且在筛选过程中运用了DpnI这一IV型酶,缺点是由于质粒比较大,扩增效率不高,而且筛选过程略微麻烦一点;第二代是运用线性片段和两组引物先分别进行扩增,再运用类似于overlap PCR的方法,利用长引物扩增得到目的片段; *** 多突变PCR,有DNA洗牌技术和随机启动重组,主要是获得依托答辩一样序列混乱的DNA; *** 不对称PCR,某一向引物比另一向多,扩增产物的量不对等,主要是获取探针和长引物; *** 反向PCR,很简单了,其中有一个引伸技术质粒获救; *** 反转录PCR,原理简单,引出来了一堆子技术如SMART、RACE、锚定PCR; *** 巢式PCR,在克隆里面就叫染色体步移了,原理没甚区别,但讲起来费劲,不赘述; *** TAIL-PCR,又称热不对称交错PCR,貌似除了朱玉贤院士的《现代分子生物学》没见谁讲过,有兴趣可参阅,原理复杂,不赘述; *** cDNA差异分析,类似于运用PCR对两个不同样本的基因表达多少进行粗略比较,一个样本加引物的接头,一个不加,混合样本后进行扩增,线性扩增则量一致,指数则前大于后,扩增缓慢则后大于前,当然定量精确度差,应用实例较少。 * '''基因工程'''(genetic engineering) ** 基因打靶 *** 胸苷激酶和新霉素抗性 *** 条件性敲除:Cre-loxP、Flp-FRT ** 基因编辑 *** ZFN锌指核酸酶 *** TALEN类转录活化因子核酸酶 *** CRISPER-Cas9 **** prime-editing引物编辑 **** dCas9 **** Cas9n *电泳 **'''[[脉冲场凝胶电泳]]''' **二维琼脂糖凝胶电泳 **非变性电泳native page ***blue native page ***clear native page ***quantitative preparative native continuous(QPNC-PAGE)
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