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DNA解链酶
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DNA解链酶(解旋酶)为催化DNA螺旋解链的酶,在DNA复制、转录、修复、重组起作用。无序列特异性,大多数优先结合单链区域,少部分为双链区域,还需要结合ATP,并有ATPase活性。顺模板向不断延伸,需要Mg<sup>2+</sup>。如Dna B。 == Dna蛋白 == {| class="wikitable" !蛋白 !E.coli !真核 !古菌 |- |Dna A |复制起始蛋白,结合上ATP,并形成四聚体,在HU蛋白和IHF帮助下,协同地识别并结合复制起始区''OciC''的9bp(TTATCCACA)重复序列,此区亦称A盒(A box),Dam可激活其表达。Dna A可以结合ATP,属于AAA<sup>+</sup>(与细胞多种活性相关的ATPase),组装成类似于核小体的结构,水解ATP开始解链,形成45bp开放的起始复合物。之后被取代下来。 |对应ORC。 |对应Orc1/Cdc6 |- |Dna B |DNA解链酶,在Dna C和Dna D帮助下,2个被招募形成前引发体(消耗ATP),形成前引发体后,Dna B将''OriC''的解链区扩大,之后取代Dna A,当接触到Tus蛋白(Dna B蛋白抑制剂)的β股构成的一面时,就无法穿过,受阻于此(若为Tus蛋白的另一面可通过)。 |对应MCM复合物。 |对应MCM |- |Dna C |招募Dna B到复制叉。 |对应Cdc6+Cdr1。 |对应Orc1/Cdc6 |- |Dna E |为DNA聚合酶III。 |对应PCNA(滑动钳)、3种细胞核DNA复制用的DNA聚合酶。 |对应PCNA(滑动钳)、古菌的B类DNA聚合酶。 |- |Dna G |为DNA引发酶,在Pri A、Pri B和Pri C帮助下,与DnaB蛋白结合,一般在CTG序列,之后合成引物,引物一般为11nt(±1nt),引物的前两个碱基一般为AG。 |与DNA聚合酶α结合的引发酶。 |<nowiki>-</nowiki> |- |Dna T |辅助Dna C将Dna B招募到复制叉。 |<nowiki>-</nowiki> |<nowiki>-</nowiki> |} <ref>杨荣武.2018.生物化学原理.3版.北京:高等教育出版社</ref><ref>Katarzyna Bebenek,Thomas A.Kunkel(2004)Advances in Protein Chemistry Volume 69, 2004, Page 138</ref> == 其他有解链酶活性的酶 == B——Bacteria 细菌 A——archaea 古菌 E——eukaryote 真核生物 M——mitochondrion 线粒体 C——chloroplast 叶绿体 {| class="wikitable" |+ !蛋白名称 !生物范围 !功能 !备注 |- |ρ 因子 |B |原核生物转录终止时DNA·RNA杂交链的分离 | |- |σ 因子 |B |RNApol 封闭复合物到开放复合物的转化 | |- |细菌 RNApol |B |转录延伸时DNA解链 |具体哪个亚基待考证 |- |SL1 (选择因子1) |E |RNApol I 转录起始中的解链 |TBP |- |TFIII B |E |RNApol III 转录起始中的解链 |TBP |- |Sen 1 |E |RNApol I和II负责的转录的终止时DNA/RNA杂交链分离 |在核酸外切酶rat1触及RNApol时 |- |TFII H |E |RNApol II 转录起始解链(待考证);NER时解链 |九个亚基,其中XPB亚基向5'解链,XPD亚基向3'解链 |- |Uvr B |B |细菌NER中微弱的解链酶活性,同时招募UvrC切割 | |- |Uvr D |B |UvrC切割后解链下12nt-13nt的切割产物 | |- |Rec BCD |B |同源重组中结合dsDNA自由末端,向下游解链 |解链的同时表现3'外切酶(遇到χ序列前) 杨sir认为遇到chi序列后RecBCD将获得5'外切酶活性,但是Lewin's gene XII 认为RecBCD只具有3'外切酶活性,遇到chi序列后RecD亚基解离并失去3'外切酶活性。本人准备向杨sir发邮件问这个问题。 |- |Ruv B |B |同源重组中催化分支迁移 | |- |RecQ,RecG, DNA解链酶I,DNA解链酶IV等 |B |参加同源重组,可能是RecF和RecE的同源重组途径 |杨sir书都没仔细讲。 Lewin's gene XII 指出RecG与RecBCD作用相同,其他没讲 我赌它不考 |- |eIF 4a |E |翻译中解开稳定性小于126kJ的mRNA二级结构 | |} 待补充 <ref>杨荣武,2017,分子生物学,第2版,南京大学出版社</ref><ref>Lewin's Gene XII 中文版,科学出版社,2021</ref><references />
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