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报告基因是用于筛选和指示转化的细胞、组织的有效标记，有时也可作为目的基因，应为显性基因，非转化者不能生存，对自身发育等无伤害，易得到，无抗性。

= 植物报告基因 =

== ''npt'' 新霉素磷酸转移酶基因 ==
来自转座子Tn5，对卡那霉素、G418、巴龙霉素、新霉素有抗性，其中卡那霉素抗性基因（''kan''<sup>r</sup>）或新霉素抗性基因（''NPT II''）为第一个使用并现在常用的标记基因，

== ''aph IV'' 潮霉素磷酸转移酶基因 ==
来自大肠杆菌，对潮霉素抗性，在禾谷类的选择效率比新霉素高，对人无食品安全问题（因为潮霉素只用于兽医临床）。

== ''spt'' 链霉素磷酸转移酶基因 ==
<br />

== ''cat'' 氯霉素乙酰转移酶基因 ==
<br />

== ''aacc3''和''aacc4'' 庆大霉素-3-N-乙酰转移酶基因 ==
对庆大霉素有抗性。

== ''ble'' 博来霉素抗性基因 ==
来源于Tn5，对博来霉素有抗性。

== ''bar'' 膦化麦黄酮乙酰转移酶（PAT）基因 ==

== ''epsps'' 草甘膦抗性标记基因 ==

== ''als'' 绿黄隆抗性标记基因 ==

== ''GUS'' β-葡萄糖苷酶基因 ==

== 荧光素酶基因 ==

== GFP基因 ==