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Western Blot条带结果分析
== 未检测到任何结果 ==
出现原因：
* 加错了抗体，如一抗加的是小鼠抗人，二抗加的是山羊抗兔。
* 提取的总蛋白中压根没有目的蛋白，如用改变离子强度的方式提取膜蛋白（所以做Input很重要啊）。当然，梦想总是要有的，说不定你也可以在五车酵母上清中提到Cyt c；转移时间过短。
* 转移电场过弱；转移缓冲液未优化。
* 凝胶选择不恰当。
* 转膜时膜放反了（真是个小机灵鬼）。
* 蛋白上样量太少（小小的细微条带）。
* 一抗浓度过低（小小的细微条带）。
* ECL发光液失效（小小的细微条带）。<br>
解决方案：
* 如果使用湿转法，则需增加转移时间。
* 增加转移电压或电流。
* 在转移缓冲液中加入0.01~0.05%的SDS。
* 将转移缓冲液中的甲醇浓度减少至5%或更少。
* 使用更低百分比的丙烯酰胺凝胶。
* 检查上样的量、抗体和反光液的量（小小的细微条带）<br>
其他原因及解决办法： 
* 转移时间过长→减少转印时间。 
* 转移电场过强→降低转印电压或电流。 
* 转移缓冲液未优化→组装“三明治”之前，在转印缓冲液中平衡凝胶20分钟以降低凝胶中SDS浓度，从而避免小分子量蛋白的过度转移。将转印缓冲液中的甲醇浓度增加至40%提高其极性有助于从蛋白质中移除残留SDS。  
* 凝胶选择不恰当→使用更高百分比的丙烯酰胺凝胶当目标蛋白分子量小于10KD时使用Tris/tricine 凝胶。  
* 使用0.2μm的印迹膜解决小蛋白转印过度的情况。 
* 小蛋白会穿过大孔径的印迹膜→使用0.2 μm的印迹膜检测小蛋白转印过度情况<br>
抗体问题：<br>低活性或低浓度，低亲和力的一抗，错配的一抗和二抗结合比率提高。<br>
抗体浓度： 
* 抗体可能已经丧失活性；进行斑点杂交以确定其活性和最佳浓度。 
* 测试不同一抗和/或一抗/二抗组合。 
* 同时使用阳性对照和阴性对照。 
* 抗原提呈不足增加凝胶中每个样品的总蛋白上样量。 
* 检查样品的完整性;确保蛋白未降解。 
* 抗原被封闭缓冲液封闭尝试不同的封闭液（比如，在检测磷蛋白时避免使用牛奶）。 
* 优化封闭液浓度→建议使用浓度为3~5%的牛血清白蛋白或脱脂奶粉 
* 化学发光底物性能不佳→增加底物孵育时间。 
* 准备少量工作液以确定底物是否已经丧失活性。暗室内，在底物工作液中加入少量HPR偶联物则应该会出现蓝光。如果没有的话，必定是底物或HRP偶联物已丧失活性。 
* 确保底物试剂盒中的两个瓶子之间没有发生交叉污染。两种试剂之间如果发生交叉污染，则会引起试剂活性下降。 
* 叠氮化物是HRP的抑制剂，所以不要在二抗缓冲液中使用叠氮化物。 
* 印迹膜抗体剥离和再杂交优化抗体剥离条件。 
* 仅在必要时进行再杂交检测。 
* 避免对同一印迹膜进行多次重复再杂交。 
* 蛋白质未转移→优化目标蛋白转移效率。

== 高背景 ==
目的条带单一清晰，但其他地方弥漫着连续性的单一背景。是WB最常见的问题之一，注意操作规范，不偷工减料，洗膜按照规定来5min×5次或者10min×3次，不要改成5min×3次，或者10min×2次。<br>
出现原因：
* 为封闭不完善（脱脂牛奶多加点）。
* 一抗浓度过高导致出现了非特异性结合。
* 洗膜的时间及次数不足导致未洗脱游离抗体。

== 出现异常的多个条带 ==
出现原因：
* 可能是一抗与杂蛋白出现了非特异性结合。 
* 抗体浓度过高。 
* 非特异位点封闭不足。 
* 向封闭缓冲溶液中加入0.05%的Tween®20。 
* SDS使抗体和固定的蛋白条带发生非特异性结合。 <br>
解决方案：
* 可尝试更换一抗（你的一抗实在是太屎了花点钱重买一个吧）。
* 降低抗体浓度。
* 提高封闭剂浓度，如从5%提高到7%。
* 增加封闭时间和/或提高温度。
* 抗体稀释液采用相同的封闭缓冲液(加入0.05%的 Tween®20)。
* 转移后洗涤印迹膜。
* 在免疫检测过程中不要使用SDS。
* 抗体质量尝试使用不同抗体。
== 条带中出现圆圈 ==
出现的原因是电转时PAGE胶与尼龙膜之间存在气泡。 出现气泡的原因基本上是在转膜过程中转移“三明治”组装不恰当。<br> 
解决方法：
* 在组装转移“三明治”的时候使用更多的转印缓冲液。 
* 确保在组装“三明治”的时候移除凝胶和印迹膜之间所有的气泡。 
* 在抗体孵育前用丽春红S为印迹膜染色，以检查转移质量。 
* 尽量不要使用半干法（使用湿法转膜，即泡在整个的转移buffer溶液中）。 
* 将“三明治”压压紧。
操作注意：<br>
我们常常将电转液倒入一个盘子里，倒入的液体不能太多也不能太少，最好的高度是与放上第一层滤纸齐平，然后往滤纸上浇点转膜液，把电泳胶用清水清洗下，将电泳胶平铺到滤纸上，仔细检查滤纸与胶之间是否有气泡，可以左右前后观察，不同方向观察之后确认无气泡，然后再往胶上面浇点电转液，用两只手的拇指和食指轻轻夹住PVDF膜的两侧中间，使膜成U型，然后将U型的底部接触胶的中间，慢慢往两边放下膜，这样一般气泡很少。然后上层滤纸同样用U型的放置方法，用玻璃棒稍微贴实下，然后盖上海绵。注意不要来回赶气泡，这样反而会带入气泡。

== 条带中出现浅色 ==
中心部位高浓度的辣根过氧化物酶（HRP）等消耗底物过快，使得胶片曝光时底物已消耗殆尽。解决方法是降低蛋白量，降低一抗和二抗浓度，加快X光片定影。 
== 出现黑点和黑斑 ==
出现原因：
* 凝胶碎片粘附于印迹膜之上；成块的封闭剂粘附于印迹膜之上。 
* 抗体聚合。 
* 缓冲液污染。 
* 一抗与膜某些地方非特异性结合。 <br>
解决方案：
* 将印迹膜表面残留的丙烯酰胺凝胶碎片移除。
* 确保封闭剂在使用前完全溶解。
* 向封闭缓冲溶液中加入0.1%的Tween-20®。
* 使用0.2μm的过滤器过滤抗体缓冲液。
* 使用新鲜抗体、向抗体缓冲溶液中加入0.1%的 Tween-20®。
* 使用新的缓冲液或使用0.2μm的过滤器过滤缓冲液。
* 封闭牛奶一定要纯，封闭结束之后要洗，如果没有完全溶解的情况下加牛奶倒膜上，会导致很多不溶性颗粒附着在膜上，这就会导致发光时候膜上的黑点。

== 条带拖尾 ==
蛋白量过大，一抗的浓度过大，加入的时间过长，洗一抗和洗二抗不要凑活，一定要5min×5次。样品溶解度不佳。

== 出现重影 ==
荧光强度较高，压片曝光时，胶片放好后又移动了一段距离。不要瞎动，放歪了也不要调整。（有的时候出现重新刚好在上下位置，并且重影会相对弱一些，不要误以为抗体识别了该蛋白的另外一种异构形式。）

== 出现非均一性背景 ==
可能的原因是膜干了失水皱缩，所以多加点水。 
== 某个条带变形 ==
PAGE胶中可能存在气泡或不溶性颗粒，故配胶时要小心，使用无杂质液体。制作“三明治”时也要压紧。更换陈年老用的海绵垫。

== 条带哑铃型 ==
更换更高品质的PAGE胶。 
== 最边缘的条带弯曲 ==
电泳电流不均一，可换用新的电泳槽，不使用两边的泳道。找电工修修你家的变压器。

== 蛋白质分子量过高或过低 ==
出现原因：
* 胶配置的浓度与蛋白质分子浓度不符。
* 当然也有可能是蛋白质中碱性氨基酸过多导致SDS无法屏蔽这些正电荷，或者蛋白质中脯氨酸含量过高。
* 抗体用错了，变性不彻底出现二聚体或者多聚体；
* 蛋白修饰，蛋白剪切；
* 非特异性的蛋白强于待检测的样品。<br>
解决方案：<br>用特异性高的抗体检测，变性彻底。
== 在主条带下方出现条带 ==
蛋白质降解，下方产生的模糊不清的小条带是其碎片。提取蛋白的时候PMSF（苯甲基磺酰氟，蛋白酶抑制剂）多加点。 
== 条带“╰╯”笑脸状（U 形状） ==
凝胶冷却不均一，电泳槽老化，在上样的时候没有吹打干净、跑胶电压过大造成拖尾。 
== 条带“╭╮”哭脸状 ==
凝胶的左右两头没有固定好。 
== 溴酚蓝（前沿染料）拖尾 ==
样品溶解度不好。 
== 条带出现纵向纹理 ==
上样样品中存在不溶性颗粒。 
== 溴酚蓝占据的范围很粗 ==
浓缩胶效果不好。 
== 分离胶中条带无法分离 ==
缓冲液pH不正确，或者SDS加的太少。 
== 边缘效应 ==
出现于胶图的两端最靠边的条带，会发现跑出来的带不是水平直线。<br> 
解决方案：<br>宁可将Loading buffer加到两边也不要将样品加到两边。 
== 脏……全屏条带 == 
出现原因：
* 一抗和/或二抗浓度过高。 
* 非特异位点封闭不足。 
* 使用了错误的封闭缓冲溶液。 
* 洗涤不足增加洗涤次数和缓冲液用量（最少5×5分钟）。 
* 曝光时间过长。 
* 印迹过程中印迹膜变干。 
* 缓冲液重复利用导致污染。
* 所有条带连成一片没有间隔，上样量过多，样品弥散<br>
解决方案：<br>
* 稀释一抗和/或二抗浓度。
* 提高封闭剂浓度，如3~5% 的牛血清蛋白、酪蛋白、脱脂牛奶.
* 降低封闭时间和/或温度。
* 向封闭缓冲溶液中加入0.05%的Tween®-20。
* 一抗和/或二抗与 封闭缓冲液中的蛋白相结合或者尝试其他封闭剂（白蛋白、酪蛋白、脱脂牛奶等）。
* 在使用亲和素-生物素系统时不要使用牛奶来封闭印迹膜，因为牛奶含有生物素。
* 增加洗涤次数和缓冲液用量(最少5×5分钟)。
* 如果洗涤液中未含有0.1%的Tween®-20，请添加。
* 减少成像曝光时间。
* 确保印迹膜保持湿润，覆盖有足够液体以防止其变干。
* 使用新制缓冲液。

== 脏……区域性黑屏 ==
出现原因：
* 部分印迹膜变干。
* 洗涤缓冲液与某些印迹区域接触不足。
* 洗涤缓冲液与某些印迹区域接触不足。
* 印迹膜污染。<br>
解决方案：
* 确保印迹膜保持湿润，一直覆盖有足够液体以防止其变干。
* 增加洗涤缓冲液用量。
* 避免过多印迹堆叠在一个孵育容器内。
* 使用干净的或新的转移三明治；请勿用手直接接触印迹膜，一直配戴清洁手套或使用医用镊子。
* 确保电泳设备、转移设备和孵育盘清洁，远离外部污染源。
<ref>本文档由拟态章鱼编写，由恺凌、Eric校对审核。</ref>
<ref>[https://www.dxy.cn/bbs/newweb/pc/post/41165994]Western Blot 原理、protocol--及条带常见问题分析.与你畅游世界</ref>