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{| class="wikitable"
!门类
!光合产物
!光合色素
!载色体膜数和类囊体结构
!生殖方式
!鞭毛类型
!细胞壁
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|蓝藻(原核)
|蓝藻淀粉，蓝藻颗粒体
|叶绿素a,（f,d），藻蓝素，藻红素
|没有载色体，只有光合片层
|直接分裂，如藻殖段，厚壁孢子（颤藻除外）丝状蓝藻； 外生和内生孢子；无有性生殖
|整个生活史都没有鞭毛
|4层，可被溶菌酶分解，主要为肽聚糖，外有果胶酸粘多糖构成的胶质鞘，含非光合色素
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|隐藻
|淀粉、油滴
|叶绿素a，c，β-胡萝卜素，硅甲藻素、甲藻黄素，藻胆素
|四重套膜所包裹的二层类囊体
|多为细胞纵分裂，不具鞭毛的种类产生游动孢子，有些种类产生厚壁的休眠孢子
|2条，略等长或不等长，自腹侧前侧口沟伸出
|种类细胞不具纤维素细胞壁，细胞外有一层周质体，柔软或坚固
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| rowspan="2" |甲藻
| rowspan="2" |淀粉和油
| rowspan="2" |叶绿素a,c，β-胡萝卜素，多甲藻素，硅甲藻素。甲藻素，硅藻黄素
| rowspan="2" |3一层内质网不连核膜，两层载色体，类囊体3条一束
|无性生殖：细胞分裂，游动孢子，不动孢子，厚壁孢子等
| rowspan="2" |2根顶生或2根侧生。顶生一尾鞭型向前，一短茸鞭型向后。侧生鞭毛，横鞭毛茸鞭型，纵鞭毛尾鞭型，都是9+2
| rowspan="2" |部分有壁，含纤维素
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|有性生殖：为同配，罕见
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| rowspan="2" |金藻
| rowspan="2" |金藻昆布糖—β1-3葡聚糖，油滴
| rowspan="2" |叶绿素a,c，β-胡萝卜素，墨角藻黄素，硅藻黄素，硅甲藻素
| rowspan="2" |4两层内质网连核膜，两层载色体，类囊体3条一束
|无性生殖：纵分裂，断裂，游动孢子，不动孢子等
| rowspan="2" |1~2根。2根时，一茸鞭型向前，一短尾鞭型向后。
| rowspan="2" |少见（金球藻目与金枝藻目），纤维素和果胶质
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|有性生殖：为同配，少见
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| rowspan="2" |黄藻
| rowspan="2" |金藻昆布糖，油
| rowspan="2" |叶绿素a，（c存于无隔藻属），β-胡萝卜素，硅甲黄素，没有墨角藻黄素
| rowspan="2" |4两层内质网连核膜，两层载色体，类囊体3条一束
|无性生殖：游动/不动孢子
| rowspan="2" |亚顶生，不等长的两根9+2，一茸鞭型向前，一短尾鞭型向后。
| rowspan="2" |由U形或H形嵌套构成，果胶质
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|有性生殖：少见，黄丝藻属-同配；气球藻属-同配和异配；无隔藻属-卵配
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| rowspan="2" |红藻
| rowspan="2" |红藻淀粉（细胞质中的糖原类多糖，非水溶），红藻糖
| rowspan="2" |叶绿素a,b,d，β-胡萝卜素，藻蓝素，藻红素，叶黄素，蒲公英黄素
| rowspan="2" |2类囊体不成束
|无性生殖：静孢子，单孢子-紫菜；四分孢子-多管藻
| rowspan="2" |整个生活史都没有鞭毛
| rowspan="2" |内层纤维素，外层果胶质
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|有性生殖：精子囊与果胞，产果孢子（体）（果孢子为n，果孢子体又称囊果为2n，后减数分裂为四分孢子）
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|硅藻
|金藻昆布糖，油
|叶绿素a,c，α,β-胡萝卜素，墨角藻黄素，硅藻黄素，硅甲黄素
|4两层内质网连核膜，两层载色体，类囊体3条一束
|细胞分裂增殖，连续分裂使细胞减小（老壳均在外套上壳），可以多种方式形成复大孢子回复大小。
|仅精子有鞭毛，茸鞭型，9+0（特殊）
|U形嵌套形成，果胶质与硅质
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| rowspan="3" |褐藻
| rowspan="3" |褐藻淀粉，甘露醇
| rowspan="3" |叶绿素a,c，α,β-胡萝卜素，墨角藻黄素（特别多），6种叶黄素等
| rowspan="3" |4两层内质网连核膜，两层载色体，类囊体3条一束
|营养繁殖：断裂或繁殖枝 
| rowspan="3" |精子和运动细胞一般有两不等长侧生鞭毛，一茸鞭型向前较长，一尾鞭型向后较短，墨角藻目向后较长，网地藻目仅1鞭毛向前。
| rowspan="3" |内层纤维素，外层藻胶，壁内含褐藻糖胶
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|无性生殖：静孢子和游动孢子（除了墨角菜目都可以形成）
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|有性生殖：同异卵，除墨角菜目都有世代交替，多数孢子体发达
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| rowspan="2" |绿藻
| rowspan="2" |淀粉
| rowspan="2" |叶绿素a,b，α,β-胡萝卜素，虾青素，叶黄素等
| rowspan="2" |2类囊体3~6条一束
|营养繁殖：断裂，分裂等等
| rowspan="2" |运动细胞有2或4条顶生等长鞭毛，9+2，全是尾鞭型，多数种类仅孢子或配子可移动。
| rowspan="2" |纤维素，果胶
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|无性生殖：静孢子和游动孢子，有性生殖多样化（同异卵接）
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|裸藻
|裸藻淀粉（只存在于裸藻细胞质）
|叶绿素a,b，β-胡萝卜素，3种叶黄素
|3一层内质网，两层载色体，类囊体3条一束
|细胞纵分裂增殖，可形成胞囊，没有无性生殖。有性生殖尚不明确。
|1~3根，9+2，茸鞭型
|无细胞壁（除胶柄藻属）
|}