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报告基因是用于筛选和指示转化的细胞、组织的有效标记，有时也可作为目的基因，应为显性基因，非转化者不能生存，对自身发育等无伤害，易得到，无抗性。<ref>本文来自：袁婺洲.基因工程.2版.北京：化学工业出版社</ref>

=植物报告基因=

==''npt'' 新霉素磷酸转移酶基因==
来自转座子Tn5，对卡那霉素、G418、巴龙霉素、新霉素有抗性，其中卡那霉素抗性基因（''kan''<sup>r</sup>）或新霉素抗性基因（''NPT II''）为第一个使用并现在常用的标记基因，

==''aph IV'' 潮霉素磷酸转移酶基因==
来自大肠杆菌，对潮霉素抗性，在禾谷类的选择效率比新霉素高，对人无食品安全问题（因为潮霉素只用于兽医临床）。

==''spt'' 链霉素磷酸转移酶基因==
<br />

==''cat'' 氯霉素乙酰转移酶基因==
<br />

==''aacc3''和''aacc4'' 庆大霉素-3-N-乙酰转移酶基因==
对庆大霉素有抗性。

==''ble'' 博来霉素抗性基因==
来源于Tn5，对博来霉素有抗性。

==''bar'' 膦化麦黄酮乙酰转移酶（PAT）基因==

==''epsps'' 草甘膦抗性标记基因==

==''als'' 绿黄隆抗性标记基因==

==''GUS'' β-葡萄糖苷酶基因==

==荧光素酶基因==
荧光素酶一般催化萤光素 +ATP→ 萤光素化腺苷酸（luciferyl adenylate） +PPi

萤光素化腺苷酸 +O2→ 氧萤光素 +AMP+ 光

反应光产物具有最高的量子效率

==GFP基因==
绿色荧光蛋白基因