DNA解链酶:修订间差异

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!真核
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!古菌
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|Dna A
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|复制起始蛋白,结合上ATP,并形成四聚体,在HU蛋白和IHF帮助下,协同地识别并结合复制起始区''OciC''的9bp(TTATCCACA)重复序列,此区亦称A盒(A box),Dam可激活其表达。Dna A可以结合ATP,属于AAA<sup>+</sup>(与细胞多种活性相关的ATPase),组装成类似于核小体的结构,水解ATP开始解链,形成45bp开放的起始复合物。之后被取代下来。
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|对应ORC。
|对应Orc1/Cdc6
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|Dna B
|Dna B
|DNA解链酶,在Dna C和Dna D帮助下,2个被招募形成前引发体(消耗ATP),形成前引发体后,Dna B将''OriC''的解链区扩大,之后取代Dna A,当接触到Tus蛋白(Dna B蛋白抑制剂)的β股构成的一面时,就无法穿过,受阻于此(若为Tus蛋白的另一面可通过)。
|对应MCM复合物。
|对应MCM
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|Dna C
|招募Dna B到复制叉。
|对应Cdc6+Cdr1。
|对应Orc1/Cdc6
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|Dna E
|为DNA聚合酶III。
|对应PCNA(滑动钳)、3种细胞核DNA复制用的DNA聚合酶。
|对应PCNA(滑动钳)、古菌的B类DNA聚合酶。
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|Dna G
|为DNA引发酶,在Pri A、Pri B和Pri C帮助下,与DnaB蛋白结合,一般在CTG序列,之后合成引物,引物一般为11nt(±1nt),引物的前两个碱基一般为AG。
|与DNA聚合酶α结合的引发酶。
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|Dna T
|辅助Dna C将Dna B招募到复制叉。
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<ref>杨荣武.2018.生物化学原理.3版.北京:高等教育出版社</ref><ref>Katarzyna Bebenek,Thomas A.Kunkel(2004)Advances in Protein Chemistry Volume 69, 2004, Page 138</ref>
== 其他有解链酶活性的酶 ==
B——Bacteria 细菌
A——archaea 古菌
E——eukaryote 真核生物
M——mitochondrion 线粒体
C——chloroplast 叶绿体
备注1:建议在功能上继续分类
{| class="wikitable"
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!蛋白名称
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!备注
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因子
|B
|原核生物转录终止时DNA·RNA杂交链的分离
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因子
|B
|RNApol 封闭复合物到开放复合物的转化
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|Dna C
|细菌
RNApol
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|转录延伸时DNA解链
|具体哪个亚基待考证
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|SL1
(选择因子1)
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|RNApol I 转录起始中的解链
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|TFIII
B
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|RNApol III 转录起始中的解链
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|E
|RNApol I和II负责的转录的终止时DNA/RNA杂交链分离
|在核酸外切酶rat1触及RNApol时
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|TFII
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|RNApol II 转录起始解链(待考证);NER时解链
|九个亚基,其中XPB亚基向5'解链,XPD亚基向3'解链
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|B
|细菌NER中微弱的解链酶活性,同时招募UvrC切割
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|UvrC切割后解链下12nt-13nt的切割产物
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|Dna G
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|B
|同源重组中结合dsDNA自由末端,向下游解链
|解链的同时表现3'外切酶(遇到χ序列前)5'外切酶(遇到χ序列后)
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|Ruv
B
|B
|同源重组中催化分支迁移
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|RecQ,RecG,
DNA解链酶I
DNA解链酶IV等
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|参加同源重组,可能是RecF和RecE的同源重组途径
|杨sir书都没仔细讲,等我去看看Lewin's Gene XII
我赌它不考
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待补充
<ref>杨荣武,2017,分子生物学,第2版,南京大学出版社</ref><references />

2024年11月21日 (四) 15:15的最新版本

DNA解链酶(解旋酶)为催化DNA螺旋解链的酶,在DNA复制、转录、修复、重组起作用。无序列特异性,大多数优先结合单链区域,少部分为双链区域,还需要结合ATP,并有ATPase活性。顺模板向不断延伸,需要Mg2+。如Dna B。

Dna蛋白

蛋白 E.coli 真核 古菌
Dna A 复制起始蛋白,结合上ATP,并形成四聚体,在HU蛋白和IHF帮助下,协同地识别并结合复制起始区OciC的9bp(TTATCCACA)重复序列,此区亦称A盒(A box),Dam可激活其表达。Dna A可以结合ATP,属于AAA+(与细胞多种活性相关的ATPase),组装成类似于核小体的结构,水解ATP开始解链,形成45bp开放的起始复合物。之后被取代下来。 对应ORC。 对应Orc1/Cdc6
Dna B DNA解链酶,在Dna C和Dna D帮助下,2个被招募形成前引发体(消耗ATP),形成前引发体后,Dna B将OriC的解链区扩大,之后取代Dna A,当接触到Tus蛋白(Dna B蛋白抑制剂)的β股构成的一面时,就无法穿过,受阻于此(若为Tus蛋白的另一面可通过)。 对应MCM复合物。 对应MCM
Dna C 招募Dna B到复制叉。 对应Cdc6+Cdr1。 对应Orc1/Cdc6
Dna E 为DNA聚合酶III。 对应PCNA(滑动钳)、3种细胞核DNA复制用的DNA聚合酶。 对应PCNA(滑动钳)、古菌的B类DNA聚合酶。
Dna G 为DNA引发酶,在Pri A、Pri B和Pri C帮助下,与DnaB蛋白结合,一般在CTG序列,之后合成引物,引物一般为11nt(±1nt),引物的前两个碱基一般为AG。 与DNA聚合酶α结合的引发酶。 -
Dna T 辅助Dna C将Dna B招募到复制叉。 - -

[1][2]

其他有解链酶活性的酶

B——Bacteria 细菌

A——archaea 古菌

E——eukaryote 真核生物

M——mitochondrion 线粒体

C——chloroplast 叶绿体

备注1:建议在功能上继续分类

蛋白名称 生物范围 功能 备注
ρ

因子

B 原核生物转录终止时DNA·RNA杂交链的分离
σ

因子

B RNApol 封闭复合物到开放复合物的转化
细菌

RNApol

B 转录延伸时DNA解链 具体哪个亚基待考证
SL1

(选择因子1)

E RNApol I 转录起始中的解链 TBP
TFIII

B

E RNApol III 转录起始中的解链 TBP
Sen

1

E RNApol I和II负责的转录的终止时DNA/RNA杂交链分离 在核酸外切酶rat1触及RNApol时
TFII

H

E RNApol II 转录起始解链(待考证);NER时解链 九个亚基,其中XPB亚基向5'解链,XPD亚基向3'解链
Uvr

B

B 细菌NER中微弱的解链酶活性,同时招募UvrC切割
Uvr

D

B UvrC切割后解链下12nt-13nt的切割产物
Rec

BCD

B 同源重组中结合dsDNA自由末端,向下游解链 解链的同时表现3'外切酶(遇到χ序列前)5'外切酶(遇到χ序列后)
Ruv

B

B 同源重组中催化分支迁移
RecQ,RecG,

DNA解链酶I DNA解链酶IV等

B 参加同源重组,可能是RecF和RecE的同源重组途径 杨sir书都没仔细讲,等我去看看Lewin's Gene XII

我赌它不考

待补充

[3]

  1. 杨荣武.2018.生物化学原理.3版.北京:高等教育出版社
  2. Katarzyna Bebenek,Thomas A.Kunkel(2004)Advances in Protein Chemistry Volume 69, 2004, Page 138
  3. 杨荣武,2017,分子生物学,第2版,南京大学出版社