系统发育学:修订间差异

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* 有些出题人会用裸子植物不是单系群凌辱你,请各位小伙伴见仁见智,这个说法可能主要是基于化石种的问题出发的,因此会认为在被归为“裸子植物”的化石种中存在被子植物祖先,比如开通目等等,了解就好,古生物学就是天坑。
* 有些出题人会用裸子植物不是单系群凌辱你,请各位小伙伴见仁见智,这个说法可能主要是基于化石种的问题出发的,因此会认为在被归为“裸子植物”的化石种中存在被子植物祖先,比如开通目等等,了解就好,古生物学就是天坑。
* 基于现有的研究,裸子植物的分子系统学分类大面上定了,主要分为三个纲(基于单系群理念划分),分别为:
* 基于现有的研究,现生裸子植物的分子系统学分类大面上定了,主要分为三个纲(基于单系群理念划分),分别为:
** 苏铁纲(Cycadopsida);
** 苏铁纲(Cycadopsida);
** 银杏纲(Ginkgoopsida);
** 银杏纲(Ginkgoopsida);
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** 银杏纲一枝独秀,目、科、属、种都一样(植物界著名独户)。
** 银杏纲一枝独秀,目、科、属、种都一样(植物界著名独户)。
* 松柏纲的系统发育关系变化较大,首先注意到红豆杉纲和买麻藤纲均取消,归入松柏纲。在现有的松柏纲内,存在三个亚纲(分别代表三个独立单系群):
* 松柏纲的系统发育关系变化较大,首先注意到红豆杉纲和买麻藤纲均取消,归入松柏纲。在现有的松柏纲内,存在三个亚纲(分别代表三个独立单系群):
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**柏亚纲(Cupressidae);
**松亚纲(Pinidae);
**买麻藤亚纲(Gnetidae)。
*其中,松亚纲与买麻藤亚纲聚为一支。说实在的是很令人意外的结果。
*买麻藤亚纲下仍是原来的三目三科,也仍旧是百岁兰科与买麻藤科聚为一支,这一点与过去的分类系统完全一致。
*松亚纲下仅松目、松科,下分冷杉亚科(Abietoideae)与松亚科(Pinoideae),具体的属不再赘述。
*柏亚纲是一坨错综复杂的分类群,主要分两个目:
**南洋杉目(Araucariales);
**柏目(Cupressales)。
*当然有的说法不叫柏亚纲而叫柏杉纲,松和买麻藤又另论,这只是把纲的等级降到了更低一级单系群上去,画出来的树是一样的。
*南洋杉目下分两科,南洋杉科与罗汉松科(Podacarpaceae),罗汉松进一步分为叶枝杉亚科和罗汉松亚科,下属不赘述。注意到原本被认为是单系的红豆杉纲被拆到了两个目中,变化相当大。
*柏目四科,其中金松科(Sciadopityaceae)属于最基部类群(金松终于单独成科了),剩余三科中三尖杉科与红豆杉科聚为一支。
*柏科中,原有的杉科作为一个并系群位于柏科的基部,不过水杉没有变成柏亚科还是值得庆幸的。
*[[文件:裸子植物系统发育树.jpg|替代=裸子植物系统发育树|缩略图|裸子植物系统发育树]]
*图在此处:
*参考文献:[https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2468265922000440?via%3Dihub Recent advances on phylogenomics of gymnosperms and a new classification],是杨永教授的一篇文章。


=== 被子植物的系统发育 ===
=== 被子植物的系统发育 ===

2024年10月16日 (三) 10:16的版本

这个页面是对近年来分子证据揭示的新系统发育结果的汇总,可以避免你被出题人用“以下哪些是单系群”凌辱。

真核生物的系统发育

植物的系统发育

泛植物类的系统发育

苔藓植物的系统发育

  • 苔藓植物是单系群
    • 苔纲和藓纲是姐妹群,合称“蒴柄植物”
    • “蒴柄植物”和角苔纲是姐妹群
    • 苔纲,藓纲,角苔纲都是单系群

石松类和真蕨类的系统发育

裸子植物的系统发育

  • 有些出题人会用裸子植物不是单系群凌辱你,请各位小伙伴见仁见智,这个说法可能主要是基于化石种的问题出发的,因此会认为在被归为“裸子植物”的化石种中存在被子植物祖先,比如开通目等等,了解就好,古生物学就是天坑。
  • 基于现有的研究,现生裸子植物的分子系统学分类大面上定了,主要分为三个纲(基于单系群理念划分),分别为:
    • 苏铁纲(Cycadopsida);
    • 银杏纲(Ginkgoopsida);
    • 松柏纲(Piniopsida)。
  • 其中,苏铁纲与银杏纲聚为一支,属于较为古老的裸子植物。
    • 苏铁纲的下属:苏铁目(Cycadales),下属科:苏铁科(Cycadaceae)与泽米铁科(Zamiaceae)。泽米铁科下还分两亚科,不过鉴于非研究无意义原则不多赘述。
    • 银杏纲一枝独秀,目、科、属、种都一样(植物界著名独户)。
  • 松柏纲的系统发育关系变化较大,首先注意到红豆杉纲和买麻藤纲均取消,归入松柏纲。在现有的松柏纲内,存在三个亚纲(分别代表三个独立单系群):
    • 柏亚纲(Cupressidae);
    • 松亚纲(Pinidae);
    • 买麻藤亚纲(Gnetidae)。
  • 其中,松亚纲与买麻藤亚纲聚为一支。说实在的是很令人意外的结果。
  • 买麻藤亚纲下仍是原来的三目三科,也仍旧是百岁兰科与买麻藤科聚为一支,这一点与过去的分类系统完全一致。
  • 松亚纲下仅松目、松科,下分冷杉亚科(Abietoideae)与松亚科(Pinoideae),具体的属不再赘述。
  • 柏亚纲是一坨错综复杂的分类群,主要分两个目:
    • 南洋杉目(Araucariales);
    • 柏目(Cupressales)。
  • 当然有的说法不叫柏亚纲而叫柏杉纲,松和买麻藤又另论,这只是把纲的等级降到了更低一级单系群上去,画出来的树是一样的。
  • 南洋杉目下分两科,南洋杉科与罗汉松科(Podacarpaceae),罗汉松进一步分为叶枝杉亚科和罗汉松亚科,下属不赘述。注意到原本被认为是单系的红豆杉纲被拆到了两个目中,变化相当大。
  • 柏目四科,其中金松科(Sciadopityaceae)属于最基部类群(金松终于单独成科了),剩余三科中三尖杉科与红豆杉科聚为一支。
  • 柏科中,原有的杉科作为一个并系群位于柏科的基部,不过水杉没有变成柏亚科还是值得庆幸的。
  • 裸子植物系统发育树
    裸子植物系统发育树
  • 图在此处:
  • 参考文献:Recent advances on phylogenomics of gymnosperms and a new classification,是杨永教授的一篇文章。

被子植物的系统发育

  • 单子叶植物是单系群,原双子叶植物不是单系群。

蔷薇科

  • 原蔷薇亚科、李亚科、绣线菊亚科不是单系群,原苹果亚科是单系群。
  • 剔除了几个成员(如棣棠)的原蔷薇亚科构成新的蔷薇亚科
  • 几个成员构成了仙女木亚科
  • 原绣线菊亚科、李亚科、苹果亚科构成了桃亚科
  • 桃亚科、仙女木亚科、新的蔷薇亚科之间的关系尚未确定

豆科

  • 原含羞草亚科和蝶形亚科是单系群,云实亚科不是
  • 现在分为六个亚科:
    • 紫荆亚科:独立自原云实亚科
    • 甘豆亚科:独立自原云实亚科
    • 山姜豆亚科:独立自原云实亚科
    • 酸揽豆亚科:独立自原云实亚科
    • 云实亚科:残留的云实亚科+含羞草亚科
    • 蝶形花亚科:不变。

菊科

  • 原舌状花亚科不是单系群,原管状花亚科是。

动物的系统发育

真菌的系统发育

传统上真菌通常分为:壶菌chytridiomycetes,接合菌zygomycetes,子囊菌ascomycetes,担子菌basidiomycetes。

  • 原壶菌不是单系群,是最基部的三条谱系:Cryptomycota/Microsporidia, Chytridiomycota, Blastocladiomycota。
    • 这暗示“具有鞭毛”不是壶菌的共衍征,而是真菌共同祖先的祖征。在Microsporidia和原壶菌门之外的所有类群中,鞭毛发生了两次丢失。
  • 原接合菌门不是单系群,而是构成了接下来的两条谱系:Zoopagomycota和Mucoromycota。
  • 子囊菌和担子菌是单系群,两者是姐妹群

顺带一提,具有游动孢子的水霉、霜霉、马铃薯晚疫病(爱尔兰大饥荒)属于卵菌门(吴国芳的鞭毛菌门),并不是真菌,而是一种不等鞭毛类,和海带之类是亲戚。