DNA解链酶：修订间差异
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C——chloroplast 叶绿体 | C——chloroplast 叶绿体 | ||
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|同源重组中结合dsDNA自由末端，向下游解链 | |同源重组中结合dsDNA自由末端，向下游解链 | ||
|解链的同时表现3'外切酶（遇到χ序列前） 杨sir认为遇到chi序列后RecBCD将获得5'外切酶活性，但是Lewin's gene XII 认为RecBCD只具有3'外切酶活性，遇到chi序列后RecD亚基解离并失去3' | |解链的同时表现3'外切酶（遇到χ序列前） 杨sir认为遇到chi序列后RecBCD将获得5'外切酶活性，但是Lewin's gene XII 认为RecBCD只具有3'外切酶活性，遇到chi序列后RecD亚基解离并失去3'外切酶活性。本人准备向杨sir发邮件问这个问题。 | ||
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|RecQ，RecG， | |RecQ，RecG， | ||
DNA解链酶I | DNA解链酶I,DNA解链酶IV等 | ||
DNA解链酶IV等 | |||
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|参加同源重组,可能是RecF和RecE的同源重组途径 | |参加同源重组,可能是RecF和RecE的同源重组途径 | ||
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Lewin's gene XII 指出RecG与RecBCD作用相同，其他没讲 | |||
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|翻译中解开稳定性小于126kJ的mRNA二级结构 | |||
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<ref>杨荣武,2017,分子生物学,第2版，南京大学出版社</ref><references /> | <ref>杨荣武,2017,分子生物学,第2版，南京大学出版社</ref><ref>Lewin's Gene XII 中文版，科学出版社，2021</ref><references /> | ||
2024年11月24日 (日) 22:02的最新版本
DNA解链酶（解旋酶）为催化DNA螺旋解链的酶，在DNA复制、转录、修复、重组起作用。无序列特异性，大多数优先结合单链区域，少部分为双链区域，还需要结合ATP，并有ATPase活性。顺模板向不断延伸，需要Mg2+。如Dna B。
Dna蛋白
| 蛋白 | E.coli | 真核 | 古菌 |
|---|---|---|---|
| Dna A | 复制起始蛋白，结合上ATP，并形成四聚体，在HU蛋白和IHF帮助下，协同地识别并结合复制起始区OciC的9bp（TTATCCACA）重复序列，此区亦称A盒（A box），Dam可激活其表达。Dna A可以结合ATP，属于AAA+（与细胞多种活性相关的ATPase），组装成类似于核小体的结构，水解ATP开始解链，形成45bp开放的起始复合物。之后被取代下来。 | 对应ORC。 | 对应Orc1/Cdc6 |
| Dna B | DNA解链酶，在Dna C和Dna D帮助下，2个被招募形成前引发体（消耗ATP），形成前引发体后，Dna B将OriC的解链区扩大，之后取代Dna A，当接触到Tus蛋白（Dna B蛋白抑制剂）的β股构成的一面时，就无法穿过，受阻于此（若为Tus蛋白的另一面可通过）。 | 对应MCM复合物。 | 对应MCM |
| Dna C | 招募Dna B到复制叉。 | 对应Cdc6+Cdr1。 | 对应Orc1/Cdc6 |
| Dna E | 为DNA聚合酶III。 | 对应PCNA（滑动钳）、3种细胞核DNA复制用的DNA聚合酶。 | 对应PCNA（滑动钳）、古菌的B类DNA聚合酶。 |
| Dna G | 为DNA引发酶，在Pri A、Pri B和Pri C帮助下，与DnaB蛋白结合，一般在CTG序列，之后合成引物，引物一般为11nt（±1nt），引物的前两个碱基一般为AG。 | 与DNA聚合酶α结合的引发酶。 | - |
| Dna T | 辅助Dna C将Dna B招募到复制叉。 | - | - |
其他有解链酶活性的酶
B——Bacteria 细菌
A——archaea 古菌
E——eukaryote 真核生物
M——mitochondrion 线粒体
C——chloroplast 叶绿体
| 蛋白名称 | 生物范围 | 功能 | 备注 |
|---|---|---|---|
| ρ
因子 |
B | 原核生物转录终止时DNA·RNA杂交链的分离 | |
| σ
因子 |
B | RNApol 封闭复合物到开放复合物的转化 | |
| 细菌
RNApol |
B | 转录延伸时DNA解链 | 具体哪个亚基待考证 |
| SL1
(选择因子1） |
E | RNApol I 转录起始中的解链 | TBP |
| TFIII
B |
E | RNApol III 转录起始中的解链 | TBP |
| Sen
1 |
E | RNApol I和II负责的转录的终止时DNA/RNA杂交链分离 | 在核酸外切酶rat1触及RNApol时 |
| TFII
H |
E | RNApol II 转录起始解链（待考证）；NER时解链 | 九个亚基，其中XPB亚基向5'解链，XPD亚基向3'解链 |
| Uvr
B |
B | 细菌NER中微弱的解链酶活性，同时招募UvrC切割 | |
| Uvr
D |
B | UvrC切割后解链下12nt-13nt的切割产物 | |
| Rec
BCD |
B | 同源重组中结合dsDNA自由末端，向下游解链 | 解链的同时表现3'外切酶（遇到χ序列前） 杨sir认为遇到chi序列后RecBCD将获得5'外切酶活性，但是Lewin's gene XII 认为RecBCD只具有3'外切酶活性，遇到chi序列后RecD亚基解离并失去3'外切酶活性。本人准备向杨sir发邮件问这个问题。 |
| Ruv
B |
B | 同源重组中催化分支迁移 | |
| RecQ，RecG，
DNA解链酶I,DNA解链酶IV等 |
B | 参加同源重组,可能是RecF和RecE的同源重组途径 | 杨sir书都没仔细讲。
Lewin's gene XII 指出RecG与RecBCD作用相同，其他没讲 我赌它不考 |
| eIF
4a |
E | 翻译中解开稳定性小于126kJ的mRNA二级结构 |
待补充