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生态学小汇总(2):修订间差异

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'''测度指标''':
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* '''等位基因数目(Number of Alleles)''':特定基因座上不同等位基因的数量。
'''等位基因数目(Number of Alleles)''':特定基因座上不同等位基因的数量。
* '''杂合度(Heterozygosity)''':
'''杂合度(Heterozygosity)''':
** '''预期杂合度(He''He''​)''':根据哈迪-温伯格平衡计算的杂合度,He=1−∑pi2''He''​=1−∑''pi''2​,其中pi''pi''​为等位基因频率。
'''预期杂合度(He''He''​)''':根据哈迪-温伯格平衡计算的杂合度,He=1−∑pi2''He''​=1−∑''pi''2​,其中pi''pi''​为等位基因频率。
** '''观测杂合度(Ho''Ho''​)''':实际观测到的杂合个体比例。
'''观测杂合度(Ho''Ho''​)''':实际观测到的杂合个体比例。
* '''核苷酸多样性(π,Pi)''':衡量DNA序列中平均每对核苷酸的差异数,适用于分子数据。
'''核苷酸多样性(π,Pi)''':衡量DNA序列中平均每对核苷酸的差异数,适用于分子数据。
* '''有效种群大小(Ne''Ne''​)''':反映种群遗传多样性的维持能力,Ne''Ne''​越大,多样性越高。
'''有效种群大小(Ne''Ne''​)''':反映种群遗传多样性的维持能力,Ne''Ne''​越大,多样性越高。


'''应用场景''':
'''应用场景''':


* 濒危物种保护(如评估华南虎的遗传瓶颈);
濒危物种保护(如评估华南虎的遗传瓶颈);
* 农作物种质资源评价(如水稻抗病基因多样性分析)。
农作物种质资源评价(如水稻抗病基因多样性分析)。




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'''测度指标''':
'''测度指标''':


* '''物种丰富度(Species Richness)''':区域内的物种总数,最基础指标。
'''物种丰富度(Species Richness)''':区域内的物种总数,最基础指标。
* '''香农-维纳指数(Shannon-Wiener Index, H')''':
'''香农-维纳指数(Shannon-Wiener Index, H')''':


H′=−∑i=1Spiln⁡pi''H''′=−''i''=1∑''S''​''pi''​ln''pi''​
H′=−∑i=1Spiln⁡pi''H''′=−''i''=1∑''S''​''pi''​ln''pi''​


** S''S''为物种数,pi''pi''​为第i''i''种的个体比例。
S''S''为物种数,pi''pi''​为第i''i''种的个体比例。
** 值越大,多样性越高,对稀有物种敏感。
值越大,多样性越高,对稀有物种敏感。
* '''辛普森指数(Simpson Index, D)''':
'''辛普森指数(Simpson Index, D)''':


D=1−∑i=1Spi2''D''=1−''i''=1∑''S''​''pi''2​
D=1−∑i=1Spi2''D''=1−''i''=1∑''S''​''pi''2​


** 值越大,多样性越高,强调优势种的作用。
值越大,多样性越高,强调优势种的作用。
* '''均匀度(Evenness)''':
'''均匀度(Evenness)''':


J′=H′ln⁡S''J''′=ln''SH''′​
J′=H′ln⁡S''J''′=ln''SH''′​


** 反映各物种个体分布的均匀程度。
反映各物种个体分布的均匀程度。


'''应用场景''':
'''应用场景''':


* 森林群落调查(如热带雨林与温带森林的多样性对比);
森林群落调查(如热带雨林与温带森林的多样性对比);
* 保护区管理效果评估。
保护区管理效果评估。


'''(2) β多样性(Beta Diversity)'''
'''(2) β多样性(Beta Diversity)'''
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'''测度指标''':
'''测度指标''':


* '''Bray-Curtis相异度(Bray-Curtis Dissimilarity)'''
'''Bray-Curtis相异度(Bray-Curtis Dissimilarity)'''
** BC=∑∣xi−yi∣∑(xi+yi)
BC=∑∣xi−yi∣∑(xi+yi)
** ''xi''​和''yi''​为两个群落中第i''i''种的个体数。
''xi''​和''yi''​为两个群落中第i''i''种的个体数。
** 值范围0(完全相同)到1(完全不同)。
值范围0(完全相同)到1(完全不同)。
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* '''Jaccard指数(Jaccard Index)''':
'''Jaccard指数(Jaccard Index)''':
** ''J''=A/(''A''+''B''+''C)''
''J''=A/(''A''+''B''+''C)''
** A''A''为两群落共有种数,B''B''和C''C''为独有种数。
A''A''为两群落共有种数,B''B''和C''C''为独有种数。
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* '''Sørensen指数''':类似Jaccard,但计算方式为2A/(2A+B+C)
'''Sørensen指数''':类似Jaccard,但计算方式为2A/(2A+B+C)
*
 


'''应用场景''':
'''应用场景''':


* 比较不同生境间的物种组成差异(如湿地与草原);
比较不同生境间的物种组成差异(如湿地与草原);
* 评估环境梯度对群落的影响。
评估环境梯度对群落的影响。


'''(3) γ多样性(Gamma Diversity)'''
'''(3) γ多样性(Gamma Diversity)'''
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'''测度指标''':
'''测度指标''':


* '''区域总物种数''':大地理范围内(如整个山脉)的所有物种数目。
'''区域总物种数''':大地理范围内(如整个山脉)的所有物种数目。
* '''α与β多样性的乘积''':γ=α×β''γ''=''α''×''β''(Whittaker公式)。
'''α与β多样性的乘积''':γ=α×β''γ''=''α''×''β''(Whittaker公式)。


'''应用场景''':
'''应用场景''':


* 生物地理区划(如全球生物多样性热点区识别);
生物地理区划(如全球生物多样性热点区识别);
* 区域生态保护规划。
区域生态保护规划。




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'''测度指标''':
'''测度指标''':


* '''生态系统类型数''':区域内森林、湿地、草原等类型的数量。
'''生态系统类型数''':区域内森林、湿地、草原等类型的数量。
* '''景观异质性指数''':
'''景观异质性指数''':
** '''斑块密度(Patch Density)''':单位面积内的斑块数量。
'''斑块密度(Patch Density)''':单位面积内的斑块数量。
** '''香农景观多样性指数''':类似物种多样性,反映景观类型丰富度与均匀度。
'''香农景观多样性指数''':类似物种多样性,反映景观类型丰富度与均匀度。
* '''生态过程指标''':如生产力、养分循环速率、抵抗力稳定性。
'''生态过程指标''':如生产力、养分循环速率、抵抗力稳定性。


'''应用场景''':
'''应用场景''':


* 国家公园生态系统分类管理;
国家公园生态系统分类管理;
* 评估土地利用变化对生态服务的影响。
评估土地利用变化对生态服务的影响。




第111行: 第111行:
'''测度指标''':
'''测度指标''':


* '''功能丰富度(Functional Richness)''':功能性状空间被占据的体积。
'''功能丰富度(Functional Richness)''':功能性状空间被占据的体积。
* '''功能均匀度(Functional Evenness)''':功能性状分布的均匀性。
'''功能均匀度(Functional Evenness)''':功能性状分布的均匀性。
* '''功能离散度(Functional Divergence)''':物种性状偏离群落平均的程度。
'''功能离散度(Functional Divergence)''':物种性状偏离群落平均的程度。
* '''功能分散度(Functional Dispersion)''':加权平均的性状差异。
'''功能分散度(Functional Dispersion)''':加权平均的性状差异。


'''应用场景''':
'''应用场景''':


* 预测生态系统功能(如碳储量、抗干扰能力);
预测生态系统功能(如碳储量、抗干扰能力);
* 农业多样化种植设计(如混合种植不同根系深度的作物)。
农业多样化种植设计(如混合种植不同根系深度的作物)。




第128行: 第128行:
'''测度指标''':
'''测度指标''':


* '''Faith’s PD指数''':系统发育树上所有分支长度的总和。
'''Faith’s PD指数''':系统发育树上所有分支长度的总和。
* '''净亲缘关系指数(NRI)''':群落内物种亲缘关系与随机期望的偏差。
'''净亲缘关系指数(NRI)''':群落内物种亲缘关系与随机期望的偏差。


'''应用场景''':
'''应用场景''':


* 保护优先区划定(如优先保护古老孑遗物种);
保护优先区划定(如优先保护古老孑遗物种);
* 解析群落构建机制(如环境过滤 vs. 竞争排斥)。
解析群落构建机制(如环境过滤 vs. 竞争排斥)。

2025年5月6日 (二) 12:52的版本

生物多样性类型及其测度方法

生物多样性通常分为四个层次:遗传多样性物种多样性生态系统多样性功能多样性。每个层次有不同的测度指标,具体如下:


1. 遗传多样性(Genetic Diversity)

定义:同一物种内不同个体或种群间的遗传变异。

测度指标

等位基因数目(Number of Alleles):特定基因座上不同等位基因的数量。
杂合度(Heterozygosity)预期杂合度(HeHe​):根据哈迪-温伯格平衡计算的杂合度,He=1−∑pi2He​=1−∑pi2​,其中pipi​为等位基因频率。
观测杂合度(HoHo​):实际观测到的杂合个体比例。
核苷酸多样性(π,Pi):衡量DNA序列中平均每对核苷酸的差异数,适用于分子数据。
有效种群大小(NeNe​):反映种群遗传多样性的维持能力,NeNe​越大,多样性越高。

应用场景

濒危物种保护(如评估华南虎的遗传瓶颈);
农作物种质资源评价(如水稻抗病基因多样性分析)。


2. 物种多样性(Species Diversity)

定义:特定区域内物种的丰富程度及其分布均匀性,通常分为三个层次:

(1) α多样性(Alpha Diversity)

测度指标

物种丰富度(Species Richness):区域内的物种总数,最基础指标。
香农-维纳指数(Shannon-Wiener Index, H')

H′=−∑i=1Spiln⁡piH′=−i=1∑Spi​lnpi

SS为物种数,pipi​为第ii种的个体比例。
值越大,多样性越高,对稀有物种敏感。
辛普森指数(Simpson Index, D)

D=1−∑i=1Spi2D=1−i=1∑Spi2​

值越大,多样性越高,强调优势种的作用。
均匀度(Evenness)

J′=H′ln⁡SJ′=lnSH′​

反映各物种个体分布的均匀程度。

应用场景

森林群落调查(如热带雨林与温带森林的多样性对比);
保护区管理效果评估。

(2) β多样性(Beta Diversity)

测度指标

Bray-Curtis相异度(Bray-Curtis Dissimilarity)
BC=∑∣xi−yi∣∑(xi+yi)
xi​和yi​为两个群落中第ii种的个体数。
值范围0(完全相同)到1(完全不同)。
Jaccard指数(Jaccard Index)J=A/(A+B+C)
AA为两群落共有种数,BB和CC为独有种数。
Sørensen指数:类似Jaccard,但计算方式为2A/(2A+B+C)


应用场景

比较不同生境间的物种组成差异(如湿地与草原);
评估环境梯度对群落的影响。

(3) γ多样性(Gamma Diversity)

测度指标

区域总物种数:大地理范围内(如整个山脉)的所有物种数目。
α与β多样性的乘积:γ=α×βγ=α×β(Whittaker公式)。

应用场景

生物地理区划(如全球生物多样性热点区识别);
区域生态保护规划。


3. 生态系统多样性(Ecosystem Diversity)

定义:不同生态系统类型及其结构、功能的多样性。

测度指标

生态系统类型数:区域内森林、湿地、草原等类型的数量。
景观异质性指数斑块密度(Patch Density):单位面积内的斑块数量。
香农景观多样性指数:类似物种多样性,反映景观类型丰富度与均匀度。
生态过程指标:如生产力、养分循环速率、抵抗力稳定性。

应用场景

国家公园生态系统分类管理;
评估土地利用变化对生态服务的影响。


4. 功能多样性(Functional Diversity)

定义:物种功能性状(如体型、食性、生长速率)的差异及其对生态系统功能的贡献。

测度指标

功能丰富度(Functional Richness):功能性状空间被占据的体积。
功能均匀度(Functional Evenness):功能性状分布的均匀性。
功能离散度(Functional Divergence):物种性状偏离群落平均的程度。
功能分散度(Functional Dispersion):加权平均的性状差异。

应用场景

预测生态系统功能(如碳储量、抗干扰能力);
农业多样化种植设计(如混合种植不同根系深度的作物)。


5. 系统发育多样性(Phylogenetic Diversity)

定义:基于物种进化历史的多样性,反映物种间的遗传差异时间。

测度指标

Faith’s PD指数:系统发育树上所有分支长度的总和。
净亲缘关系指数(NRI):群落内物种亲缘关系与随机期望的偏差。

应用场景

保护优先区划定(如优先保护古老孑遗物种);
解析群落构建机制(如环境过滤 vs. 竞争排斥)。