生物信息数据库（简略概要，欢迎补充）：修订间差异
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一．核酸数据库（一下三个数据库合作，每日交换信息，组成INSDC) | 一．核酸数据库（一下三个数据库合作，每日交换信息，组成INSDC) | ||
1.GenBank数据库（由NCBI提供） | 1.GenBank数据库（由NCBI提供） | ||
核苷酸序列数据库：EST数据库，GSS数据库 | |||
蛋白质结构数据库：PDB | |||
参考序列数据库：RefSeq数据库 | |||
第三方注释数据：TPA | |||
2.欧洲核酸档案EDA（由EMBL提供，原EMBL-Bank发展而来） | 2.欧洲核酸档案EDA（由EMBL提供，原EMBL-Bank发展而来） | ||
序列片段归档SRA，Trace归档（收录高通量测序获得的短读段及测序质量） | |||
EMBL-Bank（收录核酸序列及相关信息） | |||
3.DDBJ数据库（由NIG日本国立遗传学研究所提供） | 3.DDBJ数据库（由NIG日本国立遗传学研究所提供） | ||
二．蛋白质序列数据库 | 二．蛋白质序列数据库 | ||
1.PIR数据库（由NBRF创建） | |||
iProClass数据库（整合各种蛋白质数据，是一个全面的蛋白质信息数据库） | iProClass数据库（整合各种蛋白质数据，是一个全面的蛋白质信息数据库） | ||
PIRSF数据库（提供蛋白质家族分类信息，反应蛋白质进化关系） | PIRSF数据库（提供蛋白质家族分类信息，反应蛋白质进化关系） | ||
2.Swiss-Prot数据库（由EBI创建，并入UniProt） | |||
Swiss-Prot数据库（高质量的，手工注释的，非冗余的蛋白质序列数据库） | |||
TrEMBL数据库（计算机注释的蛋白质数据库，包含编码序列翻译的蛋白质序列） | |||
3.UnitProt数据库（universal protein resource通用蛋白质资源库，整合了上文三个数据库） | 3.UnitProt数据库（universal protein resource通用蛋白质资源库，整合了上文三个数据库） | ||
1.UnitProt知识库（UnitProtKB) | |||
UnitProtKB/Swiss-Prot（手工注释，已检查） | |||
UnitProtKB/TrEMBL（计算机注释，未检查） | |||
2.UnitProt档案（UnitParc） | 2.UnitProt档案（UnitParc） | ||
3.UnitProt参考资料库（UnitRef） | 综合性非冗余数据库，包含所有主要的，公开的蛋白质序列 | ||
3.UnitProt参考资料库（UnitRef） | |||
对UnitProtKB与UnitParc中一些数据提供聚类信息 | |||
三．蛋白质结构数据库 | 三．蛋白质结构数据库 | ||
1.蛋白质结构数据库PDB | |||
存储实验测定的生物大分子三维结构（90%蛋白质，也包括核酸，核酸复合物） | 存储实验测定的生物大分子三维结构（90%蛋白质，也包括核酸，核酸复合物） | ||
2.蛋白质结构分类数据库SCOP | |||
对已知三维结构的蛋白质分类，描述结构与进化关系，工作需人工完成 | 对已知三维结构的蛋白质分类，描述结构与进化关系，工作需人工完成 | ||
基于类（class），折叠（fold），超家族（superfamily），家族（family），蛋白质结构域（protein domains），物种（species） | 基于类（class），折叠（fold），超家族（superfamily），家族（family），蛋白质结构域（protein domains），物种（species） | ||
3.蛋白质二级结构数据库DSSP | |||
对蛋白质结构中的氨基酸残基进行二级结构构想分类的标准化算法，根据PDB数据库中的三维结构推导出二级结构 | 对蛋白质结构中的氨基酸残基进行二级结构构想分类的标准化算法，根据PDB数据库中的三维结构推导出二级结构 | ||
from：彧 | |||
2026年4月26日 (日) 21:50的最新版本
一．核酸数据库（一下三个数据库合作，每日交换信息，组成INSDC)
1.GenBank数据库（由NCBI提供）
核苷酸序列数据库：EST数据库，GSS数据库
蛋白质结构数据库：PDB
参考序列数据库：RefSeq数据库
第三方注释数据：TPA
2.欧洲核酸档案EDA（由EMBL提供，原EMBL-Bank发展而来）
序列片段归档SRA，Trace归档（收录高通量测序获得的短读段及测序质量）
EMBL-Bank（收录核酸序列及相关信息）
3.DDBJ数据库（由NIG日本国立遗传学研究所提供）
二．蛋白质序列数据库
1.PIR数据库（由NBRF创建）
iProClass数据库（整合各种蛋白质数据，是一个全面的蛋白质信息数据库）
PIRSF数据库（提供蛋白质家族分类信息，反应蛋白质进化关系）
2.Swiss-Prot数据库（由EBI创建，并入UniProt）
Swiss-Prot数据库（高质量的，手工注释的，非冗余的蛋白质序列数据库）
TrEMBL数据库（计算机注释的蛋白质数据库，包含编码序列翻译的蛋白质序列）
3.UnitProt数据库（universal protein resource通用蛋白质资源库，整合了上文三个数据库）
1.UnitProt知识库（UnitProtKB)
UnitProtKB/Swiss-Prot（手工注释，已检查）
UnitProtKB/TrEMBL（计算机注释，未检查）
2.UnitProt档案（UnitParc）
综合性非冗余数据库，包含所有主要的，公开的蛋白质序列
3.UnitProt参考资料库（UnitRef）
对UnitProtKB与UnitParc中一些数据提供聚类信息
三．蛋白质结构数据库
1.蛋白质结构数据库PDB
存储实验测定的生物大分子三维结构（90%蛋白质，也包括核酸，核酸复合物）
2.蛋白质结构分类数据库SCOP
对已知三维结构的蛋白质分类，描述结构与进化关系，工作需人工完成
基于类（class），折叠（fold），超家族（superfamily），家族（family），蛋白质结构域（protein domains），物种（species）
3.蛋白质二级结构数据库DSSP
对蛋白质结构中的氨基酸残基进行二级结构构想分类的标准化算法，根据PDB数据库中的三维结构推导出二级结构
from：彧