DNA聚合酶:修订间差异

来自osm&bio
跳转到导航 跳转到搜索
无编辑摘要
无编辑摘要
第94行: 第94行:
|}
|}
=== DNA聚合酶I ===
=== DNA聚合酶I ===
     DNA聚合酶I于1957年首次分离,又称Kornberg酶,具有5'→3'聚合酶活性(换上正确之碱基)、5'外切酶活性(切除5'端引物)、3'外切酶活性(自我校对用)。此酶可被枯草杆菌蛋白酶和胰蛋白酶分为2部分:大片段-Klenow片段或称Klenow酶,小结构域-3'外切酶活性,大结构域-5'→3'聚合酶活性;小片段-5'外切酶活性。Klenow酶的外形似右手,L-P螺旋(手指)和H-I螺(拇指)旋间有与单链DNA模板结合之位点,宽2.2nm,长3nm,适合结合B-DNA,外切酶活性位于“掌心”处。此酶用于切除3'端复制错配的碱基,并重新合成正确之配对。
     DNA聚合酶I于1957年首次分离,又称Kornberg酶,具有5'→3'聚合酶活性(换上正确之碱基)、5'外切酶活性(切除5'端引物)、3'外切酶活性(自我校对用)。此酶可被枯草杆菌蛋白酶和胰蛋白酶分为2部分:'''大片段'''-''Klenow片段''或称''Klenow酶'','''小结构域'''-3'外切酶活性,'''大结构域'''-5'→3'聚合酶活性;'''小片段'''-5'外切酶活性。Klenow酶的外形似右手,L-P螺旋(手指)和H-I螺(拇指)旋间有与单链DNA模板结合之位点,宽2.2nm,长3nm,适合结合B-DNA,外切酶活性位于“掌心”处。此酶用于切除3'端复制错配的碱基,并重新合成正确之配对。


=== DNA聚合酶II ===
=== DNA聚合酶II ===
第138行: 第138行:
|钳载复合物
|钳载复合物
|}
|}
     此酶的Vmax更接近体内的实际值,酶量适中,高度进行性。该酶对温度比较敏感。全酶由3部分构成,核心酶(可催化DNA复制)、滑动钳(松散夹住DNA模板,自由地向前滑动,外径8nm,内径3.5nm)、钳载复合物(可耗ATP打开钳子)。
     此酶的Vmax更接近体内的实际值,酶量适中,高度进行性。该酶对温度比较敏感。全酶由3部分构成,'''核心酶'''(可催化DNA复制)、'''滑动钳'''(松散夹住DNA模板,自由地向前滑动,外径8nm,内径3.5nm)、'''钳载复合物'''(可耗ATP打开钳子)。
=== DNA聚合酶IV ===
=== DNA聚合酶IV ===
     合成任性,不按照碱基互补配对规律,为易错DNA聚合酶,参与DNA合成,尤其是SOS修复过程中的跨损伤合成。
     合成任性,不按照碱基互补配对规律,为易错DNA聚合酶,参与DNA合成,尤其是SOS修复过程中的跨损伤合成。
=== DNA聚合酶V ===
=== DNA聚合酶V ===
     合成任性,不按照碱基互补配对规律,为易错DNA聚合酶,参与DNA合成,尤其是SOS修复过程中的跨损伤合成。
     合成任性,不按照碱基互补配对规律,为易错DNA聚合酶,参与DNA合成,尤其是SOS修复过程中的跨损伤合成。
== 真核DNA聚合酶 ==

2020年4月28日 (二) 19:57的版本

DNA聚合酶(DNA ploymerase),全称为依赖于DNA的DNA聚合酶(DNA-dependent DNA polymerase,DNAP)或DNA依赖的DNA聚合酶(DNA-directed DNA polymerase)。此酶催化的反应需要引物、模板,合成方向为5’→3’,也需要Mg2+的参与。

分类

可根据同源性分为7类

类型 例子 注文
A 噬菌体:T7噬菌体DNA聚合酶
真核生物:DNA聚合酶γ
细菌:DNA聚合酶I
-
B 真核生物:DNA聚合酶α、DNA聚合酶δ、DNA聚合酶ε
噬菌体:T4噬菌体DNA聚合酶、Φ29噬菌体DNA聚合酶
存在于细菌、古菌和真核中
C 细菌:DNA聚合酶III 只存在于细菌中
D - 只存在于古菌中,参与DNA复制与修复
X 真核生物:DNA聚合酶β、DNA聚合酶λ、DNA聚合酶μ -
Y 真核生物:DNA聚合酶η、DNA聚合酶ι、DNA聚合酶κ、DNA聚合酶Rev1
细菌:DNA聚合酶IV、DNA聚合酶V
-
RT 反转录病毒:反转录酶
真核生物:端粒酶
专指逆转录酶

细菌DNA聚合酶

现发现5种:I、II、III、IV、V

比较

性质 DNA聚合酶I DNA聚合酶II DNA聚合酶III DNA聚合酶IV DNA聚合酶V
结构基因 polA polBdinA polCdnaE)(编码α亚基) - -
相对分子质量/103 103 90 130 - -
分子数/细胞 400 100 10 - -
Vmax(参入的nt·s-1 16-20 2-5 250-1000 - -
3'-外切酶活性 - -
5'-外切酶活性 × × - -
进行性/nt 3-200 10000 500000 - -
突变体表现型 UV敏感、硫酸二甲酯敏感 - DNA复制温度敏感型 - -
生物功能 DNA修复、RNA引物切除 DNA修复 染色体DNA复制 属易错DNA聚合酶,参与DNA修复合成、SOS修复中的跨损伤合成

DNA聚合酶I

   DNA聚合酶I于1957年首次分离,又称Kornberg酶,具有5'→3'聚合酶活性(换上正确之碱基)、5'外切酶活性(切除5'端引物)、3'外切酶活性(自我校对用)。此酶可被枯草杆菌蛋白酶和胰蛋白酶分为2部分:大片段-Klenow片段或称Klenow酶小结构域-3'外切酶活性,大结构域-5'→3'聚合酶活性;小片段-5'外切酶活性。Klenow酶的外形似右手,L-P螺旋(手指)和H-I螺(拇指)旋间有与单链DNA模板结合之位点,宽2.2nm,长3nm,适合结合B-DNA,外切酶活性位于“掌心”处。此酶用于切除3'端复制错配的碱基,并重新合成正确之配对。

DNA聚合酶II

   DNA聚合酶II有5'→3'聚合酶活性和3'外切酶活性,无5'外切酶活性。参与DNA损伤修复。

DNA聚合酶III

   DNA聚合酶III有5'→3'聚合酶活性和3'外切酶活性,分属于不同亚基,无5'外切酶活性。    
聚合酶III
亚基 功能
polIII' 核心酶 α 5'→3'聚合酶活性
ε 3'-外切酶活性
θ α和ε的装配
τ 将全酶装配到DNA
β 滑动钳(进行性因子)
γ 钳载复合物,有ATP酶活性,帮助装载
δ 钳载复合物
δ' 钳载复合物
χ 钳载复合物
ψ 钳载复合物
   此酶的Vmax更接近体内的实际值,酶量适中,高度进行性。该酶对温度比较敏感。全酶由3部分构成,核心酶(可催化DNA复制)、滑动钳(松散夹住DNA模板,自由地向前滑动,外径8nm,内径3.5nm)、钳载复合物(可耗ATP打开钳子)。

DNA聚合酶IV

   合成任性,不按照碱基互补配对规律,为易错DNA聚合酶,参与DNA合成,尤其是SOS修复过程中的跨损伤合成。

DNA聚合酶V

   合成任性,不按照碱基互补配对规律,为易错DNA聚合酶,参与DNA合成,尤其是SOS修复过程中的跨损伤合成。

真核DNA聚合酶