DNA聚合酶：修订间差异

来自osm&bio
跳转到导航 跳转到搜索
←上一编辑下一编辑→
可视化wikitext
无编辑摘要
无编辑摘要
第127行： 第127行：
|-
|-
| colspan="3" |δ
| colspan="3" |δ
|钳载复合物
|钳载复合物与β亚基结合，打开钳子
|-
|-
| colspan="3" |δ'
| colspan="3" |δ'
|钳载复合物
|钳载复合物，安装钳子
|-
|-
| colspan="3" |χ
| colspan="3" |χ
|钳载复合物
|钳载复合物，与SSB相互作用
|-
|-
| colspan="3" |ψ
| colspan="3" |ψ
|钳载复合物
|钳载复合物，与γ和χ互作
|}
|}
     此酶的Vmax更接近体内的实际值，酶量适中，高度进行性。该酶对温度比较敏感。全酶由3部分构成，'''核心酶'''（可催化DNA复制）、'''滑动钳'''（松散夹住DNA模板，自由地向前滑动，外径8nm，内径3.5nm）、'''钳载复合物'''（可耗ATP打开钳子）。
     此酶的Vmax更接近体内的实际值，酶量适中，高度进行性。该酶对温度比较敏感。全酶由3部分构成，'''核心酶'''（可催化DNA复制）、'''滑动钳'''（松散夹住DNA模板，自由地向前滑动，外径8nm，内径3.5nm）、'''钳载复合物'''（可耗ATP打开钳子）。
第144行： 第144行：
     合成任性，不按照碱基互补配对规律，为易错DNA聚合酶，参与DNA合成，尤其是SOS修复过程中的跨损伤合成。
     合成任性，不按照碱基互补配对规律，为易错DNA聚合酶，参与DNA合成，尤其是SOS修复过程中的跨损伤合成。
== 真核DNA聚合酶 ==
== 真核DNA聚合酶 ==
=== 比较 ===
{| class="wikitable"
!性质
!DNA聚合酶α（I）
!DNA聚合酶β（IV）
!DNA聚合酶γ（M）
!DNA聚合酶δ（III）
!DNA聚合酶ε（II）
|-
|亚细胞定位
|细胞核
|细胞核
|线粒体基质
|细胞核
|细胞核
|-
|引发酶（引物合成酶）活性
|有
|无
|无
|无
|无
|-
|亚基数目
|4
|1
|4
|2
|≥4
|-
|内在进行性
|中等
|低
|高
|低
|高
|-
|内在进行性
|中等
|低
|高
|高
|高
|-
|3'-外切酶活性
|×
|×
|√
|√
|√
|-
|5'-外切酶活性
|×
|×
|×
|×
|×
|-
|抑制剂
|蚜肠霉素
|ddTTP
|ddTTP
|蚜肠霉素
|蚜肠霉素
|-
|生物功能
|引物合成
|修复
|线粒体DNA复制和修复
|核DNA复制和修复
|核DNA复制和修复
|-
|colspan="5" |注：括号内罗马数字和字母为酵母中的DNA聚合酶
|}

2020年4月28日 (二) 20:23的版本

DNA聚合酶（DNA ploymerase），全称为依赖于DNA的DNA聚合酶（DNA-dependent DNA polymerase，DNAP）或DNA依赖的DNA聚合酶（DNA-directed DNA polymerase）。此酶催化的反应需要引物、模板，合成方向为5’→3’，也需要Mg2+的参与。

分类

可根据同源性分为7类

类型 例子 注文
A 噬菌体：T7噬菌体DNA聚合酶
真核生物：DNA聚合酶γ
细菌：DNA聚合酶I		 -
B 真核生物：DNA聚合酶α、DNA聚合酶δ、DNA聚合酶ε
噬菌体：T4噬菌体DNA聚合酶、Φ29噬菌体DNA聚合酶		 存在于细菌、古菌和真核中
C 细菌：DNA聚合酶III 只存在于细菌中
D - 只存在于古菌中，参与DNA复制与修复
X 真核生物：DNA聚合酶β、DNA聚合酶λ、DNA聚合酶μ -
Y 真核生物：DNA聚合酶η、DNA聚合酶ι、DNA聚合酶κ、DNA聚合酶Rev1
细菌：DNA聚合酶IV、DNA聚合酶V		 -
RT 反转录病毒：反转录酶
真核生物：端粒酶		 专指逆转录酶

细菌DNA聚合酶

现发现5种：I、II、III、IV、V

比较

性质 DNA聚合酶I DNA聚合酶II DNA聚合酶III DNA聚合酶IV DNA聚合酶V
结构基因 polA polB（dinA） polC（dnaE）（编码α亚基） - -
相对分子质量/103 103 90 130 - -
分子数/细胞 400 100 10 - -
Vmax（参入的nt·s-1） 16-20 2-5 250-1000 - -
3'-外切酶活性 √ √ √ - -
5'-外切酶活性 √ × × - -
进行性/nt 3-200 10000 500000 - -
突变体表现型 UV敏感、硫酸二甲酯敏感 - DNA复制温度敏感型 - -
生物功能 DNA修复、RNA引物切除 DNA修复 染色体DNA复制 属易错DNA聚合酶，参与DNA修复合成、SOS修复中的跨损伤合成

DNA聚合酶I

   DNA聚合酶I于1957年首次分离，又称Kornberg酶，具有5'→3'聚合酶活性（换上正确之碱基）、5'外切酶活性（切除5'端引物）、3'外切酶活性（自我校对用）。此酶可被枯草杆菌蛋白酶和胰蛋白酶分为2部分：大片段-Klenow片段或称Klenow酶，小结构域-3'外切酶活性，大结构域-5'→3'聚合酶活性；小片段-5'外切酶活性。Klenow酶的外形似右手，L-P螺旋（手指）和H-I螺（拇指）旋间有与单链DNA模板结合之位点，宽2.2nm，长3nm，适合结合B-DNA，外切酶活性位于“掌心”处。此酶用于切除3'端复制错配的碱基，并重新合成正确之配对。

DNA聚合酶II

   DNA聚合酶II有5'→3'聚合酶活性和3'外切酶活性，无5'外切酶活性。参与DNA损伤修复。

DNA聚合酶III

   DNA聚合酶III有5'→3'聚合酶活性和3'外切酶活性，分属于不同亚基，无5'外切酶活性。
聚合酶III
亚基 功能
polIII' 核心酶 α 5'→3'聚合酶活性
ε 3'-外切酶活性
θ α和ε的装配
τ 将全酶装配到DNA
β 滑动钳（进行性因子）
γ 钳载复合物，有ATP酶活性，帮助装载
δ 钳载复合物与β亚基结合，打开钳子
δ' 钳载复合物，安装钳子
χ 钳载复合物，与SSB相互作用
ψ 钳载复合物，与γ和χ互作 
   此酶的Vmax更接近体内的实际值，酶量适中，高度进行性。该酶对温度比较敏感。全酶由3部分构成，核心酶（可催化DNA复制）、滑动钳（松散夹住DNA模板，自由地向前滑动，外径8nm，内径3.5nm）、钳载复合物（可耗ATP打开钳子）。

DNA聚合酶IV

   合成任性，不按照碱基互补配对规律，为易错DNA聚合酶，参与DNA合成，尤其是SOS修复过程中的跨损伤合成。

DNA聚合酶V

   合成任性，不按照碱基互补配对规律，为易错DNA聚合酶，参与DNA合成，尤其是SOS修复过程中的跨损伤合成。

真核DNA聚合酶

比较

性质 DNA聚合酶α（I） DNA聚合酶β（IV） DNA聚合酶γ（M） DNA聚合酶δ（III） DNA聚合酶ε（II）
亚细胞定位 细胞核 细胞核 线粒体基质 细胞核 细胞核
引发酶（引物合成酶）活性 有 无 无 无 无
亚基数目 4 1 4 2 ≥4
内在进行性 中等 低 高 低 高
内在进行性 中等 低 高 高 高
3'-外切酶活性 × × √ √ √
5'-外切酶活性 × × × × ×
抑制剂 蚜肠霉素 ddTTP ddTTP 蚜肠霉素 蚜肠霉素
生物功能 引物合成 修复 线粒体DNA复制和修复 核DNA复制和修复 核DNA复制和修复
注：括号内罗马数字和字母为酵母中的DNA聚合酶
取自“https://osm.bio/index.php?title=DNA聚合酶&oldid=97”