所以我们这么辛苦生产NTP是为什么:修订间差异
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===== 总结… ===== | ===== 总结… ===== | ||
生成一分子葡萄糖需要两分子3-磷酸甘油醛,一共需要2(1+1+1+2.5)=11个ATP | |||
总反应式为 | 总反应式为 | ||
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α(1→4)糖苷键水解的自由能为-15.5kJ/mol,而α(1→6)糖苷键水解的自由能为-7.1kJ/mol,因此α(1→4)糖苷键的水解可以驱动α(1→6)糖苷键的合成,不需要能量 | α(1→4)糖苷键水解的自由能为-15.5kJ/mol,而α(1→6)糖苷键水解的自由能为-7.1kJ/mol,因此α(1→4)糖苷键的水解可以驱动α(1→6)糖苷键的合成,不需要能量 | ||
==== 4.卡尔文循环 ==== | |||
==== 5.C<sub>4</sub>途径 ==== | |||
==== 6.光呼吸 ==== | |||
=== 脂类 === | |||
==== 1.酮体生成 ==== | |||
乙酰乙酸生成D-β-羟丁酸这一步需要消耗一分子NADH,相当于2.5个ATP,这一步反应由'''D-β-羟丁酸脱氢酶'''催化 | |||
反应式为 | |||
乙酰乙酸+NADH+H<sup>+</sup>→D-β-羟丁酸+NAD<sup>+</sup> | |||
==== 2.脂肪酸合成(以第一个丙二酸单酰-CoA的引入为例) ==== | |||
耗能反应分别是 | |||
===== 丙二酸单酰-CoA的合成 ===== | |||
由生物素羧化酶和转羧酶催化,需要生物素作为辅基(羧基载体),这三个东西在一条肽链上。消耗一个ATP | |||
反应式为 | |||
生物素+ATP+CO<sub>2</sub>+H<sub>2</sub>O→羧基生物素+ADP+Pi+2H<sup>+</sup> | |||
羧基生物素+乙酰-CoA→丙二酸单酰-CoA+生物素 | |||
===== 乙酰乙酰-ACP生成D-β-羟丁酰-ACP ===== | |||
ACP为酰基载体蛋白 | |||
由β-酮酰-ACP还原酶催化,需要一分子NADPH,相当于2.5分子ATP | |||
反应式为 | |||
乙酰乙酰-ACP+NADPH+H<sup>+</sup>→D-β-羟丁酰-ACP+NADP<sup>+</sup> | |||
===== α,β-反式-丁烯酰-ACP生成丁酰-ACP ===== | |||
反应由烯酰-ACP还原酶催化,需要一分子NADPH,相当于2.5分子ATP | |||
α,β-反式-丁烯酰-ACP+NAHPH+H<sup>+</sup>→丁酰-ACP+NADP<sup>+</sup> | |||
- | |||
在合成软脂酸(C<sub>16</sub>)之前,每延长两个碳原子需要1+2.5+2.5=6个ATP | |||
合成一分子软脂酸一共需要42个ATP | |||
==== 3.脂肪酸(软脂酸)链的延长 ==== | |||
发生延长位置的不同,反应耗能也不同 | |||
===== 线粒体 ===== | |||
相当于脂肪酸降解的逆反应,但是最后一步使用的还原剂是NADPH(脂肪酸降解的对应步骤用的是FADH<sub>2</sub>) | |||
每延长两个碳原子需要5个ATP | |||
====== β-酮酰-CoA生成L-β-羟酰-CoA ====== | |||
反应由3-L-羟酰-CoA酶催化,消耗一个NADH | |||
反应式为 | |||
β-酮酰-CoA+NADH+H<sup>+</sup>→L-β-羟酰-CoA+NAD<sup>+</sup> | |||
====== α,β-反式-烯酰-CoA生成脂酰-CoA ====== | |||
由烯酰还原酶催化,消耗一个NADPH | |||
反应式为 | |||
α,β-反式-烯酰-CoA+NAHPH+H<sup>+</sup>→脂酰-CoA+NADP<sup>+</sup> | |||
===== 内质网 ===== | |||
和细胞质基质中的反应相同,只是由CoA替代ACP,每延长两个碳原子需要6个ATP | |||
2025年7月13日 (日) 20:58的版本
前言……
耗能分析 生化篇
后面有时间写写分子篇(挖坑ing)
参考书籍:《生物化学(第三版)》 王镜岩 朱圣庚
写上来的内容基本都有和杨书进行对比以及进行资料查询 但毕竟主要参考书籍是旧版 若有错误欢迎指正
正文
糖
1.糖异生
耗能反应一共有四步,分别是
丙酮酸生成草酰乙酸
反应由丙酮酸羧化酶催化,消耗一个ATP
反应式为
丙酮酸+ATP+CO2→草酰乙酸+ADP+Pi
草酰乙酸生成磷酸烯醇式丙酮酸
反应由磷酸烯醇式丙酮酸羧基酶催化,消耗一个GTP,相当于一个ATP
反应式为
草酰乙酸+GTP→磷酸烯醇式丙酮酸+GDP+Pi+CO2
甘油酸-3-磷酸生成甘油酸-1,3-二磷酸
反应由磷酸甘油酸激酶催化,消耗一个ATP
反应式为
甘油酸-3-磷酸+ATP→甘油酸-1,3-二磷酸+ADP+Pi
甘油酸-1,3-二磷酸生成甘油醛-3-磷酸
反应由甘油醛-3-磷酸脱氢酶催化,消耗一个NADH
这个NADH由于是在细胞质内消耗的,所以要考虑穿梭系统,如果是甘油磷酸系统就是1.5个ATP,如果是苹果酸-天冬氨酸穿梭系统就是2.5个(不过我们一般按2.5来计算)
反应式为
甘油酸-1,3-二磷酸+NADH+H+→甘油醛-3-磷酸+NAD++Pi
总结…
生成一分子葡萄糖需要两分子3-磷酸甘油醛,一共需要2(1+1+1+2.5)=11个ATP
总反应式为
2丙酮酸+4ATP+2GTP+2NADH+6H2O→葡萄糖+4ADP+2GDP+6Pi+2NAD++2H+
2.乳糖合成
耗能的地方为UDP-葡萄糖(UDPG)的合成,产生一分子焦磷酸,相当于两分子ATP
反应式为
葡萄糖-1-磷酸+UTP→UDPG+PPi
UDP-葡萄糖+半乳糖-1-磷酸→葡萄糖-1-磷酸+UDP-半乳糖
UDP-半乳糖+葡萄糖→乳糖+UDP
理论上产生半乳糖-1-磷酸也要一分子ATP,但这个反应产生的葡萄糖-1-磷酸进入糖酵解后可以节省一分子ATP,两者抵消
3.糖原合成
主链
糖基的来源是UDPG,先是葡萄糖在己糖激酶(葡萄糖激酶)的催化下合成葡萄糖-6-磷酸,接着在磷酸葡萄糖变位酶的作用下变成葡萄糖-1-磷酸,再在UDP-葡萄糖焦磷酸化酶的催化下形成UDPG,一共需要相当于三分子ATP的能量,即主链上每延长一个糖原单位需要三分子ATP
反应式为
葡萄糖+ATP→葡萄糖-6-磷酸+ADP
葡萄糖-6-磷酸→葡萄糖-1-磷酸
葡萄糖-1-磷酸+UTP→UDPG+PPi
注意,糖原合成需要“引物”,起引物作用的是一个叫做生糖原蛋白的东西,上面带着一个α-1,4葡萄糖单位的寡糖分子,连接在Tyr残基的酚基上。生糖原蛋白有自催化作用,可以催化大约8个葡萄糖单位的连续合成,自动糖基化的糖基供体也是UDPG。后续糖链的延长需要糖原合酶的参与。
支链
由糖原分支酶(1,4→1,6-转葡糖基酶/4→6-转糖基酶)催化,从非还原端约7个葡萄糖残基处切断,转移到同一个或其他的糖原分子某个葡萄糖上连接。
α(1→4)糖苷键水解的自由能为-15.5kJ/mol,而α(1→6)糖苷键水解的自由能为-7.1kJ/mol,因此α(1→4)糖苷键的水解可以驱动α(1→6)糖苷键的合成,不需要能量
4.卡尔文循环
5.C4途径
6.光呼吸
脂类
1.酮体生成
乙酰乙酸生成D-β-羟丁酸这一步需要消耗一分子NADH,相当于2.5个ATP,这一步反应由D-β-羟丁酸脱氢酶催化
反应式为
乙酰乙酸+NADH+H+→D-β-羟丁酸+NAD+
2.脂肪酸合成(以第一个丙二酸单酰-CoA的引入为例)
耗能反应分别是
丙二酸单酰-CoA的合成
由生物素羧化酶和转羧酶催化,需要生物素作为辅基(羧基载体),这三个东西在一条肽链上。消耗一个ATP
反应式为
生物素+ATP+CO2+H2O→羧基生物素+ADP+Pi+2H+
羧基生物素+乙酰-CoA→丙二酸单酰-CoA+生物素
乙酰乙酰-ACP生成D-β-羟丁酰-ACP
ACP为酰基载体蛋白
由β-酮酰-ACP还原酶催化,需要一分子NADPH,相当于2.5分子ATP
反应式为
乙酰乙酰-ACP+NADPH+H+→D-β-羟丁酰-ACP+NADP+
α,β-反式-丁烯酰-ACP生成丁酰-ACP
反应由烯酰-ACP还原酶催化,需要一分子NADPH,相当于2.5分子ATP
α,β-反式-丁烯酰-ACP+NAHPH+H+→丁酰-ACP+NADP+
-
在合成软脂酸(C16)之前,每延长两个碳原子需要1+2.5+2.5=6个ATP
合成一分子软脂酸一共需要42个ATP
3.脂肪酸(软脂酸)链的延长
发生延长位置的不同,反应耗能也不同
线粒体
相当于脂肪酸降解的逆反应,但是最后一步使用的还原剂是NADPH(脂肪酸降解的对应步骤用的是FADH2)
每延长两个碳原子需要5个ATP
β-酮酰-CoA生成L-β-羟酰-CoA
反应由3-L-羟酰-CoA酶催化,消耗一个NADH
反应式为
β-酮酰-CoA+NADH+H+→L-β-羟酰-CoA+NAD+
α,β-反式-烯酰-CoA生成脂酰-CoA
由烯酰还原酶催化,消耗一个NADPH
反应式为
α,β-反式-烯酰-CoA+NAHPH+H+→脂酰-CoA+NADP+
内质网
和细胞质基质中的反应相同,只是由CoA替代ACP,每延长两个碳原子需要6个ATP