生化分子细胞技术列表

• 染色体构象捕获
  • 3C
  • 4C
  • 5C
  • Hi-C
  • ChIP-loop
  • ChIA-PET
• 蛋白质-蛋白质互作
  • Y2H酵母双杂交
  • CoIP免疫共沉淀
  • pull down下拉实验
  • FERT荧光共振能量转移
  • BiFC双分子荧光互补
  • SPR表面等离子共振
  • ITC等温滴定量热法
• 蛋白质-RNA互作
  • RIP-RNA结合蛋白免疫共沉淀：甲醛交联，裂解细胞，抗体沉淀特定蛋白，去交联获得RNA。
  • RNA pull down：标记的诱饵RNA与细胞裂解物孵育；检测与诱饵RNA结合的蛋白
  • MeRIP-RNA甲基化免疫沉淀：用甲基化RNA特异抗体沉淀并检测结合蛋白
• 染色质开放性检测
  • MNase-seq
  • FAIRE-seq
  • DNase-seq
  • ATAC-seq
• 各种印记
  • western blotting：蛋白质
  • northern blotting：RNA
  • southern blotting：DNA
  • eastern blotting：二维电泳蛋白质
  • dot blotting ：不经电泳
  • Southwestern blotting：DNA探针检测蛋白质电泳结果
  • Far-western blotting：不用抗体而用可能互作的蛋白
  • northwestern blotting：RNA探针检测蛋白质电泳结果
  • middle eastern：DNA检测RNA
  • far western：检测脂质
• 层析/色谱技术
  • 凝胶过滤层析
  • 亲和层析
    • IMAC
  • 聚焦层析：固定相上有缓冲剂，酸性的层析液流过，从上到下被缓冲，形成ph梯度；蛋白质会在进入等电点以上的pH后吸附在层析柱上；随着层析液不断流入，层析柱缓冲能力被逐渐耗竭，pH梯度移动(原来某一pH的位置下移)，不同的蛋白就随等电点相应的梯度流出。
  • 离子交换层析
  • 疏水层析
  • 反向层析
• 克隆某特定基因的办法
  • 功能克隆：已知基因产物(蛋白质)，获得编码序列
  • 定位克隆：已知基因位置，染色体步移
  • 序列克隆：已知基因部分序列，获得全部序列
  • 表型克隆：
• 基因克隆的具体技术
  • 鸟枪克隆法：将基因组打成片段，转入受体，寻找相关表型变化
  • 消减杂交：将两份cDNA混合，去除双链，剩余的可能是与表型差异有关的序列。
  • 转座子标签：转座子插入使得基因突变，在有相关表型改变的个体中寻找转座子，就能找到被突变的基因。
  • 图位克隆：染色体步移