氨基酸性质整理
1.甘氨酸 Gly G 中性疏水,结构最简单的氨基酸,唯一不具手性,在清蛋白中含量最少,肌酸、卟啉的前体 2.丙氨酸 Ala A 中性疏水,侧链基团为一个甲基 3.脯氨酸 Pro P 中性疏水,亚氨基酸,茚三酮反应黄色(同羟脯氨酸hyp),溶解度最大,不能发生转氨基反应,在醇溶蛋白中含量较高 4.缬氨酸 Val V 中性疏水,侧链氨基酸 5.亮氨酸 Leu L 中性疏水,侧链氨基酸,严格生酮 6.异亮氨酸 Ile I 中性疏水,有2个手性C,生糖兼生酮 7.丝氨酸 Ser S 中性亲水,羟基氨基酸,在丝心蛋白中含量第三(甘丙丝),磷脂合成需要Ser 8.苏氨酸 Thr T 中性亲水,羟基氨基酸,不能发生转氨基反应,有2个手性C,生糖兼生酮 9.谷氨酰胺 Gln Q(和谷氨酸一起记,情商要高,EQ)中性亲水 10.天冬酰胺 Asn N 中性亲水 11.甲硫氨酸 Met M 中性疏水,侧链含S,乙烯的前体,常作为甲基供体。 12.半胱氨酸 Cys C 中性疏水,侧链含S,易形成二硫键 13.苯丙氨酸 Phe F 中性疏水,芳香族,生糖兼生酮 14.酪氨酸 Tyr Y 中性疏水,芳香族,酚基,米伦、黄色、bradford、棕黄色pauly(即偶氮)反应,生糖兼生酮,多巴胺、肾上腺素、黑色素和甲状腺素的前体,溶解性最小 15.色氨酸 Trp W(色狼)中性疏水,芳香族,紫外吸收最大(280nm),吲哚环的紫色乙醛酸反应,对二甲基氨基苯甲醛,维生素PP的原料,生糖兼生酮,褪黑素、羟色胺和生长素的前体 16.天冬氨酸 Asp D(天地),酸性亲水 17.谷氨酸 Glu E(小米粥熬成稀饭很黏,glue)酸性亲水,GABA、卟啉的前体,绝大多数转氨酶以其作为氨基的供体,以α-酮戊二酸作为氨基的受体,谷胱甘肽 18.精氨酸 Arg R 碱性亲水,胍基,红色坂口反应,和lys同为组蛋白的主要成分,等电点最大,NO、肌酸的前体,可转变为瓜氨酸(CCP)和鸟氨酸(om),在尿素循环中起重要作用。可发生单双甲基化 19.赖氨酸 Lys K(要喜欢它,Like)碱性亲水,严格生酮,ε氨基,含有孤对电子,参与多种酶的催化,不能发生转氨基反应,肉碱的前体,可发生单双三甲基化 20.组氨酸 His H 碱性亲水,咪唑基,橘红色pauly(即偶氮粗体文本)反应,与羟基氨基酸都易发生磷酸化修饰,最接近生理中性,是生理条件下唯一可以既作质子供体又作质子受体的氨基酸,与镍离子紧密结合,常用作His-Tag标记外源蛋白,组胺的前体 21.硒代半胱氨酸 Sec U 由Ser转变而来,具有抗氧化活性。密码子为UGA 22.吡咯赖氨酸 Pyl O(吡咯前的口字旁像个O),仅在古菌和少数细菌中发现 UAG
一些不方便标的 有利于形成α螺旋的氨基酸:Ala,Cys,Leu,Met,Glu,Gln,His,Lys 有利于形成β折叠的氨基酸:Val,Ile,Phe,Tyr,Trp(绝对不可能有Pro) 有利于形成β转角的氨基酸:Thr,Gly,Ser,Asp,Asn,Pro 什么都不适合:Arg
胰蛋白酶切Arg和Lys 胰凝乳蛋白酶切芳香族(Phe,Trp,Tyr) 胃蛋白酶切芳香族和中性aa CNBr会使Met变成高聚Ser内酯 羟胺断裂Asn-Gly,部分断Asn-leu和Asn-Ala 胰弹性蛋白酶水解小的中性aa(AVGS) 葡萄球菌蛋白酶切E和R 羧菌蛋白酶水解R 嗜热球菌蛋白酶水解所有疏水aa