DNA解链酶
DNA解链酶(解旋酶)为催化DNA螺旋解链的酶,在DNA复制、转录、修复、重组起作用。无序列特异性,大多数优先结合单链区域,少部分为双链区域,还需要结合ATP,并有ATPase活性。顺模板向不断延伸,需要Mg2+。如Dna B。
Dna蛋白
蛋白 | E.coli | 真核 | 古菌 |
---|---|---|---|
Dna A | 复制起始蛋白,结合上ATP,并形成四聚体,在HU蛋白和IHF帮助下,协同地识别并结合复制起始区OciC的9bp(TTATCCACA)重复序列,此区亦称A盒(A box),Dam可激活其表达。Dna A可以结合ATP,属于AAA+(与细胞多种活性相关的ATPase),组装成类似于核小体的结构,水解ATP开始解链,形成45bp开放的起始复合物。之后被取代下来。 | 对应ORC。 | 对应Orc1/Cdc6 |
Dna B | DNA解链酶,在Dna C和Dna D帮助下,2个被招募形成前引发体(消耗ATP),形成前引发体后,Dna B将OriC的解链区扩大,之后取代Dna A,当接触到Tus蛋白(Dna B蛋白抑制剂)的β股构成的一面时,就无法穿过,受阻于此(若为Tus蛋白的另一面可通过)。 | 对应MCM复合物。 | 对应MCM |
Dna C | 招募Dna B到复制叉。 | 对应Cdc6+Cdr1。 | 对应Orc1/Cdc6 |
Dna E | 为DNA聚合酶III。 | 对应PCNA(滑动钳)、3种细胞核DNA复制用的DNA聚合酶。 | 对应PCNA(滑动钳)、古菌的B类DNA聚合酶。 |
Dna G | 为DNA引发酶,在Pri A、Pri B和Pri C帮助下,与DnaB蛋白结合,一般在CTG序列,之后合成引物,引物一般为11nt(±1nt),引物的前两个碱基一般为AG。 | 与DNA聚合酶α结合的引发酶。 | - |
Dna T | 辅助Dna C将Dna B招募到复制叉。 | - | - |
其他有解链酶活性的酶
B——Bacteria 细菌
A——archaea 古菌
E——eukaryote 真核生物
M——mitochondrion 线粒体
C——chloroplast 叶绿体
蛋白名称 | 生物范围 | 功能 | 备注 |
---|---|---|---|
ρ
因子 |
B | 原核生物转录终止时DNA·RNA杂交链的分离 | |
σ
因子 |
B | RNApol 封闭复合物到开放复合物的转化 | |
细菌
RNApol |
B | 转录延伸时DNA解链 | 具体哪个亚基待考证 |
SL1
(选择因子1) |
E | RNApol I 转录起始中的解链 | TBP |
TFIII
B |
E | RNApol III 转录起始中的解链 | TBP |
Sen
1 |
E | RNApol I和II负责的转录的终止时DNA/RNA杂交链分离 | 在核酸外切酶rat1触及RNApol时 |
TFII
H |
E | RNApol II 转录起始解链(待考证);NER时解链 | 九个亚基,其中XPB亚基向5'解链,XPD亚基向3'解链 |
Uvr
B |
B | 细菌NER中微弱的解链酶活性,同时招募UvrC切割 | |
Uvr
D |
B | UvrC切割后解链下12nt-13nt的切割产物 | |
Rec
BCD |
B | 同源重组中结合dsDNA自由末端,向下游解链 | 解链的同时表现3'外切酶(遇到χ序列前) 杨sir认为遇到chi序列后RecBCD将获得5'外切酶活性,但是Lewin's gene XII 认为RecBCD只具有3'外切酶活性,遇到chi序列后RecD亚基解离并失去3'外切酶活性。本人准备向杨sir发邮件问这个问题。 |
Ruv
B |
B | 同源重组中催化分支迁移 | |
RecQ,RecG,
DNA解链酶I,DNA解链酶IV等 |
B | 参加同源重组,可能是RecF和RecE的同源重组途径 | 杨sir书都没仔细讲。
Lewin's gene XII 指出RecG与RecBCD作用相同,其他没讲 我赌它不考 |
eIF
4a |
E | 翻译中解开稳定性小于126kJ的mRNA二级结构 |
待补充