车哥的一些漫谈

来自osm&bio
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本页面写点本人关于各学科的一些不成熟的想法,可能谈不上科学。

细胞生物学的思想

一个真核细胞可能面临的最大的问题,也是一个我一直疑惑的问题是,细胞空间太大,信号蛋白、结构蛋白,酶和它的底物太少,为什么生命还会有条不紊的进行而不是在无休止的内耗中collapse?

信号蛋白和功能蛋白的低浓度是显而易见的,例如,转录因子许多情况下所干的活不过是将一系列的activator/inhibitor招募过来,进而调控基因表达;细胞因子受体其实基本上没干什么事,只是在受刺激后把几个Jak招募到支架上,Jak自己就会交叉磷酸化。同时一些稳定的调控因子被保持在基底的低量表达状态也是必然的,否则调控表观遗传的蛋白就可能会非特异性的在DNA附近短暂停留导致表观遗传修饰,Jak和一些只要低浓度就可激活转录的因子(NFκB不知道算不算)也会不经意间启动下游调控,况且合成蛋白是耗能的,掺入一个氨基酸需要4个ATP。

那么怎么解决呢?

1:支架蛋白使之区域化

2:膜

3:创造出一个不稳定的messenger

待补充。


生物化学比较解剖学

我们生物化学也有自己的比较解剖!!

Asp-Glu-Ala小论:

个人认为动物体内调节氮平衡的主要枢纽是Glu,N的代谢都是围着Glu转的过程。

Asp也干了:

我们先来看Asp是怎么合成的:OAA+Glu←→Asp+α酮戊二酸 显然这是一个可逆反应,催化这个反应的是谷草转氨酶(GOT,Glu-OAA Transfer氨ase)在线粒体和胞质都有分布并且达到平衡。动物体内就是靠这一步创造出Asp浓度梯度来达成NADH的穿梭。

我们再看OAA还原:OAA+NADH/H+→Mal+NAD, ΔG=29.7kJ/mol

待补充