核酸酶整理

来自osm&bio
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分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中,核酸(DNA和RNA)显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作:创造(DNA/RNA pol),读取(各种反式元件)和编辑(各种修饰蛋白)和清除(核酸酶)。核酸酶在中心法则各大方面都有大作为,同时本人曾因为做到某道细分核酸酶的题而红温,故在此对核酸酶做简要整理。

核酸酶催化机理

待补充

主要活性为核酸酶的酶

此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。

外切酶

名称 生物 功能 备注
Xrn1 E 水解无帽的mRNA的5’
FEN I E 切割因为双链DNA合成而被替换的RNA 因RNA突出如翼状故取名翼状核酸酶
Artemis

蛋白

E NHEJ途径中强行将两个粘端水解成平端 需要DNA-PKCS将其磷酸化,

Artemis是希腊神话中的狩猎女神,并且她支持的人基本上都没善终,这大概是因为希腊神话主要是雅典人写的吧

Rnase D B/E 切下tRNA前体3端最后三个核苷酸(3'-5')
Rnase E E 细胞质中各种mRNA的降解
Rnase L E 水解病毒mRNA 被干扰素诱导
dRPase B BER中切下5'端的磷酸核糖 BER还有一个3'AP裂合酶,但是它同时催化核糖去环化和内切。
外切核酸酶

IX

B MMR中从3'端降解错配核酸段
外切核酸酶

VII和RecJ

B MMR中从5'端降解错配核酸段
EXO1

外切核酸酶1

E MMR中水解错配核酸端
Rat1 E RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割

内切酶

名称 生物 功能 备注
Rnase H B 杂交链RNA切割 H代表hybrid杂交
Rnase H1 E 杂交链RNA切割 H代表hybrid杂交
Rnase M5,M16,M23 B rRNA前体剪切 M5切5S前体发卡,M16切16S前体发卡,M23切23S前体发卡
Rnase III B 16S,23SrRNA前体预剪接
Uvr C B 细菌NER中的内切酶,一次在3'距离4-5nt处切,另一次在5'距离8nt处切 分别用两个结构域切
XPF和XPG E 真核生物中NER切割,XPG在3'端先切,XPF在5'端后切
5'AP内切酶 B&E BER中切AP(脱嘌呤位点)的5'端
RuvC B 同源重组中切割Holliday连接 切两次,切出的产物理论随机。
MutH B MMR中识别Gm6ATC,并切非甲基化那条链的GATC的G的5'端
Rnase P B/E tRNA 5'加工 核酶
Rnase F B tRNA 3'预剪接 下一步接Rnase D
CF I,CF II E mRNA 在加尾信号处剪接
Xrn2 E RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割
RMRP B&E 线粒体D环复制时引物加工;5.8S rRNA 5'端加工

[1]

兼具有核酸酶活性的酶

待补充

  1. 杨荣武,2017,分子生物学,第2版,南京大学出版社