核酸酶整理
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分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中,核酸(DNA和RNA)显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作:创造(DNA/RNA pol),读取(各种反式元件)和编辑(各种修饰蛋白)和清除(核酸酶)。核酸酶在中心法则各大方面都有大作为,同时本人曾因为做到某道细分核酸酶的题而红温,故在此对核酸酶做简要整理。
核酸酶催化机理
待补充
主要活性为核酸酶的酶
此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。
外切酶
名称 | 生物 | 功能 | 备注 |
---|---|---|---|
Xrn1 | E | 水解无帽的mRNA的5’ | |
FEN I | E | 切割因为双链DNA合成而被替换的RNA | 因RNA突出如翼状故取名翼状核酸酶 |
Artemis
蛋白 |
E | NHEJ途径中强行将两个粘端水解成平端 | 需要DNA-PKCS将其磷酸化,
|
Rnase D | B/E | 切下tRNA前体3端最后三个核苷酸(3'-5') | |
Rnase E | E | 细胞质中各种mRNA的降解 | |
Rnase L | E | 水解病毒mRNA | 被干扰素诱导 |
dRPase | B | BER中切下5'端的磷酸核糖 | BER还有一个3'AP裂合酶,但是它同时催化核糖去环化和内切。 |
外切核酸酶
IX |
B | MMR中从3'端降解错配核酸段 | |
外切核酸酶
VII和RecJ |
B | MMR中从5'端降解错配核酸段 | |
EXO1
外切核酸酶1 |
E | MMR中水解错配核酸端 | |
Rat1 | E | RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割 |
内切酶
名称 | 生物 | 功能 | 备注 |
---|---|---|---|
Rnase H | B | 杂交链RNA切割 | H代表hybrid杂交 |
Rnase H1 | E | 杂交链RNA切割 | H代表hybrid杂交 |
Rnase M5,M16,M23 | B | rRNA前体剪切 | M5切5S前体发卡,M16切16S前体发卡,M23切23S前体发卡 |
Rnase III | B | 16S,23SrRNA前体预剪接 | |
Uvr C | B | 细菌NER中的内切酶,一次在3'距离4-5nt处切,另一次在5'距离8nt处切 | 分别用两个结构域切 |
XPF和XPG | E | 真核生物中NER切割,XPG在3'端先切,XPF在5'端后切 | |
5'AP内切酶 | B&E | BER中切AP(脱嘌呤位点)的5'端 | |
RuvC | B | 同源重组中切割Holliday连接 | 切两次,切出的产物理论随机。 |
MutH | B | MMR中识别Gm6ATC,并切非甲基化那条链的GATC的G的5'端 | |
Rnase P | B/E | tRNA 5'加工 | 核酶 |
Rnase F | B | tRNA 3'预剪接 | 下一步接Rnase D |
CF I,CF II | E | mRNA 在加尾信号处剪接 | |
Xrn2 | E | RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割 | |
RMRP | B&E | 线粒体D环复制时引物加工;5.8S rRNA 5'端加工 |
兼具有核酸酶活性的酶
待补充
- ↑ 杨荣武,2017,分子生物学,第2版,南京大学出版社