自噬相关知识总结

自噬相关基因及其蛋白质功能描述

哺乳动物基因	酵母同源基因	蛋白质功能描述
ULK1/2 (Unc51样激酶1和2)	Atg1	是ULK-ATG13-ATG101-FIP200复合物的一部分，磷酸化Beclin1 与Atg13相互作用 参与自噬的启动、膜靶向、膜曲率感知和脂质囊泡拴系
ATG2A/B	Atg2	是ATG9/ATG12-WIPI复合物的一部分，对ATG9的招募以扩展自噬体很重要
ATG3	Atg3	LC3脂化中的E2样酶 自催化形成ATG12-ATG3复合物以维持线粒体稳态
ATG4A-D	Atg4	半胱氨酸蛋白酶，通过去除Atg8的最后一个氨基酸来处理Atg8 去结合Atg8-PE，参与LC3激活和去脂化
ATG5	Atg5	是ATG12-ATG5复合物的一部分，参与自噬体形成/延伸 作为LC3脂化中的E3样酶 与Atg16相互作用并在自噬中起关键作用
Beclin1	Atg6	VPS34-PI3K复合物的亚基 招募Atg14或Vps38，与Bcl-2相互作用 脂质结合和膜变形功能
ATG7	Atg7	E1样酶，与E2酶Atg10或Atg3相互作用 参与LC3和ATG12结合，并与Atg8形成硫酯键
MAP 1 LC3A-C, GABARAPs, GATE-16	Atg8	泛素样模块与PE结合，用作自噬体标记 识别货物特异性适配体，支持体外膜拴系
ATG9L1/L2	Atg9	跨膜蛋白，与ATG2-WIPI复合物相互作用 在PAS和外围细胞器之间穿梭以传递脂质/因子 具有自相互作用功能
ATG10	Atg10	ATG12与Atg5结合的E2样酶
ATG12	Atg12	泛素样模块与Atg5结合 与Atg5和Atg16形成E3复合物，与Atg3相互作用
ATG13	Atg13	是ULK-ATG13-ATG101-FIP200复合物的一部分，参与自噬启动 靶向mTOR信号通路，桥接Atg1和Atg17-Atg31-Atg29 通过Atg14招募Vps34复合物，与LC3结合
ATG14L(Barkor)	Atg14	VPS34-PI3K复合物的亚基，与Beclin1相互作用 支持膜靶向、膜曲率感知和膜融合
ATG16L1/L2 RB1CC1/ FIP200	Atg16	与ATG5-ATG12复合物结合，作为E3酶复合物的一部分
WIP11-4	Atg18	是ATG2-WIPI复合物的一部分，对ATG9的招募到自噬体很重要 与PI3P结合，支持Atg9的逆行运输
ATG101	-	与Atg13相互作用并形成ULK-ATG13-ATG101-FIP200复合物

分子伴侣介导的自噬CMA

• 迄今为止只在哺乳动物细胞中发现。
• 被CMA降解的蛋白质都包含一个五肽序列。
  • 其中有1-2个K/R、1-2个I/L/V/F、一个E/D，和一个Q在五肽序列的一端。共有序列是KFERQ。
  • 可以位于C端/N端/内部，但一定要可接近。
  • 这个序列可能通过翻译后修饰来形成，如乙酰化赖氨酸承担Q的功能，磷酸化承担E/D的功能。
• HSC70识别KFERQ。该蛋白是否被降解，是由此基序能否暴露并且被识别调控的。