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微生物代谢可分为多种方式，其中明显的主要分为：

* 自养生物'''autotrophs'''：使用'''CO2/HCO3作为唯一碳源'''，同时从'''光介导反应'''（'''光自养生物photoautotrophs'''）或'''无机氧化反应'''（'''化能自养生物lithoautotrophs'''）获取能量
* 异养生物'''heterotrophs'''：使用多碳原子的化合物，其能量和碳都来自同一分子，而不是来自不同的来源，其中'''甲烷营养methanotrophs和甲基营养methylotrophs是某种“灰色区域”'''（它们生长在比二氧化碳更少的一碳化合物上，它们与自养生物共享一些能量限制，但也可以被视为异养生物的一个特例，因为例如，'''甲烷既用作碳源，又用作能量来源'''）。异养生物可进一步分为：
** '''专性异养生物obligate heterotrophs'''（只能异养生长）
** '''兼性自养生物 facultative autotrophs'''（既能异养生长也能自养生长），
** '''混合营养生物mixotrophs'''（同时进行异养和自养生长）

还存在其他混合代谢模式，例如，当异养生物（例如，以己糖为食）氧化无机电子供体时，就会出现这种情况——实际上有四种可能的结果：

1. '''电子供体被氧化，而特定生长产量没有任何明显的增加'''。这表明该生物是异养的，不会从电子供体的无端氧化中获得能量，'''它可能只是在解毒或无意中氧化，而没有对电子进行有用的捕获'''。值得注意的是，这是批量培养中的常见观察结果，但在底物受限的恒化器中生长的相同生物体却会显示出结果4。

2. '''电子供体的氧化和从中获取的能量的利用为二氧化碳固定提供燃料'''，同时进行异养生长。这将表明该生物体是我们已经提到的混合营养mixotroph。

3. '''电子供体的氧化，特定生长产量适度增加，但没有二氧化碳固定'''，并且'''在提供电子供体时，静息细胞中没有任何 ATP 产生'''。这将表明该生物体没有从氧化中获得有用的能量，而是由于作为“电子供体”提供的化学物质'''作为抗氧化剂'''而产量略有增加。

4. 电子供体的氧化使'''特定生长产量大幅增加，但没有二氧化碳固定，尽管在提供电子供体时，静息细胞中会产生 ATP。'''这表明异养生长过程中的'''呼吸作用得到了来自电子供体的电子的补充，增加了质子动力，从而增加了 ATP 的产生，导致更高的特定生长产量'''——这种异养的特殊情况是'''化能无机异养chemolithoheterotrophy'''。

参考资料：https://doi.org/10.1007/978-3-319-50418-6_51