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泛素相关知识
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== 泛素 == 泛素有76个氨基酸残基,以Gly-Gly结尾。 泛素可以共价连接在别的蛋白的Lys残基上(也可能为另一个泛素的7个赖氨酸残基之一),此过程由三个酶催化: # '''泛素活化酶E1''' 消耗ATP将泛素C端羧基与E1自己的半胱氨酸残基共价连接,形成硫酯键。 # '''泛素结合酶E2''' 将E1上的泛素转移至E2的半胱氨酸残基上,形成硫酯键 # '''泛素连接酶E3''' 将E2的泛素转移到靶蛋白的赖氨酸残基上,形成酯键。 === 参与泛素化的三种酶 === '''泛素活化酶E1''':已知的只有两种,Ube1和Uba6. '''泛素结合酶E2''':Ubc,人至少有38种E2。同一种E2可以和许多种E3相互作用。 [[文件:SCF E3的结构.png|缩略图]] '''泛素连接酶E3''':E3要识别特异性的底物,因此种类最多。可以分为两大类: * HECT结构域E3:单亚基,修饰底物时先自身与泛素形成硫酯键,再将泛素转移至底物上。 * 含环指结构域E3:分为两类:单亚基和多亚基(比如APC/C和SCF)的。'''SCF E3'''包括'''S'''kp1、环指蛋白Rbx1、'''C'''ull、'''F'''-box蛋白。Cull为分子支架,一端结合Skp1,一端结合Rbx1。E2携带泛素结合Rbx1,F-box蛋白携带泛素化底物结合Skp1(通过F-box结构域)。 * 除了这两大类,人还有一些别的E3,但种类不是很多。 === 泛素化的功能 === '''蛋白质降解''':K48多聚泛素化导致。记忆:48谐音“死吧”因此导致蛋白酶体降解。 '''其他功能''':泛素链也可以位于K6、K11、K27、K33、K63的位置上,甚至在一条泛素链有时会有多种连接方法。泛素有时候不会形成多聚链,而是单个泛素或者寡聚链。K63多聚泛素链与细胞表面受体胞吞、DNA损伤修复等有关。 === 去泛素化 === '''去泛素化酶''':人已知一百多种泛素化酶。 == 类泛素 == 类泛素有两种:一种是类泛素修饰蛋白,能够修饰别的蛋白,如SUMO、Nedd8、ISG15;一种是含有类泛素结构域的蛋白,不能修饰。 === SUMO === SUMO即<u>小的泛素相关的修饰物</u>,有时称为'''苏素'''。哺乳动物有SUMO-1、SUMO-2、SUMO-3。 SUMO-1长101氨基酸,与泛素相比只有18%的序列相同,N端还有一段延伸序列,但三级结构却非常相似。 SUMO在C端的Gly-Gly后面还有较短的一段延伸序列,在Gly-Gly结合在底物上前,这段序列需要被切除。 SUMO化也是发生在底物的Lys残基上,但这个K位于'''ψKXE基序'''中。ψ代表疏水氨基酸。 '''SUMO活化酶E1'''是双亚基蛋白(Aos1+Uba2),分别和泛素活化酶的N端和C端类似。消耗ATP将SUMO共价结合在Uba2的半胱氨酸残基上。 '''SUMO结合酶E2'''目前只发现了一种:Ubc9.将SUMO转移到自身的半胱氨酸残基上。在体外,Ubc9自身即可催化SUMO转移到底物上。 随着研究进展,发现SUM连接酶E3可以结合Ubc9促进SUMO的转移。有多种。 原认为SUMO一般不发生多聚化,但发现SUMO-2和SUMO-3可以形成多聚化。 '''SUMO化的功能''':RanGAP1被SUMO化后可以定位到核孔处;许多转录因子可以被SUMO化改变活性;某些蛋白SUMO化竞争泛素化位点,增强稳定性;有些蛋白的SUMO化反而导致泛素化降解;…… === Nedd8 === Nedd8由81个氨基酸组成,是与泛素最类似的类泛素。 E1是异源二聚体,ATP形成硫酯键;E2只发现一种Ubc12,转移到自己的半胱氨酸上;发现的E3数量很少。 功能有改变转录因子活性、改变蛋白质相互作用等。
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