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电泳染色方法
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=蛋白质电泳染色= ==银染法== ===原理=== 碱性环境下,甲醛等还原剂将蛋白质上结合的银离子还原为单质银颗粒,从而显现出棕黑色。不过确切原理还不是很清楚。 ===试剂=== *乙醇、冰醋酸:固定剂,稳定凝胶中的蛋白质并去除杂质。 *乙酸钠、硫代硫酸钠:致敏剂,使得银离子更容易结合在凝胶上。 *硝酸银溶液:提供银离子。 *甲醛溶液、碳酸钠:显色剂,碳酸钠提供碱性环境,甲醛还原银离子。 *EDTA、甘氨酸溶液:终止液:终止显色反应。 ===实验步骤=== *固定:使用含有乙醇和冰醋酸的固定液处理凝胶。 *致敏:加入乙酸钠和硫代硫酸钠。 *洗涤:使用纯水洗涤凝胶,去除多余的试剂。 *染色:将凝胶浸泡在含有硝酸银和甲醛的显色剂中进行反应。 *显色:显色剂使银离子还原成金属银,形成可见的染色效果,应当为棕黑色条带。 *终止:使用终止液停止显色反应,并固定染色结果。 ===特点=== *灵敏度极高,可以检出低丰度(<1ng)蛋白质。 *染色结果和蛋白质氨基酸组成有关,不含或者很少含半胱氨酸残基的蛋白质有时候呈负染。 *染色强度与蛋白质浓度并非完全线性关系,蛋白质定量受到一定限制。 *对实验操作要求较高,试剂刺激性强。 *可能干扰后续质谱 ==考马斯亮蓝染色法== ===原理=== 考马斯亮蓝R-250分子中的芳香环可以通过范德华力与疏水氨基酸残基结合,而磺酸基则通过静电作用与带正电的氨基酸残基结合。游离状态下呈红色而与蛋白质结合后呈蓝色。 [[文件:考马斯亮蓝R-250和考马斯亮蓝G-250的分子结构.jpg|缩略图|考马斯亮蓝R-250和考马斯亮蓝G-250的分子结构]] ===试剂=== *50%甲醇+10%冰醋酸:固定剂,固定蛋白质,去除SDS和盐。 *0.1%考马斯亮蓝R-250+50%甲醇+10%冰醋酸:染色剂,显色。 *40%甲醇+10%冰醋酸:脱色剂,去除未结合染料,降低背景噪声。 *1%乙酸:保存剂,防止凝胶干燥和条带褪色。 ===实验步骤=== *固定:将凝胶浸泡于固定液中,室温摇动30分钟至过夜。 *染色:倒弃固定液,加入染色液(液面需完全覆盖凝胶),室温摇床震荡染色12小时(或微波加热至95℃加速至20分钟,避免沸腾)。 *脱色:弃染色液,加入脱色液震荡脱色;每30分钟更换脱色液,直至背景透明(通常需3~4次);若需低背景,可用纯水脱色过夜。 *保存:将凝胶浸泡于1%乙酸中,4℃可保存1周。 ===特点=== *相对灵敏,0.2μg-0.5μg/条带。 *成本低。 *永久性染色,不能继续进行印记分析。 ==荧光染色== ===原理=== 荧光染料(如SYPRO Ruby、Deep Purple)通过疏水作用结合蛋白质,紫外激发下发光。 ===试剂(以SYPRO Ruby为例)=== *SYPRO Ruby:染色剂,最大激发光波长300/420nm,最大发射光波长618nm。 *40%甲醇+10%乙酸:固定剂,作用同上。 *2%乙酸水溶液(或蒸馏水):脱色剂,用于去除未结合的染料。 *2%甘油溶液:保存剂,用于长期保存凝胶(可维持6个月荧光信号稳定)。 ===实验步骤=== *固定:将电泳后的凝胶转移至塑料容器中,加入足量固定液(覆盖凝胶体积5-10倍),室温摇动30分钟。 *染色:倒掉固定液,加入SYPRO Ruby染色液(覆盖凝胶),避光条件下室温摇动染色90分钟至过夜。 *脱色:倒掉染色液,加入2%乙酸或蒸馏水(覆盖凝胶),室温摇动洗涤30-60分钟。 *成像:使用荧光扫描仪或蓝光/紫外透射仪照射凝胶。 *保存: **短期:将凝胶浸泡于2%甘油中避光保存(室温或4℃)。 **长期:用湿玻璃纸包裹凝胶,空气干燥后永久保存。 ===特点=== *灵敏度1-2ng。 *染色和保存全程需避光,防止荧光猝灭。 *染色不影响后续质谱分析,无需额外脱色步骤。 ==负染法== ===原理=== 通过金属离子(如铜、锌)选择性沉淀在凝胶背景上,使未被染色的蛋白质条带呈现透明区域。 ===试剂(以咪唑锌法为例)=== *40%甲醇+10%乙酸:固定剂,作用同上。 *0.2 mol/L咪唑+0.1% SDS、0.2 mol/L硫酸锌:染色剂,形成咪唑锌沉淀。 *去离子水或0.1%乙酸:洗涤剂,去除多余金属离子。 ===实验步骤=== *固定:将凝胶浸入固定液中室温摇动30分钟。 *洗涤:倒掉固定液,加入去离子水覆盖凝胶,摇动洗涤2次,每次15分钟以洗去残留的固定液。 *预处理:加入咪唑-SDS溶液(体积为凝胶2倍),摇床孵育15分钟。 *染色:快速倒掉咪唑-SDS液,立即加入0.2 M硫酸锌溶液,剧烈摇动30-60秒。 *终止:倒掉硫酸锌溶液,用去离子水冲洗凝胶2次(每次1分钟)。 *成像:使用白光透射仪观察,或拍照时在凝胶下方放置黑色背景板增强对比度。 *保存:浸入水中避光保存。 ===特点=== *速度快,全程仅需45-60分钟。 *可用于Western Blot前验证转膜效率。 *蛋白质可回收,不影响后续质谱分析。 *单独使用检测限1-10 ng,低于荧光染色和银染法,但是高于考马斯亮蓝染色。 *对实验操作要求高,pH和离子浓度要求苛刻,重复性差。 ==丽春红染色== ===原理=== 丽春红是酸性染料,可以与带正电的氨基酸残基结合,也可以通过疏水相互作用与蛋白质的非极性区域结合。 ===试剂=== *5%三氯乙酸:固定剂,作用同上。 *丽春红S:染色剂。 *5%醋酸或去离子水:脱色剂。 *PBS或TPBS:完全脱色剂,脱去条带上的染料以用于后续印记分析。 ===实验步骤=== *固定:转膜后,将PVDF/硝酸纤维素膜浸入含5% TCA的溶液中5分钟。 *染色:将膜完全浸没于丽春红染色液中,室温摇床孵育 3-10分钟(视膜厚度调整)。 *脱色:用去离子水或 5%醋酸溶液 漂洗膜3次(每次1分钟),直至背景透明、条带清晰。 *成像:在白光透射扫描仪(波长520-540 nm)下观察,拍照保存结果。 ===特点=== *全程仅需10-15分钟,远快于考马斯亮蓝(3小时)和银染(4-6小时)。 *染色后染料可完全洗脱,不干扰抗体结合(对比考马斯亮蓝的永久性染色)。 *适用于PVDF膜、硝酸纤维素膜,支持高盐/去污剂样本(如细胞裂解液),但是不支持尼龙膜,因为尼龙膜带正电会导致背景噪声过大。 *灵敏度较低,检测下限约 250 ng/条带,低于银染和荧光染色。
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