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|+ 自噬相关基因及其蛋白质功能描述
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! 哺乳动物基因 !! 酵母同源基因 !! 蛋白质功能描述
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| ULK1/2 (Unc51样激酶1和2) || Atg1 || 
* 是ULK-ATG13-ATG101-FIP200复合物的一部分，磷酸化Beclin1
* 与Atg13相互作用
* 参与自噬的启动、膜靶向、膜曲率感知和脂质囊泡拴系
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| ATG2A/B || Atg2 || 
* 是ATG9/ATG12-WIPI复合物的一部分，对ATG9的招募以扩展自噬体很重要
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| ATG3 || Atg3 || 
* LC3脂化中的E2样酶
* 自催化形成ATG12-ATG3复合物以维持线粒体稳态
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| ATG4A-D || Atg4 || 
* 半胱氨酸蛋白酶，通过去除Atg8的最后一个氨基酸来处理Atg8
* 去结合Atg8-PE，参与LC3激活和去脂化
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| ATG5 || Atg5 || 
* 是ATG12-ATG5复合物的一部分，参与自噬体形成/延伸
* 作为LC3脂化中的E3样酶
* 与Atg16相互作用并在自噬中起关键作用
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| Beclin1 || Atg6 || 
* VPS34-PI3K复合物的亚基
* 招募Atg14或Vps38，与Bcl-2相互作用
* 脂质结合和膜变形功能
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| ATG7 || Atg7 || 
* E1样酶，与E2酶Atg10或Atg3相互作用
* 参与LC3和ATG12结合，并与Atg8形成硫酯键
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| MAP 1 LC3A-C, GABARAPs, GATE-16 || Atg8 || 
* 泛素样模块与PE结合，用作自噬体标记
* 识别货物特异性适配体，支持体外膜拴系
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| ATG9L1/L2 || Atg9 || 
* 跨膜蛋白，与ATG2-WIPI复合物相互作用
* 在PAS和外围细胞器之间穿梭以传递脂质/因子
* 具有自相互作用功能
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| ATG10 || Atg10 || 
* ATG12与Atg5结合的E2样酶
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| ATG12 || Atg12 || 
* 泛素样模块与Atg5结合
* 与Atg5和Atg16形成E3复合物，与Atg3相互作用
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| ATG13 || Atg13 || 
* 是ULK-ATG13-ATG101-FIP200复合物的一部分，参与自噬启动
* 靶向mTOR信号通路，桥接Atg1和Atg17-Atg31-Atg29
* 通过Atg14招募Vps34复合物，与LC3结合
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| ATG14L(Barkor) || Atg14 || 
* VPS34-PI3K复合物的亚基，与Beclin1相互作用
* 支持膜靶向、膜曲率感知和膜融合
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| ATG16L1/L2 RB1CC1/ FIP200 || Atg16 || 
* 与ATG5-ATG12复合物结合，作为E3酶复合物的一部分
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| WIP11-4 || Atg18 || 
* 是ATG2-WIPI复合物的一部分，对ATG9的招募到自噬体很重要
* 与PI3P结合，支持Atg9的逆行运输
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| ATG101 || - || 
* 与Atg13相互作用并形成ULK-ATG13-ATG101-FIP200复合物
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=== 分子伴侣介导的自噬CMA ===

* 迄今为止只在哺乳动物细胞中发现。
* 被CMA降解的蛋白质都包含一个五肽序列。
** 其中有1-2个K/R、1-2个I/L/V/F、一个E/D，和一个Q在五肽序列的一端。共有序列是KFERQ。
** 可以位于C端/N端/内部，但一定要可接近。
** 这个序列可能通过翻译后修饰来形成，如乙酰化赖氨酸承担Q的功能，磷酸化承担E/D的功能。
* HSC70识别KFERQ。该蛋白是否被降解，是由此基序能否暴露并且被识别调控的。
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