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常见序列整理：修订间差异

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第1行： 第1行：
AQP                                                                Asn-Pro-Ala


O-linked或N-linked                                        Asn-X-Ser/Thr
PS：有无好心人帮我对齐一下QAQ，不会编辑
 
PTS1 转运序列                                                Ser-Lys-Leu
 
PTS2 转运序列                                                Arg/Lys-Leu/Ile-5X-His/Gln-Leu
 
ER 转运序列                                                     疏水aa核心，多碱性aa（Arg，Lys）
 
Mt 转运序列                                                   两性螺旋，一侧疏水，一侧碱性（Arg，Lys）
 
Cp 转运序列                                                    富含Ser，Thr和少量疏水aa，罕见Glu和Asp
 
Nuclear 转运序列                                            富含短的Arg，Lys序列
 
KDEL                                                              字面意思
 
KKXX                                                              字面意思
 
两酸                                                                字面意思，如：Asp-X-Gln
 
NPXY                                                              字面意思
 
YXXφ                                                              字面意思
 
LL                                                                    字面意思
 
SH2结构域特异结合                                          p-Tyr
 
SH3结构域特异结合                                          PXXP和RXXK
 
PTB结构域特异结合                                          NPXY
 
PDZ结构域特异结合                                        膜蛋白C端aa，通常末端为Val-COOH
 
WW结构域特异结合                                        XPPXY
 
（还剩几个结构域无特定结合序列，故不特地列出）
 
PKA磷酸化序列                                                X-Arg-Arg/Lys-X-Ser/Thr-Φ
 
膜蛋白内吞序列                                                YXXΦ
 
P62 Nup153核孔复合物蛋白疏水结构域          FXFG
 
Nup98核孔复合物蛋白疏水结构域                    GLFG
 
NLS                                                                PKKKRKV


破坏框                                                            RXXLGXIXN
——全部改成了表格形式，感觉看起来会舒服一点ww--[[用户:W. Machine|W. Machine]]（[[用户讨论:W. Machine|留言]]） 2025年8月10日 (日) 11:16 (CST)


层粘连蛋白，纤连蛋白等与外基质结合区域      RGD
{| class="wikitable"
 
|+
胶原α链                                                          GXY（X常为Pro，Y常为Hypro或Hylys）
!
 
!名称
 
!序列或特征
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!描述
!附加说明
|-
| rowspan="15" |定位信号
|KDEL
|KDEL
|可溶性蛋白内质网驻留信号
|
|-
|HDEL
|HDEL
|同上，在酵母和植物中更常见
|
|-
|KKXX
|KKXX(X为任意氨基酸)
|膜蛋白内质网驻留信号
|受体为COP I α和β亚基
|-
|两酸
|如DXE
|ER→高尔基体转运信号
|受体为COP II Sec24亚基
|-
|NPXY
|Asn-Pro-X-Tyr
|质膜上LDL受体
|受体为AP2复合物
|-
| rowspan="2" |YXXΦ
| rowspan="2" |Tyr-X-X-Φ(其中Φ为疏水氨基酸)
|高尔基体反面膜囊蛋白
|受体为AP1（μ1亚基）
|-
|质膜膜蛋白
|受体为AP2（μ2亚基）
|-
|LL
|Leu-Leu
|质膜膜蛋白
|受体为AP2复合物
|-
|PTS1
|SKL，存在许多变体
|C端过氧化物酶体定位信号
|受体为PEX5
|-
|PTS2
|(R/K)(L/V/I/Q)(X)<sub>5</sub>(H/Q)(L/A/F)
|N端过氧化物酶体定位信号
|受体为PEX7，共受体为18或20
|-
|mPTS
|
|膜蛋白过氧化物酶体定位信号
|受体为PEX19
|-
|信号肽
|疏水aa核心，多碱性aa（Arg，Lys）
|内质网定位序列
|
|-
|转运肽
|富含Ser，Thr和少量疏水aa，罕见Glu和Asp
|叶绿体定位序列
|
|-
|导肽
|两性螺旋，一侧疏水，一侧碱性（Arg，Lys）
|线粒体定位序列
|
|-
|NLS
|PKKKRKV
|核定位序列
|该序列为第一个被确定的NLS序列，来自SV40的T抗原
|-
|细胞周期
|破坏框
|RXXLGXIXN
|M期周期蛋白破坏框
|
|-
| rowspan="9" |功能序列
|
|GXY（X常为Pro，Y常为Hypro或Hylys）
|胶原的三股螺旋重复序列
|
|-
|RGD
|Arg-Gly-Asp
|整联蛋白胞外部分结合胞外基质（如层粘连蛋白，纤连蛋白等）的序列
|
|-
|
|富含Ala、Lys
|弹性蛋白α螺旋区域
|通过Lys残基相互交联
|-
|
|七肽重复序列，第一位和第四位是疏水氨基酸
|α角蛋白的卷曲螺旋重复序列
|
|-
|
|G-A/S-G-A/S
|β角蛋白的β折叠重复序列
|
|-
|
|N*-X-S/T，X≠P
|N糖基化，发生在N上
|'''O糖基化没有特定的识别位点'''
|-
|
|NPA
|水孔蛋白通道中的关键序列
|
|-
|
|CTGnCAGn
|核小体容易形成 和弯曲有关
|
|-
|
|UNCG、GNRA或CUYG
|发夹结构稳定四环
|
|-
|基团修饰
|
|X-Arg-Arg/Lys-X-Ser/Thr-Φ
|PKA磷酸化序列
|
|-
| rowspan="5" |结构域结合
|SH2
|
|结合p-Tyr
|eg: Src、Grb2、Shc、STAT
|-
|SH3
|
|结合PXXP和RXXK
|eg: Src、Nck
|-
|PTB
|
|结合NPXY
|eg: Shc、IRS1
|-
|PDZ
|
|结合膜蛋白C端aa，通常末端为Val-COOH
|eg: Dishevelled、FAP
|-
|WW
|
|结合XPPXY
|eg: Nedd4(E3泛素连接酶)、Smurf、Dystrophin
|-
| rowspan="4" |核孔复合体蛋白
|Pom121
|C端有FXFG重复序列
|孔膜区，跨膜蛋白
|
|-
|Nup153
|N端有FXFG重复序列
|“捕鱼笼”
|具有锌指结构，能够结合DNA（在体外）
|-
|p62
|FXFG重复序列
|中央颗粒
|与酵母的Nsp1p同源，带有O-连接GlcNac类型的糖基化修饰
|-
|Nup98
|GLFG重复序列
|
|与酵母的Nup116p同源
|}

2025年8月10日 (日) 11:16的最新版本

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——全部改成了表格形式，感觉看起来会舒服一点ww--W. Machine（留言） 2025年8月10日 (日) 11:16 (CST)

名称 序列或特征 描述 附加说明
定位信号 KDEL KDEL 可溶性蛋白内质网驻留信号
HDEL HDEL 同上，在酵母和植物中更常见
KKXX KKXX(X为任意氨基酸) 膜蛋白内质网驻留信号 受体为COP I α和β亚基
两酸 如DXE ER→高尔基体转运信号 受体为COP II Sec24亚基
NPXY Asn-Pro-X-Tyr 质膜上LDL受体 受体为AP2复合物
YXXΦ Tyr-X-X-Φ(其中Φ为疏水氨基酸) 高尔基体反面膜囊蛋白 受体为AP1（μ1亚基）
质膜膜蛋白 受体为AP2（μ2亚基）
LL Leu-Leu 质膜膜蛋白 受体为AP2复合物
PTS1 SKL，存在许多变体 C端过氧化物酶体定位信号 受体为PEX5
PTS2 (R/K)(L/V/I/Q)(X)5(H/Q)(L/A/F) N端过氧化物酶体定位信号 受体为PEX7，共受体为18或20
mPTS 膜蛋白过氧化物酶体定位信号 受体为PEX19
信号肽 疏水aa核心，多碱性aa（Arg，Lys） 内质网定位序列
转运肽 富含Ser，Thr和少量疏水aa，罕见Glu和Asp 叶绿体定位序列
导肽 两性螺旋，一侧疏水，一侧碱性（Arg，Lys） 线粒体定位序列
NLS PKKKRKV 核定位序列 该序列为第一个被确定的NLS序列，来自SV40的T抗原
细胞周期 破坏框 RXXLGXIXN M期周期蛋白破坏框
功能序列 GXY（X常为Pro，Y常为Hypro或Hylys） 胶原的三股螺旋重复序列
RGD Arg-Gly-Asp 整联蛋白胞外部分结合胞外基质（如层粘连蛋白，纤连蛋白等）的序列
富含Ala、Lys 弹性蛋白α螺旋区域 通过Lys残基相互交联
七肽重复序列，第一位和第四位是疏水氨基酸 α角蛋白的卷曲螺旋重复序列
G-A/S-G-A/S β角蛋白的β折叠重复序列
N*-X-S/T，X≠P N糖基化，发生在N上 O糖基化没有特定的识别位点
NPA 水孔蛋白通道中的关键序列
CTGnCAGn 核小体容易形成 和弯曲有关
UNCG、GNRA或CUYG 发夹结构稳定四环
基团修饰 X-Arg-Arg/Lys-X-Ser/Thr-Φ PKA磷酸化序列
结构域结合 SH2 结合p-Tyr eg: Src、Grb2、Shc、STAT
SH3 结合PXXP和RXXK eg: Src、Nck
PTB 结合NPXY eg: Shc、IRS1
PDZ 结合膜蛋白C端aa，通常末端为Val-COOH eg: Dishevelled、FAP
WW 结合XPPXY eg: Nedd4(E3泛素连接酶)、Smurf、Dystrophin
核孔复合体蛋白 Pom121 C端有FXFG重复序列 孔膜区，跨膜蛋白
Nup153 N端有FXFG重复序列 “捕鱼笼” 具有锌指结构，能够结合DNA（在体外）
p62 FXFG重复序列 中央颗粒 与酵母的Nsp1p同源，带有O-连接GlcNac类型的糖基化修饰
Nup98 GLFG重复序列 与酵母的Nup116p同源
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