核酸酶整理:修订间差异
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分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中,核酸(DNA和RNA)显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作:创造(DNA/RNA pol), | 分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中,核酸(DNA和RNA)显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作:创造(DNA/RNA pol),读取(各种反式元件)和编辑(各种修饰蛋白)和清除(核酸酶)。核酸酶在中心法则各大方面都有大作为,<s>同时本人曾因为做到某道细分核酸酶的题而红温,</s>故在此对核酸酶做简要整理。 | ||
== | == 核酸酶催化机理 == | ||
待补充 | |||
== 主要活性为核酸酶的酶 == | |||
此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。 | 此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。 | ||
=== 外切酶 === | |||
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| | |Xrn1 | ||
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|E | |E | ||
|切割因为双链DNA合成而被替换的RNA | |切割因为双链DNA合成而被替换的RNA | ||
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<s>Artemis是希腊神话中的狩猎女神,并且她支持的人基本上都没善终,这大概是因为希腊神话主要是雅典人写的吧</s> | <s>Artemis是希腊神话中的狩猎女神,并且她支持的人基本上都没善终,这大概是因为希腊神话主要是雅典人写的吧</s> | ||
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| | |Rnase D | ||
|B/E | |||
|切下tRNA前体3端最后三个核苷酸(3'-5') | |||
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|Rnase E | |||
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|细胞质中各种mRNA的降解 | |||
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|Rnase L | |||
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|水解病毒mRNA | |||
|被干扰素诱导 | |||
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|dRPase | |||
|B | |||
|BER中切下5'端的磷酸核糖 | |||
|BER还有一个3'AP裂合酶,但是它同时催化核糖去环化和内切。 | |||
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|外切核酸酶 | |||
IX | |||
|B | |||
|MMR中从3'端降解错配核酸段 | |||
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|外切核酸酶 | |||
VII和RecJ | |||
|B | |||
|MMR中从5'端降解错配核酸段 | |||
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|EXO1 | |||
外切核酸酶1 | |||
|E | |||
|MMR中水解错配核酸端 | |||
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|Rat1 | |||
|E | |||
|RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割 | |||
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=== 内切酶 === | |||
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|- | |||
|Rnase H | |||
|B | |B | ||
| | |杂交链RNA切割 | ||
|H代表hybrid杂交 | |||
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|Rnase H1 | |||
|E | |||
|杂交链RNA切割 | |||
|H代表hybrid杂交 | |||
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|Rnase M5,M16,M23 | |||
|B | |||
|rRNA前体剪切 | |||
|M5切5S前体发卡,M16切16S前体发卡,M23切23S前体发卡 | |||
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|Rnase III | |||
|B | |||
|16S,23SrRNA前体预剪接 | |||
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|Uvr C | |||
|B | |||
|细菌NER中的内切酶,一次在3'距离4-5nt处切,另一次在5'距离8nt处切 | |||
|分别用两个结构域切 | |分别用两个结构域切 | ||
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|XPF和XPG | |XPF和XPG | ||
|E | |E | ||
| | |真核生物中NER切割,XPG在3'端先切,XPF在5'端后切 | ||
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| | |RuvC | ||
|B | |B | ||
| | |同源重组中切割Holliday连接 | ||
| | |切两次,切出的产物理论随机。 | ||
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|MutH | |MutH | ||
|B | |B | ||
| | |MMR中识别Gm<sup>6</sup>ATC,并切非甲基化那条链的GATC的G的5'端 | ||
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| | |Rnase P | ||
|B/E | |||
|tRNA 5'加工 | |||
|核酶 | |||
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|Rnase F | |||
|B | |B | ||
| | |tRNA 3'预剪接 | ||
|下一步接Rnase D | |||
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|CF I,CF II | |||
|E | |||
|mRNA 在加尾信号处剪接 | |||
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|Xrn2 | |||
|E | |||
|RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割 | |||
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| | |RMRP | ||
|B&E | |||
|B | |线粒体D环复制时引物加工;5.8S rRNA 5'端加工 | ||
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|} | |} | ||
<ref>杨荣武,2017,分子生物学,第2版,南京大学出版社</ref> | <ref>杨荣武,2017,分子生物学,第2版,南京大学出版社</ref> | ||
== 兼具有核酸酶活性的酶 == | |||
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2024年12月2日 (一) 22:02的最新版本
分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中,核酸(DNA和RNA)显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作:创造(DNA/RNA pol),读取(各种反式元件)和编辑(各种修饰蛋白)和清除(核酸酶)。核酸酶在中心法则各大方面都有大作为,同时本人曾因为做到某道细分核酸酶的题而红温,故在此对核酸酶做简要整理。
核酸酶催化机理
待补充
主要活性为核酸酶的酶
此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。
外切酶
名称 | 生物 | 功能 | 备注 |
---|---|---|---|
Xrn1 | E | 水解无帽的mRNA的5’ | |
FEN I | E | 切割因为双链DNA合成而被替换的RNA | 因RNA突出如翼状故取名翼状核酸酶 |
Artemis
蛋白 |
E | NHEJ途径中强行将两个粘端水解成平端 | 需要DNA-PKCS将其磷酸化,
|
Rnase D | B/E | 切下tRNA前体3端最后三个核苷酸(3'-5') | |
Rnase E | E | 细胞质中各种mRNA的降解 | |
Rnase L | E | 水解病毒mRNA | 被干扰素诱导 |
dRPase | B | BER中切下5'端的磷酸核糖 | BER还有一个3'AP裂合酶,但是它同时催化核糖去环化和内切。 |
外切核酸酶
IX |
B | MMR中从3'端降解错配核酸段 | |
外切核酸酶
VII和RecJ |
B | MMR中从5'端降解错配核酸段 | |
EXO1
外切核酸酶1 |
E | MMR中水解错配核酸端 | |
Rat1 | E | RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割 |
内切酶
名称 | 生物 | 功能 | 备注 |
---|---|---|---|
Rnase H | B | 杂交链RNA切割 | H代表hybrid杂交 |
Rnase H1 | E | 杂交链RNA切割 | H代表hybrid杂交 |
Rnase M5,M16,M23 | B | rRNA前体剪切 | M5切5S前体发卡,M16切16S前体发卡,M23切23S前体发卡 |
Rnase III | B | 16S,23SrRNA前体预剪接 | |
Uvr C | B | 细菌NER中的内切酶,一次在3'距离4-5nt处切,另一次在5'距离8nt处切 | 分别用两个结构域切 |
XPF和XPG | E | 真核生物中NER切割,XPG在3'端先切,XPF在5'端后切 | |
5'AP内切酶 | B&E | BER中切AP(脱嘌呤位点)的5'端 | |
RuvC | B | 同源重组中切割Holliday连接 | 切两次,切出的产物理论随机。 |
MutH | B | MMR中识别Gm6ATC,并切非甲基化那条链的GATC的G的5'端 | |
Rnase P | B/E | tRNA 5'加工 | 核酶 |
Rnase F | B | tRNA 3'预剪接 | 下一步接Rnase D |
CF I,CF II | E | mRNA 在加尾信号处剪接 | |
Xrn2 | E | RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割 | |
RMRP | B&E | 线粒体D环复制时引物加工;5.8S rRNA 5'端加工 |
兼具有核酸酶活性的酶
待补充
- ↑ 杨荣武,2017,分子生物学,第2版,南京大学出版社