核酸酶整理:修订间差异

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分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中,核酸(DNA和RNA)显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作:创造(DNA/RNA pol),读取(各种反式元件)和编辑(各种修饰蛋白)和清除(核酸酶)。核酸酶在中心法则各大方面都有大作为。故在此对核酸酶做简要整理。
分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中,核酸(DNA和RNA)显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作:创造(DNA/RNA pol),读取(各种反式元件)和编辑(各种修饰蛋白)和清除(核酸酶)。核酸酶在中心法则各大方面都有大作为,<s>同时本人曾因为做到某道细分核酸酶的题而红温,</s>故在此对核酸酶做简要整理。
 
== 核酸酶催化机理 ==
待补充


== 主要活性为核酸酶的酶 ==
== 主要活性为核酸酶的酶 ==
此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。
此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。
=== 外切酶 ===
{| class="wikitable"
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|+
!名称
!名称
!生物
!生物
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!备注
!备注
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|Rnase
|Xrn1
H
|B
|杂交链RNA切割
|H代表hybrid杂交
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|Rnase
H1
|E
|E
|杂交链RNA切割
|水解无帽的mRNA的5’
|H代表hybrid杂交
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|Fen
|FEN I
I
|E
|E
|切割因为双链DNA合成而被替换的RNA
|切割因为双链DNA合成而被替换的RNA
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<s>Artemis是希腊神话中的狩猎女神,并且她支持的人基本上都没善终,这大概是因为希腊神话主要是雅典人写的吧</s>
<s>Artemis是希腊神话中的狩猎女神,并且她支持的人基本上都没善终,这大概是因为希腊神话主要是雅典人写的吧</s>
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|Uvr
|Rnase D
C
|B/E
|切下tRNA前体3端最后三个核苷酸(3'-5')
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|Rnase E
|E
|细胞质中各种mRNA的降解
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|Rnase L
|E
|水解病毒mRNA
|被干扰素诱导
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|dRPase
|B
|B
|细菌NMR中的内切酶,一次在3'距离4-5nt处切,另一次在5'距离8nt处切
|BER中切下5'端的磷酸核糖
|BER还有一个3'AP裂合酶,但是它同时催化核糖去环化和内切。
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|外切核酸酶
IX
|B
|MMR中从3'端降解错配核酸段
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|外切核酸酶
VII和RecJ
|B
|MMR中从5'端降解错配核酸段
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|EXO1
外切核酸酶1
|E
|MMR中水解错配核酸端
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|Rat1
|E
|RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割
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|}
 
=== 内切酶 ===
{| class="wikitable"
|+
!名称
!生物
!功能
!备注
|-
|Rnase H
|B
|杂交链RNA切割
|H代表hybrid杂交
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|Rnase H1
|E
|杂交链RNA切割
|H代表hybrid杂交
|-
|Rnase M5,M16,M23
|B
|rRNA前体剪切
|M5切5S前体发卡,M16切16S前体发卡,M23切23S前体发卡
|-
|Rnase III
|B
|16S,23SrRNA前体预剪接
|
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|Uvr C
|B
|细菌NER中的内切酶,一次在3'距离4-5nt处切,另一次在5'距离8nt处切
|分别用两个结构域切
|分别用两个结构域切
|-
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|XPF和XPG
|XPF和XPG
|E
|E
|真核生物中NMR切割,XPG在3'端先切,XPF在5'端后切
|真核生物中NER切割,XPG在3'端先切,XPF在5'端后切
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|dRPase
|RuvC
|B
|B
|BER中切下5'端的磷酸核糖
|同源重组中切割Holliday连接
|BER还有一个3'AP裂合酶,但是它同时催化核糖去环化和内切。
|切两次,切出的产物理论随机。
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|-
|MutH
|MutH
|B
|B
|MMR中识别m6GATC,并切非甲基化的GATC的G的5'端
|MMR中识别Gm<sup>6</sup>ATC,并切非甲基化那条链的GATC的G的5'端
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|-
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|外切核酸酶
|Rnase P
I X
|B/E
|tRNA 5'加工
|核酶
|-
|Rnase F
|B
|B
|MMR中从3'端降解错配核酸段
|tRNA 3'预剪接
|下一步接Rnase D
|-
|CF I,CF II
|E
|mRNA 在加尾信号处剪接
|
|-
|Xrn2
|E
|RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割
|
|
|-
|-
|外切核酸酶
|RMRP
VII 和RecJ
|B&E
|B
|线粒体D环复制时引物加工;5.8S rRNA 5'端加工
|MMR中从5'端降解错配核酸段
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2024年12月2日 (一) 22:02的最新版本

分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中,核酸(DNA和RNA)显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作:创造(DNA/RNA pol),读取(各种反式元件)和编辑(各种修饰蛋白)和清除(核酸酶)。核酸酶在中心法则各大方面都有大作为,同时本人曾因为做到某道细分核酸酶的题而红温,故在此对核酸酶做简要整理。

核酸酶催化机理

待补充

主要活性为核酸酶的酶

此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。

外切酶

名称 生物 功能 备注
Xrn1 E 水解无帽的mRNA的5’
FEN I E 切割因为双链DNA合成而被替换的RNA 因RNA突出如翼状故取名翼状核酸酶
Artemis

蛋白

E NHEJ途径中强行将两个粘端水解成平端 需要DNA-PKCS将其磷酸化,

Artemis是希腊神话中的狩猎女神,并且她支持的人基本上都没善终,这大概是因为希腊神话主要是雅典人写的吧

Rnase D B/E 切下tRNA前体3端最后三个核苷酸(3'-5')
Rnase E E 细胞质中各种mRNA的降解
Rnase L E 水解病毒mRNA 被干扰素诱导
dRPase B BER中切下5'端的磷酸核糖 BER还有一个3'AP裂合酶,但是它同时催化核糖去环化和内切。
外切核酸酶

IX

B MMR中从3'端降解错配核酸段
外切核酸酶

VII和RecJ

B MMR中从5'端降解错配核酸段
EXO1

外切核酸酶1

E MMR中水解错配核酸端
Rat1 E RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割

内切酶

名称 生物 功能 备注
Rnase H B 杂交链RNA切割 H代表hybrid杂交
Rnase H1 E 杂交链RNA切割 H代表hybrid杂交
Rnase M5,M16,M23 B rRNA前体剪切 M5切5S前体发卡,M16切16S前体发卡,M23切23S前体发卡
Rnase III B 16S,23SrRNA前体预剪接
Uvr C B 细菌NER中的内切酶,一次在3'距离4-5nt处切,另一次在5'距离8nt处切 分别用两个结构域切
XPF和XPG E 真核生物中NER切割,XPG在3'端先切,XPF在5'端后切
5'AP内切酶 B&E BER中切AP(脱嘌呤位点)的5'端
RuvC B 同源重组中切割Holliday连接 切两次,切出的产物理论随机。
MutH B MMR中识别Gm6ATC,并切非甲基化那条链的GATC的G的5'端
Rnase P B/E tRNA 5'加工 核酶
Rnase F B tRNA 3'预剪接 下一步接Rnase D
CF I,CF II E mRNA 在加尾信号处剪接
Xrn2 E RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割
RMRP B&E 线粒体D环复制时引物加工;5.8S rRNA 5'端加工

[1]

兼具有核酸酶活性的酶

待补充

  1. 杨荣武,2017,分子生物学,第2版,南京大学出版社