核酸酶整理:修订间差异
外观
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|E | |E | ||
|水解无帽的mRNA的5’ | |水解无帽的mRNA的5’ | ||
| | |参与真核生物无义介导的mRNA降解(NMD) | ||
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|FEN | |FEN I | ||
I | |||
|E | |E | ||
|切割因为双链DNA合成而被替换的RNA | |切割因为双链DNA合成而被替换的RNA | ||
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<s>Artemis是希腊神话中的狩猎女神,并且她支持的人基本上都没善终,这大概是因为希腊神话主要是雅典人写的吧</s> | <s>Artemis是希腊神话中的狩猎女神,并且她支持的人基本上都没善终,这大概是因为希腊神话主要是雅典人写的吧</s> | ||
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|Rnase | |Rnase D | ||
D | |||
|B/E | |B/E | ||
|切下tRNA前体3端最后三个核苷酸(3'-5') | |切下tRNA前体3端最后三个核苷酸(3'-5') | ||
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|Rnase | |Rnase E | ||
E | |||
|E | |E | ||
|细胞质中各种mRNA的降解 | |细胞质中各种mRNA的降解 | ||
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|Rnase | |Rnase L | ||
L | |||
|E | |E | ||
|水解病毒mRNA | |水解病毒mRNA | ||
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|外切核酸酶 | |外切核酸酶 | ||
IX | |||
|B | |B | ||
|MMR中从3'端降解错配核酸段 | |MMR中从3'端降解错配核酸段 | ||
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|外切核酸酶 | |外切核酸酶 | ||
VII和RecJ | |||
|B | |B | ||
|MMR中从5'端降解错配核酸段 | |MMR中从5'端降解错配核酸段 | ||
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|E | |E | ||
|RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割 | |RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割 | ||
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!备注 | !备注 | ||
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|Rnase | |Rnase H | ||
H | |||
|B | |B | ||
|杂交链RNA切割 | |杂交链RNA切割 | ||
|H代表hybrid杂交 | |H代表hybrid杂交 | ||
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|Rnase | |Rnase H1 | ||
H1 | |||
|E | |E | ||
|杂交链RNA切割 | |杂交链RNA切割 | ||
| 第114行: | 第103行: | ||
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|Uvr | |Uvr C | ||
C | |||
|B | |B | ||
|细菌NER中的内切酶,一次在3'距离4-5nt处切,另一次在5'距离8nt处切 | |细菌NER中的内切酶,一次在3'距离4-5nt处切,另一次在5'距离8nt处切 | ||
| 第143行: | 第131行: | ||
|B/E | |B/E | ||
|tRNA 5'加工 | |tRNA 5'加工 | ||
| | |核酶(人mt不是核酶--来自yang sir) | ||
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|Rnase F | |Rnase F | ||
| 第161行: | 第149行: | ||
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|RMRP | |RMRP | ||
| | |E | ||
|线粒体D环复制时引物加工;5.8S rRNA 5'端加工 | |线粒体D环复制时引物加工;5.8S rRNA 5'端加工 | ||
|核酶 | |||
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|Ago蛋白(包括PIWI) | |||
|E | |||
|转录后基因表达调控(剪切miRNA、切割mRNA)、转座子沉默 | |||
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| 第168行: | 第161行: | ||
== 兼具有核酸酶活性的酶 == | == 兼具有核酸酶活性的酶 == | ||
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!名称 | |||
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|DNA聚合酶 | |||
|all | |||
|不言而喻 | |||
|5'-3'外切酶活性只有pol I有,Taq没有外切酶活性 | |||
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|逆转录酶 | |||
|all | |||
|不言而喻 | |||
|RNase H活性 体外常用AMV(最适ph8.3,强活性)和M-MULV(ph7.6,弱活性)的逆转录酶 | |||
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|重组酶 | |||
|all | |||
|同源重组 位点特异性重组 转座 | |||
|内切酶活性 | |||
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2025年6月6日 (五) 08:51的最新版本
分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中,核酸(DNA和RNA)显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作:创造(DNA/RNA pol),读取(各种反式元件)和编辑(各种修饰蛋白)和清除(核酸酶)。核酸酶在中心法则各大方面都有大作为,同时本人曾因为做到某道细分核酸酶的题而红温,故在此对核酸酶做简要整理。
核酸酶催化机理
待补充
主要活性为核酸酶的酶
此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。
外切酶
| 名称 | 生物 | 功能 | 备注 |
|---|---|---|---|
| Xrn1 | E | 水解无帽的mRNA的5’ | 参与真核生物无义介导的mRNA降解(NMD) |
| FEN I | E | 切割因为双链DNA合成而被替换的RNA | 因RNA突出如翼状故取名翼状核酸酶 |
| Artemis
蛋白 |
E | NHEJ途径中强行将两个粘端水解成平端 | 需要DNA-PKCS将其磷酸化,
|
| Rnase D | B/E | 切下tRNA前体3端最后三个核苷酸(3'-5') | |
| Rnase E | E | 细胞质中各种mRNA的降解 | |
| Rnase L | E | 水解病毒mRNA | 被干扰素诱导 |
| dRPase | B | BER中切下5'端的磷酸核糖 | BER还有一个3'AP裂合酶,但是它同时催化核糖去环化和内切。 |
| 外切核酸酶
IX |
B | MMR中从3'端降解错配核酸段 | |
| 外切核酸酶
VII和RecJ |
B | MMR中从5'端降解错配核酸段 | |
| EXO1
外切核酸酶1 |
E | MMR中水解错配核酸端 | |
| Rat1 | E | RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割 |
内切酶
| 名称 | 生物 | 功能 | 备注 |
|---|---|---|---|
| Rnase H | B | 杂交链RNA切割 | H代表hybrid杂交 |
| Rnase H1 | E | 杂交链RNA切割 | H代表hybrid杂交 |
| Rnase M5,M16,M23 | B | rRNA前体剪切 | M5切5S前体发卡,M16切16S前体发卡,M23切23S前体发卡 |
| Rnase III | B | 16S,23SrRNA前体预剪接 | |
| Uvr C | B | 细菌NER中的内切酶,一次在3'距离4-5nt处切,另一次在5'距离8nt处切 | 分别用两个结构域切 |
| XPF和XPG | E | 真核生物中NER切割,XPG在3'端先切,XPF在5'端后切 | |
| 5'AP内切酶 | B&E | BER中切AP(脱嘌呤位点)的5'端 | |
| RuvC | B | 同源重组中切割Holliday连接 | 切两次,切出的产物理论随机。 |
| MutH | B | MMR中识别Gm6ATC,并切非甲基化那条链的GATC的G的5'端 | |
| Rnase P | B/E | tRNA 5'加工 | 核酶(人mt不是核酶--来自yang sir) |
| Rnase F | B | tRNA 3'预剪接 | 下一步接Rnase D |
| CF I,CF II | E | mRNA 在加尾信号处剪接 | |
| Xrn2 | E | RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割 | |
| RMRP | E | 线粒体D环复制时引物加工;5.8S rRNA 5'端加工 | 核酶 |
| Ago蛋白(包括PIWI) | E | 转录后基因表达调控(剪切miRNA、切割mRNA)、转座子沉默 |
兼具有核酸酶活性的酶
| 名称 | 生物 | 功能 | 备注 |
|---|---|---|---|
| DNA聚合酶 | all | 不言而喻 | 5'-3'外切酶活性只有pol I有,Taq没有外切酶活性 |
| 逆转录酶 | all | 不言而喻 | RNase H活性 体外常用AMV(最适ph8.3,强活性)和M-MULV(ph7.6,弱活性)的逆转录酶 |
| 重组酶 | all | 同源重组 位点特异性重组 转座 | 内切酶活性 |
- ↑ 杨荣武,2017,分子生物学,第2版,南京大学出版社