自噬相关知识总结:修订间差异
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创建页面,内容为“{| class="wikitable" |+ 自噬相关基因及其蛋白质功能描述 |- ! 基因 !! 蛋白质功能描述 |- | '''哺乳动物''' || '''酵母''' |- | ULK1/2 (Unc51样激酶1和2) || Atg1 |- | ATG2A/B || Atg2 |- | ATG3 || Atg3 |- | ATG4A-D || Atg4 |- | ATG5 || Atg5 |- | Beclin1 || Atg6 |- | ATG7 || Atg7 |- | MAP 1 LC3A-C, GABARAPs, GATE-16 || Atg8 |- | ATG9L1/L2 || Atg9 |- | ATG10 || Atg10 |- | ATG12 || Atg12 |- | ATG13 || Atg13 |- | ATG14L(Barkor) || Atg14 |-…” |
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|+ 自噬相关基因及其蛋白质功能描述 | |+ 自噬相关基因及其蛋白质功能描述 | ||
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! | ! 哺乳动物基因 !! 酵母同源基因 !! 蛋白质功能描述 | ||
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| | | ULK1/2 (Unc51样激酶1和2) || Atg1 || | ||
* 是ULK-ATG13-ATG101-FIP200复合物的一部分,磷酸化Beclin1 | |||
* 与Atg13相互作用 | |||
* 参与自噬的启动、膜靶向、膜曲率感知和脂质囊泡拴系 | |||
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| | | ATG2A/B || Atg2 || | ||
* 是ATG9/ATG12-WIPI复合物的一部分,对ATG9的招募以扩展自噬体很重要 | |||
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| | | ATG3 || Atg3 || | ||
* LC3脂化中的E2样酶 | |||
* 自催化形成ATG12-ATG3复合物以维持线粒体稳态 | |||
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| | | ATG4A-D || Atg4 || | ||
* 半胱氨酸蛋白酶,通过去除Atg8的最后一个氨基酸来处理Atg8 | |||
* 去结合Atg8-PE,参与LC3激活和去脂化 | |||
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| | | ATG5 || Atg5 || | ||
* 是ATG12-ATG5复合物的一部分,参与自噬体形成/延伸 | |||
* 作为LC3脂化中的E3样酶 | |||
* 与Atg16相互作用并在自噬中起关键作用 | |||
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| | | Beclin1 || Atg6 || | ||
* VPS34-PI3K复合物的亚基 | |||
* 招募Atg14或Vps38,与Bcl-2相互作用 | |||
* 脂质结合和膜变形功能 | |||
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| | | ATG7 || Atg7 || | ||
* E1样酶,与E2酶Atg10或Atg3相互作用 | |||
* 参与LC3和ATG12结合,并与Atg8形成硫酯键 | |||
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| | | MAP 1 LC3A-C, GABARAPs, GATE-16 || Atg8 || | ||
* 泛素样模块与PE结合,用作自噬体标记 | |||
* 识别货物特异性适配体,支持体外膜拴系 | |||
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| | | ATG9L1/L2 || Atg9 || | ||
* 跨膜蛋白,与ATG2-WIPI复合物相互作用 | |||
* 在PAS和外围细胞器之间穿梭以传递脂质/因子 | |||
* 具有自相互作用功能 | |||
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| | | ATG10 || Atg10 || | ||
* ATG12与Atg5结合的E2样酶 | |||
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| | | ATG12 || Atg12 || | ||
* 泛素样模块与Atg5结合 | |||
* 与Atg5和Atg16形成E3复合物,与Atg3相互作用 | |||
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| | | ATG13 || Atg13 || | ||
* 是ULK-ATG13-ATG101-FIP200复合物的一部分,参与自噬启动 | |||
* 靶向mTOR信号通路,桥接Atg1和Atg17-Atg31-Atg29 | |||
* 通过Atg14招募Vps34复合物,与LC3结合 | |||
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| | | ATG14L(Barkor) || Atg14 || | ||
* VPS34-PI3K复合物的亚基,与Beclin1相互作用 | |||
* 支持膜靶向、膜曲率感知和膜融合 | |||
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| | | ATG16L1/L2 RB1CC1/ FIP200 || Atg16 || | ||
* 与ATG5-ATG12复合物结合,作为E3酶复合物的一部分 | |||
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| | | WIP11-4 || Atg18 || | ||
* 是ATG2-WIPI复合物的一部分,对ATG9的招募到自噬体很重要 | |||
* 与PI3P结合,支持Atg9的逆行运输 | |||
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| ATG101 || - || | |||
* 与Atg13相互作用并形成ULK-ATG13-ATG101-FIP200复合物 | |||
| ATG101 || - | |||
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=== 分子伴侣介导的自噬CMA === | |||
* 迄今为止只在哺乳动物细胞中发现。 | |||
* 被CMA降解的蛋白质都包含一个五肽序列。 | |||
** 其中有1-2个K/R、1-2个I/L/V/F、一个E/D,和一个Q在五肽序列的一端。共有序列是KFERQ。 | |||
** 可以位于C端/N端/内部,但一定要可接近。 | |||
** 这个序列可能通过翻译后修饰来形成,如乙酰化赖氨酸承担Q的功能,磷酸化承担E/D的功能。 | |||
* HSC70识别KFERQ。该蛋白是否被降解,是由此基序能否暴露并且被识别调控的。 | |||
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2025年2月5日 (三) 15:28的最新版本
哺乳动物基因 | 酵母同源基因 | 蛋白质功能描述 |
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ULK1/2 (Unc51样激酶1和2) | Atg1 |
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ATG2A/B | Atg2 |
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ATG3 | Atg3 |
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ATG4A-D | Atg4 |
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ATG5 | Atg5 |
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Beclin1 | Atg6 |
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ATG7 | Atg7 |
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MAP 1 LC3A-C, GABARAPs, GATE-16 | Atg8 |
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ATG9L1/L2 | Atg9 |
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ATG10 | Atg10 |
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ATG12 | Atg12 |
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ATG13 | Atg13 |
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ATG14L(Barkor) | Atg14 |
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ATG16L1/L2 RB1CC1/ FIP200 | Atg16 |
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WIP11-4 | Atg18 |
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ATG101 | - |
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分子伴侣介导的自噬CMA
- 迄今为止只在哺乳动物细胞中发现。
- 被CMA降解的蛋白质都包含一个五肽序列。
- 其中有1-2个K/R、1-2个I/L/V/F、一个E/D,和一个Q在五肽序列的一端。共有序列是KFERQ。
- 可以位于C端/N端/内部,但一定要可接近。
- 这个序列可能通过翻译后修饰来形成,如乙酰化赖氨酸承担Q的功能,磷酸化承担E/D的功能。
- HSC70识别KFERQ。该蛋白是否被降解,是由此基序能否暴露并且被识别调控的。