RNA的生物合成:修订间差异
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*特殊处:最大的亚基在C端无CTD结构。 | *特殊处:最大的亚基在C端无CTD结构。 | ||
== 依赖于RNA的RNA聚合酶(RdRP) == | |||
=== 概述——DNA复制(病毒特供) === | |||
* 复制方向同转录 | |||
* RNA聚合酶在模版的一端从头复制,原料为NTP,需要镁离子,少数需要引物,引物为与基因组相连的病毒蛋白质 | |||
* 易错、高突变,因为酶一点校对能力都没有 | |||
* 对放线菌素D一般不敏感,对核糖核酸酶敏感 | |||
* 复制绝大多发生在宿主细胞的胞质,少数在核 | |||
=== RNA聚合酶(复制酶) === | |||
* 来源:一般由病毒基因组编码,但有可能成分复杂。例如大肠杆菌的一种噬菌体,其复制酶为4亚基,却只有1个亚基为自身编码,另三个亚基是宿主的S1核糖体蛋白、翻译延伸因子EF-Tu、EF-Ts | |||
* 结构:与其他聚合酶相似,类似右手 | |||
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2024年4月4日 (四) 23:54的最新版本
概述
- 转录具有选择性和不对称性,一条链为RNA的合成提供模板,称为模板链(又称无意义链或Waston链)。另一条链与RNA编码信息一致,称为编码链(又称有意义链和Crick链)
- 以四种NTP为原料,还需要镁离子(一个镁离子同NTP进入活性中心,进行静电屏蔽)
- 转录不需要引物
- 转录方向为5'→3'
- 转录的忠实性低于复制,但在特定因子作用下可以发挥校对功能(RNS聚合酶通常无3'外切酶活性)
- 有高度的进行性
- 以上为DNA转录的概述
RNA聚合酶(RNAP)
RNA聚合酶是负责在生物体内催化RNA合成的酶,具体信息如下:
依赖于DNA的RNA聚合酶
细菌的RNA聚合酶
细菌只有一种RNA聚合酶。
- 组成:由核心酶和σ因子组成全酶。核心酶由2个α亚基、1个β亚基、一个β'亚基和一个ω亚基组成。σ因子有种属特异性和条件特异性,以大肠杆菌为例,σ70因子起始大多数转录物的转录,用于大多数启动子的识别,但在特殊情况(如热激情况下,σ24,σ32起始相关基因转录)由其他σ因子起始转录。(σ28 专门负责鞭毛相关的mRNA的合成)
- 功能:α亚基的N端参与酶组装,C端参与和调节蛋白与增强元件的作用;两种β亚基共同构成催化中心,其中β’亚基带正电,与DNA结合;ω亚基促进酶的组装并维持其稳定。
- 抑制剂:利福平(利福霉素)作用于β亚基,抑制起始;利(迪)链霉素作用于β亚基,抑制延伸;肝素作用于β'亚基(抵消正电),抑制酶活性。
真核的RNA聚合酶
分类
真核生物的RNA聚合酶可分为三类,分别为RNA聚合酶I、RNA聚合酶II和RNA聚合酶III,另外还有细胞器RNA聚合酶。
- 组成:有2个大亚基,加上12~15个小亚基,2个大亚基的一级结构与细菌的两种β亚基相似,含有细菌α亚基的同源物。
- RNA聚合酶I:位于核仁,起始5.8SrRNA、28SrRNA、18SrRNA(以45SrRNA的形式转录),对α-鹅膏蕈碱不敏感,对放线菌素D高度敏感。
- 主要功能:亚基A190相当于β′亚基,亚基A135相当于β亚基,亚基AC40、AC19相当于α亚基,亚基Rbp6相当于ω亚基
- RNA聚合酶II:位于核质,起始mRNA,lncRNA,多数miRNA,具有帽子结构的snRNA与snoRNA的转录,对α-鹅膏蕈碱最敏感,对放线菌素D轻度敏感。
- 主要功能:亚基Rbp1相当于β′亚基,亚基Rbp2相当于β亚基,亚基Rbp3、11相当于α亚基,亚基Rbp6相当于ω亚基
- RNA聚合酶III:位于核质,起始tRNA,5SrRNA,7SrRNA,无帽子的snRNA和snoRNA,端粒酶RNA和多种小RNA转录,对α-鹅膏蕈碱中度敏感,对放线菌素D轻度敏感。
- 主要功能:亚基C160相当于β′亚基,亚基C128相当于β亚基,亚基AC40、AC19相当于α亚基,亚基Rbp6相当于ω亚基
- 线粒体RNA聚合酶:单体酶,与T7噬菌体同源,由核基因编码,负责mt内全部RNA的合成。
- 叶绿体RNA聚合酶:分两种:一种是由核基因编码的单体酶,负责管家基因(包括rRNA)的转录;一种是由cp基因编码的多聚酶,负责光合链上cp自身合成的亚基基因的转录。
细胞器RNA聚合酶对α-鹅膏蕈碱不敏感,对放线菌素D敏感。
- 所有真核的RNAPII在最大亚基C端,都重复的富含羟基氨基酸残基,构成了特别的羧基端结构域(CTD),是活性必需的。一旦CTD磷酸化,转录就从起始进入延伸阶段。
- 此外,植物细胞还有两种特化的RNA聚合酶II(缺乏CTD),为RNA聚合酶IV和V,负责转录lncRNA,介导RNA引导的DNA甲基化。
抑制剂
- α-鹅膏蕈碱:见上;
- 放线菌素D:见上,作用机制为插入DNA双螺旋中的GC碱基对,阻止聚合酶移动。
- 利福霉素与利链霉素只对线粒体与叶绿体有抑制作用,效果与其抑制细菌时相同。
古菌的RNA聚合酶
- 类似真核生物的特征:不受利福霉素与利链霉素的抑制,不能直接识别启动子,需要转录因子,结构上类似于RNApolII。
- 类似原核生物的特征:只有一种。
- 特殊处:最大的亚基在C端无CTD结构。
依赖于RNA的RNA聚合酶(RdRP)
概述——DNA复制(病毒特供)
- 复制方向同转录
- RNA聚合酶在模版的一端从头复制,原料为NTP,需要镁离子,少数需要引物,引物为与基因组相连的病毒蛋白质
- 易错、高突变,因为酶一点校对能力都没有
- 对放线菌素D一般不敏感,对核糖核酸酶敏感
- 复制绝大多发生在宿主细胞的胞质,少数在核
RNA聚合酶(复制酶)
- 来源:一般由病毒基因组编码,但有可能成分复杂。例如大肠杆菌的一种噬菌体,其复制酶为4亚基,却只有1个亚基为自身编码,另三个亚基是宿主的S1核糖体蛋白、翻译延伸因子EF-Tu、EF-Ts
- 结构:与其他聚合酶相似,类似右手