核酸酶整理：修订间差异

来自osm&bio
跳转到导航 跳转到搜索
←上一编辑下一编辑→
可视化wikitext
SIMgt（留言 | 贡献）
46次编辑
小无编辑摘要
SIMgt（留言 | 贡献）
46次编辑
无编辑摘要
第1行： 第1行：
分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中，核酸（DNA和RNA）显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作：创造（DNA/RNA pol),读取（各种反式元件）和编辑（各种修饰蛋白）和清除（核酸酶）。核酸酶在中心法则各大方面都有大作为，<s>同时本人曾因为做到某道细分核酸酶的题而红温，</s>故在此对核酸酶做简要整理。
分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中，核酸（DNA和RNA）显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作：创造（DNA/RNA pol),读取（各种反式元件）和编辑（各种修饰蛋白）和清除（核酸酶）。核酸酶在中心法则各大方面都有大作为，<s>同时本人曾因为做到某道细分核酸酶的题而红温，</s>故在此对核酸酶做简要整理。
== 核酸酶催化机理 ==
待补充


== 主要活性为核酸酶的酶 ==
== 主要活性为核酸酶的酶 ==
此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。
此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。
=== 外切酶 ===
{| class="wikitable"
!名称
!生物
!功能
!备注
|-
|Xrn1
|E
|水解无帽的mRNA的5’
|
|-
|Fen
I
|E
|切割因为双链DNA合成而被替换的RNA
|因RNA突出如翼状故取名翼状核酸酶
|-
|Artemis
蛋白
|E
|NHEJ途径中强行将两个粘端水解成平端
|需要DNA-PK<sub>CS</sub>将其磷酸化，
<s>Artemis是希腊神话中的狩猎女神，并且她支持的人基本上都没善终，这大概是因为希腊神话主要是雅典人写的吧</s>
|-
|Rnase
D
|B/E
|切下tRNA前体3端最后三个核苷酸（3'-5')
|
|-
|Rnase
E
|E
|细胞质中各种mRNA的降解
|
|-
|Rnase
L
|E
|水解病毒mRNA
|被干扰素诱导
|-
|dRPase
|B
|BER中切下5'端的磷酸核糖
|BER还有一个3'AP裂合酶，但是它同时催化核糖去环化和内切。
|-
|外切核酸酶
I X
|B
|MMR中从3'端降解错配核酸段
|
|-
|外切核酸酶
VII 和RecJ
|B
|MMR中从5'端降解错配核酸段
|
|-
|EXO1
外切核酸酶1
|E
|MMR中水解错配核酸端
|
|-
|Rat1
|E
|RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割
|
|-
|
|
|
|
|}
=== 内切酶 ===
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
|+
|+
第22行： 第104行：
|H代表hybrid杂交
|H代表hybrid杂交
|-
|-
|Fen
|Rnase M5,M16,M23
I
|B
|E
|rRNA前体剪切
|切割因为双链DNA合成而被替换的RNA
|M5切5S前体发卡，M16切16S前体发卡，M23切23S前体发卡
|因RNA突出如翼状故取名翼状核酸酶
|-
|-
|Artemis
|Rnase III
蛋白
|B
|E
|16S,23SrRNA前体预剪接
|NHEJ途径中强行将两个粘端水解成平端
|
|需要DNA-PK<sub>CS</sub>将其磷酸化，
<s>Artemis是希腊神话中的狩猎女神，并且她支持的人基本上都没善终，这大概是因为希腊神话主要是雅典人写的吧</s>
|-
|-
|Uvr
|Uvr
第51行： 第130行：
|
|
|-
|-
|dRPase
|RuvC
|B
|B
|BER中切下5'端的磷酸核糖
|同源重组中切割Holliday连接
|BER还有一个3'AP裂合酶，但是它同时催化核糖去环化和内切。
|切两次，切出的产物理论随机。
|-
|-
|MutH
|MutH
第61行： 第140行：
|
|
|-
|-
|外切核酸酶
|Rnase P
I X
|B/E
|tRNA 5'加工
|核酶
|-
|Rnase F
|B
|B
|MMR中从3'端降解错配核酸段
|tRNA 3'预剪接
|下一步接Rnase D
|-
|CF I,CF II
|E
|mRNA 在加尾信号处剪接
|
|
|-
|-
|外切核酸酶
|Xrn2
VII 和RecJ
|E
|B
|RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割
|MMR中从5'端降解错配核酸段
|
|
|}
|}

2024年11月27日 (三) 23:11的版本

分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中，核酸（DNA和RNA）显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作：创造（DNA/RNA pol),读取（各种反式元件）和编辑（各种修饰蛋白）和清除（核酸酶）。核酸酶在中心法则各大方面都有大作为，同时本人曾因为做到某道细分核酸酶的题而红温，故在此对核酸酶做简要整理。

核酸酶催化机理

待补充

主要活性为核酸酶的酶

此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。

外切酶

名称 生物 功能 备注
Xrn1 E 水解无帽的mRNA的5’
Fen

I

E 切割因为双链DNA合成而被替换的RNA 因RNA突出如翼状故取名翼状核酸酶
Artemis

蛋白

E NHEJ途径中强行将两个粘端水解成平端 需要DNA-PKCS将其磷酸化，

Artemis是希腊神话中的狩猎女神，并且她支持的人基本上都没善终，这大概是因为希腊神话主要是雅典人写的吧

Rnase

D

B/E 切下tRNA前体3端最后三个核苷酸（3'-5')
Rnase

E

E 细胞质中各种mRNA的降解
Rnase

L

E 水解病毒mRNA 被干扰素诱导
dRPase B BER中切下5'端的磷酸核糖 BER还有一个3'AP裂合酶，但是它同时催化核糖去环化和内切。
外切核酸酶

I X

B MMR中从3'端降解错配核酸段
外切核酸酶

VII 和RecJ

B MMR中从5'端降解错配核酸段
EXO1

外切核酸酶1

E MMR中水解错配核酸端
Rat1 E RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割

内切酶

名称 生物 功能 备注
Rnase

H

B 杂交链RNA切割 H代表hybrid杂交
Rnase

H1

E 杂交链RNA切割 H代表hybrid杂交
Rnase M5,M16,M23 B rRNA前体剪切 M5切5S前体发卡，M16切16S前体发卡，M23切23S前体发卡
Rnase III B 16S,23SrRNA前体预剪接
Uvr

C

B 细菌NMR中的内切酶，一次在3'距离4-5nt处切，另一次在5'距离8nt处切 分别用两个结构域切
XPF和XPG E 真核生物中NMR切割，XPG在3'端先切，XPF在5'端后切
5'AP内切酶 B&E BER中切AP（脱嘌呤位点）的5'端
RuvC B 同源重组中切割Holliday连接 切两次，切出的产物理论随机。
MutH B MMR中识别m6GATC，并切非甲基化的GATC的G的5'端
Rnase P B/E tRNA 5'加工 核酶
Rnase F B tRNA 3'预剪接 下一步接Rnase D
CF I,CF II E mRNA 在加尾信号处剪接
Xrn2 E RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割

[1]

兼具有核酸酶活性的酶

待补充

  1. ↑ 杨荣武,2017,分子生物学,第2版，南京大学出版社
取自“https://osm.bio/index.php?title=核酸酶整理&oldid=1889”