常见序列整理
AQP Asn-Pro-Ala
O-linked或N-linked Asn-X-Ser/Thr
PTS1 转运序列 Ser-Lys-Leu
PTS2 转运序列 Arg/Lys-Leu/Ile-5X-His/Gln-Leu
ER 转运序列 疏水aa核心,多碱性aa(Arg,Lys)
Mt 转运序列 两性螺旋,一侧疏水,一侧碱性(Arg,Lys)
Cp 转运序列 富含Ser,Thr和少量疏水aa,罕见Glu和Asp
Nuclear 转运序列 富含短的Arg,Lys序列
KDEL 字面意思
KKXX 字面意思
两酸 字面意思,如:Asp-X-Gln
NPXY 字面意思
YXXφ 字面意思
LL 字面意思
SH2结构域特异结合 p-Tyr
SH3结构域特异结合 PXXP和RXXK
PTB结构域特异结合 NPXY
PDZ结构域特异结合 膜蛋白C端aa,通常末端为Val-COOH
WW结构域特异结合 XPPXY
(还剩几个结构域无特定结合序列,故不特地列出)
PKA磷酸化序列 X-Arg-Arg/Lys-X-Ser/Thr-Φ
膜蛋白内吞序列 YXXΦ
P62 Nup153核孔复合物蛋白疏水结构域 FXFG
Nup98核孔复合物蛋白疏水结构域 GLFG
NLS PKKKRKV
破坏框 RXXLGXIXN
层粘连蛋白,纤连蛋白等与外基质结合区域 RGD
胶原α链 GXY(X常为Pro,Y常为Hypro或Hylys)