常见序列整理

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AQP   Asn-Pro-Ala

O-linked或N-linked     Asn-X-Ser/Thr

PTS1 转运序列   Ser-Lys-Leu

PTS2 转运序列   Arg/Lys-Leu/Ile-5X-His/Gln-Leu

ER 转运序列    疏水aa核心,多碱性aa(Arg,Lys)

Mt 转运序列    两性螺旋,一侧疏水,一侧碱性(Arg,Lys)

Cp 转运序列     富含Ser,Thr和少量疏水aa,罕见Glu和Asp

Nuclear 转运序列 富含短的Arg,Lys序列

KDEL   字面意思

KKXX   字面意思

两酸   字面意思,如:Asp-X-Gln

NPXY   字面意思

YXXφ 字面意思

LL     字面意思

SH2结构域特异结合 p-Tyr

SH3结构域特异结合 PXXP和RXXK

PTB结构域特异结合 NPXY

PDZ结构域特异结合 膜蛋白C端aa,通常末端为Val-COOH

WW结构域特异结合 XPPXY

(还剩几个结构域无特定结合序列,故不特地列出)

PKA磷酸化序列   X-Arg-Arg/Lys-X-Ser/Thr-Φ

膜蛋白内吞序列   YXXΦ

P62 Nup153核孔复合物蛋白疏水结构域     FXFG

Nup98核孔复合物蛋白疏水结构域         GLFG

NLS         PKKKRKV

破坏框       RXXLGXIXN

层粘连蛋白,纤连蛋白等与外基质结合区域   RGD

胶原α链 GXY(X常为Pro,Y常为Hypro或Hylys)