常见序列整理
PS：有无好心人帮我对齐一下QAQ，不会编辑
——全部改成了表格形式，感觉看起来会舒服一点ww--W. Machine（留言） 2025年8月10日 (日) 11:16 (CST)
| 名称 | 序列或特征 | 描述 | 附加说明 | |
|---|---|---|---|---|
| 定位信号 | KDEL | KDEL | 可溶性蛋白内质网驻留信号 | |
| HDEL | HDEL | 同上，在酵母和植物中更常见 | ||
| KKXX | KKXX(X为任意氨基酸) | 膜蛋白内质网驻留信号 | 受体为COP I α和β亚基 | |
| 两酸 | 如DXE | ER→高尔基体转运信号 | 受体为COP II Sec24亚基 | |
| NPXY | Asn-Pro-X-Tyr | 质膜上LDL受体 | 受体为AP2复合物 | |
| YXXΦ | Tyr-X-X-Φ(其中Φ为疏水氨基酸) | 高尔基体反面膜囊蛋白 | 受体为AP1（μ1亚基） | |
| 质膜膜蛋白 | 受体为AP2（μ2亚基） | |||
| LL | Leu-Leu | 质膜膜蛋白 | 受体为AP2复合物 | |
| PTS1 | SKL，存在许多变体 | C端过氧化物酶体定位信号 | 受体为PEX5 | |
| PTS2 | (R/K)(L/V/I/Q)(X)5(H/Q)(L/A/F) | N端过氧化物酶体定位信号 | 受体为PEX7，共受体为18或20 | |
| mPTS | 膜蛋白过氧化物酶体定位信号 | 受体为PEX19 | ||
| 信号肽 | 疏水aa核心，多碱性aa（Arg，Lys） | 内质网定位序列 | ||
| 转运肽 | 富含Ser，Thr和少量疏水aa，罕见Glu和Asp | 叶绿体定位序列 | ||
| 导肽 | 两性螺旋，一侧疏水，一侧碱性（Arg，Lys） | 线粒体定位序列 | ||
| NLS | PKKKRKV | 核定位序列 | 该序列为第一个被确定的NLS序列，来自SV40的T抗原 | |
| 细胞周期 | 破坏框 | RXXLGXIXN | M期周期蛋白破坏框 | |
| 功能序列 | GXY（X常为Pro，Y常为Hypro或Hylys） | 胶原的三股螺旋重复序列 | ||
| RGD | Arg-Gly-Asp | 整联蛋白胞外部分结合胞外基质（如层粘连蛋白，纤连蛋白等）的序列 | ||
| 富含Ala、Lys | 弹性蛋白α螺旋区域 | 通过Lys残基相互交联 | ||
| 七肽重复序列，第一位和第四位是疏水氨基酸 | α角蛋白的卷曲螺旋重复序列 | |||
| G-A/S-G-A/S | β角蛋白的β折叠重复序列 | |||
| N*-X-S/T，X≠P | N糖基化，发生在N上 | O糖基化没有特定的识别位点 | ||
| NPA | 水孔蛋白通道中的关键序列 | |||
| CTGnCAGn | 核小体容易形成 和弯曲有关 | |||
| UNCG、GNRA或CUYG | 发夹结构稳定四环 | |||
| 基团修饰 | X-Arg-Arg/Lys-X-Ser/Thr-Φ | PKA磷酸化序列 | ||
| 结构域结合 | SH2 | 结合p-Tyr | eg: Src、Grb2、Shc、STAT | |
| SH3 | 结合PXXP和RXXK | eg: Src、Nck | ||
| PTB | 结合NPXY | eg: Shc、IRS1 | ||
| PDZ | 结合膜蛋白C端aa，通常末端为Val-COOH | eg: Dishevelled、FAP | ||
| WW | 结合XPPXY | eg: Nedd4(E3泛素连接酶)、Smurf、Dystrophin | ||
| 核孔复合体蛋白 | Pom121 | C端有FXFG重复序列 | 孔膜区，跨膜蛋白 | |
| Nup153 | N端有FXFG重复序列 | “捕鱼笼” | 具有锌指结构，能够结合DNA（在体外） | |
| p62 | FXFG重复序列 | 中央颗粒 | 与酵母的Nsp1p同源，带有O-连接GlcNac类型的糖基化修饰 | |
| Nup98 | GLFG重复序列 | 与酵母的Nup116p同源 |