常见序列整理
AQP Asn-Pro-Ala
O-linked或N-linked Asn-X-Ser/Thr
PTS1 转运序列 Ser-Lys-Leu
PTS2 转运序列 Arg/Lys-Leu/Ile-5X-His/Gln-Leu
ER 转运序列 疏水aa核心,多碱性aa(Arg,Lys)
Mt 转运序列 两性螺旋,一侧疏水,一侧碱性(Arg,Lys)
Cp 转运序列 富含Ser,Thr和少量疏水aa,罕见Glu和Asp
Nuclear 转运序列 富含短的Arg,Lys序列
KDEL 字面意思
KKXX 字面意思
两酸 字面意思,如:Asp-X-Gln
NPXY 字面意思
YXXφ 字面意思
LL 字面意思
SH2结构域特异结合 p-Tyr
SH3结构域特异结合 PXXP和RXXK
PTB结构域特异结合 NPXY
PDZ结构域特异结合 膜蛋白C端aa,通常末端为Val-COOH
WW结构域特异结合 XPPXY
(还剩几个结构域无特定结合序列,故不特地列出)
PKA磷酸化序列 X-Arg-Arg/Lys-X-Ser/Thr-Φ
膜蛋白内吞序列 YXXΦ
P62 Nup153核孔复合物蛋白疏水结构域 FXFG
Nup98核孔复合物蛋白疏水结构域 GLFG
NLS PKKKRKV
破坏框 RXXLGXIXN
层粘连蛋白,纤连蛋白等与外基质结合区域 RGD
胶原α链 GXY(X常为Pro,Y常为Hypro或Hylys)
PS:有无好心人帮我对齐一下QAQ,不会编辑
名称 | 序列或特征 | 描述 | 附加说明 | |
---|---|---|---|---|
定位信号 | KDEL | KDEL | 可溶性蛋白内质网驻留信号 | |
HDEL | HDEL | 同上,在酵母和植物中更常见 | ||
KKXX | KKXX(X为任意氨基酸) | 膜蛋白内质网驻留信号 | ||
两酸 | 如DXE | ER→高尔基体转运信号 | ||
PTS1 | SKL,存在许多变体 | C端过氧化物酶体定位信号 | 受体为PEX5 | |
PTS2 | (R/K)(L/V/I/Q)(X)5(H/Q)(L/A/F) | N端过氧化物酶体定位信号 | 受体为PEX7,共受体为18或20 | |
mPTS | 膜蛋白过氧化物酶体定位信号 | 受体为PEX19 | ||
信号肽 | 疏水aa核心,多碱性aa(Arg,Lys) | 内质网定位序列 | ||
转运肽 | 富含Ser,Thr和少量疏水aa,罕见Glu和Asp | 叶绿体定位序列 | ||
导肽 | 两性螺旋,一侧疏水,一侧碱性(Arg,Lys) | 线粒体定位序列 | ||
功能序列 | GXY(X常为Pro,Y常为Hypro或Hylys) | 胶原的三股螺旋重复序列 | ||
七肽重复序列,第一位和第四位是疏水氨基酸 | α角蛋白的卷曲螺旋重复序列 | |||
G-A/S-G-A/S | β角蛋白的β折叠重复序列 | |||
N*-X-S/T,X≠P | N糖基化,发生在N上 | O糖基化没有特定的识别位点 | ||
NPA | 水孔蛋白通道中的关键序列 |